[gpumd] About group method in GPUMD

  • From: ymyang_2018 <ymyang_2018@xxxxxxx>
  • To: gpumd@xxxxxxxxxxxxx
  • Date: Tue, 5 May 2020 23:52:46 +0800 (CST)

Dear developers
       Thanks for doing GPUMD. I don't understand the group methods in xyz.in. 
The manual mentioned that in 'xyz.in' ,the data for GPUMD, there is 
number_of_grouping_methods for grouping different atoms. If I want to heat up a 
region in system specially dynamic region like LJ fluid. How to write the 
number_of_grouping_methods in xyz.in. How do I choice different methods, I 
guess there should be a selection for checking different atom moving to this 
region and further reset group number. Also I notice an example 'ensemble 
heat_nhc 300 100 10 1 6', the last two parameters 1 6, like reduced units in 
LAMMPs, which is 1 of number_of_grouping_methods. The half system has been 
sliced into 6 parts, first one part is being heated up. If the atom in first 
part moves to others, which group method will allow the 
number_of_grouping_methods be changed as atom moving? If I am wrong please help 
me, thanks again!
Mingyang Yang
YMYang_2018@xxxxxxx

Other related posts: