[gpumd] Re: how can I deal with the number of independent simulations by changing the command in run.in file?

  • From: Bruce Fan <brucenju@xxxxxxxxx>
  • To: gpumd@xxxxxxxxxxxxx
  • Date: Thu, 26 Sep 2019 19:56:05 +0300

And I saw that
hac.out have 15000 columns, resulting in three independent simulation
values.

If the path to this simulation has been written 3 times in the "driver
input file":

3
path/to/this/simulation
path/to/this/simulation
path/to/this/simulation

this is what expected. For each simulation, you have 50000/10=5000 rows and
three simulations amount to 15000 rows (nor columns as you wrote).

how could I have just 3 independent values instead of 10 independent
values that I expected to get.
How can I understand what was happened in here?

I don't quite understand your question here. What do "3 independent values"
and "10 independent values" mean here?

Zheyong

On Thu, Sep 26, 2019 at 7:07 PM "소순성" <soonsung2001@xxxxxxxxxx> wrote:

Thank you to Zheyong Fan for using this good GPUMD program.

Today, I have question again.
When I use GPUMD for EMD calculation of pristine graphene,  I set the
run.in file like below:


##################################################################################

potential_definition type
potential
/home/soonsung/GPUMD-master/potentials/tersoff/Graphene_Lindsay_2010_modified.txt
0
velocity    300


ensemble    nvt_nhc 300 300 100
time_step   0.5
dump_thermo 100
dump_restart 200000
run          2000000

ensemble    nve
time_step   0.5
compute_hac 20 50000 10
run         100000000


###################################################################################

And I saw that
hac.out have 15000 columns, resulting in three independent simulation
values.


how could I have just 3 independent values instead of 10 independent
values that I expected to get.
How can I understand what was happened in here?




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