[qfish] Re: correcting for bias in gear characterization study

  • From: Mike Errigo <Mike.Errigo@xxxxxxxxx>
  • To: "qfish@xxxxxxxxxxxxx" <qfish@xxxxxxxxxxxxx>
  • Date: Wed, 25 Jan 2017 15:20:34 +0000

I'm not a survey biologist, but it seems to me that if you want to account for 
the side bias you need to identify the factors causing it. Several come to 
mind. Were the tows done in a straight line? If not, being on the inside vs. 
outside of the turn would make a difference. Also, the direction of the 
current. If you were headed directly into or away from the current you'd be 
fine, but if it was hitting the boat at an angle or directly on one side it 
could affect how each net performs. Time of day is another factor. If the sun 
was visible and hitting one side of the vessel vs. the other, that could have 
an effect on net performance as well. Of course, you would have had to collect 
data on these factors in order to test them, say in a standardization model. I 
would start by looking at what you have data on and using those factors to 
attempt a standardization of the net affect (say using a glm).


From: qfish-bounce@xxxxxxxxxxxxx [mailto:qfish-bounce@xxxxxxxxxxxxx] On Behalf ;
Of Lee, Laura
Sent: Monday, January 23, 2017 11:48 AM
To: qfish@xxxxxxxxxxxxx
Subject: [qfish] correcting for bias in gear characterization study

Hi all!

This is not a stock assessment question, but I felt the audience of this 
listserv would have the answer.

Some background...the study is a gear characterization project looking at 
paired hauls from a trawling vessel to compare catches in the experimental net 
to those of the control net. We are looking at three different experimental 
gears. Ideally, the control and experimental nets are swapped between the port 
and starboard sides so that each gear (control or experimental) tows on each 
side the same number of times as the other gear. This was not always the case. 
For example, in testing of one of the gears, the control gear was on the port 
side 20 times and on the starboard side 4 times. If there is a side bias, this 
unequal towing could magnify differences in results.

Another analyst I'm working with "solved" this problem by randomly identifying 
and eliminating 16 of the tows in which the control gear was on the port side 
so the analysis was restricted to tows for which each gear was on each side 4 
times (for the example above). This does not seem correct to me.

I've run randomization tests to test for side bias (and day/night bias) in the 
catches of select species. There is a side bias (and sometimes a time of day 
bias) in some cases. What is the best way to adjust for this bias so I can 
determine whether the difference between the control and experimental gear 
catches is due to the gear modification alone.

I hope this makes sense. Thanks so much for your time!



Laura M. Lee
Senior Stock Assessment Scientist
Division of Marine Fisheries
Department of Environmental Quality

252 808 8094    office
252 726 6062    fax

3441 Arendell Street
P.O. Box 769
Morehead City, NC 28557-0769


Email correspondence to and from this address is subject to the
North Carolina Public Records Law and may be disclosed to third parties.

PNG image

Other related posts: