[Ilugc] Query on Gromacs Installation

  • From: suraj@xxxxxxxxx (Suraj Kumar)
  • Date: Thu Mar 25 15:36:05 2010

On Thu, Mar 25, 2010 at 12:04 PM, Gowriishankar Raju
<rgsanbioinfo@xxxxxxxxx> wrote:


How to choose the Gromacs version to be install in Ubuntu?
Is any special Gromacs versions available for ubuntu?
And what is the purpose to install FFTW?
Shall i use the latest version of FFTW to install?
Should the versions of FFTW and Gromacs be the same? (Like FFTW 3.2.2 V and
Gromacs 3.2.2V)

Ubuntu uses debian's "APT" package management system. Using apt, one
can pick and install any of the available packages in the configured
APT repositories.

gromacs seems to be available on 9.10 in "universe" repository (this
means, if not enabled, you'll have to enable the universe repo first).
Please see http://www.google.com/search?q=enable%20universe%20ubuntu

Once you've enabled universe and done sudo apt-get update, you should
be able to seamlessly install gromacs by just typing:

$ sudo apt-get install gromacs

This will pull all the needed dependencies and install everything for you.

HTH,

? -Suraj

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