[gpumd] questions on diffusion constant

  • From: 孙琳 <sunlin18@xxxxxxxxxx>
  • To: gpumd@xxxxxxxxxxxxx
  • Date: Sun, 5 Jul 2020 17:16:50 +0800 (GMT+08:00)

Dear all,




Recently, I've done some EMD simulations for twisted bilayer graphene (tBLG) 
with GPUMD-2.4-correction. When calculating the PDOS with velocity 
autocorrelation function VAC, I learned that the diffusion constant could also 
be induced by the integral of the running VAC. 




I have just learned MD for two months, so I'm not very clear with the physical 
meaning of the diffusion constant. Is this diffusion constant identical to the 
thermal diffusion coefficient? Intuitively, the calculated diffusion constant 
is related to the atom's motion rather than phonon's motion. However, not only 
the unit but also the value of the calculated diffusion constant is almost the 
same as those of tBLG's thermal diffusion coefficient. Thus, can I regard the 
calculated diffusion constant as the thermal diffusion coefficient?




Thank you very much, and I'm looking forward for your kindly response.

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