[PWC-MEDIA] Persbericht TU Delft: Hybride nanogaatjes voor nieuw type DNA-analyse

From: "Michel van Baal" <M.vanBaal@xxxxxxxxxx>
To: <pwc-media@xxxxxxxxxxxxx>
Date: Sun, 28 Nov 2010 19:16:12 +0100

Hybride nanogaatjes voor nieuw type DNA-analyse

Onderzoekers van de TU Delft en Oxford hebben een nieuw, hybride nanogaatje
ontwikkeld dat bestaat uit biologische en kunstmatige onderdelen. Dit nieuwe
type nanogaatje kan helpen bij de ontwikkeling van een snelle en goedkope
manier om DNA moleculen te lezen. Zij publiceerden hierover vandaag (zondag 28
november) in de online versie van Nature Nanotechnology.

Biologisch

"Het eerste project waarbij het menselijk genoom in kaart werd gebracht en de
inhoud van het menselijk DNA werd uitgelezen ('gesequenced') werd in 2003
voltooid en kostte naar schatting 3 miljard dollar. Stelt u zich eens voor dat
deze kosten zouden kunnen worden teruggebracht tot een paar honderd euro en dat
iedereen zijn of haar eigen genoom zou kunnen laten uitlezen. Dan zouden artsen
ziekten kunnen diagnosticeren en behandelen voordat er zelfs maar een eerste
symptoom merkbaar zou zijn", legt professor Cees Dekker van het Kavli Institute
of Nanoscience in Delft uit.

Een veelbelovend hulpmiddel hierbij is het zogenaamde nanogaatje: een minuscuul
klein gaatje van slechts een paar nanometer grootte waarmee de informatie van
een enkel DNA-molecuul is te 'lezen' terwijl deze door het gaatje wordt
getrokken.

Nieuw onderzoek door Dekkers team, in samenwerking met de groep van prof. Hagan
Bayley van de Oxford University, heeft nu een nieuw, veel robuuster type
nanogaatje opgeleverd, dat bestaat uit een biologische en een kunstmatige
onderdelen.

Kwetsbaar

Dekker: "Nanoporiën worden al voor DNA-analyse gebruikt door natuurlijke,
porievormende eiwitten in een vloeistofachtig membraam van lipides te plaatsen.
DNA-moleculen kunnen afzonderlijk door de porie worden getrokken en worden
geanalyseerd door een elektrische spanning te zetten over dat membraam. De
methode is vergelijkbaar met de manier waarop een ouderwetse cassetterecorder
muziek op een tape afleest. Een probleem bij deze biologische technologie is
echter die kwetsbare laag lipides. Onze nieuwe hybride aanpak is veel robuuster
en geschikt om nanoporiën in silicium devices te integreren."

Proteïnen op een siliciumchip

Het nieuwe onderzoek, hoofdzakelijk uitgevoerd door postdoc dr. Adam Hall, laat
een eenvoudige methode zien waarmee de porievormende eiwitten aangebracht
kunnen worden in een stevige laag in een siliciumchip. Een enkel eiwit wordt
daarbij gekoppeld aan een stukje DNA, dat door een gaatje in een membraam van
siliciumnitride wordt getrokken (zie bijgevoegde afbeelding).

Als het DNA-molecuul door het gat gaat, trekt het de porievormende eiwit achter
zich aan, dat vervolgens in de opening blijft steken. Zo ontstaat een stevig
chipsysteem dat zich prima leent om te integreren in een sensortoepassing. De
onderzoekers hebben aangetoond dat de hybride apparatuur goed werkt en
inderdaad gebruikt kan worden voor het detecteren van DNA-moleculen.

Noot voor de redactie

voor meer informatie:

Prof. Cees Dekker, Kavli Institute of Nanoscience, TU Delft. C.dekker@xxxxxxxxxx

Michel van Baal, persvoorlichting. m.vanbaal@xxxxxxxxxx, 06 14015699

Artikel:

Tijdschrift: Nature Nanotechnology. Advance Online Publication (AOP)

Titel: Hybrid pore formation by directed insertion of alpha hemolysin into
solid-state nanopores

Auteurs: Adam R. Hall1, Andrew Scott1, Dvir Rotem2, Kunal K. Mehta2, Hagan
Bayley2 en Cees Dekker1

Adres: 1: Kavli Institute of Nanoscience; 2: Department of Chemistry,
University of Oxford,

Een pdf van het artikel kan per e-mail worden aangevraagd bij:
c.dekker@xxxxxxxxxx <mailto:c.dekker@xxxxxxxxxx>

Afbeelding:

http://ceesdekkerlab.tudelft.nl/wp-content/uploads/pore_creation_final.jpg
<https://legacywebmail.tudelft.nl/exchweb/bin/redir.asp?URL=http://ceesdekkerlab.tudelft.nl/wp-content/uploads/pore_creation_final.jpg>

De illustratie mag vrij worden gebruikt voor nieuwsartikelen, mits onder
vermelding van: 'Afbeelding: Cees Dekker Lab TU Delft / Tremani'

Afbeeldingen met hoge resolutie kunnen per e-mail worden aangevraagd:
c.dekker@xxxxxxxxxx <mailto:c.dekker@xxxxxxxxxx>

Bijschrift:

Artistieke impressie van de vorming van hybride poriën door het gecontroleerd
plaatsen van het biologische porie-eiwit alfa-hemolysine (roze) in SiN
nanogaatjes (gaten in de groene onderlaag). Een elektrisch veld stuurt een
dubbelstrengs DNA-molecuul (blauw, links) door het gat, dat vervolgens het roze
hemolysine eiwit in positie trekt. Eenmaal op hun plaats kunnen de hybride
nanoporiën worden gebruikt om er enkelstrengs DNA (blauw, midden) doorheen te
trekken voor analyse en sequencing.

U ontvangt dit bericht via de PWC-medialijst. U kunt zich afmelden via
www.platformwetenschapscommunicatie.nl
<file://www.platformwetenschapscommunicatie.nl/> .
Dit bericht is afkomstig van de TU Delft, Marketing & Communicatie, Postbus 5,
2600 AA Delft, www.tudelft.nl <http://www.tudelft.nl/> .

[PWC-MEDIA] Persbericht TU Delft: Hybride nanogaatjes voor nieuw type DNA-analyse

Other related posts: