[PWC-MEDIA] FOM-persbericht: DNA draait zich vast

  • From: info@xxxxxx
  • To: undisclosed-recipients:;
  • Date: Mon, 18 Oct 2010 10:18:38 +0200

DNA draait zich vast

Onderzoekers van de TU Delft en de Stichting FOM hebben een nieuw 
instrument, de magnetische koppelpincet, ontwikkeld om de draaistijfheid 
in individuele DNA- moleculen te meten. Hiermee kunnen zij zowel zuiver 
DNA als DNA bedekt met het reparatie-eiwitten bestuderen. Een beter begrip 
van dit soort materiaaleigenschappen van biologische moleculen is 
belangrijk voor de constructie van op DNA gebaseerde nanostructuren en 
voor inzicht in de werking van moleculaire motoren. De resultaten van het 
onderzoek, uitgevoerd met een Veni-subsidie van Jan Lipfert, is op 17 
oktober online gepubliceerd door Nature Methods. 

De onderzoekers ontwikkelden een magnetische koppelpincet ('magnetic 
torque tweezers') om de draaiweerstand (torsiekracht) beter te kunnen 
meten. Met de pincet bevestigen zij een stuk DNA tussen een glasplaatje en 
een klein (~ 1 micrometer) magnetisch bolletje. De meting van de 
draaiweerstand berust op een nieuw algoritme waarmee zowel de positie als 
de rotatie van het bolletje via videomicroscopie in kaart wordt gebracht. 
Daarnaast kan met een nieuwe magneetopstelling een kracht en een 
draaiweerstand aan het DNA worden opgelegd. 

Experimenten met het nieuwe instrument tonen onder meer aan dat de 
draaistijfheid van DNA afhankelijk is van de kracht waarmee aan DNA wordt 
getrokken, en dat de draaistijfheid toeneemt wanneer DNA-reparatie 
eiwitten op het DNA binden. Hiermee kan in de toekomst meer inzicht 
verkregen worden in de werking van moleculaire motoren op DNA. 

DNA kan een draaiweerstand opbouwen door de dubbele helixstructuur: DNA 
bestaat uit twee lange strengen die in elkaar grijpen en verbonden zijn 
door basenparen. De beide strengen draaien als een wenteltrap om elkaar 
heen. Bij het ontrafelen van de strengen speelt deze torsiekracht een 
belangrijke rol. Bij polymeren gebeurt het ontrafelen op een vergelijkbare 
manier als wanneer men een gevlochten touw ontrafeld. De vele 
dwarsverbindingen (basenparen) van DNA zorgen voor de draaistijfheid die 
kenmerkend is voor DNA. Dit heeft belangrijke consequenties in de 
biologie: wanneer moleculaire motoren het DNA ontrafelen, zoals bij het 
kopiëren of repareren van DNA gebeurt, ontstaat de torsiekracht.

Noot voor de redactie:

Bijschrift figuren:
(links) De magneetopstelling van de magnetische koppelpincet, met in blauw 
de glasplaat met DNA eraan vast en bovenaan de magneet die aan het DNA 
trekt. De rechterinzet toont een elektronenmicroscopie beeld van het 
magnetische bolletje. Aan het magnetische bolletje is een kleiner, 
niet-magnetisch bolletje bevestigd waardoor hoekmetingen mogelijk zijn. 

(rechts) Metingen van de draaistijfheid van DNA als functie van de 
opgelegde kracht. Rode punten zijn gemeten met de magnetische 
koppelpincet, blauwe en bruine punten zijn vergelijkende metingen bij lage 
en hoge krachten, gemeten met andere technieken.

Voor meer informatie kunt u contact opnemen met:
·       Dr. Jan Lipfert (Afdeling Bionanoscience, Kavli Institute of 
NanoScience, Technische Universiteit Delft); (015) 278 35 52, 
j.lipfert@xxxxxxxxxx
·       Prof. dr. Nynke Dekker (Afdeling Bionanoscience, Kavli Institute 
of NanoScience, Technishe Universiteit Delft); (015) 278 32 19, 
n.h.dekker@xxxxxxxxxx

Referentie:
Jan Lipfert, Jacob W.J. Kerssemakers, Tessa Jager, and Nynke Dekker
“Magnetic Torque Tweezers: Measuring Torsional Stiffness in DNA and 
RecA-DNA Filaments” Nature Methods (2010) 
http://dx.doi.org/10.1038/nmeth.1520

Public Information Office 
Stichting voor Fundamenteel Onderzoek der Materie (FOM)
Foundation for Fundamental Research on Matter
e-mail: info@xxxxxx
tel: ++31-30-6001 211
fax: ++31-30-6014 406
http://www.fom.nl

Post adres/ Postal address
Postbus 3021
3502 GA Utrecht
The Netherlands

Als u geen prijs stelt op de persberichten van de Stichting FOM en u wilt 
uit het adressenbestand verwijderd worden, stuur dan een mail met uw 
gegevens naar info@xxxxxxx 

If you no longer wish to receive the press releases from FOM and you would 
like to be removed from the address list then please send an e-mail with 
your details to info@xxxxxxx

Other related posts:

  • » [PWC-MEDIA] FOM-persbericht: DNA draait zich vast - info