[gpumd] Re: [gpumd]

  • From: Bruce Fan <brucenju@xxxxxxxxx>
  • To: gpumd@xxxxxxxxxxxxx, Alex Gabourie <gabourie@xxxxxxxxxxxx>
  • Date: Wed, 16 Oct 2019 16:58:00 +0300

Hi Mostafa,

So the simulation was done using a developing version, right?

First, I add the contents of your LJ potential file here (you sent me this
in a private email):

lj 1
2.84e-3 3.405 10.0

Will this contradict the line
potential    potentials/lj/c_clj.txt 0 1
in the run.in file?

@Alex Gabourie <gabourie@xxxxxxxxxxxx> How do you think?

Apart from this, I notice a possible source of error in the first line of
xyz.in:
 17466 50 11 0 0 1

Here, the parameter M (maximum number of neighbors) is set to 50. This
seems to be too small for a cutoff of 10 Angstrom (from the LJ part). You
can change it to 500. This might be the reason for the error message you
got.

Best,
Zheyong

On Wed, Oct 16, 2019 at 4:42 PM Mostafa Valadkhani <mostafa.v68@xxxxxxxxx>
wrote:

Hi
Sorry if I ask a lot and time to time. Actually I'm calculating SHC with
lammps using Kimmo Codes and wanna relate it somehow with the results from
GPUMD.
I wanna calculate SHC on the bilayer/monolayer graphene as your paper with
Ali.The attachments are my inputs, when I run the script following error
comes up:

CUDA Error:
    File:       neighbor_ON1.cu
    Line:       245
    Error code: 700
    Error text: an illegal memory access was encountered

can you give me some hints as always?
And I'm looking forward for your implementation of GKMA on GPUMD too.
Thanks,
M.V.


  • References:

Other related posts: