[mira_talk] Re: BUG Nasty Repeats?

  • From: Bastien Chevreux <bach@xxxxxxxxxxxx>
  • To: mira_talk@xxxxxxxxxxxxx
  • Date: Sun, 20 Mar 2016 21:15:22 -0400

On 20 Mar 2016, at 16:33 , Adrian Pelin <apelin20@xxxxxxxxx> wrote:

I got this odd message saying 0 percent of reads are nasty repeats:
[…]
Any idea what could be happening?

Hmmmm. One possibility is that while the flag for warnings is set in one of the 
earlier passes, the condition is not fulfilled in the last pass. However, I did 
not foresee this and the warning is written out to disk anyway. With 
nonsensical values.

A bug of the warning code if you will.

B.


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