[mira_talk] Re: Nanopore support

  • From: Bastien Chevreux <bach@xxxxxxxxxxxx>
  • To: mira_talk@xxxxxxxxxxxxx
  • Date: Mon, 7 Mar 2016 10:51:10 -0500 (EST)

I currently do not plan to support nanopore with MIRA 4 or 5. The fragmentation
when feeding ~10% erroneous data does not really surprise me.
 
B.
 

On March 7, 2016 at 9:33 AM Adrian Pelin <apelin20@xxxxxxxxx> wrote:

 Hello,

 I was wondering if there would be support eventually for nanocorrected data
of nanopore reads. These can now achieve error rates below 10%.

 I am trying to feed these as pacbiohq, however am getting very fragmented
assemblies.

 Adrian


 

Other related posts: