[codeface] Re: Fwd: Re: Can't execute analysis_example

• From: Stefan Kuppelwieser <stefan.kuppelwieser@xxxxxxxxx>
• To: codeface@xxxxxxxxxxxxx
• Date: Sat, 25 Mar 2017 14:08:51 +0100

Hello,

Am 24.03.2017 um 19:04 schrieb Wolfgang Mauerer:

Am 24/03/2017 um 18:32 schrieb Stefan Kuppelwieser:

Hello,


Am 23.03.2017 um 00:48 schrieb Wolfgang Mauerer:

Am 21/03/2017 um 23:50 schrieb Stefan Kuppelwieser:

After, I ran the analysis I want to start the webserver -> with ..

cd vagrant; ./shiny-server.sh

.. , but I get the message "No such file or directory"

I also tried to execute the lines from the ./shiny-server.sh script
manuelly [3]
The first two commands works fine, but the third commands did not
execute.
I get the error "No such file or directory"

that is caused by the fact that shiny server is not installed on the
machine. Can you please execute (in /vagrant)

bash shiny-server-pack.sh

After i run 'bash shiny-server-pack.sh' it solves the problem on my new
Linux environment.
With the operating system MS Windows it doesn't work again [1].

that's because you did not run

bash shiny-server-pack.sh

After I deleted codeface from my local computer, beacause it almost worked over the Linux environment, I wanted to reproduce the Windows environment.
Unfortunately, I can not restore the environment as we did at that in your office.


I have following programms installed on my Windows-PC:

 * Vagrant 1.9.1
 * Git Version 2.12.1.windows.1
 * VirtualBox 5.1.6 r110634(Qt5.5.1)

My Workflow is:

1. Codeface clone with git
     * https://github.com/clhunsen/codeface.git
2. Change to the directory codeface
3. Execute commands
     * vagrant up
     * I have attached the log-file[1]
4. I have execute a workaround.
     * I have attached my workaround [2]

Unfortunately I get an error when I run the workaround.
I was able to successfully reproduce the workaround on my desktop PC after our meeting.
Now I can not reproduce it successfully.
Mabe is not be able to find dependencies during the vagrant installation.
But I can unfortunately not confirm the guess [3].

Next I looked more closely at the errors after the test_codeface.sh.
I have checked if the files are all available. All files are present.
The priveleges should also be correct [4].

I have try it on three Windows computers (desktop computer, tablet, company notebook).
Unfortunately, I get the same error on all three systems.
In reasons, that I wanted to exclude if the problem ist on my windows computer.

So I could not execute the command, beacuse Codeface is unfortunately not running again.

bash shiny-server-pack.sh

After Codeface is back on a Windows environment, I can gladly validate the command and check if the webservice is available.


[1] codeface-claus-hunsen-update.log
[2] WORKAROUND.txt
[3] test_codface.sh.log; install_npm.log; npm_install--no-bin-links.log
[4] privileges.log


Best reagrds,
Stefan Kuppelwieser

buy just

shiny-server-pack.sh

(which should normally not be possible anyway, but works in the Windows
case because oddly all files are marked executable there). In the
interest of other users trying to run Codeface on windows, can you
please try this again and see if things work then?

Thanks & best regards, Wolfgang Mauerer

(I'm not following the problem anymore, because it works with a Linux
environment.
Finally, I can say that codeface must be installed in a Linux
environment, because it does not (probably) work with the Windows file
system )

[1]: Attachment -> shiny-server-pack-error.log

Best regards,
Stefan Kuppelwieser

This should populate node-v0.10.13-linux-x64/. I just noticed that
this is a documentation fault; the step is missing in the manual.
Does that solve your issues?

Best regards, Wolfgang Mauerer

vagrant@vagrant-ubuntu-trusty-64:/vagrant/codeface/test/integration$ ll
total 121
drwxrwxrwx 1 vagrant vagrant  4096 Mar 25 12:28 ./
drwxrwxrwx 1 vagrant vagrant     0 Mar 25 12:28 ../
-rwxrwxrwx 1 vagrant vagrant 26159 Mar 25 12:04 example_projects.py*
-rwxrwxrwx 1 vagrant vagrant 17593 Mar 25 12:28 example_projects.pyc*
-rwxrwxrwx 1 vagrant vagrant 10202 Mar 25 12:04 gitproject.py*
-rwxrwxrwx 1 vagrant vagrant 10574 Mar 25 12:28 gitproject.pyc*
-rwxrwxrwx 1 vagrant vagrant   782 Mar 25 12:04 __init__.py*
-rwxrwxrwx 1 vagrant vagrant   133 Mar 25 12:28 __init__.pyc*
-rwxrwxrwx 1 vagrant vagrant 12368 Mar 25 12:04 test_exampleprojects.py*
-rwxrwxrwx 1 vagrant vagrant 10464 Mar 25 12:28 test_exampleprojects.pyc*
-rwxrwxrwx 1 vagrant vagrant 15589 Mar 25 12:04 test_features.py*
-rwxrwxrwx 1 vagrant vagrant  6081 Mar 25 12:28 test_features.pyc*
-rwxrwxrwx 1 vagrant vagrant  3911 Mar 25 12:04 test_logger.py*
-rwxrwxrwx 1 vagrant vagrant  2884 Mar 25 12:28 test_logger.pyc*

vagrant@vagrant-ubuntu-trusty-64:/vagrant/id_service$ 
/vagrant/integration-scripts/test_codeface.sh
/vagrant/integration-scripts/test_codeface.sh: line 5: cd: id_service: No such 
file or directory

===== running unittests =====

DEBUG:codeface.util:Starting job id 1
DEBUG:codeface.util:Starting job id 2
DEBUG:codeface.util:Starting job id 3
DEBUG:codeface.util:Starting job id 4
DEBUG:codeface.util:Starting job id 9
DEBUG:codeface.util:Starting job id 5
DEBUG:codeface.util:Starting job id 6
DEBUG:codeface.util:Starting job id 7
DEBUG:codeface.util:Starting job id 8
DEBUG:codeface.util:Starting job id 10
2017-03-25 12:31:48 [codeface.test.unit.batchjob] Process-8 INFO: 6
INFO:codeface.test.unit.batchjob:6
DEBUG:codeface.util:Finished work id 7
2017-03-25 12:31:48 [codeface.test.unit.batchjob] Process-7 INFO: 7
INFO:codeface.test.unit.batchjob:7
DEBUG:codeface.util:Finished work id 8
2017-03-25 12:31:48 [codeface.test.unit.batchjob] Process-1 INFO: 0
INFO:codeface.test.unit.batchjob:0
DEBUG:codeface.util:Finished work id 1
DEBUG:codeface.util:Job 1 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 8 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 7 has finished!
2017-03-25 12:31:48 [codeface.test.unit.batchjob] Process-4 INFO: 1
INFO:codeface.test.unit.batchjob:1
DEBUG:codeface.util:Finished work id 2
2017-03-25 12:31:48 [codeface.test.unit.batchjob] Process-5 INFO: 5
INFO:codeface.test.unit.batchjob:5
DEBUG:codeface.util:Finished work id 6
2017-03-25 12:31:48 [codeface.test.unit.batchjob] Process-6 INFO: 2
INFO:codeface.test.unit.batchjob:2
DEBUG:codeface.util:Finished work id 3
DEBUG:codeface.util:Job 2 has finished!
2017-03-25 12:31:48 [codeface.test.unit.batchjob] Process-10 INFO: 8
INFO:codeface.test.unit.batchjob:8
DEBUG:codeface.util:Finished work id 9
2017-03-25 12:31:48 [codeface.test.unit.batchjob] Process-3 INFO: 3
INFO:codeface.test.unit.batchjob:3
DEBUG:codeface.util:Finished work id 4
2017-03-25 12:31:48 [codeface.test.unit.batchjob] Process-12 INFO: 9
INFO:codeface.test.unit.batchjob:9
DEBUG:codeface.util:Finished work id 10
DEBUG:codeface.util:Job 4 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 6 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 3 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 9 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 10 has finished!
2017-03-25 12:31:48 [codeface.test.unit.batchjob] Process-2 INFO: 4
INFO:codeface.test.unit.batchjob:4
DEBUG:codeface.util:Finished work id 5
DEBUG:codeface.util:Job 5 has finished!
DEVINFO:codeface.util:Terminating workers...
DEVINFO:codeface.util:Workers terminated.
.DEBUG:codeface.util:Starting job id 1
2017-03-25 12:31:49 [codeface.test.unit.batchjob] Process-25 INFO: 0
INFO:codeface.test.unit.batchjob:0
DEBUG:codeface.util:Finished work id 1
DEBUG:codeface.util:Job 1 has finished!
DEBUG:codeface.util:Starting job id 2
2017-03-25 12:31:49 [codeface.test.unit.batchjob] Process-27 INFO: 1
INFO:codeface.test.unit.batchjob:1
DEBUG:codeface.util:Finished work id 2
DEBUG:codeface.util:Job 2 has finished!
DEBUG:codeface.util:Starting job id 3
2017-03-25 12:31:49 [codeface.test.unit.batchjob] Process-26 INFO: 2
INFO:codeface.test.unit.batchjob:2
DEBUG:codeface.util:Finished work id 3
DEBUG:codeface.util:Job 3 has finished!
DEBUG:codeface.util:Starting job id 4
2017-03-25 12:31:49 [codeface.test.unit.batchjob] Process-28 INFO: 3
INFO:codeface.test.unit.batchjob:3
DEBUG:codeface.util:Finished work id 4
DEBUG:codeface.util:Job 4 has finished!
DEBUG:codeface.util:Starting job id 5
2017-03-25 12:31:49 [codeface.test.unit.batchjob] Process-29 INFO: 4
INFO:codeface.test.unit.batchjob:4
DEBUG:codeface.util:Finished work id 5
DEBUG:codeface.util:Job 5 has finished!
DEBUG:codeface.util:Starting job id 6
2017-03-25 12:31:49 [codeface.test.unit.batchjob] Process-30 INFO: 5
INFO:codeface.test.unit.batchjob:5
DEBUG:codeface.util:Finished work id 6
DEBUG:codeface.util:Job 6 has finished!
DEBUG:codeface.util:Starting job id 7
2017-03-25 12:31:49 [codeface.test.unit.batchjob] Process-31 INFO: 6
INFO:codeface.test.unit.batchjob:6
DEBUG:codeface.util:Finished work id 7
DEBUG:codeface.util:Job 7 has finished!
DEBUG:codeface.util:Starting job id 8
2017-03-25 12:31:49 [codeface.test.unit.batchjob] Process-32 INFO: 7
INFO:codeface.test.unit.batchjob:7
DEBUG:codeface.util:Finished work id 8
DEBUG:codeface.util:Job 8 has finished!
DEBUG:codeface.util:Starting job id 9
2017-03-25 12:31:49 [codeface.test.unit.batchjob] Process-34 INFO: 8
INFO:codeface.test.unit.batchjob:8
DEBUG:codeface.util:Finished work id 9
DEBUG:codeface.util:Job 9 has finished!
DEBUG:codeface.util:Starting job id 10
2017-03-25 12:31:49 [codeface.test.unit.batchjob] Process-35 INFO: 9
INFO:codeface.test.unit.batchjob:9
DEBUG:codeface.util:Finished work id 10
Starting REST Service with logging level "info"
info: Connecting to MySQL at codeface@localhost database codeface
DEBUG:codeface.util:Job 10 has finished!
DEVINFO:codeface.util:Terminating workers...
DEVINFO:codeface.util:Workers terminated.
.DEBUG:codeface.util:Starting job id 1
DEBUG:codeface.util:Finished work id 1
DEBUG:codeface.util:Starting job id 2
DEBUG:codeface.util:Finished work id 2
DEBUG:codeface.util:Starting job id 3
DEBUG:codeface.util:Finished work id 3
DEBUG:codeface.util:Starting job id 4
DEBUG:codeface.util:Starting job id 5
DEBUG:codeface.util:Finished work id 5
DEBUG:codeface.util:Starting job id 6
DEBUG:codeface.util:Finished work id 6
DEBUG:codeface.util:Job 1 has finished!
DEBUG:codeface.util:Starting job id 7
DEBUG:codeface.util:Starting job id 8
DEBUG:codeface.util:Starting job id 9
DEBUG:codeface.util:Starting job id 10
DEBUG:codeface.util:Starting job id 11
DEBUG:codeface.util:Finished work id 9
DEBUG:codeface.util:Starting job id 12
DEBUG:codeface.util:Starting job id 13
DEBUG:codeface.util:Starting job id 14
DEBUG:codeface.util:Starting job id 15
DEBUG:codeface.util:Job 2 has finished!
DEBUG:codeface.util:Finished work id 15
DEBUG:codeface.util:Starting job id 16
DEBUG:codeface.util:Starting job id 17
DEBUG:codeface.util:Starting job id 18
DEBUG:codeface.util:Starting job id 19
DEBUG:codeface.util:Starting job id 20
DEBUG:codeface.util:Starting job id 22
DEBUG:codeface.util:Starting job id 23
DEBUG:codeface.util:Starting job id 25
DEBUG:codeface.util:Finished work id 25
DEBUG:codeface.util:Starting job id 24
DEBUG:codeface.util:Starting job id 26
DEBUG:codeface.util:Finished work id 26
DEBUG:codeface.util:Starting job id 21
DEBUG:codeface.util:Finished work id 10
DEBUG:codeface.util:Finished work id 18
DEBUG:codeface.util:Finished work id 11
DEBUG:codeface.util:Finished work id 7
DEBUG:codeface.util:Finished work id 8
DEBUG:codeface.util:Finished work id 12
DEBUG:codeface.util:Finished work id 14
DEBUG:codeface.util:Finished work id 13
DEBUG:codeface.util:Finished work id 19
DEBUG:codeface.util:Finished work id 22
DEBUG:codeface.util:Finished work id 21
DEBUG:codeface.util:Finished work id 16
DEBUG:codeface.util:Finished work id 24
DEBUG:codeface.util:Finished work id 23
DEBUG:codeface.util:Finished work id 20
DEBUG:codeface.util:Finished work id 17
DEBUG:codeface.util:Finished work id 4
DEBUG:codeface.util:Starting job id 28
DEBUG:codeface.util:Finished work id 28
DEBUG:codeface.util:Starting job id 29
DEBUG:codeface.util:Starting job id 30
DEBUG:codeface.util:Finished work id 30
DEBUG:codeface.util:Starting job id 31
DEBUG:codeface.util:Starting job id 37
DEBUG:codeface.util:Finished work id 37
DEBUG:codeface.util:Starting job id 40
DEBUG:codeface.util:Starting job id 32
DEBUG:codeface.util:Starting job id 33
DEBUG:codeface.util:Starting job id 34
DEBUG:codeface.util:Finished work id 40
DEBUG:codeface.util:Finished work id 34
DEBUG:codeface.util:Starting job id 27
DEBUG:codeface.util:Starting job id 42
DEBUG:codeface.util:Finished work id 42
DEBUG:codeface.util:Starting job id 44
DEBUG:codeface.util:Finished work id 44
DEBUG:codeface.util:Starting job id 35
DEBUG:codeface.util:Starting job id 36
DEBUG:codeface.util:Finished work id 36
DEBUG:codeface.util:Finished work id 31
DEBUG:codeface.util:Starting job id 45
DEBUG:codeface.util:Starting job id 46
DEBUG:codeface.util:Starting job id 38
DEBUG:codeface.util:Starting job id 39
DEBUG:codeface.util:Starting job id 47
DEBUG:codeface.util:Finished work id 47
DEBUG:codeface.util:Starting job id 48
DEBUG:codeface.util:Starting job id 41
DEBUG:codeface.util:Finished work id 41
DEBUG:codeface.util:Finished work id 33
DEBUG:codeface.util:Starting job id 50
DEBUG:codeface.util:Starting job id 43
DEBUG:codeface.util:Finished work id 43
DEBUG:codeface.util:Starting job id 52
DEBUG:codeface.util:Finished work id 52
DEBUG:codeface.util:Starting job id 53
DEBUG:codeface.util:Finished work id 53
DEBUG:codeface.util:Finished work id 32
DEBUG:codeface.util:Finished work id 27
DEBUG:codeface.util:Finished work id 29
DEBUG:codeface.util:Starting job id 54
DEBUG:codeface.util:Starting job id 55
DEBUG:codeface.util:Finished work id 35
DEBUG:codeface.util:Finished work id 45
DEBUG:codeface.util:Starting job id 58
DEBUG:codeface.util:Finished work id 58
DEBUG:codeface.util:Starting job id 59
DEBUG:codeface.util:Job 9 has finished!
DEBUG:codeface.util:Finished work id 59
DEBUG:codeface.util:Starting job id 60
DEBUG:codeface.util:Finished work id 60
DEBUG:codeface.util:Finished work id 39
DEBUG:codeface.util:Finished work id 38
DEBUG:codeface.util:Finished work id 46
DEBUG:codeface.util:Starting job id 62
DEBUG:codeface.util:Starting job id 49
DEBUG:codeface.util:Finished work id 49
DEBUG:codeface.util:Starting job id 65
DEBUG:codeface.util:Finished work id 65
DEBUG:codeface.util:Starting job id 64
DEBUG:codeface.util:Finished work id 48
DEBUG:codeface.util:Starting job id 51
DEBUG:codeface.util:Starting job id 68
DEBUG:codeface.util:Finished work id 50
DEBUG:codeface.util:Finished work id 54
DEBUG:codeface.util:Starting job id 70
DEBUG:codeface.util:Starting job id 56
DEBUG:codeface.util:Finished work id 70
DEBUG:codeface.util:Starting job id 57
DEBUG:codeface.util:Finished work id 56
DEBUG:codeface.util:Finished work id 57
DEBUG:codeface.util:Starting job id 72
DEBUG:codeface.util:Starting job id 73
DEBUG:codeface.util:Finished work id 72
DEBUG:codeface.util:Starting job id 74
DEBUG:codeface.util:Finished work id 74
DEBUG:codeface.util:Starting job id 67
DEBUG:codeface.util:Job 3 has finished!
DEBUG:codeface.util:Starting job id 61
DEBUG:codeface.util:Finished work id 64
DEBUG:codeface.util:Starting job id 63
DEBUG:codeface.util:Starting job id 66
DEBUG:codeface.util:Finished work id 62
DEBUG:codeface.util:Finished work id 51
DEBUG:codeface.util:Starting job id 77
DEBUG:codeface.util:Starting job id 69
DEBUG:codeface.util:Starting job id 71
DEBUG:codeface.util:Finished work id 69
DEBUG:codeface.util:Finished work id 66
DEBUG:codeface.util:Starting job id 79
DEBUG:codeface.util:Starting job id 78
DEBUG:codeface.util:Job 25 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 26 has finished!
DEBUG:codeface.util:Finished work id 73
DEBUG:codeface.util:Job 4 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 5 has finished!
DEBUG:codeface.util:Starting job id 75
DEBUG:codeface.util:Finished work id 68
DEBUG:codeface.util:Finished work id 75
DEBUG:codeface.util:Starting job id 76
DEBUG:codeface.util:Finished work id 61
DEBUG:codeface.util:Starting job id 84
DEBUG:codeface.util:Finished work id 84
DEBUG:codeface.util:Starting job id 85
DEBUG:codeface.util:Finished work id 63
DEBUG:codeface.util:Finished work id 71
DEBUG:codeface.util:Starting job id 87
DEBUG:codeface.util:Finished work id 87
DEBUG:codeface.util:Starting job id 89
DEBUG:codeface.util:Finished work id 89
DEBUG:codeface.util:Starting job id 90
DEBUG:codeface.util:Finished work id 90
DEBUG:codeface.util:Starting job id 91
DEBUG:codeface.util:Finished work id 76
DEBUG:codeface.util:Starting job id 92
DEBUG:codeface.util:Finished work id 92
DEBUG:codeface.util:Finished work id 77
DEBUG:codeface.util:Finished work id 85
DEBUG:codeface.util:Starting job id 93
DEBUG:codeface.util:Finished work id 93
DEBUG:codeface.util:Starting job id 95
DEBUG:codeface.util:Finished work id 95
DEBUG:codeface.util:Finished work id 79
DEBUG:codeface.util:Starting job id 80
DEBUG:codeface.util:Starting job id 98
DEBUG:codeface.util:Finished work id 78
DEBUG:codeface.util:Finished work id 98
DEBUG:codeface.util:Starting job id 99
DEBUG:codeface.util:Finished work id 80
DEBUG:codeface.util:Finished work id 67
DEBUG:codeface.util:Starting job id 101
DEBUG:codeface.util:Finished work id 101
DEBUG:codeface.util:Starting job id 104
DEBUG:codeface.util:Starting job id 82
DEBUG:codeface.util:Starting job id 81
DEBUG:codeface.util:Finished work id 55
DEBUG:codeface.util:Starting job id 105
DEBUG:codeface.util:Finished work id 105
DEBUG:codeface.util:Starting job id 106
DEBUG:codeface.util:Starting job id 107
DEBUG:codeface.util:Finished work id 107
DEBUG:codeface.util:Starting job id 108
DEBUG:codeface.util:Finished work id 108
DEBUG:codeface.util:Finished work id 106
DEBUG:codeface.util:Starting job id 110
DEBUG:codeface.util:Job 6 has finished!
DEBUG:codeface.util:Starting job id 83
DEBUG:codeface.util:Starting job id 86
DEBUG:codeface.util:Starting job id 88
DEBUG:codeface.util:Finished work id 88
DEBUG:codeface.util:Starting job id 112
DEBUG:codeface.util:Finished work id 112
DEBUG:codeface.util:Starting job id 113
DEBUG:codeface.util:Finished work id 113
DEBUG:codeface.util:Starting job id 114
DEBUG:codeface.util:Finished work id 114
DEBUG:codeface.util:Starting job id 94
DEBUG:codeface.util:Finished work id 94
DEBUG:codeface.util:Starting job id 117
DEBUG:codeface.util:Starting job id 96
DEBUG:codeface.util:Finished work id 91
DEBUG:codeface.util:Finished work id 117
DEBUG:codeface.util:Starting job id 119
DEBUG:codeface.util:Finished work id 119
DEBUG:codeface.util:Finished work id 99
DEBUG:codeface.util:Starting job id 100
DEBUG:codeface.util:Starting job id 121
DEBUG:codeface.util:Finished work id 121
DEBUG:codeface.util:Starting job id 122
DEBUG:codeface.util:Finished work id 122
DEBUG:codeface.util:Starting job id 123
DEBUG:codeface.util:Finished work id 123
DEBUG:codeface.util:Starting job id 125
DEBUG:codeface.util:Finished work id 125
DEBUG:codeface.util:Starting job id 126
DEBUG:codeface.util:Finished work id 126
DEBUG:codeface.util:Starting job id 127
DEBUG:codeface.util:Finished work id 127
DEBUG:codeface.util:Starting job id 102
DEBUG:codeface.util:Starting job id 103
DEBUG:codeface.util:Finished work id 103
DEBUG:codeface.util:Finished work id 102
DEBUG:codeface.util:Starting job id 109
DEBUG:codeface.util:Starting job id 111
DEBUG:codeface.util:Finished work id 111
DEBUG:codeface.util:Finished work id 110
DEBUG:codeface.util:Finished work id 86
DEBUG:codeface.util:Finished work id 81
DEBUG:codeface.util:Starting job id 132
DEBUG:codeface.util:Starting job id 138
DEBUG:codeface.util:Finished work id 138
DEBUG:codeface.util:Starting job id 139
DEBUG:codeface.util:Finished work id 139
DEBUG:codeface.util:Starting job id 140
DEBUG:codeface.util:Finished work id 140
DEBUG:codeface.util:Starting job id 141
DEBUG:codeface.util:Finished work id 141
DEBUG:codeface.util:Starting job id 142
DEBUG:codeface.util:Finished work id 142
DEBUG:codeface.util:Starting job id 143
DEBUG:codeface.util:Finished work id 143
DEBUG:codeface.util:Starting job id 144
DEBUG:codeface.util:Finished work id 144
DEBUG:codeface.util:Starting job id 145
DEBUG:codeface.util:Finished work id 145
DEBUG:codeface.util:Starting job id 146
DEBUG:codeface.util:Finished work id 146
DEBUG:codeface.util:Finished work id 82
DEBUG:codeface.util:Finished work id 104
DEBUG:codeface.util:Starting job id 147
DEBUG:codeface.util:Starting job id 97
DEBUG:codeface.util:Finished work id 83
DEBUG:codeface.util:Starting job id 115
DEBUG:codeface.util:Starting job id 116
DEBUG:codeface.util:Starting job id 118
DEBUG:codeface.util:Finished work id 96
DEBUG:codeface.util:Starting job id 120
DEBUG:codeface.util:Finished work id 100
DEBUG:codeface.util:Starting job id 151
DEBUG:codeface.util:Starting job id 152
DEBUG:codeface.util:Starting job id 124
DEBUG:codeface.util:Finished work id 124
DEBUG:codeface.util:Job 7 has finished!
DEBUG:codeface.util:Starting job id 128
DEBUG:codeface.util:Starting job id 129
DEBUG:codeface.util:Finished work id 129
DEBUG:codeface.util:Starting job id 154
DEBUG:codeface.util:Finished work id 154
DEBUG:codeface.util:Starting job id 156
DEBUG:codeface.util:Finished work id 156
DEBUG:codeface.util:Starting job id 157
DEBUG:codeface.util:Finished work id 157
DEBUG:codeface.util:Starting job id 158
DEBUG:codeface.util:Finished work id 158
DEBUG:codeface.util:Starting job id 159
DEBUG:codeface.util:Finished work id 159
DEBUG:codeface.util:Starting job id 160
DEBUG:codeface.util:Starting job id 130
DEBUG:codeface.util:Starting job id 131
DEBUG:codeface.util:Finished work id 109
DEBUG:codeface.util:Starting job id 161
DEBUG:codeface.util:Starting job id 133
DEBUG:codeface.util:Starting job id 134
DEBUG:codeface.util:Finished work id 133
DEBUG:codeface.util:Finished work id 134
DEBUG:codeface.util:Starting job id 135
DEBUG:codeface.util:Starting job id 162
DEBUG:codeface.util:Finished work id 135
DEBUG:codeface.util:Finished work id 162
DEBUG:codeface.util:Starting job id 136
DEBUG:codeface.util:Starting job id 164
DEBUG:codeface.util:Finished work id 164
DEBUG:codeface.util:Starting job id 165
DEBUG:codeface.util:Starting job id 166
DEBUG:codeface.util:Finished work id 166
DEBUG:codeface.util:Starting job id 137
DEBUG:codeface.util:Finished work id 137
DEBUG:codeface.util:Starting job id 148
DEBUG:codeface.util:Starting job id 149
DEBUG:codeface.util:Finished work id 149
DEBUG:codeface.util:Finished work id 132
DEBUG:codeface.util:Starting job id 168
DEBUG:codeface.util:Finished work id 168
DEBUG:codeface.util:Starting job id 169
DEBUG:codeface.util:Finished work id 147
DEBUG:codeface.util:Finished work id 115
DEBUG:codeface.util:Finished work id 116
DEBUG:codeface.util:Finished work id 120
DEBUG:codeface.util:Finished work id 169
DEBUG:codeface.util:Starting job id 174
DEBUG:codeface.util:Starting job id 150
DEBUG:codeface.util:Finished work id 118
DEBUG:codeface.util:Finished work id 151
DEBUG:codeface.util:Starting job id 177
DEBUG:codeface.util:Starting job id 153
DEBUG:codeface.util:Finished work id 97
DEBUG:codeface.util:Finished work id 153
DEBUG:codeface.util:Finished work id 128
DEBUG:codeface.util:Starting job id 179
DEBUG:codeface.util:Starting job id 180
DEBUG:codeface.util:Job 8 has finished!
DEBUG:codeface.util:Finished work id 179
DEBUG:codeface.util:Job 10 has finished!
DEBUG:codeface.util:Starting job id 155
DEBUG:codeface.util:Finished work id 155
DEBUG:codeface.util:Finished work id 152
DEBUG:codeface.util:Finished work id 131
DEBUG:codeface.util:Starting job id 182
DEBUG:codeface.util:Finished work id 182
DEBUG:codeface.util:Starting job id 183
DEBUG:codeface.util:Finished work id 161
DEBUG:codeface.util:Starting job id 163
DEBUG:codeface.util:Finished work id 183
DEBUG:codeface.util:Finished work id 163
DEBUG:codeface.util:Starting job id 185
DEBUG:codeface.util:Starting job id 186
DEBUG:codeface.util:Finished work id 186
DEBUG:codeface.util:Starting job id 187
DEBUG:codeface.util:Finished work id 136
DEBUG:codeface.util:Starting job id 191
DEBUG:codeface.util:Finished work id 130
DEBUG:codeface.util:Finished work id 191
DEBUG:codeface.util:Starting job id 192
DEBUG:codeface.util:Finished work id 165
DEBUG:codeface.util:Finished work id 160
DEBUG:codeface.util:Finished work id 192
DEBUG:codeface.util:Starting job id 195
DEBUG:codeface.util:Starting job id 167
DEBUG:codeface.util:Finished work id 167
DEBUG:codeface.util:Starting job id 197
DEBUG:codeface.util:Finished work id 148
DEBUG:codeface.util:Starting job id 198
DEBUG:codeface.util:Starting job id 170
DEBUG:codeface.util:Starting job id 171
DEBUG:codeface.util:Starting job id 172
DEBUG:codeface.util:Finished work id 171
DEBUG:codeface.util:Finished work id 172
DEBUG:codeface.util:Starting job id 199
DEBUG:codeface.util:Starting job id 173
DEBUG:codeface.util:Starting job id 200
DEBUG:codeface.util:Finished work id 199
DEBUG:codeface.util:Starting job id 175
DEBUG:codeface.util:Starting job id 176
DEBUG:codeface.util:Starting job id 178
DEBUG:codeface.util:Finished work id 178
DEBUG:codeface.util:Finished work id 150
DEBUG:codeface.util:Starting job id 201
DEBUG:codeface.util:Finished work id 201
DEBUG:codeface.util:Starting job id 202
DEBUG:codeface.util:Starting job id 203
DEBUG:codeface.util:Finished work id 177
DEBUG:codeface.util:Finished work id 174
DEBUG:codeface.util:Finished work id 203
DEBUG:codeface.util:Starting job id 205
DEBUG:codeface.util:Finished work id 205
DEBUG:codeface.util:Starting job id 206
DEBUG:codeface.util:Finished work id 206
DEBUG:codeface.util:Starting job id 209
DEBUG:codeface.util:Finished work id 209
DEBUG:codeface.util:Starting job id 210
DEBUG:codeface.util:Starting job id 181
DEBUG:codeface.util:Job 11 has finished!
DEBUG:codeface.util:Finished work id 180
DEBUG:codeface.util:Starting job id 211
DEBUG:codeface.util:Starting job id 184
DEBUG:codeface.util:Finished work id 184
DEBUG:codeface.util:Starting job id 188
DEBUG:codeface.util:Starting job id 189
DEBUG:codeface.util:Finished work id 188
DEBUG:codeface.util:Finished work id 185
DEBUG:codeface.util:Finished work id 210
DEBUG:codeface.util:Starting job id 190
DEBUG:codeface.util:Finished work id 190
DEBUG:codeface.util:Finished work id 187
DEBUG:codeface.util:Starting job id 214
DEBUG:codeface.util:Finished work id 214
DEBUG:codeface.util:Starting job id 215
DEBUG:codeface.util:Finished work id 215
DEBUG:codeface.util:Starting job id 216
DEBUG:codeface.util:Finished work id 216
DEBUG:codeface.util:Starting job id 217
DEBUG:codeface.util:Finished work id 217
DEBUG:codeface.util:Starting job id 218
DEBUG:codeface.util:Starting job id 193
DEBUG:codeface.util:Finished work id 193
DEBUG:codeface.util:Starting job id 194
DEBUG:codeface.util:Starting job id 196
DEBUG:codeface.util:Finished work id 196
DEBUG:codeface.util:Starting job id 222
DEBUG:codeface.util:Finished work id 222
DEBUG:codeface.util:Finished work id 197
DEBUG:codeface.util:Starting job id 224
DEBUG:codeface.util:Finished work id 195
DEBUG:codeface.util:Starting job id 226
DEBUG:codeface.util:Finished work id 170
DEBUG:codeface.util:Finished work id 200
DEBUG:codeface.util:Starting job id 227
DEBUG:codeface.util:Finished work id 227
DEBUG:codeface.util:Starting job id 228
DEBUG:codeface.util:Finished work id 228
DEBUG:codeface.util:Starting job id 229
DEBUG:codeface.util:Starting job id 230
DEBUG:codeface.util:Finished work id 198
DEBUG:codeface.util:Finished work id 173
DEBUG:codeface.util:Finished work id 175
DEBUG:codeface.util:Finished work id 176
DEBUG:codeface.util:Starting job id 204
DEBUG:codeface.util:Starting job id 207
DEBUG:codeface.util:Finished work id 204
DEBUG:codeface.util:Starting job id 208
DEBUG:codeface.util:Finished work id 208
DEBUG:codeface.util:Starting job id 235
DEBUG:codeface.util:Finished work id 202
DEBUG:codeface.util:Job 12 has finished!
DEBUG:codeface.util:Starting job id 236
DEBUG:codeface.util:Job 13 has finished!
DEBUG:codeface.util:Starting job id 212
DEBUG:codeface.util:Finished work id 189
DEBUG:codeface.util:Finished work id 212
DEBUG:codeface.util:Finished work id 211
DEBUG:codeface.util:Starting job id 239
DEBUG:codeface.util:Starting job id 213
DEBUG:codeface.util:Finished work id 213
DEBUG:codeface.util:Finished work id 235
DEBUG:codeface.util:Starting job id 219
DEBUG:codeface.util:Starting job id 220
DEBUG:codeface.util:Finished work id 220
DEBUG:codeface.util:Starting job id 221
DEBUG:codeface.util:Finished work id 221
DEBUG:codeface.util:Finished work id 181
DEBUG:codeface.util:Finished work id 194
DEBUG:codeface.util:Starting job id 223
DEBUG:codeface.util:Finished work id 223
DEBUG:codeface.util:Starting job id 225
DEBUG:codeface.util:Finished work id 225
DEBUG:codeface.util:Finished work id 218
DEBUG:codeface.util:Finished work id 224
DEBUG:codeface.util:Finished work id 229
DEBUG:codeface.util:Finished work id 230
DEBUG:codeface.util:Finished work id 226
DEBUG:codeface.util:Finished work id 207
DEBUG:codeface.util:Starting job id 231
DEBUG:codeface.util:Starting job id 234
DEBUG:codeface.util:Finished work id 234
DEBUG:codeface.util:Starting job id 232
DEBUG:codeface.util:Starting job id 233
DEBUG:codeface.util:Starting job id 237
DEBUG:codeface.util:Finished work id 233
DEBUG:codeface.util:Finished work id 237
DEBUG:codeface.util:Finished work id 232
DEBUG:codeface.util:Finished work id 236
DEBUG:codeface.util:Job 14 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 15 has finished!
DEBUG:codeface.util:Starting job id 238
DEBUG:codeface.util:Finished work id 238
DEBUG:codeface.util:Finished work id 239
DEBUG:codeface.util:Starting job id 240
DEBUG:codeface.util:Finished work id 240
DEBUG:codeface.util:Finished work id 219
DEBUG:codeface.util:Finished work id 231
DEBUG:codeface.util:Job 16 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 17 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 18 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 19 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 20 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 21 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 22 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 23 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 24 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 28 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 27 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 30 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 31 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 35 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 34 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 33 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 61 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 105 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 36 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 138 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 103 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 45 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 151 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 135 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 37 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 54 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 111 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 117 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 32 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 129 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 43 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 29 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 126 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 39 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 55 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 38 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 46 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 58 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 42 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 50 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 84 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 107 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 49 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 139 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 131 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 59 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 178 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 163 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 40 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 71 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 133 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 119 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 56 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 154 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 52 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 115 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 128 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 62 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 106 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 64 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 63 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 67 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 44 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 70 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 86 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 108 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 65 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 140 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 182 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 60 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 201 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 189 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 41 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 88 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 162 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 121 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 72 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 156 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 53 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 176 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 180 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 77 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 110 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 81 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 87 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 101 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 47 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 74 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 136 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 109 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 69 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 141 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 183 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 66 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 203 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 237 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 51 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 112 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 164 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 123 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 75 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 157 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 57 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 233 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 211 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 93 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 134 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 137 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 89 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 104 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 48 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 76 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 191 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 161 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 79 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 142 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 188 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 80 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 205 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 78 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 113 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 166 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 125 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 85 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 158 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 73 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 239 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 96 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 165 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 168 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 90 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 147 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 68 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 92 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 192 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 186 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 98 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 143 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 213 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 102 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 207 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 100 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 114 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 167 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 127 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 95 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 159 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 82 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 150 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 195 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 170 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 91 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 173 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 83 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 94 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 196 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 187 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 99 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 144 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 132 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 152 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 116 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 197 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 130 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 97 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 160 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 148 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 202 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 226 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 230 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 118 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 234 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 153 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 120 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 222 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 218 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 122 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 145 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 169 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 185 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 174 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 224 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 193 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 179 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 194 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 198 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 238 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 177 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 190 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 172 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 225 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 124 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 146 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 175 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 214 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 204 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 223 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 181 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 231 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 206 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 220 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 200 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 155 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 149 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 232 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 215 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 235 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 209 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 227 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 184 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 171 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 216 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 210 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 228 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 212 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 199 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 217 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 221 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 229 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 240 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 208 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 219 has finished!
DEBUG:codeface.util:Job 236 has finished!
info: Starting to listen on localhost:8080
DEVINFO:codeface.util:Terminating workers...
DEVINFO:codeface.util:Workers terminated.
.DEBUG:codeface.util:Starting job id 1
DEBUG:codeface.util:Failed work id 1
2017-03-25 12:31:50 [codeface.util] MainProcess CRITICAL: Uncaught exception in 
worker thread:
CRITICAL:codeface.util:Uncaught exception in worker thread:
DEVINFO:codeface.util:Terminating workers...
DEVINFO:codeface.util:Workers terminated.
.DEBUG:codeface.util:Starting job id 1
DEBUG:codeface.util:Failed work id 1
2017-03-25 12:31:50 [codeface.util] MainProcess CRITICAL: Uncaught exception in 
worker thread:
CRITICAL:codeface.util:Uncaught exception in worker thread:
DEVINFO:codeface.util:Terminating workers...
DEVINFO:codeface.util:Workers terminated.
.DEBUG:codeface.util:Starting job id 1
HALLO
DEBUG:codeface.util:Failed work id 1
2017-03-25 12:31:50 [codeface.util] MainProcess CRITICAL: Uncaught exception in 
worker thread:
CRITICAL:codeface.util:Uncaught exception in worker thread:
DEVINFO:codeface.util:Terminating workers...
DEVINFO:codeface.util:Workers terminated.
....--- # global codeface configuration
idServiceHostname: '127.0.0.1'
idServicePort: 8080
# codeface project configuration
.DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/tmp/does_not_exist_42_42'
2017-03-25 12:31:50 [codeface.configuration] MainProcess ERROR: Could not open 
configuration file '/tmp/does_not_exist_42_42'
Traceback (most recent call last):
  File "/vagrant/codeface/configuration.py", line 85, in _load
    return yaml.load(open(filename))
IOError: [Errno 2] No such file or directory: '/tmp/does_not_exist_42_42'
ERROR:codeface.configuration:Could not open configuration file 
'/tmp/does_not_exist_42_42'
Traceback (most recent call last):
  File "/vagrant/codeface/configuration.py", line 85, in _load
    return yaml.load(open(filename))
IOError: [Errno 2] No such file or directory: '/tmp/does_not_exist_42_42'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/tmp/tmpe7j31N'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/tmpO_XzwU'
2017-03-25 12:31:50 [codeface.configuration] MainProcess ERROR: Could not parse 
configuration file '/tmp/tmpO_XzwU'
Traceback (most recent call last):
  File "/vagrant/codeface/configuration.py", line 85, in _load
    return yaml.load(open(filename))
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/__init__.py", line 71, in load
    return loader.get_single_data()
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/constructor.py", line 37, in 
get_single_data
    node = self.get_single_node()
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/composer.py", line 36, in 
get_single_node
    document = self.compose_document()
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/composer.py", line 55, in 
compose_document
    node = self.compose_node(None, None)
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/composer.py", line 84, in 
compose_node
    node = self.compose_mapping_node(anchor)
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/composer.py", line 127, in 
compose_mapping_node
    while not self.check_event(MappingEndEvent):
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/parser.py", line 98, in 
check_event
    self.current_event = self.state()
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/parser.py", line 428, in 
parse_block_mapping_key
    if self.check_token(KeyToken):
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/scanner.py", line 115, in 
check_token
    while self.need_more_tokens():
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/scanner.py", line 149, in 
need_more_tokens
    self.stale_possible_simple_keys()
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/scanner.py", line 289, in 
stale_possible_simple_keys
    "could not found expected ':'", self.get_mark())
ScannerError: while scanning a simple key
  in "/tmp/tmpO_XzwU", line 6, column 1
could not found expected ':'
  in "/tmp/tmpO_XzwU", line 7, column 1
ERROR:codeface.configuration:Could not parse configuration file '/tmp/tmpO_XzwU'
Traceback (most recent call last):
  File "/vagrant/codeface/configuration.py", line 85, in _load
    return yaml.load(open(filename))
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/__init__.py", line 71, in load
    return loader.get_single_data()
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/constructor.py", line 37, in 
get_single_data
    node = self.get_single_node()
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/composer.py", line 36, in 
get_single_node
    document = self.compose_document()
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/composer.py", line 55, in 
compose_document
    node = self.compose_node(None, None)
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/composer.py", line 84, in 
compose_node
    node = self.compose_mapping_node(anchor)
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/composer.py", line 127, in 
compose_mapping_node
    while not self.check_event(MappingEndEvent):
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/parser.py", line 98, in 
check_event
    self.current_event = self.state()
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/parser.py", line 428, in 
parse_block_mapping_key
    if self.check_token(KeyToken):
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/scanner.py", line 115, in 
check_token
    while self.need_more_tokens():
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/scanner.py", line 149, in 
need_more_tokens
    self.stale_possible_simple_keys()
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/scanner.py", line 289, in 
stale_possible_simple_keys
    "could not found expected ':'", self.get_mark())
ScannerError: while scanning a simple key
  in "/tmp/tmpO_XzwU", line 6, column 1
could not found expected ':'
  in "/tmp/tmpO_XzwU", line 7, column 1
DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/tmp/tmpe7j31N'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/tmpkyWR0J'
2017-03-25 12:31:50 [codeface.configuration] MainProcess CRITICAL: Malformed 
configuration: revision and rcs list lengths differ! Found 5 revisions and 4 
release candidates.
CRITICAL:codeface.configuration:Malformed configuration: revision and rcs list 
lengths differ! Found 5 revisions and 4 release candidates.
.DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/tmp/tmpUb_IBq'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/tmpYgg5bc'
2017-03-25 12:31:50 [codeface.configuration] MainProcess WARNING: Unknown key 
'new_tag' in configuration.
WARNING:codeface.configuration:Unknown key 'new_tag' in configuration.
DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/tmp/tmplXY1wP'
DEVINFO:codeface.configuration:Not loading project configuration file!
2017-03-25 12:31:50 [codeface.configuration] MainProcess WARNING: Unknown key 
'new_tag' in configuration.
WARNING:codeface.configuration:Unknown key 'new_tag' in configuration.
..DEBUG:codeface.util:Running command: /usr/bin/env cppstats --kind 
featurelocations --file /tmp/tmpG8bTc9.c /tmp/tmpSktGDL.csv
...............DEBUG:codeface.util:Running command: Rscript do_test.r
Loading required package: NLP
TESTS=====

projects list from database  id                        name
1 12 codeface_test_projectoovCWy
R data structure[[1]]
[[1]]$label
[1] "Codeface projects"

[[1]]$url
[1] "../dashboard/"

[[1]]$active
[1] FALSE

[[1]]$children
[[1]]$children[[1]]
[[1]]$children[[1]]$label
[1] "codeface_test_projectoovCWy"

[[1]]$children[[1]]$url
[1] "../dashboard/?projectid=12"




[[2]]
[[2]]$label
character(0)

[[2]]$url
[1] "../dashboard/?projectid=4"

[[2]]$active
[1] FALSE

[[2]]$children
[[2]]$children[[1]]
[[2]]$children[[1]]$label
<div style="font-family: symbola; display: inline; font-weight: 
500;">&#128129</div>
Basics

[[2]]$children[[1]]$url
[1] "../dashboard/?projectid=4&topic=basics&widget="


[[2]]$children[[2]]
[[2]]$children[[2]]$label
<div style="font-family: symbola; display: inline; font-weight: 
500;">&#128491</div>
Communication

[[2]]$children[[2]]$url
[1] "../dashboard/?projectid=4&topic=communication&widget="


[[2]]$children[[3]]
[[2]]$children[[3]]$label
<div style="font-family: symbola; display: inline; font-weight: 
500;">&#128296</div>
Construction

[[2]]$children[[3]]$url
[1] "../dashboard/?projectid=4&topic=construction&widget="


[[2]]$children[[4]]
[[2]]$children[[4]]$label
<div style="font-family: symbola; display: inline; font-weight: 
500;">&#127983</div>
Complexity

[[2]]$children[[4]]$url
[1] "../dashboard/?projectid=4&topic=complexity&widget="


[[2]]$children[[5]]
[[2]]$children[[5]]$label
<div style="font-family: symbola; display: inline; font-weight: 
500;">&#128101</div>
Collaboration

[[2]]$children[[5]]$url
[1] "../dashboard/?projectid=4&topic=collaboration&widget="




[[3]]
[[3]]$label
<div style="font-family: symbola; display: inline; font-weight: 
500;">&#128129</div>
Basics

[[3]]$url
[1] "../dashboard/?projectid=4&widget="

[[3]]$active
[1] FALSE

[[3]]$children
[[3]]$children[[1]]
[[3]]$children[[1]]$label
[1] "Commit Information"

[[3]]$children[[1]]$url
[1] 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.commit.info.splom,widget.commit.info.corrgram,widget.commit.doc"


[[3]]$children[[2]]
[[3]]$children[[2]]$label
[1] "Authors / Contributions"

[[3]]$children[[2]]$url
[1] 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.contributions.overview,widget.contributions.multiCycles,widget.contributions.authorsPerCycle"


[[3]]$children[[3]]
[[3]]$children[[3]]$label
[1] "Authors / Pagerank"

[[3]]$children[[3]]$url
[1] 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.contributors.pagerank,widget.contributors.pagerank.transposed,widget.contributors.commits,widget.contributors.changes"


[[3]]$children[[4]]
[[3]]$children[[4]]$label
[1] "Show Time Series"

[[3]]$children[[4]]$url
[1] "../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.timeseries.plots"


[[3]]$children[[5]]
[[3]]$children[[5]]$label
[1] "Developer commit timezones"

[[3]]$children[[5]]$url
[1] "../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.timezones.commits"


[[3]]$children[[6]]
[[3]]$children[[6]]$label
[1] "Authors / Time of Activity"

[[3]]$children[[6]]$url
[1] 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.weekend.fraction,widget.weekend.fraction.type,widget.punchcard"




[[4]]
[[4]]$label
[1] "Details"

[[4]]$url
[1] "../details?projectid=4"

[[4]]$active
[1] TRUE

[[4]]$children
list()



JSON data structure[
        {
                "label" : "Codeface projects",
                "url" : "../dashboard/",
                "active" : false,
                "children" : [
                        {
                                "label" : "codeface_test_projectoovCWy",
                                "url" : "../dashboard/?projectid=12"
                        }
                ]
        },
        {
                "label" : [],
                "url" : "../dashboard/?projectid=4",
                "active" : false,
                "children" : [
                        {
                                "label" : [
                                        {
                                                "name" : "div",
                                                "attribs" : {
                                                        "style" : "font-family: 
symbola; display: inline; font-weight: 500;"
                                                },
                                                "children" : [
                                                        "&#128129"
                                                ]
                                        },
                                        "Basics"
                                ],
                                "url" : 
"../dashboard/?projectid=4&topic=basics&widget="
                        },
                        {
                                "label" : [
                                        {
                                                "name" : "div",
                                                "attribs" : {
                                                        "style" : "font-family: 
symbola; display: inline; font-weight: 500;"
                                                },
                                                "children" : [
                                                        "&#128491"
                                                ]
                                        },
                                        "Communication"
                                ],
                                "url" : 
"../dashboard/?projectid=4&topic=communication&widget="
                        },
                        {
                                "label" : [
                                        {
                                                "name" : "div",
                                                "attribs" : {
                                                        "style" : "font-family: 
symbola; display: inline; font-weight: 500;"
                                                },
                                                "children" : [
                                                        "&#128296"
                                                ]
                                        },
                                        "Construction"
                                ],
                                "url" : 
"../dashboard/?projectid=4&topic=construction&widget="
                        },
                        {
                                "label" : [
                                        {
                                                "name" : "div",
                                                "attribs" : {
                                                        "style" : "font-family: 
symbola; display: inline; font-weight: 500;"
                                                },
                                                "children" : [
                                                        "&#127983"
                                                ]
                                        },
                                        "Complexity"
                                ],
                                "url" : 
"../dashboard/?projectid=4&topic=complexity&widget="
                        },
                        {
                                "label" : [
                                        {
                                                "name" : "div",
                                                "attribs" : {
                                                        "style" : "font-family: 
symbola; display: inline; font-weight: 500;"
                                                },
                                                "children" : [
                                                        "&#128101"
                                                ]
                                        },
                                        "Collaboration"
                                ],
                                "url" : 
"../dashboard/?projectid=4&topic=collaboration&widget="
                        }
                ]
        },
        {
                "label" : [
                        {
                                "name" : "div",
                                "attribs" : {
                                        "style" : "font-family: symbola; 
display: inline; font-weight: 500;"
                                },
                                "children" : [
                                        "&#128129"
                                ]
                        },
                        "Basics"
                ],
                "url" : "../dashboard/?projectid=4&widget=",
                "active" : false,
                "children" : [
                        {
                                "label" : "Commit Information",
                                "url" : 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.commit.info.splom,widget.commit.info.corrgram,widget.commit.doc"
                        },
                        {
                                "label" : "Authors / Contributions",
                                "url" : 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.contributions.overview,widget.contributions.multiCycles,widget.contributions.authorsPerCycle"
                        },
                        {
                                "label" : "Authors / Pagerank",
                                "url" : 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.contributors.pagerank,widget.contributors.pagerank.transposed,widget.contributors.commits,widget.contributors.changes"
                        },
                        {
                                "label" : "Show Time Series",
                                "url" : 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.timeseries.plots"
                        },
                        {
                                "label" : "Developer commit timezones",
                                "url" : 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.timezones.commits"
                        },
                        {
                                "label" : "Authors / Time of Activity",
                                "url" : 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.weekend.fraction,widget.weekend.fraction.type,widget.punchcard"
                        }
                ]
        },
        {
                "label" : "Details",
                "url" : "../details?projectid=4",
                "active" : true,
                "children" : []
        }
]
Bootstrap Html code<ul class="breadcrumb">
  <li class="dropdown">
    <a data-target="#" href="../dashboard/">Codeface projects</a>
    <b class="dropdown-toggle caret" data-toggle="dropdown"></b>
    <ul class="dropdown-menu" role="menu">
      <li role="presentation" style="display:inline;">
        <a href="../dashboard/?projectid=12" tabindex="-1" 
role="menuitem">codeface_test_projectoovCWy</a>
      </li>
    </ul>
    <span class="divider">/</span>
  </li>
  <li class="dropdown">
    <a data-target="#" href="../dashboard/?projectid=4"></a>
    <b class="dropdown-toggle caret" data-toggle="dropdown"></b>
    <ul class="dropdown-menu" role="menu">
      <li role="presentation" style="display:inline;">
        <a href="../dashboard/?projectid=4&amp;topic=basics&amp;widget=" 
tabindex="-1" role="menuitem">&lt;div style="font-family: symbola; display: 
inline; font-weight: 500;"&gt;&amp;#128129&lt;/div&gt;
Basics</a>
      </li>
      <li role="presentation" style="display:inline;">
        <a href="../dashboard/?projectid=4&amp;topic=communication&amp;widget=" 
tabindex="-1" role="menuitem">&lt;div style="font-family: symbola; display: 
inline; font-weight: 500;"&gt;&amp;#128491&lt;/div&gt;
Communication</a>
      </li>
      <li role="presentation" style="display:inline;">
        <a href="../dashboard/?projectid=4&amp;topic=construction&amp;widget=" 
tabindex="-1" role="menuitem">&lt;div style="font-family: symbola; display: 
inline; font-weight: 500;"&gt;&amp;#128296&lt;/div&gt;
Construction</a>
      </li>
      <li role="presentation" style="display:inline;">
        <a href="../dashboard/?projectid=4&amp;topic=complexity&amp;widget=" 
tabindex="-1" role="menuitem">&lt;div style="font-family: symbola; display: 
inline; font-weight: 500;"&gt;&amp;#127983&lt;/div&gt;
Complexity</a>
      </li>
      <li role="presentation" style="display:inline;">
        <a href="../dashboard/?projectid=4&amp;topic=collaboration&amp;widget=" 
tabindex="-1" role="menuitem">&lt;div style="font-family: symbola; display: 
inline; font-weight: 500;"&gt;&amp;#128101&lt;/div&gt;
Collaboration</a>
      </li>
    </ul>
    <span class="divider">/</span>
  </li>
  <li class="dropdown">
    <a data-target="#" href="../dashboard/?projectid=4&amp;widget=">&lt;div 
style="font-family: symbola; display: inline; font-weight: 
500;"&gt;&amp;#128129&lt;/div&gt;
Basics</a>
    <b class="dropdown-toggle caret" data-toggle="dropdown"></b>
    <ul class="dropdown-menu" role="menu">
      <li role="presentation" style="display:inline;">
        <a 
href="../details?projectid=4&amp;topic=basics&amp;widget=widget.commit.info.splom,widget.commit.info.corrgram,widget.commit.doc"
 tabindex="-1" role="menuitem">Commit Information</a>
      </li>
      <li role="presentation" style="display:inline;">
        <a 
href="../details?projectid=4&amp;topic=basics&amp;widget=widget.contributions.overview,widget.contributions.multiCycles,widget.contributions.authorsPerCycle"
 tabindex="-1" role="menuitem">Authors / Contributions</a>
      </li>
      <li role="presentation" style="display:inline;">
        <a 
href="../details?projectid=4&amp;topic=basics&amp;widget=widget.contributors.pagerank,widget.contributors.pagerank.transposed,widget.contributors.commits,widget.contributors.changes"
 tabindex="-1" role="menuitem">Authors / Pagerank</a>
      </li>
      <li role="presentation" style="display:inline;">
        <a 
href="../details?projectid=4&amp;topic=basics&amp;widget=widget.timeseries.plots"
 tabindex="-1" role="menuitem">Show Time Series</a>
      </li>
      <li role="presentation" style="display:inline;">
        <a 
href="../details?projectid=4&amp;topic=basics&amp;widget=widget.timezones.commits"
 tabindex="-1" role="menuitem">Developer commit timezones</a>
      </li>
      <li role="presentation" style="display:inline;">
        <a 
href="../details?projectid=4&amp;topic=basics&amp;widget=widget.weekend.fraction,widget.weekend.fraction.type,widget.punchcard"
 tabindex="-1" role="menuitem">Authors / Time of Activity</a>
      </li>
    </ul>
    <span class="divider">/</span>
  </li>
  <li class="dropdown">
    <b>Details</b>
    <span></span>
  </li>
</ul>.......2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.commit.info.splom
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.commit.info.splom
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.commit.info.splom
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.commit.info.corrgram
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.commit.info.corrgram
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.commit.info.corrgram
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.commit.doc
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.commit.doc
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.commit.doc
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.commit.structure.mds
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.commit.structure.mds
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.commit.structure.mds
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.commit.structure.princomp
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.commit.structure.princomp
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.commit.structure.princomp
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.contributions.multiCycles
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.contributions.multiCycles
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.contributions.multiCycles
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.contributions.authorsPerCycle
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.contributions.authorsPerCycle
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.contributions.authorsPerCycle
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.contributions.overview
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.contributions.overview
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.contributions.overview
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.contributors.pagerank
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.contributors.pagerank
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.contributors.pagerank
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.contributors.pagerank.transposed
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.contributors.pagerank.transposed
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.contributors.pagerank.transposed
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.contributors.commits
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.contributors.commits
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.contributors.commits
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.contributors.changes
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.contributors.changes
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.contributors.changes
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.complexity.loc.per.author.summary
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.complexity.loc.per.author.summary
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.complexity.loc.per.author.summary
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.complexity.loc.per.author.weighted
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.complexity.loc.per.author.weighted
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.complexity.loc.per.author.weighted
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.complexity.loc
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.complexity.loc
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.complexity.loc
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.complexity.diff.size
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.complexity.diff.size
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.complexity.diff.size
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.complexity.relative.diff.size
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.complexity.relative.diff.size
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.complexity.relative.diff.size
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.general.info.overview
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.general.info.overview
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.general.info.overview
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.gauge.commits
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.gauge.commits
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.gauge.commits
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.gauge.commitspeed
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.gauge.commitspeed
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.gauge.commitspeed
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.gauge.current.cycle
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.gauge.current.cycle
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.gauge.current.cycle
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.gauge.commits.per.cycle
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.gauge.commits.per.cycle
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.gauge.commits.per.cycle
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.overview.processing
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.overview.processing
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.overview.processing
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.overview.project
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.overview.project
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.overview.project
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.overview.communication
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.overview.communication
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.overview.communication
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.overview.collaboration
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.overview.collaboration
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.overview.collaboration
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.overview.complexity
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.overview.complexity
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.overview.complexity
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.overview.construction
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.overview.construction
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.overview.construction
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.timeseries.plots
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.timeseries.plots
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.timeseries.plots
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.punchcard.ml
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.punchcard.ml
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.punchcard.ml
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.punchcard
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.punchcard
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.punchcard
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.release.distance
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.release.distance
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.release.distance
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.tagcloud.mlsubjects
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.tagcloud.mlsubjects
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.tagcloud.mlsubjects
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.timeseries.messages.per.day
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.timeseries.messages.per.day
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: 
widget.timeseries.messages.per.day
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.timezones.test1
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.timezones.test1
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.timezones.test1
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.timezones.test2
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.timezones.test2
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.timezones.test2
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.timezones.commits
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.timezones.commits
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.timezones.commits
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.clusters.clusters
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.clusters.clusters
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.clusters.clusters
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.clusters.correlations
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.clusters.correlations
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.clusters.correlations
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.clusters.summary
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.clusters.summary
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.clusters.summary
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.weekend.fraction
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.weekend.fraction
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.weekend.fraction
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.weekend.fraction.type
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.weekend.fraction.type
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.weekend.fraction.type
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.ir
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.ir
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.ir
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.ir.details.receiving
2017-03-25 12:31:54 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.ir.details.receiving
2017-03-25 12:31:55 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.ir.details.receiving
2017-03-25 12:31:55 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.ir.details.writing
2017-03-25 12:31:55 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.ir.details.writing
2017-03-25 12:31:55 [codeface.R] INFO: newWidget: widget.ir.details.writing

[1] "Test Passed"
.
Warning messages:
1: In max(dat) : no non-missing arguments to max; returning -Inf
2: In min(dat) : no non-missing arguments to min; returning Inf
3: In max(dat) : no non-missing arguments to max; returning -Inf
4: In min(dat) : no non-missing arguments to min; returning Inf
.
----------------------------------------------------------------------
Ran 29 tests in 7.018s

OK

===== running integration tests =====

Initialized empty Git repository in /tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git/
[master (root-commit) 9eaa63b] Commit 0
 1 file changed, 2 insertions(+)
 create mode 100644 README
[master 22c535f] Commit 1
 2 files changed, 3 insertions(+), 2 deletions(-)
 create mode 100644 src/code.c
[master b5a89b4] Commit 2
 1 file changed, 1 insertion(+)
 create mode 100644 src/carp.c
[master 9c20869] Commit 3
 2 files changed, 3 insertions(+), 2 deletions(-)
 delete mode 100644 src/carp.c
[master 4cfafa9] Commit 4
 Author: Max Maintainer <max@xxxxxxxxxxx>
 1 file changed, 3 insertions(+)
 create mode 100644 src/newcode.c
[master e853181] Commit 5
 1 file changed, 0 insertions(+), 0 deletions(-)
 rename src/{newcode.c => answer.c} (100%)
[master 9c00245] Commit 6
 Author: Clara Confident <clara@xxxxxxx>
 1 file changed, 2 insertions(+)
 create mode 100644 Makefile
[master 4198f61] Commit 7
 2 files changed, 2 insertions(+), 3 deletions(-)
 delete mode 100644 Makefile
DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git/testproject.conf'
DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
2017-03-25 12:31:55 [codeface] MainProcess DEVINFO: Opened logfile 
'/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git/log' with log level 'debug'
DEVINFO:codeface:Opened logfile '/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git/log' 
with log level 'debug'
2017-03-25 12:31:55 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
2017-03-25 12:31:55 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git/testproject.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git/testproject.conf'
2017-03-25 12:31:55 [codeface.project] MainProcess INFO: => Setting up project 
'codeface_test_projectaqwauO'
INFO:codeface.project:=> Setting up project 'codeface_test_projectaqwauO'
DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
2017-03-25 12:31:55 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Creating new 
project codeface_test_projectaqwauO/committer2author
DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_projectaqwauO/committer2author
2017-03-25 12:31:55 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectaqwauO/committer2author with ID 13
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectaqwauO/committer2author with ID 13
2017-03-25 12:31:55 [codeface.dbmanager] MainProcess WARNING: Deleting and 
re-creating project codeface_test_projectaqwauO/committer2author.
WARNING:codeface.dbmanager:Deleting and re-creating project 
codeface_test_projectaqwauO/committer2author.
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Creating new 
project codeface_test_projectaqwauO/committer2author
DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_projectaqwauO/committer2author
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectaqwauO/committer2author with ID 14
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectaqwauO/committer2author with ID 14
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess INFO: Adding 3 new 
releases...
INFO:codeface.dbmanager:Adding 3 new releases...
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectaqwauO/committer2author with ID 14
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectaqwauO/committer2author with ID 14
2017-03-25 12:31:56 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> Revision range 
v0_release..v1_release: Analysing commits...
INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: Analysing 
commits...
DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
2017-03-25 12:31:56 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Creating 
data base for v0_release..v1_release
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Creating data base for v0_release..v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v0_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v1_rc_1..v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git show --format=full --shortstat 
--numstat b5a89b41acadf241dc8146c2263fff4a779573b3
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change b5a89b41acadf241dc8146c2263fff4a779573b3
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience b5a89b41acadf241dc8146c2263fff4a779573b3
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
b5a89b41acadf241dc8146c2263fff4a779573b3
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 22c535f4f19980bf1174dcb9687c70c0187c5312
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 22c535f4f19980bf1174dcb9687c70c0187c5312
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 22c535f4f19980bf1174dcb9687c70c0187c5312
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
22c535f4f19980bf1174dcb9687c70c0187c5312
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 9c20869a9ee16feef22d7cf0cc3bfc4ffddbddda
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 9c20869a9ee16feef22d7cf0cc3bfc4ffddbddda
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 9c20869a9ee16feef22d7cf0cc3bfc4ffddbddda
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
9c20869a9ee16feef22d7cf0cc3bfc4ffddbddda
Pass 1/2: 100% |############################################################| 
Time: 0:00:00
2017-03-25 12:31:56 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Shelving 
the VCS object
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Shelving the VCS object
2017-03-25 12:31:56 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Finished 
shelving the VCS object
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Finished shelving the VCS object
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectaqwauO/committer2author with ID 14
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectaqwauO/committer2author with ID 14
2017-03-25 12:31:56 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Reading 
from data base 
/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git/results/codeface_test_projectaqwauO/committer2author/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Reading from data base 
/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git/results/codeface_test_projectaqwauO/committer2author/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
2017-03-25 12:31:56 [codeface.VCS] MainProcess DEVINFO: Using cached data to 
extract commit information
DEVINFO:codeface.VCS:Using cached data to extract commit information
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectaqwauO/committer2author with ID 14
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectaqwauO/committer2author with ID 14
info: inserting/updating user Adam Awkward <adam@xxxxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Bill Bully <bill@xxxxxxxxxxx>
Pass 2/2: 100% |############################################################| 
Time: 0:00:00
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectaqwauO/committer2author with ID 14
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectaqwauO/committer2author with ID 14
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectaqwauO/committer2author with ID 14
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectaqwauO/committer2author with ID 14
2017-03-25 12:31:56 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> Revision range 
v0_release..v1_release: Commit analysis done.
INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: Commit analysis 
done.
2017-03-25 12:31:56 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> Revision range 
v0_release..v1_release: Detecting clusters...
INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: Detecting 
clusters...
DEBUG:codeface.util:Running command: /vagrant/codeface/R/cluster/persons.r 
--loglevel devinfo --logfile /tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectaqwauOeqqtdc 
/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git/results/codeface_test_projectaqwauO/committer2author/v0_release-v1_release
 13
: No such file or directory
2017-03-25 12:31:56 [codeface.util] MainProcess ERROR: Command 
'/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel devinfo --logfile 
/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git/log.R.r0 -c /vagrant/codeface.conf -p 
/tmp/codeface_test_projectaqwauOeqqtdc 
/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git/results/codeface_test_projectaqwauO/committer2author/v0_release-v1_release
 13' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)
ERROR:codeface.util:Command '/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel 
devinfo --logfile /tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectaqwauOeqqtdc 
/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git/results/codeface_test_projectaqwauO/committer2author/v0_release-v1_release
 13' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)
Left directory '/tmp/codeface_test_projectaqwauO' for inspection.
EInitialized empty Git repository in /tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/
[master (root-commit) 9eaa63b] Commit 0
 1 file changed, 2 insertions(+)
 create mode 100644 README
[master 22c535f] Commit 1
 2 files changed, 3 insertions(+), 2 deletions(-)
 create mode 100644 src/code.c
[master b5a89b4] Commit 2
 1 file changed, 1 insertion(+)
 create mode 100644 src/carp.c
[master 9c20869] Commit 3
 2 files changed, 3 insertions(+), 2 deletions(-)
 delete mode 100644 src/carp.c
[master 4cfafa9] Commit 4
 Author: Max Maintainer <max@xxxxxxxxxxx>
 1 file changed, 3 insertions(+)
 create mode 100644 src/newcode.c
[master e853181] Commit 5
 1 file changed, 0 insertions(+), 0 deletions(-)
 rename src/{newcode.c => answer.c} (100%)
[master 9c00245] Commit 6
 Author: Clara Confident <clara@xxxxxxx>
 1 file changed, 2 insertions(+)
 create mode 100644 Makefile
[master 4198f61] Commit 7
 2 files changed, 2 insertions(+), 3 deletions(-)
 delete mode 100644 Makefile
2017-03-25 12:31:56 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
2017-03-25 12:31:56 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/testproject.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/testproject.conf'
DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
2017-03-25 12:31:56 [codeface] MainProcess DEVINFO: Opened logfile 
'/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/log' with log level 'debug'
DEVINFO:codeface:Opened logfile '/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/log' 
with log level 'debug'
2017-03-25 12:31:56 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
2017-03-25 12:31:56 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/testproject.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/testproject.conf'
2017-03-25 12:31:56 [codeface.project] MainProcess INFO: => Setting up project 
'codeface_test_projectwkUxXC'
INFO:codeface.project:=> Setting up project 'codeface_test_projectwkUxXC'
DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Creating new 
project codeface_test_projectwkUxXC/tag
DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project codeface_test_projectwkUxXC/tag
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectwkUxXC/tag with ID 15
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectwkUxXC/tag with 
ID 15
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess WARNING: Deleting and 
re-creating project codeface_test_projectwkUxXC/tag.
WARNING:codeface.dbmanager:Deleting and re-creating project 
codeface_test_projectwkUxXC/tag.
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Creating new 
project codeface_test_projectwkUxXC/tag
DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project codeface_test_projectwkUxXC/tag
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectwkUxXC/tag with ID 16
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectwkUxXC/tag with 
ID 16
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess INFO: Adding 3 new 
releases...
INFO:codeface.dbmanager:Adding 3 new releases...
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectwkUxXC/tag with ID 16
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectwkUxXC/tag with 
ID 16
2017-03-25 12:31:56 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> Revision range 
v0_release..v1_release: Analysing commits...
INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: Analysing 
commits...
DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
2017-03-25 12:31:56 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Creating 
data base for v0_release..v1_release
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Creating data base for v0_release..v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v0_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v1_rc_1..v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git show --format=full --shortstat 
--numstat b5a89b41acadf241dc8146c2263fff4a779573b3
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change b5a89b41acadf241dc8146c2263fff4a779573b3
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience b5a89b41acadf241dc8146c2263fff4a779573b3
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
b5a89b41acadf241dc8146c2263fff4a779573b3
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 22c535f4f19980bf1174dcb9687c70c0187c5312
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 22c535f4f19980bf1174dcb9687c70c0187c5312
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 22c535f4f19980bf1174dcb9687c70c0187c5312
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
22c535f4f19980bf1174dcb9687c70c0187c5312
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 9c20869a9ee16feef22d7cf0cc3bfc4ffddbddda
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 9c20869a9ee16feef22d7cf0cc3bfc4ffddbddda
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 9c20869a9ee16feef22d7cf0cc3bfc4ffddbddda
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
9c20869a9ee16feef22d7cf0cc3bfc4ffddbddda
Pass 1/2: 100% |############################################################| 
Time: 0:00:00
2017-03-25 12:31:56 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Shelving 
the VCS object
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Shelving the VCS object
2017-03-25 12:31:56 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Finished 
shelving the VCS object
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Finished shelving the VCS object
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectwkUxXC/tag with ID 16
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectwkUxXC/tag with 
ID 16
2017-03-25 12:31:56 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Reading 
from data base 
/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/results/codeface_test_projectwkUxXC/tag/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Reading from data base 
/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/results/codeface_test_projectwkUxXC/tag/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
2017-03-25 12:31:56 [codeface.VCS] MainProcess DEVINFO: Using cached data to 
extract commit information
DEVINFO:codeface.VCS:Using cached data to extract commit information
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectwkUxXC/tag with ID 16
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectwkUxXC/tag with 
ID 16
info: inserting/updating user Adam Awkward <adam@xxxxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Bill Bully <bill@xxxxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Clara Confident <clara@xxxxxxx>              | 
ETA:  --:--:--
info: inserting/updating user Peter Popular <peter@xxxxxxxxx>
Pass 2/2: 100% |############################################################| 
Time: 0:00:00
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectwkUxXC/tag with ID 16
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectwkUxXC/tag with 
ID 16
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectwkUxXC/tag with ID 16
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectwkUxXC/tag with 
ID 16
2017-03-25 12:31:56 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> Revision range 
v0_release..v1_release: Commit analysis done.
INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: Commit analysis 
done.
2017-03-25 12:31:56 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> Revision range 
v0_release..v1_release: Detecting clusters...
INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: Detecting 
clusters...
DEBUG:codeface.util:Running command: /vagrant/codeface/R/cluster/persons.r 
--loglevel devinfo --logfile /tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectwkUxXCtXmzE4 
/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/results/codeface_test_projectwkUxXC/tag/v0_release-v1_release
 15
: No such file or directory
2017-03-25 12:31:56 [codeface.util] MainProcess ERROR: Command 
'/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel devinfo --logfile 
/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/log.R.r0 -c /vagrant/codeface.conf -p 
/tmp/codeface_test_projectwkUxXCtXmzE4 
/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/results/codeface_test_projectwkUxXC/tag/v0_release-v1_release
 15' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)
ERROR:codeface.util:Command '/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel 
devinfo --logfile /tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectwkUxXCtXmzE4 
/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/results/codeface_test_projectwkUxXC/tag/v0_release-v1_release
 15' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)
Left directory '/tmp/codeface_test_projectwkUxXC' for inspection.
EInitialized empty Git repository in /tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/
[master (root-commit) 9eaa63b] Commit 0
 1 file changed, 2 insertions(+)
 create mode 100644 README
[master 6fd38f3] Commit 1
 2 files changed, 5 insertions(+), 2 deletions(-)
 create mode 100644 src/code.c
[master 9b9857a] Commit 2
 1 file changed, 3 insertions(+)
 create mode 100644 src/carp.c
[master 4e1f9da] Commit 3
 1 file changed, 1 insertion(+)
[master 43913fe] Commit 4
 1 file changed, 1 insertion(+)
[master 86be366] Commit 5
 1 file changed, 1 insertion(+)
[master 96a470c] Commit 6
 1 file changed, 3 insertions(+), 1 deletion(-)
[master c31f5d8] Commit 7
 1 file changed, 2 insertions(+), 2 deletions(-)
[master 19ed287] Commit 8
 Author: Max Maintainer <max@xxxxxxxxxxx>
 1 file changed, 2 insertions(+)
[master fab5f63] Commit 9
 1 file changed, 2 insertions(+)
[master c9501ad] Commit 10
 Author: Clara Confident <clara@xxxxxxx>
 2 files changed, 5 insertions(+)
 create mode 100644 Makefile
[master ceba3d5] Commit 11
 4 files changed, 10 insertions(+), 9 deletions(-)
 delete mode 100644 Makefile
[master 54acd6d] Commit 12
 1 file changed, 2 insertions(+)
[master 4d25aab] Commit 13
 Author: Max Maintainer <max@xxxxxxxxxxx>
 4 files changed, 7 insertions(+), 20 deletions(-)
 delete mode 100644 src/carp.c
 create mode 100644 src/newcode.c
[master 2d6981d] Commit 14
 2 files changed, 1 insertion(+), 3 deletions(-)
 rename src/{newcode.c => answer.c} (100%)
[master 6c0f879] Commit 15
 Author: Clara Confident <clara@xxxxxxx>
 2 files changed, 2 insertions(+), 2 deletions(-)
 create mode 100644 Makefile
[master 88c2a52] Commit 16
 3 files changed, 10 insertions(+), 3 deletions(-)
 delete mode 100644 Makefile
2017-03-25 12:31:56 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
2017-03-25 12:31:56 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/testproject.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/testproject.conf'
DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
2017-03-25 12:31:56 [codeface] MainProcess DEVINFO: Opened logfile 
'/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/log' with log level 'debug'
DEVINFO:codeface:Opened logfile '/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/log' 
with log level 'debug'
2017-03-25 12:31:56 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
2017-03-25 12:31:56 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/testproject.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/testproject.conf'
DEBUG:codeface.util:Running command: ctags-exuberant --version
2017-03-25 12:31:56 [codeface.project] MainProcess INFO: => Setting up project 
'codeface_test_projectxUL38Q'
INFO:codeface.project:=> Setting up project 'codeface_test_projectxUL38Q'
DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Creating new 
project codeface_test_projectxUL38Q/proximity
DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_projectxUL38Q/proximity
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectxUL38Q/proximity with ID 17
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectxUL38Q/proximity 
with ID 17
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess WARNING: Deleting and 
re-creating project codeface_test_projectxUL38Q/proximity.
WARNING:codeface.dbmanager:Deleting and re-creating project 
codeface_test_projectxUL38Q/proximity.
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Creating new 
project codeface_test_projectxUL38Q/proximity
DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_projectxUL38Q/proximity
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectxUL38Q/proximity with ID 18
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectxUL38Q/proximity 
with ID 18
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess INFO: Adding 3 new 
releases...
INFO:codeface.dbmanager:Adding 3 new releases...
2017-03-25 12:31:56 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectxUL38Q/proximity with ID 18
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectxUL38Q/proximity 
with ID 18
2017-03-25 12:31:56 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> Revision range 
v0_release..v1_release: Analysing commits...
INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: Analysing 
commits...
DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
2017-03-25 12:31:56 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Creating 
data base for v0_release..v1_release
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Creating data base for v0_release..v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v0_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v1_rc_1..v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 4e1f9daf88f2208753ad5b64f2f641c84498e143
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 54acd6d5b793f615781a6b86d070562af8a2167f
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 96a470cace2d1e6a6bc983ea29253703e80642a1
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 19ed28730787cadb7209bd1e43aabd54a5734c39
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r fab5f6359b9df96367dcf6c73c61b7d04689b27f
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 43913fe3fd287177408bf186b105492600cd7292
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r ceba3d53836ec9c1ac86039d0e3d81210255248c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r c31f5d85cbb2cdac0e33825e2f4f54e88f0c9472
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 9b9857a9dc6e40072ef5f103ae44729bec717bcf
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 86be366758f7978f663438404b2c7b237aabf526
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r c9501ad4e843bc861899d2e5d416f866fe5195c4
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 6fd38f3b83b6fe80da9d14c3a43e294e6bf728d0
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git log --no-merges -M -C 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release -- src/carp.c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git ls-tree --name-only --full-tree 
-r v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git blame -p -w -C -M v1_release -- 
src/carp.c
DEBUG:codeface.VCS:Running Doxygen analysis
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git log --no-merges -M -C 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release -- src/code.c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git ls-tree --name-only --full-tree 
-r v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git blame -p -w -C -M v1_release -- 
src/code.c
DEBUG:codeface.VCS:Running Doxygen analysis
Blame Analysis: 100% |######################################################| 
Time: 0:00:00
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 4e1f9daf88f2208753ad5b64f2f641c84498e143
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 4e1f9daf88f2208753ad5b64f2f641c84498e143
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 4e1f9daf88f2208753ad5b64f2f641c84498e143
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
4e1f9daf88f2208753ad5b64f2f641c84498e143
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 54acd6d5b793f615781a6b86d070562af8a2167f
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 54acd6d5b793f615781a6b86d070562af8a2167f
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 54acd6d5b793f615781a6b86d070562af8a2167f
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
54acd6d5b793f615781a6b86d070562af8a2167f
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 96a470cace2d1e6a6bc983ea29253703e80642a1
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 96a470cace2d1e6a6bc983ea29253703e80642a1
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 96a470cace2d1e6a6bc983ea29253703e80642a1
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
96a470cace2d1e6a6bc983ea29253703e80642a1
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 19ed28730787cadb7209bd1e43aabd54a5734c39
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 19ed28730787cadb7209bd1e43aabd54a5734c39
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 19ed28730787cadb7209bd1e43aabd54a5734c39
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
19ed28730787cadb7209bd1e43aabd54a5734c39
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat fab5f6359b9df96367dcf6c73c61b7d04689b27f
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change fab5f6359b9df96367dcf6c73c61b7d04689b27f
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience fab5f6359b9df96367dcf6c73c61b7d04689b27f
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
fab5f6359b9df96367dcf6c73c61b7d04689b27f
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 43913fe3fd287177408bf186b105492600cd7292
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 43913fe3fd287177408bf186b105492600cd7292
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 43913fe3fd287177408bf186b105492600cd7292
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
43913fe3fd287177408bf186b105492600cd7292
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat ceba3d53836ec9c1ac86039d0e3d81210255248c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change ceba3d53836ec9c1ac86039d0e3d81210255248c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience ceba3d53836ec9c1ac86039d0e3d81210255248c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
ceba3d53836ec9c1ac86039d0e3d81210255248c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat c31f5d85cbb2cdac0e33825e2f4f54e88f0c9472
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change c31f5d85cbb2cdac0e33825e2f4f54e88f0c9472
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience c31f5d85cbb2cdac0e33825e2f4f54e88f0c9472
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
c31f5d85cbb2cdac0e33825e2f4f54e88f0c9472
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 9b9857a9dc6e40072ef5f103ae44729bec717bcf
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 9b9857a9dc6e40072ef5f103ae44729bec717bcf
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 9b9857a9dc6e40072ef5f103ae44729bec717bcf
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
9b9857a9dc6e40072ef5f103ae44729bec717bcf
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 86be366758f7978f663438404b2c7b237aabf526
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 86be366758f7978f663438404b2c7b237aabf526
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 86be366758f7978f663438404b2c7b237aabf526
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
86be366758f7978f663438404b2c7b237aabf526
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat c9501ad4e843bc861899d2e5d416f866fe5195c4
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change c9501ad4e843bc861899d2e5d416f866fe5195c4
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience c9501ad4e843bc861899d2e5d416f866fe5195c4
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
c9501ad4e843bc861899d2e5d416f866fe5195c4
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 6fd38f3b83b6fe80da9d14c3a43e294e6bf728d0
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 6fd38f3b83b6fe80da9d14c3a43e294e6bf728d0
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 6fd38f3b83b6fe80da9d14c3a43e294e6bf728d0
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
6fd38f3b83b6fe80da9d14c3a43e294e6bf728d0
Pass 1/2: 100% |############################################################| 
Time: 0:00:00
2017-03-25 12:31:57 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Shelving 
the VCS object
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Shelving the VCS object
2017-03-25 12:31:57 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Finished 
shelving the VCS object
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Finished shelving the VCS object
2017-03-25 12:31:57 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectxUL38Q/proximity with ID 18
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectxUL38Q/proximity 
with ID 18
2017-03-25 12:31:57 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Reading 
from data base 
/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/results/codeface_test_projectxUL38Q/proximity/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Reading from data base 
/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/results/codeface_test_projectxUL38Q/proximity/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
2017-03-25 12:31:57 [codeface.VCS] MainProcess DEVINFO: Using cached data to 
extract commit information
DEVINFO:codeface.VCS:Using cached data to extract commit information
2017-03-25 12:31:57 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectxUL38Q/proximity with ID 18
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectxUL38Q/proximity 
with ID 18
info: inserting/updating user Louie Loner <louie@xxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Geoff Genius <geoff@xxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Bill Bully <bill@xxxxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Max Maintainer <max@xxxxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Adam Awkward <adam@xxxxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Peter Popular <peter@xxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Clara Confident <clara@xxxxxxx>
2017-03-25 12:31:57 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectxUL38Q/proximity with ID 18
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectxUL38Q/proximity 
with ID 18
2017-03-25 12:31:57 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectxUL38Q/proximity with ID 18
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectxUL38Q/proximity 
with ID 18
2017-03-25 12:31:57 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectxUL38Q/proximity with ID 18
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectxUL38Q/proximity 
with ID 18
2017-03-25 12:31:57 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> Revision range 
v0_release..v1_release: Commit analysis done.
INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: Commit analysis 
done.
2017-03-25 12:31:57 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> Revision range 
v0_release..v1_release: Detecting clusters...
INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: Detecting 
clusters...
DEBUG:codeface.util:Running command: /vagrant/codeface/R/cluster/persons.r 
--loglevel devinfo --logfile /tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectxUL38QIh7WMP 
/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/results/codeface_test_projectxUL38Q/proximity/v0_release-v1_release
 17
: No such file or directory
2017-03-25 12:31:57 [codeface.util] MainProcess ERROR: Command 
'/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel devinfo --logfile 
/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/log.R.r0 -c /vagrant/codeface.conf -p 
/tmp/codeface_test_projectxUL38QIh7WMP 
/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/results/codeface_test_projectxUL38Q/proximity/v0_release-v1_release
 17' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)
ERROR:codeface.util:Command '/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel 
devinfo --logfile /tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectxUL38QIh7WMP 
/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/results/codeface_test_projectxUL38Q/proximity/v0_release-v1_release
 17' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)
Left directory '/tmp/codeface_test_projectxUL38Q' for inspection.
EInitialized empty Git repository in /tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/
[master (root-commit) 9eaa63b] Commit 0
 1 file changed, 2 insertions(+)
 create mode 100644 README
[master 6fd38f3] Commit 1
 2 files changed, 5 insertions(+), 2 deletions(-)
 create mode 100644 src/code.c
[master 9b9857a] Commit 2
 1 file changed, 3 insertions(+)
 create mode 100644 src/carp.c
[master 4e1f9da] Commit 3
 1 file changed, 1 insertion(+)
[master 43913fe] Commit 4
 1 file changed, 1 insertion(+)
[master 86be366] Commit 5
 1 file changed, 1 insertion(+)
[master 96a470c] Commit 6
 1 file changed, 3 insertions(+), 1 deletion(-)
[master c31f5d8] Commit 7
 1 file changed, 2 insertions(+), 2 deletions(-)
[master 19ed287] Commit 8
 Author: Max Maintainer <max@xxxxxxxxxxx>
 1 file changed, 2 insertions(+)
[master fab5f63] Commit 9
 1 file changed, 2 insertions(+)
[master c9501ad] Commit 10
 Author: Clara Confident <clara@xxxxxxx>
 2 files changed, 5 insertions(+)
 create mode 100644 Makefile
[master ceba3d5] Commit 11
 4 files changed, 10 insertions(+), 9 deletions(-)
 delete mode 100644 Makefile
[master 54acd6d] Commit 12
 1 file changed, 2 insertions(+)
[master 4d25aab] Commit 13
 Author: Max Maintainer <max@xxxxxxxxxxx>
 4 files changed, 7 insertions(+), 20 deletions(-)
 delete mode 100644 src/carp.c
 create mode 100644 src/newcode.c
[master 2d6981d] Commit 14
 2 files changed, 1 insertion(+), 3 deletions(-)
 rename src/{newcode.c => answer.c} (100%)
[master 6c0f879] Commit 15
 Author: Clara Confident <clara@xxxxxxx>
 2 files changed, 2 insertions(+), 2 deletions(-)
 create mode 100644 Makefile
[master 88c2a52] Commit 16
 3 files changed, 10 insertions(+), 3 deletions(-)
 delete mode 100644 Makefile
2017-03-25 12:31:57 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
2017-03-25 12:31:57 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/testproject.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/testproject.conf'
DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
2017-03-25 12:31:57 [codeface] MainProcess DEVINFO: Opened logfile 
'/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/log' with log level 'debug'
DEVINFO:codeface:Opened logfile '/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/log' 
with log level 'debug'
2017-03-25 12:31:57 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
2017-03-25 12:31:57 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/testproject.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/testproject.conf'
2017-03-25 12:31:57 [codeface.project] MainProcess INFO: => Setting up project 
'codeface_test_projectoT4jpB'
INFO:codeface.project:=> Setting up project 'codeface_test_projectoT4jpB'
DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
2017-03-25 12:31:57 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Creating new 
project codeface_test_projectoT4jpB/tag
DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project codeface_test_projectoT4jpB/tag
2017-03-25 12:31:57 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectoT4jpB/tag with ID 19
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectoT4jpB/tag with 
ID 19
2017-03-25 12:31:57 [codeface.dbmanager] MainProcess WARNING: Deleting and 
re-creating project codeface_test_projectoT4jpB/tag.
WARNING:codeface.dbmanager:Deleting and re-creating project 
codeface_test_projectoT4jpB/tag.
2017-03-25 12:31:57 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Creating new 
project codeface_test_projectoT4jpB/tag
DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project codeface_test_projectoT4jpB/tag
2017-03-25 12:31:57 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectoT4jpB/tag with ID 20
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectoT4jpB/tag with 
ID 20
2017-03-25 12:31:57 [codeface.dbmanager] MainProcess INFO: Adding 3 new 
releases...
INFO:codeface.dbmanager:Adding 3 new releases...
2017-03-25 12:31:57 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectoT4jpB/tag with ID 20
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectoT4jpB/tag with 
ID 20
2017-03-25 12:31:57 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> Revision range 
v0_release..v1_release: Analysing commits...
INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: Analysing 
commits...
DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
2017-03-25 12:31:57 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Creating 
data base for v0_release..v1_release
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Creating data base for v0_release..v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v0_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v1_rc_1..v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 4e1f9daf88f2208753ad5b64f2f641c84498e143
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 4e1f9daf88f2208753ad5b64f2f641c84498e143
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 4e1f9daf88f2208753ad5b64f2f641c84498e143
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
4e1f9daf88f2208753ad5b64f2f641c84498e143
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 54acd6d5b793f615781a6b86d070562af8a2167f
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 54acd6d5b793f615781a6b86d070562af8a2167f
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 54acd6d5b793f615781a6b86d070562af8a2167f
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
54acd6d5b793f615781a6b86d070562af8a2167f
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 96a470cace2d1e6a6bc983ea29253703e80642a1
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 96a470cace2d1e6a6bc983ea29253703e80642a1
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 96a470cace2d1e6a6bc983ea29253703e80642a1
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
96a470cace2d1e6a6bc983ea29253703e80642a1
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 19ed28730787cadb7209bd1e43aabd54a5734c39
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 19ed28730787cadb7209bd1e43aabd54a5734c39
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 19ed28730787cadb7209bd1e43aabd54a5734c39
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
19ed28730787cadb7209bd1e43aabd54a5734c39
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat fab5f6359b9df96367dcf6c73c61b7d04689b27f
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change fab5f6359b9df96367dcf6c73c61b7d04689b27f
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience fab5f6359b9df96367dcf6c73c61b7d04689b27f
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
fab5f6359b9df96367dcf6c73c61b7d04689b27f
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 43913fe3fd287177408bf186b105492600cd7292
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 43913fe3fd287177408bf186b105492600cd7292
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 43913fe3fd287177408bf186b105492600cd7292
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
43913fe3fd287177408bf186b105492600cd7292
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat ceba3d53836ec9c1ac86039d0e3d81210255248c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change ceba3d53836ec9c1ac86039d0e3d81210255248c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience ceba3d53836ec9c1ac86039d0e3d81210255248c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
ceba3d53836ec9c1ac86039d0e3d81210255248c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat c31f5d85cbb2cdac0e33825e2f4f54e88f0c9472
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change c31f5d85cbb2cdac0e33825e2f4f54e88f0c9472
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience c31f5d85cbb2cdac0e33825e2f4f54e88f0c9472
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
c31f5d85cbb2cdac0e33825e2f4f54e88f0c9472
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 9b9857a9dc6e40072ef5f103ae44729bec717bcf
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 9b9857a9dc6e40072ef5f103ae44729bec717bcf
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 9b9857a9dc6e40072ef5f103ae44729bec717bcf
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
9b9857a9dc6e40072ef5f103ae44729bec717bcf
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 86be366758f7978f663438404b2c7b237aabf526
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 86be366758f7978f663438404b2c7b237aabf526
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 86be366758f7978f663438404b2c7b237aabf526
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
86be366758f7978f663438404b2c7b237aabf526
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat c9501ad4e843bc861899d2e5d416f866fe5195c4
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change c9501ad4e843bc861899d2e5d416f866fe5195c4
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience c9501ad4e843bc861899d2e5d416f866fe5195c4
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
c9501ad4e843bc861899d2e5d416f866fe5195c4
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 6fd38f3b83b6fe80da9d14c3a43e294e6bf728d0
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 6fd38f3b83b6fe80da9d14c3a43e294e6bf728d0
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 6fd38f3b83b6fe80da9d14c3a43e294e6bf728d0
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
6fd38f3b83b6fe80da9d14c3a43e294e6bf728d0
Pass 1/2: 100% |############################################################| 
Time: 0:00:00
2017-03-25 12:31:57 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Shelving 
the VCS object
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Shelving the VCS object
2017-03-25 12:31:57 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Finished 
shelving the VCS object
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Finished shelving the VCS object
2017-03-25 12:31:57 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectoT4jpB/tag with ID 20
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectoT4jpB/tag with 
ID 20
2017-03-25 12:31:57 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Reading 
from data base 
/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/results/codeface_test_projectoT4jpB/tag/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Reading from data base 
/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/results/codeface_test_projectoT4jpB/tag/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
2017-03-25 12:31:57 [codeface.VCS] MainProcess DEVINFO: Using cached data to 
extract commit information
DEVINFO:codeface.VCS:Using cached data to extract commit information
2017-03-25 12:31:57 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectoT4jpB/tag with ID 20
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectoT4jpB/tag with 
ID 20
info: inserting/updating user Louie Loner <louie@xxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Geoff Genius <geoff@xxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Bill Bully <bill@xxxxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Max Maintainer <max@xxxxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Adam Awkward <adam@xxxxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Peter Popular <peter@xxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Clara Confident <clara@xxxxxxx>
Pass 2/2: 100% |############################################################| 
Time: 0:00:00
2017-03-25 12:31:57 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectoT4jpB/tag with ID 20
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectoT4jpB/tag with 
ID 20
2017-03-25 12:31:57 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectoT4jpB/tag with ID 20
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectoT4jpB/tag with 
ID 20
2017-03-25 12:31:57 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> Revision range 
v0_release..v1_release: Commit analysis done.
INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: Commit analysis 
done.
2017-03-25 12:31:57 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> Revision range 
v0_release..v1_release: Detecting clusters...
INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: Detecting 
clusters...
DEBUG:codeface.util:Running command: /vagrant/codeface/R/cluster/persons.r 
--loglevel devinfo --logfile /tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectoT4jpBt6cUK_ 
/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/results/codeface_test_projectoT4jpB/tag/v0_release-v1_release
 19
: No such file or directory
2017-03-25 12:31:57 [codeface.util] MainProcess ERROR: Command 
'/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel devinfo --logfile 
/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/log.R.r0 -c /vagrant/codeface.conf -p 
/tmp/codeface_test_projectoT4jpBt6cUK_ 
/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/results/codeface_test_projectoT4jpB/tag/v0_release-v1_release
 19' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)
ERROR:codeface.util:Command '/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel 
devinfo --logfile /tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectoT4jpBt6cUK_ 
/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/results/codeface_test_projectoT4jpB/tag/v0_release-v1_release
 19' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)
Left directory '/tmp/codeface_test_projectoT4jpB' for inspection.
EInitialized empty Git repository in /tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/
[master (root-commit) ac61e7e] Commit 0
 1 file changed, 6 insertions(+)
 create mode 100644 src/carp.c
[master f95b804] Commit 1
 1 file changed, 3 insertions(+), 1 deletion(-)
[master 458c1a5] Commit 2
 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
[master 4be60ac] Commit 3
 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
[master 3b7cc95] Commit 4
 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
[master 3fe9884] Commit 5
 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
[master 7b16cf1] Commit 6
 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
[master c9b5904] Commit 7
 1 file changed, 15 insertions(+)
 create mode 100644 src/code.c
[master 29b9c8b] Commit 8
 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
[master c52343a] Commit 9
 1 file changed, 3 insertions(+), 3 deletions(-)
[master 55eec10] Commit 10
 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
[master 2d29196] Commit 11
 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
2017-03-25 12:31:57 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
2017-03-25 12:31:57 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/testproject.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/testproject.conf'
DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
2017-03-25 12:31:57 [codeface] MainProcess DEVINFO: Opened logfile 
'/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/log' with log level 'debug'
DEVINFO:codeface:Opened logfile '/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/log' 
with log level 'debug'
2017-03-25 12:31:57 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
2017-03-25 12:31:57 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/testproject.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/testproject.conf'
DEBUG:codeface.util:Running command: /usr/bin/env cppstats --version
2017-03-25 12:31:58 [codeface.project] MainProcess INFO: => Setting up project 
'codeface_test_projectJkJLTL'
INFO:codeface.project:=> Setting up project 'codeface_test_projectJkJLTL'
DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
2017-03-25 12:31:58 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Creating new 
project codeface_test_projectJkJLTL/feature
DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_projectJkJLTL/feature
2017-03-25 12:31:58 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectJkJLTL/feature with ID 21
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectJkJLTL/feature 
with ID 21
2017-03-25 12:31:58 [codeface.dbmanager] MainProcess WARNING: Deleting and 
re-creating project codeface_test_projectJkJLTL/feature.
WARNING:codeface.dbmanager:Deleting and re-creating project 
codeface_test_projectJkJLTL/feature.
2017-03-25 12:31:58 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Creating new 
project codeface_test_projectJkJLTL/feature
DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_projectJkJLTL/feature
2017-03-25 12:31:58 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectJkJLTL/feature with ID 22
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectJkJLTL/feature 
with ID 22
2017-03-25 12:31:58 [codeface.dbmanager] MainProcess INFO: Adding 3 new 
releases...
INFO:codeface.dbmanager:Adding 3 new releases...
2017-03-25 12:31:58 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectJkJLTL/feature with ID 22
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectJkJLTL/feature 
with ID 22
2017-03-25 12:31:58 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> Revision range 
v0_release..v1_release: Analysing commits...
INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: Analysing 
commits...
DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
2017-03-25 12:31:58 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Creating 
data base for v0_release..v1_release
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Creating data base for v0_release..v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v0_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v1_rc_1..v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git log --no-merges -M -C 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release -- src/carp.c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git ls-tree --name-only --full-tree 
-r v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git blame -p -w -C -M v1_release -- 
src/carp.c
DEBUG:codeface.util:Running command: /usr/bin/env cppstats --kind 
featurelocations --file /tmp/tmpYy1umc.c /tmp/tmpobTFev.csv
Blame Analysis: 100% |######################################################| 
Time: 0:00:00
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
Pass 1/2: 100% |############################################################| 
Time: 0:00:00
2017-03-25 12:31:58 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Shelving 
the VCS object
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Shelving the VCS object
2017-03-25 12:31:58 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Finished 
shelving the VCS object
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Finished shelving the VCS object
2017-03-25 12:31:58 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectJkJLTL/feature with ID 22
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectJkJLTL/feature 
with ID 22
2017-03-25 12:31:58 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Reading 
from data base 
/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/results/codeface_test_projectJkJLTL/feature/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Reading from data base 
/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/results/codeface_test_projectJkJLTL/feature/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
2017-03-25 12:31:58 [codeface.VCS] MainProcess DEVINFO: Using cached data to 
extract commit information
DEVINFO:codeface.VCS:Using cached data to extract commit information
2017-03-25 12:31:58 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectJkJLTL/feature with ID 22
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectJkJLTL/feature 
with ID 22
info: inserting/updating user Adam Awkward <adam@xxxxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Louie Loner <louie@xxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Peter Popular <peter@xxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Bill Bully <bill@xxxxxxxxxxx>
2017-03-25 12:31:58 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectJkJLTL/feature with ID 22
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectJkJLTL/feature 
with ID 22
2017-03-25 12:31:58 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectJkJLTL/feature with ID 22
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectJkJLTL/feature 
with ID 22
2017-03-25 12:31:58 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectJkJLTL/feature with ID 22
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project codeface_test_projectJkJLTL/feature 
with ID 22
2017-03-25 12:31:58 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> Revision range 
v0_release..v1_release: Commit analysis done.
INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: Commit analysis 
done.
2017-03-25 12:31:58 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> Revision range 
v0_release..v1_release: Detecting clusters...
INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: Detecting 
clusters...
DEBUG:codeface.util:Running command: /vagrant/codeface/R/cluster/persons.r 
--loglevel devinfo --logfile /tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectJkJLTLWsVAQc 
/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/results/codeface_test_projectJkJLTL/feature/v0_release-v1_release
 21
: No such file or directory
2017-03-25 12:31:58 [codeface.util] MainProcess ERROR: Command 
'/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel devinfo --logfile 
/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/log.R.r0 -c /vagrant/codeface.conf -p 
/tmp/codeface_test_projectJkJLTLWsVAQc 
/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/results/codeface_test_projectJkJLTL/feature/v0_release-v1_release
 21' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)
ERROR:codeface.util:Command '/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel 
devinfo --logfile /tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectJkJLTLWsVAQc 
/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/results/codeface_test_projectJkJLTL/feature/v0_release-v1_release
 21' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)
Left directory '/tmp/codeface_test_projectJkJLTL' for inspection.
EInitialized empty Git repository in /tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/
[master (root-commit) ac61e7e] Commit 0
 1 file changed, 6 insertions(+)
 create mode 100644 src/carp.c
[master f95b804] Commit 1
 1 file changed, 3 insertions(+), 1 deletion(-)
[master 458c1a5] Commit 2
 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
[master 4be60ac] Commit 3
 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
[master 3b7cc95] Commit 4
 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
[master 3fe9884] Commit 5
 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
[master 7b16cf1] Commit 6
 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
[master c9b5904] Commit 7
 1 file changed, 15 insertions(+)
 create mode 100644 src/code.c
[master 29b9c8b] Commit 8
 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
[master c52343a] Commit 9
 1 file changed, 3 insertions(+), 3 deletions(-)
[master 55eec10] Commit 10
 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
[master 2d29196] Commit 11
 1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
2017-03-25 12:31:58 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
2017-03-25 12:31:58 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/testproject.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/testproject.conf'
DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
2017-03-25 12:31:58 [codeface] MainProcess DEVINFO: Opened logfile 
'/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/log' with log level 'debug'
DEVINFO:codeface:Opened logfile '/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/log' 
with log level 'debug'
2017-03-25 12:31:58 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
2017-03-25 12:31:58 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: Loading 
project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/testproject.conf'
DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/testproject.conf'
DEBUG:codeface.util:Running command: /usr/bin/env cppstats --version
2017-03-25 12:31:59 [codeface.project] MainProcess INFO: => Setting up project 
'codeface_test_projectxgYxLI'
INFO:codeface.project:=> Setting up project 'codeface_test_projectxgYxLI'
DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
2017-03-25 12:31:59 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Creating new 
project codeface_test_projectxgYxLI/feature_file
DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file
2017-03-25 12:31:59 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file with ID 23
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file with ID 23
2017-03-25 12:31:59 [codeface.dbmanager] MainProcess WARNING: Deleting and 
re-creating project codeface_test_projectxgYxLI/feature_file.
WARNING:codeface.dbmanager:Deleting and re-creating project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file.
2017-03-25 12:31:59 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Creating new 
project codeface_test_projectxgYxLI/feature_file
DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file
2017-03-25 12:31:59 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file with ID 24
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file with ID 24
2017-03-25 12:31:59 [codeface.dbmanager] MainProcess INFO: Adding 3 new 
releases...
INFO:codeface.dbmanager:Adding 3 new releases...
2017-03-25 12:31:59 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file with ID 24
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file with ID 24
2017-03-25 12:31:59 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> Revision range 
v0_release..v1_release: Analysing commits...
INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: Analysing 
commits...
DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
2017-03-25 12:31:59 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Creating 
data base for v0_release..v1_release
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Creating data base for v0_release..v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v0_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v1_rc_1..v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git log --no-merges -M -C 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release -- src/carp.c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git ls-tree --name-only --full-tree 
-r v1_release
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git blame -p -w -C -M v1_release -- 
src/carp.c
DEBUG:codeface.util:Running command: /usr/bin/env cppstats --kind 
featurelocations --file /tmp/tmpnNwAFj.c /tmp/tmppsaMRI.csv
Blame Analysis: 100% |######################################################| 
Time: 0:00:00
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
Pass 1/2: 100% |############################################################| 
Time: 0:00:00
2017-03-25 12:31:59 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Shelving 
the VCS object
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Shelving the VCS object
2017-03-25 12:31:59 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Finished 
shelving the VCS object
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Finished shelving the VCS object
2017-03-25 12:31:59 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file with ID 24
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file with ID 24
2017-03-25 12:31:59 [codeface.cluster.cluster] MainProcess DEVINFO: Reading 
from data base 
/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/results/codeface_test_projectxgYxLI/feature_file/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Reading from data base 
/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/results/codeface_test_projectxgYxLI/feature_file/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
2017-03-25 12:31:59 [codeface.VCS] MainProcess DEVINFO: Using cached data to 
extract commit information
DEVINFO:codeface.VCS:Using cached data to extract commit information
2017-03-25 12:31:59 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file with ID 24
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file with ID 24
info: inserting/updating user Adam Awkward <adam@xxxxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Louie Loner <louie@xxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Peter Popular <peter@xxxxxxxxx>
info: inserting/updating user Bill Bully <bill@xxxxxxxxxxx>
2017-03-25 12:31:59 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file with ID 24
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file with ID 24
2017-03-25 12:31:59 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file with ID 24
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file with ID 24
2017-03-25 12:31:59 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: Using project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file with ID 24
DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectxgYxLI/feature_file with ID 24
2017-03-25 12:31:59 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> Revision range 
v0_release..v1_release: Commit analysis done.
INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: Commit analysis 
done.
2017-03-25 12:31:59 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> Revision range 
v0_release..v1_release: Detecting clusters...
INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: Detecting 
clusters...
DEBUG:codeface.util:Running command: /vagrant/codeface/R/cluster/persons.r 
--loglevel devinfo --logfile /tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectxgYxLIFS6pRR 
/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/results/codeface_test_projectxgYxLI/feature_file/v0_release-v1_release
 23
: No such file or directory
2017-03-25 12:31:59 [codeface.util] MainProcess ERROR: Command 
'/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel devinfo --logfile 
/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/log.R.r0 -c /vagrant/codeface.conf -p 
/tmp/codeface_test_projectxgYxLIFS6pRR 
/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/results/codeface_test_projectxgYxLI/feature_file/v0_release-v1_release
 23' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)
ERROR:codeface.util:Command '/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel 
devinfo --logfile /tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectxgYxLIFS6pRR 
/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/results/codeface_test_projectxgYxLI/feature_file/v0_release-v1_release
 23' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)
Left directory '/tmp/codeface_test_projectxgYxLI' for inspection.
EDEVINFO:codeface:Opened logfile '/tmp/tmpfWx1ND' with log level 'devinfo'
DEBUG:codeface.test.integration.test_logger:Should not be in logfile! :-(
INFO:codeface.test.integration.test_logger:Should be in logfile :-)
DEVINFO:codeface.test.integration.test_logger:Should be in logfile :-)
WARNING:codeface.test.integration.test_logger:Should really be in logfile :-D
DEVINFO:codeface:Stopped logging into logfile '/tmp/tmpfWx1ND'
.WARNING:codeface.test.integration.test_logger::-)
INFO:codeface.test.integration.test_logger::-(
DEVINFO:codeface.test.integration.test_logger::-(
WARNING:codeface.test.integration.test_logger::-)
INFO:codeface.test.integration.test_logger::-)
DEVINFO:codeface.test.integration.test_logger::-(
DEVINFO:codeface.test.integration.test_logger::-)
DEBUG:codeface.test.integration.test_logger::-(
DEBUG:codeface.test.integration.test_logger::-)
.
======================================================================
ERROR: testEndToEnd (integration.test_exampleprojects.TestEndToEndExample1C2A)
----------------------------------------------------------------------
Traceback (most recent call last):
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 250, 
in testEndToEnd
    self.analyseEndToEnd()
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, 
in analyseEndToEnd
    load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
    return run(sys.argv)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
    return args.func(args)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
    args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
  File "/vagrant/codeface/project.py", line 136, in project_analyse
    endmsg=prefix + "Detecting clusters done."
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
    func(*args, **kwargs)
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 279, in execute_command
    raise Exception(msg)
Exception: Command '/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel devinfo 
--logfile /tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectaqwauOeqqtdc 
/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git/results/codeface_test_projectaqwauO/committer2author/v0_release-v1_release
 13' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)

======================================================================
ERROR: testEndToEnd (integration.test_exampleprojects.TestEndToEndExample1Tag)
----------------------------------------------------------------------
Traceback (most recent call last):
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 250, 
in testEndToEnd
    self.analyseEndToEnd()
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, 
in analyseEndToEnd
    load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
    return run(sys.argv)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
    return args.func(args)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
    args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
  File "/vagrant/codeface/project.py", line 136, in project_analyse
    endmsg=prefix + "Detecting clusters done."
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
    func(*args, **kwargs)
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 279, in execute_command
    raise Exception(msg)
Exception: Command '/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel devinfo 
--logfile /tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectwkUxXCtXmzE4 
/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/results/codeface_test_projectwkUxXC/tag/v0_release-v1_release
 15' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)

======================================================================
ERROR: testEndToEnd 
(integration.test_exampleprojects.TestEndToEndExample2Proximity)
----------------------------------------------------------------------
Traceback (most recent call last):
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 250, 
in testEndToEnd
    self.analyseEndToEnd()
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, 
in analyseEndToEnd
    load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
    return run(sys.argv)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
    return args.func(args)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
    args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
  File "/vagrant/codeface/project.py", line 136, in project_analyse
    endmsg=prefix + "Detecting clusters done."
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
    func(*args, **kwargs)
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 279, in execute_command
    raise Exception(msg)
Exception: Command '/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel devinfo 
--logfile /tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectxUL38QIh7WMP 
/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/results/codeface_test_projectxUL38Q/proximity/v0_release-v1_release
 17' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)

======================================================================
ERROR: testEndToEnd (integration.test_exampleprojects.TestEndToEndExample2Tag)
----------------------------------------------------------------------
Traceback (most recent call last):
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 250, 
in testEndToEnd
    self.analyseEndToEnd()
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, 
in analyseEndToEnd
    load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
    return run(sys.argv)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
    return args.func(args)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
    args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
  File "/vagrant/codeface/project.py", line 136, in project_analyse
    endmsg=prefix + "Detecting clusters done."
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
    func(*args, **kwargs)
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 279, in execute_command
    raise Exception(msg)
Exception: Command '/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel devinfo 
--logfile /tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectoT4jpBt6cUK_ 
/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/results/codeface_test_projectoT4jpB/tag/v0_release-v1_release
 19' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)

======================================================================
ERROR: testEndToEnd 
(integration.test_features.TestEndToEndOnlyTaggingExample3Feature)
----------------------------------------------------------------------
Traceback (most recent call last):
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_features.py", line 44, in 
testEndToEnd
    self.analyseEndToEnd()
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, 
in analyseEndToEnd
    load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
    return run(sys.argv)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
    return args.func(args)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
    args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
  File "/vagrant/codeface/project.py", line 136, in project_analyse
    endmsg=prefix + "Detecting clusters done."
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
    func(*args, **kwargs)
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 279, in execute_command
    raise Exception(msg)
Exception: Command '/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel devinfo 
--logfile /tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectJkJLTLWsVAQc 
/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/results/codeface_test_projectJkJLTL/feature/v0_release-v1_release
 21' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)

======================================================================
ERROR: testEndToEnd 
(integration.test_features.TestEndToEndOnlyTaggingExample3Feature_File)
----------------------------------------------------------------------
Traceback (most recent call last):
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_features.py", line 44, in 
testEndToEnd
    self.analyseEndToEnd()
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, 
in analyseEndToEnd
    load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
    return run(sys.argv)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
    return args.func(args)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
    args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
  File "/vagrant/codeface/project.py", line 136, in project_analyse
    endmsg=prefix + "Detecting clusters done."
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
    func(*args, **kwargs)
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 279, in execute_command
    raise Exception(msg)
Exception: Command '/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel devinfo 
--logfile /tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectxgYxLIFS6pRR 
/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/results/codeface_test_projectxgYxLI/feature_file/v0_release-v1_release
 23' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)

----------------------------------------------------------------------
Ran 8 tests in 4.039s

FAILED (errors=6)

===== Some unit or integration tests failed :( =====
Error in integration test: testEndToEnd 
(integration.test_exampleprojects.TestEndToEndExample1C2A)
                   Result: Traceback (most recent call last):
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 250, 
in testEndToEnd
    self.analyseEndToEnd()
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, 
in analyseEndToEnd
    load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
    return run(sys.argv)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
    return args.func(args)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
    args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
  File "/vagrant/codeface/project.py", line 136, in project_analyse
    endmsg=prefix + "Detecting clusters done."
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
    func(*args, **kwargs)
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 279, in execute_command
    raise Exception(msg)
Exception: Command '/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel devinfo 
--logfile /tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectaqwauOeqqtdc 
/tmp/codeface_test_projectaqwauO/.git/results/codeface_test_projectaqwauO/committer2author/v0_release-v1_release
 13' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)



Error in integration test: testEndToEnd 
(integration.test_exampleprojects.TestEndToEndExample1Tag)
                   Result: Traceback (most recent call last):
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 250, 
in testEndToEnd
    self.analyseEndToEnd()
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, 
in analyseEndToEnd
    load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
    return run(sys.argv)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
    return args.func(args)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
    args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
  File "/vagrant/codeface/project.py", line 136, in project_analyse
    endmsg=prefix + "Detecting clusters done."
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
    func(*args, **kwargs)
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 279, in execute_command
    raise Exception(msg)
Exception: Command '/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel devinfo 
--logfile /tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectwkUxXCtXmzE4 
/tmp/codeface_test_projectwkUxXC/.git/results/codeface_test_projectwkUxXC/tag/v0_release-v1_release
 15' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)



Error in integration test: testEndToEnd 
(integration.test_exampleprojects.TestEndToEndExample2Proximity)
                   Result: Traceback (most recent call last):
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 250, 
in testEndToEnd
    self.analyseEndToEnd()
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, 
in analyseEndToEnd
    load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
    return run(sys.argv)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
    return args.func(args)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
    args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
  File "/vagrant/codeface/project.py", line 136, in project_analyse
    endmsg=prefix + "Detecting clusters done."
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
    func(*args, **kwargs)
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 279, in execute_command
    raise Exception(msg)
Exception: Command '/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel devinfo 
--logfile /tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectxUL38QIh7WMP 
/tmp/codeface_test_projectxUL38Q/.git/results/codeface_test_projectxUL38Q/proximity/v0_release-v1_release
 17' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)



Error in integration test: testEndToEnd 
(integration.test_exampleprojects.TestEndToEndExample2Tag)
                   Result: Traceback (most recent call last):
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 250, 
in testEndToEnd
    self.analyseEndToEnd()
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, 
in analyseEndToEnd
    load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
    return run(sys.argv)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
    return args.func(args)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
    args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
  File "/vagrant/codeface/project.py", line 136, in project_analyse
    endmsg=prefix + "Detecting clusters done."
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
    func(*args, **kwargs)
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 279, in execute_command
    raise Exception(msg)
Exception: Command '/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel devinfo 
--logfile /tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectoT4jpBt6cUK_ 
/tmp/codeface_test_projectoT4jpB/.git/results/codeface_test_projectoT4jpB/tag/v0_release-v1_release
 19' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)



Error in integration test: testEndToEnd 
(integration.test_features.TestEndToEndOnlyTaggingExample3Feature)
                   Result: Traceback (most recent call last):
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_features.py", line 44, in 
testEndToEnd
    self.analyseEndToEnd()
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, 
in analyseEndToEnd
    load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
    return run(sys.argv)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
    return args.func(args)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
    args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
  File "/vagrant/codeface/project.py", line 136, in project_analyse
    endmsg=prefix + "Detecting clusters done."
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
    func(*args, **kwargs)
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 279, in execute_command
    raise Exception(msg)
Exception: Command '/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel devinfo 
--logfile /tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectJkJLTLWsVAQc 
/tmp/codeface_test_projectJkJLTL/.git/results/codeface_test_projectJkJLTL/feature/v0_release-v1_release
 21' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)



Error in integration test: testEndToEnd 
(integration.test_features.TestEndToEndOnlyTaggingExample3Feature_File)
                   Result: Traceback (most recent call last):
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_features.py", line 44, in 
testEndToEnd
    self.analyseEndToEnd()
  File "/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, 
in analyseEndToEnd
    load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
    return run(sys.argv)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
    return args.func(args)
  File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
    args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
  File "/vagrant/codeface/project.py", line 136, in project_analyse
    endmsg=prefix + "Detecting clusters done."
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
    func(*args, **kwargs)
  File "/vagrant/codeface/util.py", line 279, in execute_command
    raise Exception(msg)
Exception: Command '/vagrant/codeface/R/cluster/persons.r --loglevel devinfo 
--logfile /tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/log.R.r0 -c 
/vagrant/codeface.conf -p /tmp/codeface_test_projectxgYxLIFS6pRR 
/tmp/codeface_test_projectxgYxLI/.git/results/codeface_test_projectxgYxLI/feature_file/v0_release-v1_release
 23' failed with exit code 127.
(stdout: None
stderr: None)
vagrant@vagrant-ubuntu-trusty-64:~$ sudo apt-get install npm
Reading package lists... Done
Building dependency tree
Reading state information... Done
The following extra packages will be installed:
  gyp javascript-common libc-ares-dev libjs-node-uuid libv8-3.14-dev
  node-abbrev node-ansi node-archy node-async node-block-stream
  node-combined-stream node-cookie-jar node-delayed-stream node-forever-agent
  node-form-data node-fstream node-fstream-ignore node-github-url-from-git
  node-glob node-graceful-fs node-gyp node-inherits node-ini
  node-json-stringify-safe node-lockfile node-lru-cache node-mime
  node-minimatch node-mkdirp node-mute-stream node-node-uuid node-nopt
  node-normalize-package-data node-npmlog node-once node-osenv node-qs
  node-read node-read-package-json node-request node-retry node-rimraf
  node-semver node-sha node-sigmund node-slide node-tar node-tunnel-agent
  node-which nodejs-dev
Suggested packages:
  apache2 lighttpd httpd node-hawk node-aws-sign node-oauth-sign
  node-http-signature
The following NEW packages will be installed:
  gyp javascript-common libc-ares-dev libjs-node-uuid libv8-3.14-dev
  node-abbrev node-ansi node-archy node-async node-block-stream
  node-combined-stream node-cookie-jar node-delayed-stream node-forever-agent
  node-form-data node-fstream node-fstream-ignore node-github-url-from-git
  node-glob node-graceful-fs node-gyp node-inherits node-ini
  node-json-stringify-safe node-lockfile node-lru-cache node-mime
  node-minimatch node-mkdirp node-mute-stream node-node-uuid node-nopt
  node-normalize-package-data node-npmlog node-once node-osenv node-qs
  node-read node-read-package-json node-request node-retry node-rimraf
  node-semver node-sha node-sigmund node-slide node-tar node-tunnel-agent
  node-which nodejs-dev npm
0 upgraded, 51 newly installed, 0 to remove and 0 not upgraded.
Need to get 1,318 kB of archives.
After this operation, 6,557 kB of additional disk space will be used.
Do you want to continue? [Y/n] y
Get:1 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe gyp all ;
0.1~svn1729-3ubuntu1 [201 kB]
Get:2 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/main javascript-common all 11 ;
[6,066 B]
Get:3 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe libjs-node-uuid all ;
1.4.0-1 [11.1 kB]
Get:4 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe libv8-3.14-dev amd64 ;
3.14.5.8-5ubuntu2 [57.6 kB]
Get:5 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-async all 0.2.5-1 ;
[17.7 kB]
Get:6 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-node-uuid all ;
1.4.0-1 [2,530 B]
Get:7 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty-updates/main libc-ares-dev amd64 ;
1.10.0-2ubuntu0.1 [97.8 kB]
Get:8 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-abbrev all 1.0.4-2 ;
[3,814 B]
Get:9 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-ansi all 0.2.1-1 ;
[8,692 B]
Get:10 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-archy all 0.0.2-1 ;
[3,660 B]
Get:11 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-inherits all ;
2.0.0-1 [3,090 B]
Get:12 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-block-stream all ;
0.0.7-1 [4,832 B]
Get:13 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-delayed-stream ;
all 0.0.5-1 [4,750 B]
Get:14 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-combined-stream ;
all 0.0.4-1 [4,686 B]
Get:15 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-cookie-jar all ;
0.3.1-1 [3,746 B]
Get:16 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-forever-agent all ;
0.5.1-1 [3,194 B]
Get:17 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-mime all 1.2.11-1 ;
[20.2 kB]
Get:18 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-form-data all ;
0.1.0-1 [6,412 B]
Get:19 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-rimraf all ;
2.2.2-2 [5,392 B]
Get:20 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-mkdirp all ;
0.3.5-1 [4,146 B]
Get:21 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-graceful-fs all ;
2.0.0-2 [6,718 B]
Get:22 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-fstream all ;
0.1.24-1 [19.5 kB]
Get:23 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-lru-cache all ;
2.3.1-1 [5,674 B]
Get:24 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-sigmund all ;
1.0.0-1 [3,818 B]
Get:25 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-minimatch all ;
0.2.12-1 [14.9 kB]
Get:26 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-fstream-ignore ;
all 0.0.6-2 [5,586 B]
Get:27 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe ;
node-github-url-from-git all 1.1.1-1 [3,138 B]
Get:28 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-glob all 3.2.6-1 ;
[13.7 kB]
Get:29 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe nodejs-dev amd64 ;
0.10.25~dfsg2-2ubuntu1 [169 kB]
Get:30 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-nopt all 2.1.2-1 ;
[11.8 kB]
Get:31 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-npmlog all ;
0.0.4-1 [5,844 B]
Get:32 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-osenv all 0.0.3-1 ;
[3,810 B]
Get:33 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-tunnel-agent all ;
0.3.1-1 [4,018 B]
Get:34 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe ;
node-json-stringify-safe all 5.0.0-1 [3,544 B]
Get:35 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-qs all 0.6.5-1 ;
[5,876 B]
Get:36 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-request all ;
2.26.1-1 [14.5 kB]
Get:37 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-semver all ;
2.1.0-2 [16.2 kB]
Get:38 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-tar all 0.1.18-1 ;
[18.3 kB]
Get:39 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-which all 1.0.5-2 ;
[3,678 B]
Get:40 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-gyp all 0.10.10-2 ;
[22.6 kB]
Get:41 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-ini all 1.1.0-1 ;
[4,770 B]
Get:42 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-lockfile all ;
0.4.1-1 [5,450 B]
Get:43 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-mute-stream all ;
0.0.3-1 [3,738 B]
Get:44 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe ;
node-normalize-package-data all 0.2.2-1 [9,286 B]
Get:45 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-once all 1.1.1-1 ;
[2,608 B]
Get:46 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-read all 1.0.4-1 ;
[4,282 B]
Get:47 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-read-package-json ;
all 1.1.3-1 [7,762 B]
Get:48 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-retry all 0.6.0-1 ;
[6,172 B]
Get:49 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-sha all 1.2.3-1 ;
[4,272 B]
Get:50 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe node-slide all 1.1.4-1 ;
[6,118 B]
Get:51 http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ trusty/universe npm all 1.3.10~dfsg-1 ;
[442 kB]
Fetched 1,318 kB in 3s (429 kB/s)
Extracting templates from packages: 100%
Selecting previously unselected package gyp.
(Reading database ... 99998 files and directories currently installed.)
Preparing to unpack .../gyp_0.1~svn1729-3ubuntu1_all.deb ...
Unpacking gyp (0.1~svn1729-3ubuntu1) ...
Selecting previously unselected package javascript-common.
Preparing to unpack .../javascript-common_11_all.deb ...
Unpacking javascript-common (11) ...
Selecting previously unselected package libjs-node-uuid.
Preparing to unpack .../libjs-node-uuid_1.4.0-1_all.deb ...
Unpacking libjs-node-uuid (1.4.0-1) ...
Selecting previously unselected package libv8-3.14-dev.
Preparing to unpack .../libv8-3.14-dev_3.14.5.8-5ubuntu2_amd64.deb ...
Unpacking libv8-3.14-dev (3.14.5.8-5ubuntu2) ...
Selecting previously unselected package node-async.
Preparing to unpack .../node-async_0.2.5-1_all.deb ...
Unpacking node-async (0.2.5-1) ...
Selecting previously unselected package node-node-uuid.
Preparing to unpack .../node-node-uuid_1.4.0-1_all.deb ...
Unpacking node-node-uuid (1.4.0-1) ...
Selecting previously unselected package libc-ares-dev:amd64.
Preparing to unpack .../libc-ares-dev_1.10.0-2ubuntu0.1_amd64.deb ...
Unpacking libc-ares-dev:amd64 (1.10.0-2ubuntu0.1) ...
Selecting previously unselected package node-abbrev.
Preparing to unpack .../node-abbrev_1.0.4-2_all.deb ...
Unpacking node-abbrev (1.0.4-2) ...
Selecting previously unselected package node-ansi.
Preparing to unpack .../node-ansi_0.2.1-1_all.deb ...
Unpacking node-ansi (0.2.1-1) ...
Selecting previously unselected package node-archy.
Preparing to unpack .../node-archy_0.0.2-1_all.deb ...
Unpacking node-archy (0.0.2-1) ...
Selecting previously unselected package node-inherits.
Preparing to unpack .../node-inherits_2.0.0-1_all.deb ...
Unpacking node-inherits (2.0.0-1) ...
Selecting previously unselected package node-block-stream.
Preparing to unpack .../node-block-stream_0.0.7-1_all.deb ...
Unpacking node-block-stream (0.0.7-1) ...
Selecting previously unselected package node-delayed-stream.
Preparing to unpack .../node-delayed-stream_0.0.5-1_all.deb ...
Unpacking node-delayed-stream (0.0.5-1) ...
Selecting previously unselected package node-combined-stream.
Preparing to unpack .../node-combined-stream_0.0.4-1_all.deb ...
Unpacking node-combined-stream (0.0.4-1) ...
Selecting previously unselected package node-cookie-jar.
Preparing to unpack .../node-cookie-jar_0.3.1-1_all.deb ...
Unpacking node-cookie-jar (0.3.1-1) ...
Selecting previously unselected package node-forever-agent.
Preparing to unpack .../node-forever-agent_0.5.1-1_all.deb ...
Unpacking node-forever-agent (0.5.1-1) ...
Selecting previously unselected package node-mime.
Preparing to unpack .../node-mime_1.2.11-1_all.deb ...
Unpacking node-mime (1.2.11-1) ...
Selecting previously unselected package node-form-data.
Preparing to unpack .../node-form-data_0.1.0-1_all.deb ...
Unpacking node-form-data (0.1.0-1) ...
Selecting previously unselected package node-rimraf.
Preparing to unpack .../node-rimraf_2.2.2-2_all.deb ...
Unpacking node-rimraf (2.2.2-2) ...
Selecting previously unselected package node-mkdirp.
Preparing to unpack .../node-mkdirp_0.3.5-1_all.deb ...
Unpacking node-mkdirp (0.3.5-1) ...
Selecting previously unselected package node-graceful-fs.
Preparing to unpack .../node-graceful-fs_2.0.0-2_all.deb ...
Unpacking node-graceful-fs (2.0.0-2) ...
Selecting previously unselected package node-fstream.
Preparing to unpack .../node-fstream_0.1.24-1_all.deb ...
Unpacking node-fstream (0.1.24-1) ...
Selecting previously unselected package node-lru-cache.
Preparing to unpack .../node-lru-cache_2.3.1-1_all.deb ...
Unpacking node-lru-cache (2.3.1-1) ...
Selecting previously unselected package node-sigmund.
Preparing to unpack .../node-sigmund_1.0.0-1_all.deb ...
Unpacking node-sigmund (1.0.0-1) ...
Selecting previously unselected package node-minimatch.
Preparing to unpack .../node-minimatch_0.2.12-1_all.deb ...
Unpacking node-minimatch (0.2.12-1) ...
Selecting previously unselected package node-fstream-ignore.
Preparing to unpack .../node-fstream-ignore_0.0.6-2_all.deb ...
Unpacking node-fstream-ignore (0.0.6-2) ...
Selecting previously unselected package node-github-url-from-git.
Preparing to unpack .../node-github-url-from-git_1.1.1-1_all.deb ...
Unpacking node-github-url-from-git (1.1.1-1) ...
Selecting previously unselected package node-glob.
Preparing to unpack .../node-glob_3.2.6-1_all.deb ...
Unpacking node-glob (3.2.6-1) ...
Selecting previously unselected package nodejs-dev.
Preparing to unpack .../nodejs-dev_0.10.25~dfsg2-2ubuntu1_amd64.deb ...
Unpacking nodejs-dev (0.10.25~dfsg2-2ubuntu1) ...
Selecting previously unselected package node-nopt.
Preparing to unpack .../node-nopt_2.1.2-1_all.deb ...
Unpacking node-nopt (2.1.2-1) ...
Selecting previously unselected package node-npmlog.
Preparing to unpack .../node-npmlog_0.0.4-1_all.deb ...
Unpacking node-npmlog (0.0.4-1) ...
Selecting previously unselected package node-osenv.
Preparing to unpack .../node-osenv_0.0.3-1_all.deb ...
Unpacking node-osenv (0.0.3-1) ...
Selecting previously unselected package node-tunnel-agent.
Preparing to unpack .../node-tunnel-agent_0.3.1-1_all.deb ...
Unpacking node-tunnel-agent (0.3.1-1) ...
Selecting previously unselected package node-json-stringify-safe.
Preparing to unpack .../node-json-stringify-safe_5.0.0-1_all.deb ...
Unpacking node-json-stringify-safe (5.0.0-1) ...
Selecting previously unselected package node-qs.
Preparing to unpack .../node-qs_0.6.5-1_all.deb ...
Unpacking node-qs (0.6.5-1) ...
Selecting previously unselected package node-request.
Preparing to unpack .../node-request_2.26.1-1_all.deb ...
Unpacking node-request (2.26.1-1) ...
Selecting previously unselected package node-semver.
Preparing to unpack .../node-semver_2.1.0-2_all.deb ...
Unpacking node-semver (2.1.0-2) ...
Selecting previously unselected package node-tar.
Preparing to unpack .../node-tar_0.1.18-1_all.deb ...
Unpacking node-tar (0.1.18-1) ...
Selecting previously unselected package node-which.
Preparing to unpack .../node-which_1.0.5-2_all.deb ...
Unpacking node-which (1.0.5-2) ...
Selecting previously unselected package node-gyp.
Preparing to unpack .../node-gyp_0.10.10-2_all.deb ...
Unpacking node-gyp (0.10.10-2) ...
Selecting previously unselected package node-ini.
Preparing to unpack .../node-ini_1.1.0-1_all.deb ...
Unpacking node-ini (1.1.0-1) ...
Selecting previously unselected package node-lockfile.
Preparing to unpack .../node-lockfile_0.4.1-1_all.deb ...
Unpacking node-lockfile (0.4.1-1) ...
Selecting previously unselected package node-mute-stream.
Preparing to unpack .../node-mute-stream_0.0.3-1_all.deb ...
Unpacking node-mute-stream (0.0.3-1) ...
Selecting previously unselected package node-normalize-package-data.
Preparing to unpack .../node-normalize-package-data_0.2.2-1_all.deb ...
Unpacking node-normalize-package-data (0.2.2-1) ...
Selecting previously unselected package node-once.
Preparing to unpack .../node-once_1.1.1-1_all.deb ...
Unpacking node-once (1.1.1-1) ...
Selecting previously unselected package node-read.
Preparing to unpack .../node-read_1.0.4-1_all.deb ...
Unpacking node-read (1.0.4-1) ...
Selecting previously unselected package node-read-package-json.
Preparing to unpack .../node-read-package-json_1.1.3-1_all.deb ...
Unpacking node-read-package-json (1.1.3-1) ...
Selecting previously unselected package node-retry.
Preparing to unpack .../node-retry_0.6.0-1_all.deb ...
Unpacking node-retry (0.6.0-1) ...
Selecting previously unselected package node-sha.
Preparing to unpack .../node-sha_1.2.3-1_all.deb ...
Unpacking node-sha (1.2.3-1) ...
Selecting previously unselected package node-slide.
Preparing to unpack .../node-slide_1.1.4-1_all.deb ...
Unpacking node-slide (1.1.4-1) ...
Selecting previously unselected package npm.
Preparing to unpack .../npm_1.3.10~dfsg-1_all.deb ...
Unpacking npm (1.3.10~dfsg-1) ...
Processing triggers for man-db (2.6.7.1-1ubuntu1) ...
Setting up gyp (0.1~svn1729-3ubuntu1) ...
Setting up javascript-common (11) ...
Setting up libjs-node-uuid (1.4.0-1) ...
Setting up libv8-3.14-dev (3.14.5.8-5ubuntu2) ...
Setting up node-async (0.2.5-1) ...
Setting up node-node-uuid (1.4.0-1) ...
Setting up libc-ares-dev:amd64 (1.10.0-2ubuntu0.1) ...
Setting up node-abbrev (1.0.4-2) ...
Setting up node-ansi (0.2.1-1) ...
Setting up node-archy (0.0.2-1) ...
Setting up node-inherits (2.0.0-1) ...
Setting up node-block-stream (0.0.7-1) ...
Setting up node-delayed-stream (0.0.5-1) ...
Setting up node-combined-stream (0.0.4-1) ...
Setting up node-cookie-jar (0.3.1-1) ...
Setting up node-forever-agent (0.5.1-1) ...
Setting up node-mime (1.2.11-1) ...
Setting up node-form-data (0.1.0-1) ...
Setting up node-rimraf (2.2.2-2) ...
Setting up node-mkdirp (0.3.5-1) ...
Setting up node-graceful-fs (2.0.0-2) ...
Setting up node-fstream (0.1.24-1) ...
Setting up node-lru-cache (2.3.1-1) ...
Setting up node-sigmund (1.0.0-1) ...
Setting up node-minimatch (0.2.12-1) ...
Setting up node-fstream-ignore (0.0.6-2) ...
Setting up node-github-url-from-git (1.1.1-1) ...
Setting up node-glob (3.2.6-1) ...
Setting up nodejs-dev (0.10.25~dfsg2-2ubuntu1) ...
Setting up node-nopt (2.1.2-1) ...
Setting up node-npmlog (0.0.4-1) ...
Setting up node-osenv (0.0.3-1) ...
Setting up node-tunnel-agent (0.3.1-1) ...
Setting up node-json-stringify-safe (5.0.0-1) ...
Setting up node-qs (0.6.5-1) ...
Setting up node-request (2.26.1-1) ...
Setting up node-semver (2.1.0-2) ...
Setting up node-tar (0.1.18-1) ...
Setting up node-which (1.0.5-2) ...
Setting up node-gyp (0.10.10-2) ...
Setting up node-ini (1.1.0-1) ...
Setting up node-lockfile (0.4.1-1) ...
Setting up node-mute-stream (0.0.3-1) ...
Setting up node-normalize-package-data (0.2.2-1) ...
Setting up node-once (1.1.1-1) ...
Setting up node-read (1.0.4-1) ...
Setting up node-read-package-json (1.1.3-1) ...
Setting up node-retry (0.6.0-1) ...
Setting up node-sha (1.2.3-1) ...
Setting up node-slide (1.1.4-1) ...
Setting up npm (1.3.10~dfsg-1) ...
vagrant@vagrant-ubuntu-trusty-64:~$ sudo apt-get update
Ign http://cran.rstudio.com trusty/ InRelease
Ign http://archive.ubuntu.com trusty InRelease
Hit http://cran.rstudio.com trusty/ Release.gpg
Get:1 http://archive.ubuntu.com trusty-updates InRelease [65.9 kB]
Hit http://cran.rstudio.com trusty/ Release
Hit http://cran.rstudio.com trusty/ Packages
Get:2 http://security.ubuntu.com trusty-security InRelease [65.9 kB]
Hit http://archive.ubuntu.com trusty-backports InRelease
Hit http://archive.ubuntu.com trusty Release.gpg
Get:3 http://archive.ubuntu.com trusty-updates/main Sources [393 kB]
Get:4 http://security.ubuntu.com trusty-security/main Sources [127 kB]
Get:5 http://archive.ubuntu.com trusty-updates/restricted Sources [6,327 B]
Get:6 http://archive.ubuntu.com trusty-updates/universe Sources [175 kB]
Get:7 http://archive.ubuntu.com trusty-updates/multiverse Sources [7,763 B]
Get:8 http://security.ubuntu.com trusty-security/universe Sources [50.3 kB]
Get:9 http://archive.ubuntu.com trusty-updates/main amd64 Packages [963 kB]
Get:10 http://security.ubuntu.com trusty-security/main amd64 Packages [594 kB]
Ign http://cran.rstudio.com trusty/ Translation-en_US
Ign http://cran.rstudio.com trusty/ Translation-en
Get:11 http://archive.ubuntu.com trusty-updates/restricted amd64 Packages [17.1 ;
kB]
Get:12 http://archive.ubuntu.com trusty-updates/universe amd64 Packages [401 kB]
Get:13 http://archive.ubuntu.com trusty-updates/multiverse amd64 Packages [14.3 ;
kB]
Hit http://archive.ubuntu.com trusty-updates/main Translation-en
Hit http://archive.ubuntu.com trusty-updates/multiverse Translation-en
Hit http://archive.ubuntu.com trusty-updates/restricted Translation-en
Hit http://archive.ubuntu.com trusty-updates/universe Translation-en
Hit http://archive.ubuntu.com trusty-backports/main Sources
Get:14 http://security.ubuntu.com trusty-security/universe amd64 Packages [155 ;
kB]
Hit http://archive.ubuntu.com trusty-backports/restricted Sources
Hit http://archive.ubuntu.com trusty-backports/universe Sources
Hit http://archive.ubuntu.com trusty-backports/multiverse Sources
Hit http://archive.ubuntu.com trusty-backports/main amd64 Packages
Hit http://archive.ubuntu.com trusty-backports/restricted amd64 Packages
Hit http://archive.ubuntu.com trusty-backports/universe amd64 Packages
Hit http://archive.ubuntu.com trusty-backports/multiverse amd64 Packages
Hit http://security.ubuntu.com trusty-security/main Translation-en
Hit http://archive.ubuntu.com trusty-backports/main Translation-en
Hit http://archive.ubuntu.com trusty-backports/multiverse Translation-en
Hit http://archive.ubuntu.com trusty-backports/restricted Translation-en
Hit http://security.ubuntu.com trusty-security/universe Translation-en
Hit http://archive.ubuntu.com trusty-backports/universe Translation-en
Hit http://archive.ubuntu.com trusty Release
Hit http://archive.ubuntu.com trusty/main Sources
Hit http://archive.ubuntu.com trusty/restricted Sources
Hit http://archive.ubuntu.com trusty/universe Sources
Hit http://archive.ubuntu.com trusty/multiverse Sources
Hit http://archive.ubuntu.com trusty/main amd64 Packages
Hit http://archive.ubuntu.com trusty/restricted amd64 Packages
Hit http://archive.ubuntu.com trusty/universe amd64 Packages
Hit http://archive.ubuntu.com trusty/multiverse amd64 Packages
Hit http://archive.ubuntu.com trusty/main Translation-en
Hit http://archive.ubuntu.com trusty/multiverse Translation-en
Hit http://archive.ubuntu.com trusty/restricted Translation-en
Hit http://archive.ubuntu.com trusty/universe Translation-en
Ign http://archive.ubuntu.com trusty/main Translation-en_US
Ign http://archive.ubuntu.com trusty/multiverse Translation-en_US
Ign http://archive.ubuntu.com trusty/restricted Translation-en_US
Ign http://archive.ubuntu.com trusty/universe Translation-en_US
Fetched 3,036 kB in 4s (714 kB/s)
Reading package lists... Done
vagrant@vagrant-ubuntu-trusty-64:~$ cd /vagrant/id_service
vagrant@vagrant-ubuntu-trusty-64:/vagrant/id_service$ npm install --no-bin-links
npm WARN package.json id_service@1.0.0 No description
npm WARN package.json id_service@1.0.0 No repository field.
npm WARN package.json id_service@1.0.0 No README data
npm http GET https://registry.npmjs.org/express
npm http GET https://registry.npmjs.org/js-yaml
npm http GET https://registry.npmjs.org/mysql
npm http GET https://registry.npmjs.org/body-parser
npm http GET https://registry.npmjs.org/addressparser
npm http 200 https://registry.npmjs.org/addressparser
npm http GET https://registry.npmjs.org/addressparser/-/addressparser-0.3.2.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/js-yaml
npm http 200 https://registry.npmjs.org/mysql
npm http 200 https://registry.npmjs.org/body-parser
npm http GET https://registry.npmjs.org/js-yaml/-/js-yaml-3.8.2.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/mysql/-/mysql-2.13.0.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/body-parser/-/body-parser-1.17.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/addressparser/-/addressparser-0.3.2.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/js-yaml/-/js-yaml-3.8.2.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/mysql/-/mysql-2.13.0.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/body-parser/-/body-parser-1.17.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/express
npm http GET https://registry.npmjs.org/express/-/express-4.15.2.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/express/-/express-4.15.2.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/depd
npm http GET https://registry.npmjs.org/http-errors
npm http GET https://registry.npmjs.org/iconv-lite/0.4.15
npm http GET https://registry.npmjs.org/on-finished
npm http GET https://registry.npmjs.org/qs/6.4.0
npm http GET https://registry.npmjs.org/raw-body
npm http GET https://registry.npmjs.org/type-is
npm http GET https://registry.npmjs.org/bytes/2.4.0
npm http GET https://registry.npmjs.org/content-type
npm http GET https://registry.npmjs.org/debug/2.6.1
npm http 200 https://registry.npmjs.org/qs/6.4.0
npm http GET https://registry.npmjs.org/qs/-/qs-6.4.0.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/depd
npm http 200 https://registry.npmjs.org/http-errors
npm http 200 https://registry.npmjs.org/on-finished
npm http GET https://registry.npmjs.org/depd/-/depd-1.1.0.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/http-errors/-/http-errors-1.6.1.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/on-finished/-/on-finished-2.3.0.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/content-type
npm http GET https://registry.npmjs.org/content-type/-/content-type-1.0.2.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/type-is
npm http 200 https://registry.npmjs.org/debug/2.6.1
npm http 200 https://registry.npmjs.org/raw-body
npm http GET https://registry.npmjs.org/type-is/-/type-is-1.6.14.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/raw-body/-/raw-body-2.2.0.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/debug/-/debug-2.6.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/qs/-/qs-6.4.0.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/http-errors/-/http-errors-1.6.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/depd/-/depd-1.1.0.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/on-finished/-/on-finished-2.3.0.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/type-is/-/type-is-1.6.14.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/raw-body/-/raw-body-2.2.0.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/debug/-/debug-2.6.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/content-type/-/content-type-1.0.2.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/iconv-lite/0.4.15
npm http GET https://registry.npmjs.org/iconv-lite/-/iconv-lite-0.4.15.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/bytes/2.4.0
npm http GET https://registry.npmjs.org/bytes/-/bytes-2.4.0.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/iconv-lite/-/iconv-lite-0.4.15.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/bytes/-/bytes-2.4.0.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/array-flatten/1.1.1
npm http GET https://registry.npmjs.org/cookie/0.3.1
npm http GET https://registry.npmjs.org/content-disposition/0.5.2
npm http GET https://registry.npmjs.org/cookie-signature/1.0.6
npm http GET https://registry.npmjs.org/encodeurl
npm http GET https://registry.npmjs.org/escape-html
npm http GET https://registry.npmjs.org/etag
npm http GET https://registry.npmjs.org/finalhandler
npm http GET https://registry.npmjs.org/fresh/0.5.0
npm http GET https://registry.npmjs.org/merge-descriptors/1.0.1
npm http GET https://registry.npmjs.org/methods
npm http GET https://registry.npmjs.org/parseurl
npm http GET https://registry.npmjs.org/path-to-regexp/0.1.7
npm http GET https://registry.npmjs.org/proxy-addr
npm http GET https://registry.npmjs.org/range-parser
npm http GET https://registry.npmjs.org/send/0.15.1
npm http GET https://registry.npmjs.org/serve-static/1.12.1
npm http GET https://registry.npmjs.org/setprototypeof/1.0.3
npm http GET https://registry.npmjs.org/statuses
npm http GET https://registry.npmjs.org/utils-merge/1.0.0
npm http GET https://registry.npmjs.org/vary
npm http GET https://registry.npmjs.org/accepts
npm http 200 https://registry.npmjs.org/array-flatten/1.1.1
npm http 200 https://registry.npmjs.org/cookie/0.3.1
npm http 200 https://registry.npmjs.org/cookie-signature/1.0.6
npm http 200 https://registry.npmjs.org/content-disposition/0.5.2
npm http 200 https://registry.npmjs.org/encodeurl
npm http GET https://registry.npmjs.org/cookie/-/cookie-0.3.1.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/array-flatten/-/array-flatten-1.1.1.tgz
npm http GET 
https://registry.npmjs.org/cookie-signature/-/cookie-signature-1.0.6.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/encodeurl/-/encodeurl-1.0.1.tgz
npm http GET 
https://registry.npmjs.org/content-disposition/-/content-disposition-0.5.2.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/escape-html
npm http 200 https://registry.npmjs.org/fresh/0.5.0
npm http 200 https://registry.npmjs.org/merge-descriptors/1.0.1
npm http GET https://registry.npmjs.org/escape-html/-/escape-html-1.0.3.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/fresh/-/fresh-0.5.0.tgz
npm http GET 
https://registry.npmjs.org/merge-descriptors/-/merge-descriptors-1.0.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/etag
npm http 200 https://registry.npmjs.org/path-to-regexp/0.1.7
npm http 200 https://registry.npmjs.org/methods
npm http 200 https://registry.npmjs.org/finalhandler
npm http GET https://registry.npmjs.org/etag/-/etag-1.8.0.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/methods/-/methods-1.1.2.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/parseurl
npm http GET 
https://registry.npmjs.org/path-to-regexp/-/path-to-regexp-0.1.7.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/finalhandler/-/finalhandler-1.0.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/send/0.15.1
npm http 200 https://registry.npmjs.org/serve-static/1.12.1
npm http 200 https://registry.npmjs.org/range-parser
npm http 200 https://registry.npmjs.org/setprototypeof/1.0.3
npm http 200 https://registry.npmjs.org/proxy-addr
npm http GET https://registry.npmjs.org/parseurl/-/parseurl-1.3.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/utils-merge/1.0.0
npm http GET https://registry.npmjs.org/send/-/send-0.15.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/cookie/-/cookie-0.3.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/array-flatten/-/array-flatten-1.1.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/vary
npm http GET https://registry.npmjs.org/serve-static/-/serve-static-1.12.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/statuses
npm http 200 
https://registry.npmjs.org/content-disposition/-/content-disposition-0.5.2.tgz
npm http 200 
https://registry.npmjs.org/cookie-signature/-/cookie-signature-1.0.6.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/encodeurl/-/encodeurl-1.0.1.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/range-parser/-/range-parser-1.2.0.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/proxy-addr/-/proxy-addr-1.1.4.tgz
npm http GET 
https://registry.npmjs.org/setprototypeof/-/setprototypeof-1.0.3.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/escape-html/-/escape-html-1.0.3.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/fresh/-/fresh-0.5.0.tgz
npm http 200 
https://registry.npmjs.org/merge-descriptors/-/merge-descriptors-1.0.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/etag/-/etag-1.8.0.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/methods/-/methods-1.1.2.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/accepts
npm http 200 
https://registry.npmjs.org/path-to-regexp/-/path-to-regexp-0.1.7.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/finalhandler/-/finalhandler-1.0.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/parseurl/-/parseurl-1.3.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/send/-/send-0.15.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/serve-static/-/serve-static-1.12.1.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/utils-merge/-/utils-merge-1.0.0.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/vary/-/vary-1.1.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/range-parser/-/range-parser-1.2.0.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/statuses/-/statuses-1.3.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/proxy-addr/-/proxy-addr-1.1.4.tgz
npm http 200 
https://registry.npmjs.org/setprototypeof/-/setprototypeof-1.0.3.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/accepts/-/accepts-1.3.3.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/statuses/-/statuses-1.3.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/vary/-/vary-1.1.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/utils-merge/-/utils-merge-1.0.0.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/accepts/-/accepts-1.3.3.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/esprima
npm http GET https://registry.npmjs.org/argparse
npm http 200 https://registry.npmjs.org/argparse
npm http 200 https://registry.npmjs.org/esprima
npm http GET https://registry.npmjs.org/argparse/-/argparse-1.0.9.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/esprima/-/esprima-3.1.3.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/argparse/-/argparse-1.0.9.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/esprima/-/esprima-3.1.3.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/ee-first/1.1.1
npm http GET https://registry.npmjs.org/forwarded
npm http GET https://registry.npmjs.org/ipaddr.js/1.3.0
npm http GET https://registry.npmjs.org/unpipe
npm http GET https://registry.npmjs.org/debug/2.6.3
npm http GET https://registry.npmjs.org/mime-types
npm http GET https://registry.npmjs.org/media-typer/0.3.0
npm http GET https://registry.npmjs.org/negotiator/0.6.1
npm http GET https://registry.npmjs.org/mime-types
npm http 200 https://registry.npmjs.org/ee-first/1.1.1
npm http 200 https://registry.npmjs.org/forwarded
npm http 200 https://registry.npmjs.org/ipaddr.js/1.3.0
npm http 200 https://registry.npmjs.org/debug/2.6.3
npm http 200 https://registry.npmjs.org/unpipe
npm http 200 https://registry.npmjs.org/media-typer/0.3.0
npm http 200 https://registry.npmjs.org/negotiator/0.6.1
npm http GET https://registry.npmjs.org/debug/-/debug-2.6.3.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/mime-types
npm http GET https://registry.npmjs.org/forwarded/-/forwarded-0.1.0.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/unpipe/-/unpipe-1.0.0.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/ee-first/-/ee-first-1.1.1.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/ipaddr.js/-/ipaddr.js-1.3.0.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/media-typer/-/media-typer-0.3.0.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/mime-types
npm http GET https://registry.npmjs.org/negotiator/-/negotiator-0.6.1.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/mime-types/-/mime-types-2.1.15.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/ms/0.7.2
npm http GET https://registry.npmjs.org/destroy
npm http GET https://registry.npmjs.org/mime/1.3.4
npm http 200 https://registry.npmjs.org/debug/-/debug-2.6.3.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/forwarded/-/forwarded-0.1.0.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/ipaddr.js/-/ipaddr.js-1.3.0.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/unpipe/-/unpipe-1.0.0.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/ee-first/-/ee-first-1.1.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/media-typer/-/media-typer-0.3.0.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/negotiator/-/negotiator-0.6.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/mime-types/-/mime-types-2.1.15.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/ms/0.7.2
npm http 200 https://registry.npmjs.org/mime/1.3.4
npm http 200 https://registry.npmjs.org/destroy
npm http GET https://registry.npmjs.org/ms/-/ms-0.7.2.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/mime/-/mime-1.3.4.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/destroy/-/destroy-1.0.4.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/mime/-/mime-1.3.4.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/ms/-/ms-0.7.2.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/destroy/-/destroy-1.0.4.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/mime-db
npm http GET https://registry.npmjs.org/bignumber.js/3.1.2
npm http GET https://registry.npmjs.org/readable-stream/1.1.14
npm http GET https://registry.npmjs.org/sqlstring/2.2.0
npm http 200 https://registry.npmjs.org/mime-db
npm http GET https://registry.npmjs.org/mime-db/-/mime-db-1.27.0.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/mime-db/-/mime-db-1.27.0.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/readable-stream/1.1.14
npm http 200 https://registry.npmjs.org/bignumber.js/3.1.2
npm http 200 https://registry.npmjs.org/sqlstring/2.2.0
npm http GET https://registry.npmjs.org/bignumber.js/-/bignumber.js-3.1.2.tgz
npm http GET 
https://registry.npmjs.org/readable-stream/-/readable-stream-1.1.14.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/sqlstring/-/sqlstring-2.2.0.tgz
npm http 200 
https://registry.npmjs.org/readable-stream/-/readable-stream-1.1.14.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/bignumber.js/-/bignumber.js-3.1.2.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/sqlstring/-/sqlstring-2.2.0.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/inherits/2.0.3
npm http GET https://registry.npmjs.org/unpipe/1.0.0
npm http 200 https://registry.npmjs.org/inherits/2.0.3
npm http GET https://registry.npmjs.org/inherits/-/inherits-2.0.3.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/unpipe/1.0.0
npm http 200 https://registry.npmjs.org/inherits/-/inherits-2.0.3.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/unpipe/-/unpipe-1.0.0.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/unpipe/-/unpipe-1.0.0.tgz
npm WARN engine esprima@3.1.3: wanted: {"node":">=4"} (current: 
{"node":"v0.10.25","npm":"1.3.10"})
npm http GET https://registry.npmjs.org/sprintf-js
npm http 200 https://registry.npmjs.org/sprintf-js
npm http GET https://registry.npmjs.org/sprintf-js/-/sprintf-js-1.0.3.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/core-util-is
npm http GET https://registry.npmjs.org/isarray/0.0.1
npm http GET https://registry.npmjs.org/string_decoder
npm http GET https://registry.npmjs.org/inherits
npm http 200 https://registry.npmjs.org/sprintf-js/-/sprintf-js-1.0.3.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/isarray/0.0.1
npm http 200 https://registry.npmjs.org/core-util-is
npm http 200 https://registry.npmjs.org/string_decoder
npm http 200 https://registry.npmjs.org/inherits
npm http GET https://registry.npmjs.org/core-util-is/-/core-util-is-1.0.2.tgz
npm http GET https://registry.npmjs.org/isarray/-/isarray-0.0.1.tgz
npm http GET 
https://registry.npmjs.org/string_decoder/-/string_decoder-0.10.31.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/isarray/-/isarray-0.0.1.tgz
npm http 200 https://registry.npmjs.org/core-util-is/-/core-util-is-1.0.2.tgz
npm http 200 
https://registry.npmjs.org/string_decoder/-/string_decoder-0.10.31.tgz
addressparser@0.3.2 node_modules/addressparser

express@4.15.2 node_modules/express
├── setprototypeof@1.0.3
├── escape-html@1.0.3
├── array-flatten@1.1.1
├── path-to-regexp@0.1.7
├── utils-merge@1.0.0
├── cookie-signature@1.0.6
├── merge-descriptors@1.0.1
├── methods@1.1.2
├── parseurl@1.3.1
├── range-parser@1.2.0
├── encodeurl@1.0.1
├── vary@1.1.1
├── fresh@0.5.0
├── content-type@1.0.2
├── etag@1.8.0
├── statuses@1.3.1
├── cookie@0.3.1
├── content-disposition@0.5.2
├── serve-static@1.12.1
├── depd@1.1.0
├── on-finished@2.3.0 (ee-first@1.1.1)
├── debug@2.6.1 (ms@0.7.2)
├── qs@6.4.0
├── proxy-addr@1.1.4 (forwarded@0.1.0, ipaddr.js@1.3.0)
├── send@0.15.1 (ms@0.7.2, destroy@1.0.4, mime@1.3.4, http-errors@1.6.1)
├── finalhandler@1.0.1 (unpipe@1.0.0, debug@2.6.3)
├── accepts@1.3.3 (negotiator@0.6.1, mime-types@2.1.15)
└── type-is@1.6.14 (media-typer@0.3.0, mime-types@2.1.15)

mysql@2.13.0 node_modules/mysql
├── sqlstring@2.2.0
├── bignumber.js@3.1.2
└── readable-stream@1.1.14 (inherits@2.0.3, isarray@0.0.1, 
string_decoder@0.10.31, core-util-is@1.0.2)

body-parser@1.17.1 node_modules/body-parser
├── content-type@1.0.2
├── bytes@2.4.0
├── depd@1.1.0
├── on-finished@2.3.0 (ee-first@1.1.1)
├── debug@2.6.1 (ms@0.7.2)
├── qs@6.4.0
├── http-errors@1.6.1 (setprototypeof@1.0.3, inherits@2.0.3, statuses@1.3.1)
├── raw-body@2.2.0 (unpipe@1.0.0)
├── iconv-lite@0.4.15
└── type-is@1.6.14 (media-typer@0.3.0, mime-types@2.1.15)

js-yaml@3.8.2 node_modules/js-yaml
├── esprima@3.1.3
└── argparse@1.0.9 (sprintf-js@1.0.3)Bringing machine 'default' up with 'virtualbox' provider...
==> default: Importing base box 'ubuntu/trusty64'...

Progress: 90%
==> default: Matching MAC address for NAT networking...
==> default: Checking if box 'ubuntu/trusty64' is up to date...
==> default: Setting the name of the VM: codeface_default_1490443524758_71155
==> default: Clearing any previously set forwarded ports...
==> default: Clearing any previously set network interfaces...
==> default: Preparing network interfaces based on configuration...
    default: Adapter 1: nat
==> default: Forwarding ports...
    default: 8081 (guest) => 8081 (host) (adapter 1)
    default: 8100 (guest) => 8100 (host) (adapter 1)
    default: 22 (guest) => 2222 (host) (adapter 1)
==> default: Running 'pre-boot' VM customizations...
==> default: Booting VM...
==> default: Waiting for machine to boot. This may take a few minutes...
    default: SSH address: 127.0.0.1:2222
    default: SSH username: vagrant
    default: SSH auth method: private key
    default: 
    default: Vagrant insecure key detected. Vagrant will automatically replace
    default: this with a newly generated keypair for better security.
    default: 
    default: Inserting generated public key within guest...
    default: Removing insecure key from the guest if it's present...
    default: Key inserted! Disconnecting and reconnecting using new SSH key...
==> default: Machine booted and ready!
==> default: Checking for guest additions in VM...
    default: The guest additions on this VM do not match the installed version 
of
    default: VirtualBox! In most cases this is fine, but in rare cases it can
    default: prevent things such as shared folders from working properly. If 
you see
    default: shared folder errors, please make sure the guest additions within 
the
    default: virtual machine match the version of VirtualBox you have installed 
on
    default: your host and reload your VM.
    default: 
    default: Guest Additions Version: 4.3.36
    default: VirtualBox Version: 5.1
==> default: Mounting shared folders...
    default: /vagrant => D:/Vagrant/codeface
==> default: Running provisioner: fix-no-tty (shell)...
    default: Running: inline script
==> default: stdin: is not a tty
==> default: Running provisioner: build (shell)...
    default: Running: inline script
==> default: Selecting previously unselected package python-software-properties.
==> default: (Reading database ... 63125 files and directories currently 
installed.)
==> default: Preparing to unpack 
.../python-software-properties_0.92.37.7_all.deb ...
==> default: Unpacking python-software-properties (0.92.37.7) ...
==> default: Setting up python-software-properties (0.92.37.7) ...
==> default: Adding R cran repositories
==> default: deb http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu trusty/
==> default: gpg: 
==> default: directory `/home/vagrant/.gnupg' created
==> default: gpg: 
==> default: new configuration file `/home/vagrant/.gnupg/gpg.conf' created
==> default: gpg: 
==> default: WARNING: options in `/home/vagrant/.gnupg/gpg.conf' are not yet 
active during this run
==> default: gpg: 
==> default: keyring `/home/vagrant/.gnupg/secring.gpg' created
==> default: gpg: 
==> default: keyring `/home/vagrant/.gnupg/pubring.gpg' created
==> default: gpg: 
==> default: requesting key E084DAB9 from hkp server keyserver.ubuntu.com
==> default: gpg: 
==> default: /home/vagrant/.gnupg/trustdb.gpg: trustdb created
==> default: gpg: 
==> default: key E084DAB9: public key "Michael Rutter <marutter@xxxxxxxxx>" 
imported
==> default: gpg: 
==> default: Total number processed: 1
==> default: gpg: 
==> default:               imported: 1
==> default:   (RSA: 1)
==> default: OK
==> default: Providing common binaries and libraries
==> default: 
Extracting templates from packages: 7%
==> default: 
Extracting templates from packages: 15%
==> default: 
Extracting templates from packages: 23%
==> default: 
Extracting templates from packages: 31%
==> default: 
Extracting templates from packages: 39%
==> default: 
Extracting templates from packages: 47%
==> default: 
Extracting templates from packages: 55%
==> default: 
Extracting templates from packages: 63%
==> default: 
Extracting templates from packages: 71%
==> default: 
Extracting templates from packages: 78%
==> default: 
Extracting templates from packages: 86%
==> default: 
Extracting templates from packages: 94%
==> default: 
Extracting templates from packages: 100%
==> default: Preconfiguring packages ...
==> default: Selecting previously unselected package libaio1:amd64.
==> default: (Reading database ... 63141 files and directories currently 
installed.)
==> default: Preparing to unpack .../libaio1_0.3.109-4_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libaio1:amd64 (0.3.109-4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libapr1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libapr1_1.5.0-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libapr1:amd64 (1.5.0-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libaprutil1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libaprutil1_1.5.3-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libaprutil1:amd64 (1.5.3-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package liblzo2-2:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../liblzo2-2_2.06-1.2ubuntu1.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking liblzo2-2:amd64 (2.06-1.2ubuntu1.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libnettle4:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libnettle4_2.7.1-1ubuntu0.2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libnettle4:amd64 (2.7.1-1ubuntu0.2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libarchive13:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libarchive13_3.1.2-7ubuntu2.4_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libarchive13:amd64 (3.1.2-7ubuntu2.4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libasyncns0:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libasyncns0_0.8-4ubuntu2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libasyncns0:amd64 (0.8-4ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libatasmart4:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libatasmart4_0.19-3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libatasmart4:amd64 (0.19-3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgtk2.0-common.
==> default: Preparing to unpack 
.../libgtk2.0-common_2.24.23-0ubuntu1.4_all.deb ...
==> default: Unpacking libgtk2.0-common (2.24.23-0ubuntu1.4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgtk2.0-0:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libgtk2.0-0_2.24.23-0ubuntu1.4_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libgtk2.0-0:amd64 (2.24.23-0ubuntu1.4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libnspr4:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libnspr4_2%3a4.12-0ubuntu0.14.04.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libnspr4:amd64 (2:4.12-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libnss3-nssdb.
==> default: Preparing to unpack 
.../libnss3-nssdb_2%3a3.26.2-0ubuntu0.14.04.3_all.deb ...
==> default: Unpacking libnss3-nssdb (2:3.26.2-0ubuntu0.14.04.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libnss3:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libnss3_2%3a3.26.2-0ubuntu0.14.04.3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libnss3:amd64 (2:3.26.2-0ubuntu0.14.04.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package ca-certificates-java.
==> default: Preparing to unpack 
.../ca-certificates-java_20130815ubuntu1_all.deb ...
==> default: Unpacking ca-certificates-java (20130815ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package tzdata-java.
==> default: Preparing to unpack .../tzdata-java_2016j-0ubuntu0.14.04_all.deb 
...
==> default: Unpacking tzdata-java (2016j-0ubuntu0.14.04) ...
==> default: Selecting previously unselected package java-common.
==> default: Preparing to unpack .../java-common_0.51_all.deb ...
==> default: Unpacking java-common (0.51) ...
==> default: Selecting previously unselected package libpcsclite1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libpcsclite1_1.8.10-1ubuntu1.1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libpcsclite1:amd64 (1.8.10-1ubuntu1.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libflac8:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libflac8_1.3.0-2ubuntu0.14.04.1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libflac8:amd64 (1.3.0-2ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libvorbisenc2:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libvorbisenc2_1.3.2-1.3ubuntu1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libvorbisenc2:amd64 (1.3.2-1.3ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libsndfile1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libsndfile1_1.0.25-7ubuntu2.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libsndfile1:amd64 (1.0.25-7ubuntu2.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libpulse0:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libpulse0_1%3a4.0-0ubuntu11.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libpulse0:amd64 (1:4.0-0ubuntu11.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libsctp1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libsctp1_1.0.15+dfsg-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libsctp1:amd64 (1.0.15+dfsg-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package 
openjdk-7-jre-headless:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../openjdk-7-jre-headless_7u121-2.6.8-1ubuntu0.14.04.3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking openjdk-7-jre-headless:amd64 
(7u121-2.6.8-1ubuntu0.14.04.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package default-jre-headless.
==> default: Preparing to unpack .../default-jre-headless_2%3a1.7-51_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking default-jre-headless (2:1.7-51) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgif4:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libgif4_4.1.6-11_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgif4:amd64 (4.1.6-11) ...
==> default: Selecting previously unselected package openjdk-7-jre:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../openjdk-7-jre_7u121-2.6.8-1ubuntu0.14.04.3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking openjdk-7-jre:amd64 (7u121-2.6.8-1ubuntu0.14.04.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package default-jre.
==> default: Preparing to unpack .../default-jre_2%3a1.7-51_amd64.deb ...
==> default: Unpacking default-jre (2:1.7-51) ...
==> default: Selecting previously unselected package libatk-wrapper-java.
==> default: Preparing to unpack .../libatk-wrapper-java_0.30.4-4_all.deb ...
==> default: Unpacking libatk-wrapper-java (0.30.4-4) ...
==> default: Selecting previously unselected package 
libatk-wrapper-java-jni:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libatk-wrapper-java-jni_0.30.4-4_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libatk-wrapper-java-jni:amd64 (0.30.4-4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libavahi-glib1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libavahi-glib1_0.6.31-4ubuntu1.1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libavahi-glib1:amd64 (0.6.31-4ubuntu1.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libbonobo2-common.
==> default: Preparing to unpack .../libbonobo2-common_2.32.1-0ubuntu5_all.deb 
...
==> default: Unpacking libbonobo2-common (2.32.1-0ubuntu5) ...
==> default: Selecting previously unselected package libidl-common.
==> default: Preparing to unpack .../libidl-common_0.8.14-0.2ubuntu4_all.deb ...
==> default: Unpacking libidl-common (0.8.14-0.2ubuntu4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libidl0:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libidl0_0.8.14-0.2ubuntu4_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libidl0:amd64 (0.8.14-0.2ubuntu4) ...
==> default: Selecting previously unselected package liborbit-2-0:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../liborbit-2-0_1%3a2.14.19-0.3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking liborbit-2-0:amd64 (1:2.14.19-0.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package liborbit2:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../liborbit2_1%3a2.14.19-0.3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking liborbit2:amd64 (1:2.14.19-0.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libbonobo2-0:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libbonobo2-0_2.32.1-0ubuntu5_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libbonobo2-0:amd64 (2.32.1-0ubuntu5) ...
==> default: Selecting previously unselected package 
libboost-system1.54.0:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libboost-system1.54.0_1.54.0-4ubuntu3.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libboost-system1.54.0:amd64 (1.54.0-4ubuntu3.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package 
libcairo-script-interpreter2:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libcairo-script-interpreter2_1.13.0~20140204-0ubuntu1.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libcairo-script-interpreter2:amd64 
(1.13.0~20140204-0ubuntu1.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libcupsfilters1:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libcupsfilters1_1.0.52-0ubuntu1.7_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libcupsfilters1:amd64 (1.0.52-0ubuntu1.7) ...
==> default: Selecting previously unselected package libcupsimage2:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libcupsimage2_1.7.2-0ubuntu1.8_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libcupsimage2:amd64 (1.7.2-0ubuntu1.8) ...
==> default: Selecting previously unselected package libdmx1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libdmx1_1%3a1.1.3-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libdmx1:amd64 (1:1.1.3-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libdrm-amdgpu1:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libdrm-amdgpu1_2.4.67-1ubuntu0.14.04.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libdrm-amdgpu1:amd64 (2.4.67-1ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libwayland-server0:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libwayland-server0_1.4.0-1ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libwayland-server0:amd64 (1.4.0-1ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgbm1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libgbm1_10.1.3-0ubuntu0.6_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgbm1:amd64 (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxcb-xfixes0:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxcb-xfixes0_1.10-2ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxcb-xfixes0:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libegl1-mesa:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libegl1-mesa_10.1.3-0ubuntu0.6_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libegl1-mesa:amd64 (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Selecting previously unselected package libopenvg1-mesa:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libopenvg1-mesa_10.1.3-0ubuntu0.6_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libopenvg1-mesa:amd64 (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Selecting previously unselected package libwayland-egl1-mesa:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libwayland-egl1-mesa_10.1.3-0ubuntu0.6_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libwayland-egl1-mesa:amd64 (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Selecting previously unselected package libegl1-mesa-drivers:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libegl1-mesa-drivers_10.1.3-0ubuntu0.6_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libegl1-mesa-drivers:amd64 (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Selecting previously unselected package libelfg0:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libelfg0_0.8.13-5_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libelfg0:amd64 (0.8.13-5) ...
==> default: Selecting previously unselected package libfs6:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libfs6_2%3a1.0.5-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libfs6:amd64 (2:1.0.5-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package gconf2-common.
==> default: Preparing to unpack .../gconf2-common_3.2.6-0ubuntu2_all.deb ...
==> default: Unpacking gconf2-common (3.2.6-0ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgconf-2-4:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libgconf-2-4_3.2.6-0ubuntu2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgconf-2-4:amd64 (3.2.6-0ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgfortran3:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libgfortran3_4.8.4-2ubuntu1~14.04.3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgfortran3:amd64 (4.8.4-2ubuntu1~14.04.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libglade2-0:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libglade2-0_1%3a2.6.4-2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libglade2-0:amd64 (1:2.6.4-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgles2-mesa:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libgles2-mesa_10.1.3-0ubuntu0.6_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libgles2-mesa:amd64 (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Selecting previously unselected package gconf-service-backend.
==> default: Preparing to unpack 
.../gconf-service-backend_3.2.6-0ubuntu2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking gconf-service-backend (3.2.6-0ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package gconf-service.
==> default: Preparing to unpack .../gconf-service_3.2.6-0ubuntu2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking gconf-service (3.2.6-0ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package dbus-x11.
==> default: Preparing to unpack .../dbus-x11_1.6.18-0ubuntu4.5_amd64.deb ...
==> default: Unpacking dbus-x11 (1.6.18-0ubuntu4.5) ...
==> default: Selecting previously unselected package gconf2.
==> default: Preparing to unpack .../gconf2_3.2.6-0ubuntu2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking gconf2 (3.2.6-0ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgnomevfs2-common.
==> default: Preparing to unpack 
.../libgnomevfs2-common_1%3a2.24.4-1ubuntu6_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgnomevfs2-common (1:2.24.4-1ubuntu6) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgnomevfs2-0:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libgnomevfs2-0_1%3a2.24.4-1ubuntu6_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgnomevfs2-0:amd64 (1:2.24.4-1ubuntu6) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgnome2-common.
==> default: Preparing to unpack .../libgnome2-common_2.32.1-4ubuntu1_all.deb 
...
==> default: Unpacking libgnome2-common (2.32.1-4ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgnome2-bin.
==> default: Preparing to unpack .../libgnome2-bin_2.32.1-4ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgnome2-bin (2.32.1-4ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgnome2-0:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libgnome2-0_2.32.1-4ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgnome2-0:amd64 (2.32.1-4ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgssrpc4:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libgssrpc4_1.12+dfsg-2ubuntu5.3_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libgssrpc4:amd64 (1.12+dfsg-2ubuntu5.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libhunspell-1.3-0:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libhunspell-1.3-0_1.3.2-6ubuntu2.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libhunspell-1.3-0:amd64 (1.3.2-6ubuntu2.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libkadm5clnt-mit9:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libkadm5clnt-mit9_1.12+dfsg-2ubuntu5.3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libkadm5clnt-mit9:amd64 (1.12+dfsg-2ubuntu5.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libkdb5-7:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libkdb5-7_1.12+dfsg-2ubuntu5.3_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libkdb5-7:amd64 (1.12+dfsg-2ubuntu5.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libkadm5srv-mit9:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libkadm5srv-mit9_1.12+dfsg-2ubuntu5.3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libkadm5srv-mit9:amd64 (1.12+dfsg-2ubuntu5.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libprotobuf8:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libprotobuf8_2.5.0-9ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libprotobuf8:amd64 (2.5.0-9ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libmirprotobuf0:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libmirprotobuf0_0.1.8+14.04.20140411-0ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libmirprotobuf0:amd64 (0.1.8+14.04.20140411-0ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package 
libmirclientplatform-mesa:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libmirclientplatform-mesa_0.1.8+14.04.20140411-0ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libmirclientplatform-mesa:amd64 
(0.1.8+14.04.20140411-0ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libmirclient7:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libmirclient7_0.1.8+14.04.20140411-0ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libmirclient7:amd64 (0.1.8+14.04.20140411-0ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package mysql-common.
==> default: Preparing to unpack 
.../mysql-common_5.5.54-0ubuntu0.14.04.1_all.deb ...
==> default: Unpacking mysql-common (5.5.54-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libmysqlclient18:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libmysqlclient18_5.5.54-0ubuntu0.14.04.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libmysqlclient18:amd64 (5.5.54-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libpaper1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libpaper1_1.1.24+nmu2ubuntu3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libpaper1:amd64 (1.1.24+nmu2ubuntu3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libpcrecpp0:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libpcrecpp0_1%3a8.31-2ubuntu2.3_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libpcrecpp0:amd64 (1:8.31-2ubuntu2.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libpoppler44:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libpoppler44_0.24.5-2ubuntu4.4_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libpoppler44:amd64 (0.24.5-2ubuntu4.4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libpoppler-glib8:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libpoppler-glib8_0.24.5-2ubuntu4.4_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libpoppler-glib8:amd64 (0.24.5-2ubuntu4.4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libexpat1-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libexpat1-dev_2.1.0-4ubuntu1.3_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libexpat1-dev:amd64 (2.1.0-4ubuntu1.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libpython2.7-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libpython2.7-dev_2.7.6-8ubuntu0.3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libpython2.7-dev:amd64 (2.7.6-8ubuntu0.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libsecret-common.
==> default: Preparing to unpack .../libsecret-common_0.16-0ubuntu1_all.deb ...
==> default: Unpacking libsecret-common (0.16-0ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libsecret-1-0:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libsecret-1-0_0.16-0ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libsecret-1-0:amd64 (0.16-0ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libserf-1-1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libserf-1-1_1.3.3-1ubuntu0.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libserf-1-1:amd64 (1.3.3-1ubuntu0.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libsvn1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libsvn1_1.8.8-1ubuntu3.2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libsvn1:amd64 (1.8.8-1ubuntu3.2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libtcl8.6:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libtcl8.6_8.6.1-4ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libtcl8.6:amd64 (8.6.1-4ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxft2:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxft2_2.3.1-2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxft2:amd64 (2.3.1-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxss1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxss1_1%3a1.2.2-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxss1:amd64 (1:1.2.2-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libtk8.6:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libtk8.6_8.6.1-3ubuntu2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libtk8.6:amd64 (8.6.1-3ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libudisks2-0:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libudisks2-0_2.1.3-1ubuntu0.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libudisks2-0:amd64 (2.1.3-1ubuntu0.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxcb-randr0:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxcb-randr0_1.10-2ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxcb-randr0:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxcb-shape0:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxcb-shape0_1.10-2ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxcb-shape0:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxres1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxres1_2%3a1.0.7-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxres1:amd64 (2:1.0.7-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxslt1.1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxslt1.1_1.1.28-2build1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxslt1.1:amd64 (1.1.28-2build1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxv1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxv1_2%3a1.0.10-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxv1:amd64 (2:1.0.10-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxvmc1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxvmc1_2%3a1.0.8-1ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxvmc1:amd64 (2:1.0.8-1ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxxf86dga1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxxf86dga1_2%3a1.1.4-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxxf86dga1:amd64 (2:1.1.4-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package tex-common.
==> default: Preparing to unpack .../tex-common_4.04_all.deb ...
==> default: Unpacking tex-common (4.04) ...
==> default: Selecting previously unselected package fonts-lmodern.
==> default: Preparing to unpack .../fonts-lmodern_2.004.4-3_all.deb ...
==> default: Unpacking fonts-lmodern (2.004.4-3) ...
==> default: Selecting previously unselected package lmodern.
==> default: Preparing to unpack .../lmodern_2.004.4-3_all.deb ...
==> default: Unpacking lmodern (2.004.4-3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libdbi-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libdbi-perl_1.630-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libdbi-perl (1.630-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libdbd-mysql-perl.
==> default: Preparing to unpack 
.../libdbd-mysql-perl_4.025-1ubuntu0.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libdbd-mysql-perl (4.025-1ubuntu0.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libterm-readkey-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libterm-readkey-perl_2.31-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libterm-readkey-perl (2.31-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package mysql-client-core-5.5.
==> default: Preparing to unpack 
.../mysql-client-core-5.5_5.5.54-0ubuntu0.14.04.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking mysql-client-core-5.5 (5.5.54-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package mysql-client-5.5.
==> default: Preparing to unpack 
.../mysql-client-5.5_5.5.54-0ubuntu0.14.04.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking mysql-client-5.5 (5.5.54-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package mysql-server-core-5.5.
==> default: Preparing to unpack 
.../mysql-server-core-5.5_5.5.54-0ubuntu0.14.04.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking mysql-server-core-5.5 (5.5.54-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Processing triggers for ca-certificates (20160104ubuntu0.14.04.1) 
...
==> default: Updating certificates in /etc/ssl/certs... 
==> default: 0 added, 0 removed; done.
==> default: Running hooks in /etc/ca-certificates/update.d....
==> default: done.
==> default: Processing triggers for man-db (2.6.7.1-1ubuntu1) ...
==> default: Processing triggers for mime-support (3.54ubuntu1.1) ...
==> default: Processing triggers for hicolor-icon-theme (0.13-1) ...
==> default: Processing triggers for fontconfig (2.11.0-0ubuntu4.2) ...
==> default: Setting up mysql-common (5.5.54-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package mysql-server-5.5.
==> default: (Reading database ... 66723 files and directories currently 
installed.)
==> default: Preparing to unpack 
.../mysql-server-5.5_5.5.54-0ubuntu0.14.04.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking mysql-server-5.5 (5.5.54-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package poppler-data.
==> default: Preparing to unpack .../poppler-data_0.4.6-4_all.deb ...
==> default: Unpacking poppler-data (0.4.6-4) ...
==> default: Selecting previously unselected package fonts-texgyre.
==> default: Preparing to unpack .../fonts-texgyre_2.004.2-4_all.deb ...
==> default: Unpacking fonts-texgyre (2.004.2-4) ...
==> default: Selecting previously unselected package tex-gyre.
==> default: Preparing to unpack .../tex-gyre_2.004.2-4_all.deb ...
==> default: Unpacking tex-gyre (2.004.2-4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libc-ares2:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libc-ares2_1.10.0-2ubuntu0.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libc-ares2:amd64 (1.10.0-2ubuntu0.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libglu1-mesa:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libglu1-mesa_9.0.0-2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libglu1-mesa:amd64 (9.0.0-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgnutlsxx27:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libgnutlsxx27_2.12.23-12ubuntu2.7_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgnutlsxx27:amd64 (2.12.23-12ubuntu2.7) ...
==> default: Selecting previously unselected package libwebp5:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libwebp5_0.4.0-4_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libwebp5:amd64 (0.4.0-4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libwebpmux1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libwebpmux1_0.4.0-4_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libwebpmux1:amd64 (0.4.0-4) ...
==> default: Selecting previously unselected package astyle.
==> default: Preparing to unpack .../astyle_2.03-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking astyle (2.03-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package autotools-dev.
==> default: Preparing to unpack .../autotools-dev_20130810.1_all.deb ...
==> default: Unpacking autotools-dev (20130810.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libstdc++-4.8-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libstdc++-4.8-dev_4.8.4-2ubuntu1~14.04.3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libstdc++-4.8-dev:amd64 (4.8.4-2ubuntu1~14.04.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package g++-4.8.
==> default: Preparing to unpack .../g++-4.8_4.8.4-2ubuntu1~14.04.3_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking g++-4.8 (4.8.4-2ubuntu1~14.04.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package g++.
==> default: Preparing to unpack .../g++_4%3a4.8.2-1ubuntu6_amd64.deb ...
==> default: Unpacking g++ (4:4.8.2-1ubuntu6) ...
==> default: Selecting previously unselected package libdpkg-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libdpkg-perl_1.17.5ubuntu5.7_all.deb ...
==> default: Unpacking libdpkg-perl (1.17.5ubuntu5.7) ...
==> default: Selecting previously unselected package dpkg-dev.
==> default: Preparing to unpack .../dpkg-dev_1.17.5ubuntu5.7_all.deb ...
==> default: Unpacking dpkg-dev (1.17.5ubuntu5.7) ...
==> default: Selecting previously unselected package build-essential.
==> default: Preparing to unpack .../build-essential_11.6ubuntu6_amd64.deb ...
==> default: Unpacking build-essential (11.6ubuntu6) ...
==> default: Selecting previously unselected package openjdk-7-jdk:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../openjdk-7-jdk_7u121-2.6.8-1ubuntu0.14.04.3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking openjdk-7-jdk:amd64 (7u121-2.6.8-1ubuntu0.14.04.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package default-jdk.
==> default: Preparing to unpack .../default-jdk_2%3a1.7-51_amd64.deb ...
==> default: Unpacking default-jdk (2:1.7-51) ...
==> default: Selecting previously unselected package desktop-file-utils.
==> default: Preparing to unpack .../desktop-file-utils_0.22-1ubuntu1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking desktop-file-utils (0.22-1ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package dictionaries-common.
==> default: Preparing to unpack .../dictionaries-common_1.20.5_all.deb ...
==> default: Adding 'diversion of /usr/share/dict/words to 
/usr/share/dict/words.pre-dictionaries-common by dictionaries-common'
==> default: Unpacking dictionaries-common (1.20.5) ...
==> default: Selecting previously unselected package doxygen.
==> default: Preparing to unpack .../doxygen_1.8.6-2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking doxygen (1.8.6-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package exuberant-ctags.
==> default: Preparing to unpack 
.../exuberant-ctags_1%3a5.9~svn20110310-7ubuntu0.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking exuberant-ctags (1:5.9~svn20110310-7ubuntu0.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package fonts-dejavu-extra.
==> default: Preparing to unpack .../fonts-dejavu-extra_2.34-1ubuntu1_all.deb 
...
==> default: Unpacking fonts-dejavu-extra (2.34-1ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package fonts-liberation.
==> default: Preparing to unpack .../fonts-liberation_1.07.3-3_all.deb ...
==> default: Unpacking fonts-liberation (1.07.3-3) ...
==> default: Selecting previously unselected package fonts-lyx.
==> default: Preparing to unpack .../fonts-lyx_2.0.8.1-0ubuntu1_all.deb ...
==> default: Unpacking fonts-lyx (2.0.8.1-0ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgfortran-4.8-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libgfortran-4.8-dev_4.8.4-2ubuntu1~14.04.3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgfortran-4.8-dev:amd64 (4.8.4-2ubuntu1~14.04.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package gfortran-4.8.
==> default: Preparing to unpack 
.../gfortran-4.8_4.8.4-2ubuntu1~14.04.3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking gfortran-4.8 (4.8.4-2ubuntu1~14.04.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package gfortran.
==> default: Preparing to unpack .../gfortran_4%3a4.8.2-1ubuntu6_amd64.deb ...
==> default: Unpacking gfortran (4:4.8.2-1ubuntu6) ...
==> default: Selecting previously unselected package libijs-0.35.
==> default: Preparing to unpack .../libijs-0.35_0.35-8build1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libijs-0.35 (0.35-8build1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libjbig2dec0.
==> default: Preparing to unpack 
.../libjbig2dec0_0.11+20120125-1ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libjbig2dec0 (0.11+20120125-1ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgs9-common.
==> default: Preparing to unpack 
.../libgs9-common_9.10~dfsg-0ubuntu10.6_all.deb ...
==> default: Unpacking libgs9-common (9.10~dfsg-0ubuntu10.6) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgs9.
==> default: Preparing to unpack .../libgs9_9.10~dfsg-0ubuntu10.6_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgs9 (9.10~dfsg-0ubuntu10.6) ...
==> default: Selecting previously unselected package gsfonts.
==> default: Preparing to unpack 
.../gsfonts_1%3a8.11+urwcyr1.0.7~pre44-4.2ubuntu1_all.deb ...
==> default: Unpacking gsfonts (1:8.11+urwcyr1.0.7~pre44-4.2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package ghostscript.
==> default: Preparing to unpack 
.../ghostscript_9.10~dfsg-0ubuntu10.6_amd64.deb ...
==> default: Unpacking ghostscript (9.10~dfsg-0ubuntu10.6) ...
==> default: Selecting previously unselected package gir1.2-freedesktop.
==> default: Preparing to unpack 
.../gir1.2-freedesktop_1.40.0-1ubuntu0.2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking gir1.2-freedesktop (1.40.0-1ubuntu0.2) ...
==> default: Selecting previously unselected package gir1.2-poppler-0.18.
==> default: Preparing to unpack 
.../gir1.2-poppler-0.18_0.24.5-2ubuntu4.4_amd64.deb ...
==> default: Unpacking gir1.2-poppler-0.18 (0.24.5-2ubuntu4.4) ...
==> default: Selecting previously unselected package liberror-perl.
==> default: Preparing to unpack .../liberror-perl_0.17-1.1_all.deb ...
==> default: Unpacking liberror-perl (0.17-1.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package git-man.
==> default: Preparing to unpack .../git-man_1%3a1.9.1-1ubuntu0.4_all.deb ...
==> default: Unpacking git-man (1:1.9.1-1ubuntu0.4) ...
==> default: Selecting previously unselected package git.
==> default: Preparing to unpack .../git_1%3a1.9.1-1ubuntu0.4_amd64.deb ...
==> default: Unpacking git (1:1.9.1-1ubuntu0.4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libcdt5.
==> default: Preparing to unpack .../libcdt5_2.36.0-0ubuntu3.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libcdt5 (2.36.0-0ubuntu3.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libcgraph6.
==> default: Preparing to unpack .../libcgraph6_2.36.0-0ubuntu3.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libcgraph6 (2.36.0-0ubuntu3.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libpathplan4.
==> default: Preparing to unpack .../libpathplan4_2.36.0-0ubuntu3.1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libpathplan4 (2.36.0-0ubuntu3.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgvc6.
==> default: Preparing to unpack .../libgvc6_2.36.0-0ubuntu3.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgvc6 (2.36.0-0ubuntu3.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgvpr2.
==> default: Preparing to unpack .../libgvpr2_2.36.0-0ubuntu3.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgvpr2 (2.36.0-0ubuntu3.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package graphviz.
==> default: Preparing to unpack .../graphviz_2.36.0-0ubuntu3.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking graphviz (2.36.0-0ubuntu3.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11-utils.
==> default: Preparing to unpack .../x11-utils_7.7+1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking x11-utils (7.7+1) ...
==> default: Selecting previously unselected package udisks2.
==> default: Preparing to unpack .../udisks2_2.1.3-1ubuntu0.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking udisks2 (2.1.3-1ubuntu0.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package gvfs-common.
==> default: Preparing to unpack .../gvfs-common_1.20.3-0ubuntu1.2_all.deb ...
==> default: Unpacking gvfs-common (1.20.3-0ubuntu1.2) ...
==> default: Selecting previously unselected package gvfs-libs:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../gvfs-libs_1.20.3-0ubuntu1.2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking gvfs-libs:amd64 (1.20.3-0ubuntu1.2) ...
==> default: Selecting previously unselected package gvfs-daemons.
==> default: Preparing to unpack .../gvfs-daemons_1.20.3-0ubuntu1.2_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking gvfs-daemons (1.20.3-0ubuntu1.2) ...
==> default: Selecting previously unselected package gvfs:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../gvfs_1.20.3-0ubuntu1.2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking gvfs:amd64 (1.20.3-0ubuntu1.2) ...
==> default: Selecting previously unselected package hunspell-en-us.
==> default: Preparing to unpack .../hunspell-en-us_20070829-4ubuntu3_all.deb 
...
==> default: Unpacking hunspell-en-us (20070829-4ubuntu3) ...
==> default: Selecting previously unselected package comerr-dev.
==> default: Preparing to unpack .../comerr-dev_2.1-1.42.9-3ubuntu1.3_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking comerr-dev (2.1-1.42.9-3ubuntu1.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package krb5-multidev.
==> default: Preparing to unpack 
.../krb5-multidev_1.12+dfsg-2ubuntu5.3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking krb5-multidev (1.12+dfsg-2ubuntu5.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libkpathsea6.
==> default: Preparing to unpack 
.../libkpathsea6_2013.20130729.30972-2build3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libkpathsea6 (2013.20130729.30972-2build3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libptexenc1.
==> default: Preparing to unpack 
.../libptexenc1_2013.20130729.30972-2build3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libptexenc1 (2013.20130729.30972-2build3) ...
==> default: Selecting previously unselected package texlive-binaries.
==> default: Preparing to unpack 
.../texlive-binaries_2013.20130729.30972-2build3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking texlive-binaries (2013.20130729.30972-2build3) ...
==> default: Selecting previously unselected package xdg-utils.
==> default: Preparing to unpack .../xdg-utils_1.1.0~rc1-2ubuntu7.1_all.deb ...
==> default: Unpacking xdg-utils (1.1.0~rc1-2ubuntu7.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package luatex.
==> default: Preparing to unpack .../luatex_0.76.0-3ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking luatex (0.76.0-3ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libpaper-utils.
==> default: Preparing to unpack 
.../libpaper-utils_1.1.24+nmu2ubuntu3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libpaper-utils (1.1.24+nmu2ubuntu3) ...
==> default: Selecting previously unselected package texlive-base.
==> default: Preparing to unpack .../texlive-base_2013.20140215-1_all.deb ...
==> default: Unpacking texlive-base (2013.20140215-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package texlive-latex-base.
==> default: Preparing to unpack .../texlive-latex-base_2013.20140215-1_all.deb 
...
==> default: Unpacking texlive-latex-base (2013.20140215-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package texlive-latex-recommended.
==> default: Preparing to unpack 
.../texlive-latex-recommended_2013.20140215-1_all.deb ...
==> default: Unpacking texlive-latex-recommended (2013.20140215-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package latex-xcolor.
==> default: Preparing to unpack .../latex-xcolor_2.11-1.1_all.deb ...
==> default: Unpacking latex-xcolor (2.11-1.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package pgf.
==> default: Preparing to unpack .../archives/pgf_2.10-1_all.deb ...
==> default: Unpacking pgf (2.10-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package latex-beamer.
==> default: Preparing to unpack .../latex-beamer_3.24-1_all.deb ...
==> default: Unpacking latex-beamer (3.24-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libalgorithm-diff-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libalgorithm-diff-perl_1.19.02-3_all.deb 
...
==> default: Unpacking libalgorithm-diff-perl (1.19.02-3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libalgorithm-diff-xs-perl.
==> default: Preparing to unpack 
.../libalgorithm-diff-xs-perl_0.04-2build4_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libalgorithm-diff-xs-perl (0.04-2build4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libalgorithm-merge-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libalgorithm-merge-perl_0.08-2_all.deb ...
==> default: Unpacking libalgorithm-merge-perl (0.08-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libblas3.
==> default: Preparing to unpack .../libblas3_1.2.20110419-7_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libblas3 (1.2.20110419-7) ...
==> default: Selecting previously unselected package zlib1g-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../zlib1g-dev_1%3a1.2.8.dfsg-1ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking zlib1g-dev:amd64 (1:1.2.8.dfsg-1ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libpng12-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../libpng12-dev_1.2.50-1ubuntu2.14.04.2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libpng12-dev (1.2.50-1ubuntu2.14.04.2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libfreetype6-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../libfreetype6-dev_2.5.2-1ubuntu2.6_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libfreetype6-dev (2.5.2-1ubuntu2.6) ...
==> default: Selecting previously unselected package pkg-config.
==> default: Preparing to unpack .../pkg-config_0.26-1ubuntu4_amd64.deb ...
==> default: Unpacking pkg-config (0.26-1ubuntu4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libfontconfig1-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../libfontconfig1-dev_2.11.0-0ubuntu4.2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libfontconfig1-dev (2.11.0-0ubuntu4.2) ...
==> default: Selecting previously unselected package xorg-sgml-doctools.
==> default: Preparing to unpack .../xorg-sgml-doctools_1%3a1.11-1_all.deb ...
==> default: Unpacking xorg-sgml-doctools (1:1.11-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-core-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-core-dev_7.0.26-1~ubuntu2_all.deb 
...
==> default: Unpacking x11proto-core-dev (7.0.26-1~ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxau-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxau-dev_1%3a1.0.8-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxau-dev:amd64 (1:1.0.8-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxdmcp-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxdmcp-dev_1%3a1.1.1-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxdmcp-dev:amd64 (1:1.1.1-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-input-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-input-dev_2.3-1_all.deb ...
==> default: Unpacking x11proto-input-dev (2.3-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-kb-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-kb-dev_1.0.6-2_all.deb ...
==> default: Unpacking x11proto-kb-dev (1.0.6-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package xtrans-dev.
==> default: Preparing to unpack .../xtrans-dev_1.3.5-1~ubuntu14.04.1_all.deb 
...
==> default: Unpacking xtrans-dev (1.3.5-1~ubuntu14.04.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package 
libpthread-stubs0-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libpthread-stubs0-dev_0.3-4_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libpthread-stubs0-dev:amd64 (0.3-4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxcb1-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxcb1-dev_1.10-2ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxcb1-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libx11-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libx11-dev_2%3a1.6.2-1ubuntu2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libx11-dev:amd64 (2:1.6.2-1ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-render-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-render-dev_2%3a0.11.1-2_all.deb 
...
==> default: Unpacking x11proto-render-dev (2:0.11.1-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxrender-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libxrender-dev_1%3a0.9.8-1build0.14.04.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxrender-dev:amd64 (1:0.9.8-1build0.14.04.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libice-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libice-dev_2%3a1.0.8-2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libice-dev:amd64 (2:1.0.8-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libsm-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libsm-dev_2%3a1.2.1-2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libsm-dev:amd64 (2:1.2.1-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libpixman-1-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../libpixman-1-dev_0.30.2-2ubuntu1.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libpixman-1-dev (0.30.2-2ubuntu1.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxcb-render0-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxcb-render0-dev_1.10-2ubuntu1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libxcb-render0-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxcb-shm0-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxcb-shm0-dev_1.10-2ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxcb-shm0-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-xext-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-xext-dev_7.3.0-1_all.deb ...
==> default: Unpacking x11proto-xext-dev (7.3.0-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxext-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libxext-dev_2%3a1.3.2-1ubuntu0.0.14.04.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxext-dev:amd64 (2:1.3.2-1ubuntu0.0.14.04.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libglib2.0-bin.
==> default: Preparing to unpack .../libglib2.0-bin_2.40.2-0ubuntu1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libglib2.0-bin (2.40.2-0ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libpcre3-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libpcre3-dev_1%3a8.31-2ubuntu2.3_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libpcre3-dev:amd64 (1:8.31-2ubuntu2.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libglib2.0-dev.
==> default: Preparing to unpack .../libglib2.0-dev_2.40.2-0ubuntu1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libglib2.0-dev (2.40.2-0ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libcairo2-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../libcairo2-dev_1.13.0~20140204-0ubuntu1.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libcairo2-dev (1.13.0~20140204-0ubuntu1.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libidn11-dev.
==> default: Preparing to unpack .../libidn11-dev_1.28-1ubuntu2.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libidn11-dev (1.28-1ubuntu2.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libkrb5-dev.
==> default: Preparing to unpack .../libkrb5-dev_1.12+dfsg-2ubuntu5.3_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libkrb5-dev (1.12+dfsg-2ubuntu5.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libldap2-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libldap2-dev_2.4.31-1+nmu2ubuntu8.3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libldap2-dev:amd64 (2.4.31-1+nmu2ubuntu8.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgpg-error-dev.
==> default: Preparing to unpack .../libgpg-error-dev_1.12-0.2ubuntu1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libgpg-error-dev (1.12-0.2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgcrypt11-dev.
==> default: Preparing to unpack .../libgcrypt11-dev_1.5.3-2ubuntu4.4_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libgcrypt11-dev (1.5.3-2ubuntu4.4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libtasn1-6-dev.
==> default: Preparing to unpack .../libtasn1-6-dev_3.4-3ubuntu0.4_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libtasn1-6-dev (3.4-3ubuntu0.4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libp11-kit-dev.
==> default: Preparing to unpack .../libp11-kit-dev_0.20.2-2ubuntu2_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libp11-kit-dev (0.20.2-2ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgnutls-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../libgnutls-dev_2.12.23-12ubuntu2.7_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgnutls-dev (2.12.23-12ubuntu2.7) ...
==> default: Selecting previously unselected package librtmp-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../librtmp-dev_2.4+20121230.gitdf6c518-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking librtmp-dev (2.4+20121230.gitdf6c518-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libssl-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libssl-dev_1.0.1f-1ubuntu2.22_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libssl-dev:amd64 (1.0.1f-1ubuntu2.22) ...
==> default: Selecting previously unselected package libcurl4-openssl-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libcurl4-openssl-dev_7.35.0-1ubuntu2.10_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libcurl4-openssl-dev:amd64 (7.35.0-1ubuntu2.10) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-dmx-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-dmx-dev_1%3a2.3.1-2_all.deb ...
==> default: Unpacking x11proto-dmx-dev (1:2.3.1-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libdmx-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libdmx-dev_1%3a1.1.3-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libdmx-dev:amd64 (1:1.1.3-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libdrm-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libdrm-dev_2.4.67-1ubuntu0.14.04.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libdrm-dev:amd64 (2.4.67-1ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-dri2-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-dri2-dev_2.8-2_all.deb ...
==> default: Unpacking x11proto-dri2-dev (2.8-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-gl-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-gl-dev_1.4.17-1_all.deb ...
==> default: Unpacking x11proto-gl-dev (1.4.17-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-xf86vidmode-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-xf86vidmode-dev_2.3.1-2_all.deb 
...
==> default: Unpacking x11proto-xf86vidmode-dev (2.3.1-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxxf86vm-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxxf86vm-dev_1%3a1.1.3-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxxf86vm-dev:amd64 (1:1.1.3-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-fixes-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../x11proto-fixes-dev_1%3a5.0-2ubuntu2_all.deb ...
==> default: Unpacking x11proto-fixes-dev (1:5.0-2ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxfixes-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libxfixes-dev_1%3a5.0.1-1ubuntu1.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxfixes-dev:amd64 (1:5.0.1-1ubuntu1.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-damage-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-damage-dev_1%3a1.2.1-2_all.deb ...
==> default: Unpacking x11proto-damage-dev (1:1.2.1-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxdamage-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libxdamage-dev_1%3a1.1.4-1ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxdamage-dev:amd64 (1:1.1.4-1ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxcb-glx0-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxcb-glx0-dev_1.10-2ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxcb-glx0-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxcb-dri2-0-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxcb-dri2-0-dev_1.10-2ubuntu1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libxcb-dri2-0-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxcb-dri3-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxcb-dri3-dev_1.10-2ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxcb-dri3-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxcb-randr0-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxcb-randr0-dev_1.10-2ubuntu1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libxcb-randr0-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxcb-shape0-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxcb-shape0-dev_1.10-2ubuntu1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libxcb-shape0-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxcb-xfixes0-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxcb-xfixes0-dev_1.10-2ubuntu1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libxcb-xfixes0-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxcb-sync-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxcb-sync-dev_1.10-2ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxcb-sync-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxcb-present-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxcb-present-dev_1.10-2ubuntu1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libxcb-present-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxshmfence-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxshmfence-dev_1.1-2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxshmfence-dev:amd64 (1.1-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libx11-xcb-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libx11-xcb-dev_2%3a1.6.2-1ubuntu2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libx11-xcb-dev:amd64 (2:1.6.2-1ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libprotobuf-lite8:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libprotobuf-lite8_2.5.0-9ubuntu1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libprotobuf-lite8:amd64 (2.5.0-9ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libprotobuf-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libprotobuf-dev_2.5.0-9ubuntu1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libprotobuf-dev:amd64 (2.5.0-9ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libmirprotobuf-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libmirprotobuf-dev_0.1.8+14.04.20140411-0ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libmirprotobuf-dev:amd64 (0.1.8+14.04.20140411-0ubuntu1) 
...
==> default: Selecting previously unselected package mircommon-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../mircommon-dev_0.1.8+14.04.20140411-0ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking mircommon-dev:amd64 (0.1.8+14.04.20140411-0ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libmirclient-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libmirclient-dev_0.1.8+14.04.20140411-0ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libmirclient-dev:amd64 (0.1.8+14.04.20140411-0ubuntu1) 
...
==> default: Selecting previously unselected package libwayland-dev.
==> default: Preparing to unpack .../libwayland-dev_1.4.0-1ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libwayland-dev (1.4.0-1ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libegl1-mesa-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../libegl1-mesa-dev_10.1.3-0ubuntu0.6_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libegl1-mesa-dev (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Selecting previously unselected package libfile-basedir-perl.
==> default: Preparing to unpack 
.../libfile-basedir-perl_0.03-1fakesync1_all.deb ...
==> default: Unpacking libfile-basedir-perl (0.03-1fakesync1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libfile-desktopentry-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libfile-desktopentry-perl_0.07-1_all.deb 
...
==> default: Unpacking libfile-desktopentry-perl (0.07-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libfile-fcntllock-perl.
==> default: Preparing to unpack 
.../libfile-fcntllock-perl_0.14-2build1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libfile-fcntllock-perl (0.14-2build1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libfile-mimeinfo-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libfile-mimeinfo-perl_0.22-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libfile-mimeinfo-perl (0.22-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libfontenc-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libfontenc-dev_1%3a1.1.2-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libfontenc-dev:amd64 (1:1.1.2-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-fonts-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-fonts-dev_2.1.3-1~ubuntu2_all.deb 
...
==> default: Unpacking x11proto-fonts-dev (2.1.3-1~ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libfs-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libfs-dev_2%3a1.0.5-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libfs-dev:amd64 (2:1.0.5-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgconf2-4:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libgconf2-4_3.2.6-0ubuntu2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgconf2-4:amd64 (3.2.6-0ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgles2-mesa-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../libgles2-mesa-dev_10.1.3-0ubuntu0.6_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgles2-mesa-dev (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Selecting previously unselected package mesa-common-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../mesa-common-dev_10.1.3-0ubuntu0.6_amd64.deb ...
==> default: Unpacking mesa-common-dev (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgl1-mesa-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../libgl1-mesa-dev_10.1.3-0ubuntu0.6_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgl1-mesa-dev (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Selecting previously unselected package libglu1-mesa-dev.
==> default: Preparing to unpack .../libglu1-mesa-dev_9.0.0-2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libglu1-mesa-dev (9.0.0-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxdot4.
==> default: Preparing to unpack .../libxdot4_2.36.0-0ubuntu3.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxdot4 (2.36.0-0ubuntu3.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libltdl-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libltdl-dev_2.4.2-1.7ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libltdl-dev:amd64 (2.4.2-1.7ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgraphviz-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../libgraphviz-dev_2.36.0-0ubuntu3.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgraphviz-dev (2.36.0-0ubuntu3.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgtk2.0-bin.
==> default: Preparing to unpack .../libgtk2.0-bin_2.24.23-0ubuntu1.4_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libgtk2.0-bin (2.24.23-0ubuntu1.4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libhtml-template-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libhtml-template-perl_2.95-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libhtml-template-perl (2.95-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libhunspell-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libhunspell-dev_1.3.2-6ubuntu2.1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libhunspell-dev:amd64 (1.3.2-6ubuntu2.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package liblapack3.
==> default: Preparing to unpack .../liblapack3_3.5.0-2ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking liblapack3 (3.5.0-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libmysqlclient-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../libmysqlclient-dev_5.5.54-0ubuntu0.14.04.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libmysqlclient-dev (5.5.54-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libpoppler-private-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../libpoppler-private-dev_0.24.5-2ubuntu4.4_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libpoppler-private-dev (0.24.5-2ubuntu4.4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libpoppler-dev.
==> default: Preparing to unpack .../libpoppler-dev_0.24.5-2ubuntu4.4_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libpoppler-dev (0.24.5-2ubuntu4.4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libpoppler-glib-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../libpoppler-glib-dev_0.24.5-2ubuntu4.4_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libpoppler-glib-dev (0.24.5-2ubuntu4.4) ...
==> default: Selecting previously unselected package libpython-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libpython-dev_2.7.5-5ubuntu3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libpython-dev:amd64 (2.7.5-5ubuntu3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libssl-doc.
==> default: Preparing to unpack .../libssl-doc_1.0.1f-1ubuntu2.22_all.deb ...
==> default: Unpacking libssl-doc (1.0.1f-1ubuntu2.22) ...
==> default: Selecting previously unselected package libtool.
==> default: Preparing to unpack .../libtool_2.4.2-1.7ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libtool (2.4.2-1.7ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libutempter0.
==> default: Preparing to unpack .../libutempter0_1.1.5-4build1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libutempter0 (1.1.5-4build1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libv8-3.14.5.
==> default: Preparing to unpack .../libv8-3.14.5_3.14.5.8-5ubuntu2_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libv8-3.14.5 (3.14.5.8-5ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libx11-doc.
==> default: Preparing to unpack .../libx11-doc_2%3a1.6.2-1ubuntu2_all.deb ...
==> default: Unpacking libx11-doc (2:1.6.2-1ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxt-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxt-dev_1%3a1.1.4-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxt-dev:amd64 (1:1.1.4-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxmu-headers.
==> default: Preparing to unpack .../libxmu-headers_2%3a1.1.1-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libxmu-headers (2:1.1.1-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxmu-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxmu-dev_2%3a1.1.1-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxmu-dev:amd64 (2:1.1.1-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxpm-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxpm-dev_1%3a3.5.10-1ubuntu0.1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libxpm-dev:amd64 (1:3.5.10-1ubuntu0.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxaw7-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxaw7-dev_2%3a1.0.12-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxaw7-dev:amd64 (2:1.0.12-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-composite-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-composite-dev_1%3a0.4.2-2_all.deb 
...
==> default: Unpacking x11proto-composite-dev (1:0.4.2-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxcomposite-dev.
==> default: Preparing to unpack .../libxcomposite-dev_1%3a0.4.4-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxcomposite-dev (1:0.4.4-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxcursor-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxcursor-dev_1%3a1.1.14-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxcursor-dev:amd64 (1:1.1.14-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxfont-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../libxfont-dev_1%3a1.4.7-1ubuntu0.2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxfont-dev (1:1.4.7-1ubuntu0.2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxft-dev.
==> default: Preparing to unpack .../libxft-dev_2.3.1-2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxft-dev (2.3.1-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxi-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../libxi-dev_2%3a1.7.1.901-1ubuntu1.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxi-dev (2:1.7.1.901-1ubuntu1.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-xinerama-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-xinerama-dev_1.2.1-2_all.deb ...
==> default: Unpacking x11proto-xinerama-dev (1.2.1-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxinerama-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxinerama-dev_2%3a1.1.3-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxinerama-dev:amd64 (2:1.1.3-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxkbfile-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxkbfile-dev_1%3a1.0.8-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxkbfile-dev:amd64 (1:1.0.8-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxml2-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libxml2-dev_2.9.1+dfsg1-3ubuntu4.9_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxml2-dev:amd64 (2.9.1+dfsg1-3ubuntu4.9) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxmuu-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxmuu-dev_2%3a1.1.1-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxmuu-dev:amd64 (2:1.1.1-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-randr-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-randr-dev_1.5.0-1~trusty1_all.deb 
...
==> default: Unpacking x11proto-randr-dev (1.5.0-1~trusty1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxrandr-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libxrandr-dev_2%3a1.5.0-1~trusty1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxrandr-dev:amd64 (2:1.5.0-1~trusty1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-resource-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-resource-dev_1.2.0-3_all.deb ...
==> default: Unpacking x11proto-resource-dev (1.2.0-3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxres-dev.
==> default: Preparing to unpack .../libxres-dev_2%3a1.0.7-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxres-dev (2:1.0.7-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxslt1-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxslt1-dev_1.1.28-2build1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxslt1-dev:amd64 (1.1.28-2build1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-scrnsaver-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-scrnsaver-dev_1.2.2-1_all.deb ...
==> default: Unpacking x11proto-scrnsaver-dev (1.2.2-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxss-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxss-dev_1%3a1.2.2-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxss-dev:amd64 (1:1.2.2-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-record-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-record-dev_1.14.2-1_all.deb ...
==> default: Unpacking x11proto-record-dev (1.14.2-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxtst-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxtst-dev_2%3a1.2.2-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxtst-dev:amd64 (2:1.2.2-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-video-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-video-dev_2.3.2-1_all.deb ...
==> default: Unpacking x11proto-video-dev (2.3.2-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxv-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxv-dev_2%3a1.0.10-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxv-dev:amd64 (2:1.0.10-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxvmc-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxvmc-dev_2%3a1.0.8-1ubuntu1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libxvmc-dev:amd64 (2:1.0.8-1ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-xf86dga-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-xf86dga-dev_2.1-3_all.deb ...
==> default: Unpacking x11proto-xf86dga-dev (2.1-3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxxf86dga-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libxxf86dga-dev_2%3a1.1.4-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libxxf86dga-dev:amd64 (2:1.1.4-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package lksctp-tools.
==> default: Preparing to unpack .../lksctp-tools_1.0.15+dfsg-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking lksctp-tools (1.0.15+dfsg-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package mysql-client.
==> default: Preparing to unpack 
.../mysql-client_5.5.54-0ubuntu0.14.04.1_all.deb ...
==> default: Unpacking mysql-client (5.5.54-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package mysql-server.
==> default: Preparing to unpack 
.../mysql-server_5.5.54-0ubuntu0.14.04.1_all.deb ...
==> default: Unpacking mysql-server (5.5.54-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package policykit-1-gnome.
==> default: Preparing to unpack .../policykit-1-gnome_0.105-1ubuntu4_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking policykit-1-gnome (0.105-1ubuntu4) ...
==> default: Selecting previously unselected package 
texlive-generic-recommended.
==> default: Preparing to unpack 
.../texlive-generic-recommended_2013.20140215-1_all.deb ...
==> default: Unpacking texlive-generic-recommended (2013.20140215-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package texlive-pstricks.
==> default: Preparing to unpack .../texlive-pstricks_2013.20140215-2_all.deb 
...
==> default: Unpacking texlive-pstricks (2013.20140215-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package prosper.
==> default: Preparing to unpack .../prosper_1.00.4+cvs.2007.05.01-4_all.deb ...
==> default: Unpacking prosper (1.00.4+cvs.2007.05.01-4) ...
==> default: Selecting previously unselected package ps2eps.
==> default: Preparing to unpack .../ps2eps_1.68-1build1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking ps2eps (1.68-1build1) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-cairo.
==> default: Preparing to unpack .../python-cairo_1.8.8-1ubuntu5_amd64.deb ...
==> default: Unpacking python-cairo (1.8.8-1ubuntu5) ...
==> default: Selecting previously unselected package python3-pkg-resources.
==> default: Preparing to unpack .../python3-pkg-resources_3.3-1ubuntu2_all.deb 
...
==> default: Unpacking python3-pkg-resources (3.3-1ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-chardet-whl.
==> default: Preparing to unpack .../python-chardet-whl_2.2.1-2~ubuntu1_all.deb 
...
==> default: Unpacking python-chardet-whl (2.2.1-2~ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-colorama.
==> default: Preparing to unpack .../python-colorama_0.2.5-0.1ubuntu2_all.deb 
...
==> default: Unpacking python-colorama (0.2.5-0.1ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-colorama-whl.
==> default: Preparing to unpack 
.../python-colorama-whl_0.2.5-0.1ubuntu2_all.deb ...
==> default: Unpacking python-colorama-whl (0.2.5-0.1ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-dateutil.
==> default: Preparing to unpack .../python-dateutil_1.5+dfsg-1ubuntu1_all.deb 
...
==> default: Unpacking python-dateutil (1.5+dfsg-1ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package python2.7-dev.
==> default: Preparing to unpack .../python2.7-dev_2.7.6-8ubuntu0.3_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking python2.7-dev (2.7.6-8ubuntu0.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-dev.
==> default: Preparing to unpack .../python-dev_2.7.5-5ubuntu3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking python-dev (2.7.5-5ubuntu3) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-distlib.
==> default: Preparing to unpack .../python-distlib_0.1.8-1ubuntu1_all.deb ...
==> default: Unpacking python-distlib (0.1.8-1ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-distlib-whl.
==> default: Preparing to unpack .../python-distlib-whl_0.1.8-1ubuntu1_all.deb 
...
==> default: Unpacking python-distlib-whl (0.1.8-1ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-gobject-2.
==> default: Preparing to unpack .../python-gobject-2_2.28.6-12build1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking python-gobject-2 (2.28.6-12build1) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-gtk2.
==> default: Preparing to unpack .../python-gtk2_2.24.0-3ubuntu3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking python-gtk2 (2.24.0-3ubuntu3) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-glade2.
==> default: Preparing to unpack .../python-glade2_2.24.0-3ubuntu3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking python-glade2 (2.24.0-3ubuntu3) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-html5lib.
==> default: Preparing to unpack .../python-html5lib_0.999-3~ubuntu1_all.deb ...
==> default: Unpacking python-html5lib (0.999-3~ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-html5lib-whl.
==> default: Preparing to unpack 
.../python-html5lib-whl_0.999-3~ubuntu1_all.deb ...
==> default: Unpacking python-html5lib-whl (0.999-3~ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-pil.
==> default: Preparing to unpack .../python-pil_2.3.0-1ubuntu3.4_amd64.deb ...
==> default: Unpacking python-pil (2.3.0-1ubuntu3.4) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-imaging.
==> default: Preparing to unpack .../python-imaging_2.3.0-1ubuntu3.4_all.deb ...
==> default: Unpacking python-imaging (2.3.0-1ubuntu3.4) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-libxml2.
==> default: Preparing to unpack 
.../python-libxml2_2.9.1+dfsg1-3ubuntu4.9_amd64.deb ...
==> default: Unpacking python-libxml2 (2.9.1+dfsg1-3ubuntu4.9) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-lxml.
==> default: Preparing to unpack .../python-lxml_3.3.3-1ubuntu0.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking python-lxml (3.3.3-1ubuntu0.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-matplotlib-data.
==> default: Preparing to unpack 
.../python-matplotlib-data_1.3.1-1ubuntu5_all.deb ...
==> default: Unpacking python-matplotlib-data (1.3.1-1ubuntu5) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-pyparsing.
==> default: Preparing to unpack 
.../python-pyparsing_2.0.1+dfsg1-1build1_all.deb ...
==> default: Unpacking python-pyparsing (2.0.1+dfsg1-1build1) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-tz.
==> default: Preparing to unpack .../python-tz_2012c-1ubuntu0.1_all.deb ...
==> default: Unpacking python-tz (2012c-1ubuntu0.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-numpy.
==> default: Preparing to unpack 
.../python-numpy_1%3a1.8.2-0ubuntu0.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking python-numpy (1:1.8.2-0ubuntu0.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-support.
==> default: Preparing to unpack .../python-support_1.0.15_all.deb ...
==> default: Unpacking python-support (1.0.15) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-matplotlib.
==> default: Preparing to unpack .../python-matplotlib_1.3.1-1ubuntu5_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking python-matplotlib (1.3.1-1ubuntu5) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-notify.
==> default: Preparing to unpack .../python-notify_0.1.1-3ubuntu2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking python-notify (0.1.1-3ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-six-whl.
==> default: Preparing to unpack .../python-six-whl_1.5.2-1ubuntu1_all.deb ...
==> default: Unpacking python-six-whl (1.5.2-1ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-urllib3-whl.
==> default: Preparing to unpack .../python-urllib3-whl_1.7.1-1ubuntu4_all.deb 
...
==> default: Unpacking python-urllib3-whl (1.7.1-1ubuntu4) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-requests-whl.
==> default: Preparing to unpack 
.../python-requests-whl_2.2.1-1ubuntu0.3_all.deb ...
==> default: Unpacking python-requests-whl (2.2.1-1ubuntu0.3) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-setuptools-whl.
==> default: Preparing to unpack .../python-setuptools-whl_3.3-1ubuntu2_all.deb 
...
==> default: Unpacking python-setuptools-whl (3.3-1ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-pip-whl.
==> default: Preparing to unpack .../python-pip-whl_1.5.4-1ubuntu4_all.deb ...
==> default: Unpacking python-pip-whl (1.5.4-1ubuntu4) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-setuptools.
==> default: Preparing to unpack .../python-setuptools_3.3-1ubuntu2_all.deb ...
==> default: Unpacking python-setuptools (3.3-1ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-pip.
==> default: Preparing to unpack .../python-pip_1.5.4-1ubuntu4_all.deb ...
==> default: Unpacking python-pip (1.5.4-1ubuntu4) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-tk.
==> default: Preparing to unpack .../python-tk_2.7.5-1ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking python-tk (2.7.5-1ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-wheel.
==> default: Preparing to unpack .../python-wheel_0.24.0-1~ubuntu1_all.deb ...
==> default: Unpacking python-wheel (0.24.0-1~ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package sinntp.
==> default: Preparing to unpack .../archives/sinntp_1.5-1_all.deb ...
==> default: Unpacking sinntp (1.5-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package sloccount.
==> default: Preparing to unpack .../sloccount_2.26-5.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking sloccount (2.26-5.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package subversion.
==> default: Preparing to unpack .../subversion_1.8.8-1ubuntu3.2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking subversion (1.8.8-1ubuntu3.2) ...
==> default: Selecting previously unselected package tcl8.6.
==> default: Preparing to unpack .../tcl8.6_8.6.1-4ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking tcl8.6 (8.6.1-4ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package tcl.
==> default: Preparing to unpack .../tcl_8.6.0+6ubuntu3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking tcl (8.6.0+6ubuntu3) ...
==> default: Selecting previously unselected package texlive-fonts-recommended.
==> default: Preparing to unpack 
.../texlive-fonts-recommended_2013.20140215-1_all.deb ...
==> default: Unpacking texlive-fonts-recommended (2013.20140215-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package texlive.
==> default: Preparing to unpack .../texlive_2013.20140215-1_all.deb ...
==> default: Unpacking texlive (2013.20140215-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package texlive-extra-utils.
==> default: Preparing to unpack 
.../texlive-extra-utils_2013.20140215-2_all.deb ...
==> default: Unpacking texlive-extra-utils (2013.20140215-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package texlive-font-utils.
==> default: Preparing to unpack .../texlive-font-utils_2013.20140215-2_all.deb 
...
==> default: Unpacking texlive-font-utils (2013.20140215-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package 
texlive-fonts-recommended-doc.
==> default: Preparing to unpack 
.../texlive-fonts-recommended-doc_2013.20140215-1_all.deb ...
==> default: Unpacking texlive-fonts-recommended-doc (2013.20140215-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package texlive-latex-base-doc.
==> default: Preparing to unpack 
.../texlive-latex-base-doc_2013.20140215-1_all.deb ...
==> default: Unpacking texlive-latex-base-doc (2013.20140215-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package 
texlive-latex-recommended-doc.
==> default: Preparing to unpack 
.../texlive-latex-recommended-doc_2013.20140215-1_all.deb ...
==> default: Unpacking texlive-latex-recommended-doc (2013.20140215-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package texlive-luatex.
==> default: Preparing to unpack .../texlive-luatex_2013.20140215-1_all.deb ...
==> default: Unpacking texlive-luatex (2013.20140215-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package texlive-pstricks-doc.
==> default: Preparing to unpack 
.../texlive-pstricks-doc_2013.20140215-2_all.deb ...
==> default: Unpacking texlive-pstricks-doc (2013.20140215-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package tipa.
==> default: Preparing to unpack .../tipa_2%3a1.3-19_all.deb ...
==> default: Unpacking tipa (2:1.3-19) ...
==> default: Selecting previously unselected package tk8.6.
==> default: Preparing to unpack .../tk8.6_8.6.1-3ubuntu2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking tk8.6 (8.6.1-3ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package tk.
==> default: Preparing to unpack .../tk_8.6.0+6ubuntu3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking tk (8.6.0+6ubuntu3) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11-xserver-utils.
==> default: Preparing to unpack .../x11-xserver-utils_7.7+2ubuntu1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking x11-xserver-utils (7.7+2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-bigreqs-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-bigreqs-dev_1%3a1.1.2-1_all.deb 
...
==> default: Unpacking x11proto-bigreqs-dev (1:1.1.2-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-dri3-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-dri3-dev_1.0-1_all.deb ...
==> default: Unpacking x11proto-dri3-dev (1.0-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-present-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-present-dev_1.0-1_all.deb ...
==> default: Unpacking x11proto-present-dev (1.0-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-xcmisc-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-xcmisc-dev_1.2.2-1_all.deb ...
==> default: Unpacking x11proto-xcmisc-dev (1.2.2-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-xf86bigfont-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-xf86bigfont-dev_1.2.0-3_all.deb 
...
==> default: Unpacking x11proto-xf86bigfont-dev (1.2.0-3) ...
==> default: Selecting previously unselected package x11proto-xf86dri-dev.
==> default: Preparing to unpack .../x11proto-xf86dri-dev_2.1.1-2_all.deb ...
==> default: Unpacking x11proto-xf86dri-dev (2.1.1-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package xbitmaps.
==> default: Preparing to unpack .../xbitmaps_1.1.1-2_all.deb ...
==> default: Unpacking xbitmaps (1.1.1-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libpciaccess-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libpciaccess-dev_0.13.2-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libpciaccess-dev:amd64 (0.13.2-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package xserver-xorg-dev.
==> default: Preparing to unpack 
.../xserver-xorg-dev_2%3a1.15.1-0ubuntu2.7_amd64.deb ...
==> default: Unpacking xserver-xorg-dev (2:1.15.1-0ubuntu2.7) ...
==> default: Selecting previously unselected package xorg-dev.
==> default: Preparing to unpack .../xorg-dev_1%3a7.7+1ubuntu8.1_all.deb ...
==> default: Unpacking xorg-dev (1:7.7+1ubuntu8.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package xsltproc.
==> default: Preparing to unpack .../xsltproc_1.1.28-2build1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking xsltproc (1.1.28-2build1) ...
==> default: Selecting previously unselected package xterm.
==> default: Preparing to unpack .../xterm_297-1ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking xterm (297-1ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libyaml-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libyaml-dev_0.1.4-3ubuntu3.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libyaml-dev:amd64 (0.1.4-3ubuntu3.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package nodejs.
==> default: Preparing to unpack .../nodejs_0.10.25~dfsg2-2ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking nodejs (0.10.25~dfsg2-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-mock.
==> default: Preparing to unpack .../python-mock_1.0.1-3_all.deb ...
==> default: Unpacking python-mock (1.0.1-3) ...
==> default: Processing triggers for man-db (2.6.7.1-1ubuntu1) ...
==> default: Processing triggers for ureadahead (0.100.0-16) ...
==> default: Processing triggers for fontconfig (2.11.0-0ubuntu4.2) ...
==> default: Processing triggers for mime-support (3.54ubuntu1.1) ...
==> default: Processing triggers for libglib2.0-0:amd64 (2.40.2-0ubuntu1) ...
==> default: Processing triggers for install-info (5.2.0.dfsg.1-2) ...
==> default: Processing triggers for hicolor-icon-theme (0.13-1) ...
==> default: Setting up libaio1:amd64 (0.3.109-4) ...
==> default: Setting up libapr1:amd64 (1.5.0-1) ...
==> default: Setting up libaprutil1:amd64 (1.5.3-1) ...
==> default: Setting up liblzo2-2:amd64 (2.06-1.2ubuntu1.1) ...
==> default: Setting up libnettle4:amd64 (2.7.1-1ubuntu0.2) ...
==> default: Setting up libarchive13:amd64 (3.1.2-7ubuntu2.4) ...
==> default: Setting up libasyncns0:amd64 (0.8-4ubuntu2) ...
==> default: Setting up libatasmart4:amd64 (0.19-3) ...
==> default: Setting up libgtk2.0-common (2.24.23-0ubuntu1.4) ...
==> default: Setting up libgtk2.0-0:amd64 (2.24.23-0ubuntu1.4) ...
==> default: Setting up libnspr4:amd64 (2:4.12-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Setting up tzdata-java (2016j-0ubuntu0.14.04) ...
==> default: Setting up java-common (0.51) ...
==> default: Setting up libpcsclite1:amd64 (1.8.10-1ubuntu1.1) ...
==> default: Setting up libflac8:amd64 (1.3.0-2ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Setting up libvorbisenc2:amd64 (1.3.2-1.3ubuntu1) ...
==> default: Setting up libsndfile1:amd64 (1.0.25-7ubuntu2.1) ...
==> default: Setting up libpulse0:amd64 (1:4.0-0ubuntu11.1) ...
==> default: Setting up libsctp1:amd64 (1.0.15+dfsg-1) ...
==> default: Setting up libgif4:amd64 (4.1.6-11) ...
==> default: Setting up libavahi-glib1:amd64 (0.6.31-4ubuntu1.1) ...
==> default: Setting up libbonobo2-common (2.32.1-0ubuntu5) ...
==> default: Setting up libidl-common (0.8.14-0.2ubuntu4) ...
==> default: Setting up libidl0:amd64 (0.8.14-0.2ubuntu4) ...
==> default: Setting up liborbit-2-0:amd64 (1:2.14.19-0.3) ...
==> default: Setting up liborbit2:amd64 (1:2.14.19-0.3) ...
==> default: Setting up libbonobo2-0:amd64 (2.32.1-0ubuntu5) ...
==> default: Setting up libboost-system1.54.0:amd64 (1.54.0-4ubuntu3.1) ...
==> default: Setting up libcairo-script-interpreter2:amd64 
(1.13.0~20140204-0ubuntu1.1) ...
==> default: Setting up libcupsfilters1:amd64 (1.0.52-0ubuntu1.7) ...
==> default: Setting up libcupsimage2:amd64 (1.7.2-0ubuntu1.8) ...
==> default: Setting up libdmx1:amd64 (1:1.1.3-1) ...
==> default: Setting up libdrm-amdgpu1:amd64 (2.4.67-1ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Setting up libwayland-server0:amd64 (1.4.0-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up libgbm1:amd64 (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Setting up libxcb-xfixes0:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Setting up libegl1-mesa:amd64 (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/x86_64-linux-gnu/mesa-egl/ld.so.conf to provide 
/etc/ld.so.conf.d/x86_64-linux-gnu_EGL.conf (x86_64-linux-gnu_egl_conf) in auto 
mode
==> default: Setting up libopenvg1-mesa:amd64 (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Setting up libwayland-egl1-mesa:amd64 (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Setting up libegl1-mesa-drivers:amd64 (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Setting up libelfg0:amd64 (0.8.13-5) ...
==> default: Setting up libfs6:amd64 (2:1.0.5-1) ...
==> default: Setting up gconf2-common (3.2.6-0ubuntu2) ...
==> default: Creating config file /etc/gconf/2/path with new version
==> default: Setting up libgconf-2-4:amd64 (3.2.6-0ubuntu2) ...
==> default: Setting up libgfortran3:amd64 (4.8.4-2ubuntu1~14.04.3) ...
==> default: Setting up libglade2-0:amd64 (1:2.6.4-2) ...
==> default: Setting up libgles2-mesa:amd64 (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Setting up dbus-x11 (1.6.18-0ubuntu4.5) ...
==> default: Setting up libgssrpc4:amd64 (1.12+dfsg-2ubuntu5.3) ...
==> default: Setting up libhunspell-1.3-0:amd64 (1.3.2-6ubuntu2.1) ...
==> default: Setting up libkadm5clnt-mit9:amd64 (1.12+dfsg-2ubuntu5.3) ...
==> default: Setting up libkdb5-7:amd64 (1.12+dfsg-2ubuntu5.3) ...
==> default: Setting up libkadm5srv-mit9:amd64 (1.12+dfsg-2ubuntu5.3) ...
==> default: Setting up libprotobuf8:amd64 (2.5.0-9ubuntu1) ...
==> default: Setting up libmirprotobuf0:amd64 (0.1.8+14.04.20140411-0ubuntu1) 
...
==> default: Setting up libmysqlclient18:amd64 (5.5.54-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Setting up libpaper1:amd64 (1.1.24+nmu2ubuntu3) ...
==> default: 
==> default: Creating config file /etc/papersize with new version
==> default: Setting up libpcrecpp0:amd64 (1:8.31-2ubuntu2.3) ...
==> default: Setting up libpoppler44:amd64 (0.24.5-2ubuntu4.4) ...
==> default: Setting up libpoppler-glib8:amd64 (0.24.5-2ubuntu4.4) ...
==> default: Setting up libexpat1-dev:amd64 (2.1.0-4ubuntu1.3) ...
==> default: Setting up libpython2.7-dev:amd64 (2.7.6-8ubuntu0.3) ...
==> default: Setting up libsecret-common (0.16-0ubuntu1) ...
==> default: Setting up libsecret-1-0:amd64 (0.16-0ubuntu1) ...
==> default: Setting up libserf-1-1:amd64 (1.3.3-1ubuntu0.1) ...
==> default: Setting up libsvn1:amd64 (1.8.8-1ubuntu3.2) ...
==> default: Setting up libtcl8.6:amd64 (8.6.1-4ubuntu1) ...
==> default: Setting up libxft2:amd64 (2.3.1-2) ...
==> default: Setting up libxss1:amd64 (1:1.2.2-1) ...
==> default: Setting up libtk8.6:amd64 (8.6.1-3ubuntu2) ...
==> default: Setting up libudisks2-0:amd64 (2.1.3-1ubuntu0.1) ...
==> default: Setting up libxcb-randr0:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Setting up libxcb-shape0:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Setting up libxres1:amd64 (2:1.0.7-1) ...
==> default: Setting up libxslt1.1:amd64 (1.1.28-2build1) ...
==> default: Setting up libxv1:amd64 (2:1.0.10-1) ...
==> default: Setting up libxvmc1:amd64 (2:1.0.8-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up libxxf86dga1:amd64 (2:1.1.4-1) ...
==> default: Setting up tex-common (4.04) ...
==> default: Running mktexlsr. This may take some time... 
==> default: done.
==> default: texlive-base is not ready, delaying updmap-sys call
==> default: texlive-base is not ready, skipping fmtutil-sys --all call
==> default: Setting up fonts-lmodern (2.004.4-3) ...
==> default: Setting up libdbi-perl (1.630-1) ...
==> default: Setting up libdbd-mysql-perl (4.025-1ubuntu0.1) ...
==> default: Setting up libterm-readkey-perl (2.31-1) ...
==> default: Setting up mysql-client-core-5.5 (5.5.54-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Setting up mysql-client-5.5 (5.5.54-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Setting up mysql-server-core-5.5 (5.5.54-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Setting up mysql-server-5.5 (5.5.54-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: mysql start/running, process 20755
==> default: Setting up poppler-data (0.4.6-4) ...
==> default: Setting up fonts-texgyre (2.004.2-4) ...
==> default: Setting up libc-ares2:amd64 (1.10.0-2ubuntu0.1) ...
==> default: Setting up libglu1-mesa:amd64 (9.0.0-2) ...
==> default: Setting up libgnutlsxx27:amd64 (2.12.23-12ubuntu2.7) ...
==> default: Setting up libwebp5:amd64 (0.4.0-4) ...
==> default: Setting up libwebpmux1:amd64 (0.4.0-4) ...
==> default: Setting up astyle (2.03-1) ...
==> default: Setting up autotools-dev (20130810.1) ...
==> default: Setting up libstdc++-4.8-dev:amd64 (4.8.4-2ubuntu1~14.04.3) ...
==> default: Setting up g++-4.8 (4.8.4-2ubuntu1~14.04.3) ...
==> default: Setting up g++ (4:4.8.2-1ubuntu6) ...
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/bin/g++ to provide /usr/bin/c++ (c++) in auto mode
==> default: Setting up libdpkg-perl (1.17.5ubuntu5.7) ...
==> default: Setting up dpkg-dev (1.17.5ubuntu5.7) ...
==> default: Setting up build-essential (11.6ubuntu6) ...
==> default: Setting up desktop-file-utils (0.22-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up dictionaries-common (1.20.5) ...
==> default: Setting up doxygen (1.8.6-2) ...
==> default: Setting up exuberant-ctags (1:5.9~svn20110310-7ubuntu0.1) ...
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/bin/ctags-exuberant to provide /usr/bin/ctags (ctags) 
in auto mode
==> default: update-alternatives: using /usr/bin/ctags-exuberant to provide 
/usr/bin/etags (etags) in auto mode
==> default: Setting up fonts-dejavu-extra (2.34-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up fonts-liberation (1.07.3-3) ...
==> default: Setting up fonts-lyx (2.0.8.1-0ubuntu1) ...
==> default: Setting up libgfortran-4.8-dev:amd64 (4.8.4-2ubuntu1~14.04.3) ...
==> default: Setting up gfortran-4.8 (4.8.4-2ubuntu1~14.04.3) ...
==> default: Setting up gfortran (4:4.8.2-1ubuntu6) ...
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/bin/gfortran to provide /usr/bin/f95 (f95) in auto mode
==> default: Setting up libijs-0.35 (0.35-8build1) ...
==> default: Setting up libjbig2dec0 (0.11+20120125-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up libgs9-common (9.10~dfsg-0ubuntu10.6) ...
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/share/ghostscript/9.10 to provide 
/usr/share/ghostscript/current (ghostscript-current) in auto mode
==> default: Setting up libgs9 (9.10~dfsg-0ubuntu10.6) ...
==> default: Setting up gsfonts (1:8.11+urwcyr1.0.7~pre44-4.2ubuntu1) ...
==> default: Setting up ghostscript (9.10~dfsg-0ubuntu10.6) ...
==> default: Setting up gir1.2-freedesktop (1.40.0-1ubuntu0.2) ...
==> default: Setting up gir1.2-poppler-0.18 (0.24.5-2ubuntu4.4) ...
==> default: Setting up liberror-perl (0.17-1.1) ...
==> default: Setting up git-man (1:1.9.1-1ubuntu0.4) ...
==> default: Setting up git (1:1.9.1-1ubuntu0.4) ...
==> default: Setting up libcdt5 (2.36.0-0ubuntu3.1) ...
==> default: Setting up libcgraph6 (2.36.0-0ubuntu3.1) ...
==> default: Setting up libpathplan4 (2.36.0-0ubuntu3.1) ...
==> default: Setting up libgvc6 (2.36.0-0ubuntu3.1) ...
==> default: Setting up libgvpr2 (2.36.0-0ubuntu3.1) ...
==> default: Setting up graphviz (2.36.0-0ubuntu3.1) ...
==> default: Setting up x11-utils (7.7+1) ...
==> default: Setting up udisks2 (2.1.3-1ubuntu0.1) ...
==> default: Setting up gvfs-common (1.20.3-0ubuntu1.2) ...
==> default: Setting up gvfs-libs:amd64 (1.20.3-0ubuntu1.2) ...
==> default: Setting up gvfs-daemons (1.20.3-0ubuntu1.2) ...
==> default: Setting up gvfs:amd64 (1.20.3-0ubuntu1.2) ...
==> default: Setting up comerr-dev (2.1-1.42.9-3ubuntu1.3) ...
==> default: Setting up krb5-multidev (1.12+dfsg-2ubuntu5.3) ...
==> default: Setting up libkpathsea6 (2013.20130729.30972-2build3) ...
==> default: Setting up libptexenc1 (2013.20130729.30972-2build3) ...
==> default: Setting up texlive-binaries (2013.20130729.30972-2build3) ...
==> default: update-alternatives: using /usr/bin/xdvi-xaw to provide 
/usr/bin/xdvi.bin (xdvi.bin) in auto mode
==> default: update-alternatives: using /usr/bin/bibtex.original to provide 
/usr/bin/bibtex (bibtex) in auto mode
==> default: Building format(s) --refresh.
==> default:    This may take some time... 
==> default: done.
==> default: Setting up xdg-utils (1.1.0~rc1-2ubuntu7.1) ...
==> default: Setting up luatex (0.76.0-3ubuntu1) ...
==> default: texlive-base is not ready, cannot create formats
==> default: Setting up libpaper-utils (1.1.24+nmu2ubuntu3) ...
==> default: Setting up texlive-base (2013.20140215-1) ...
==> default: /usr/bin/tl-paper: setting paper size for dvips to a4.
==> default: /usr/bin/tl-paper: setting paper size for dvipdfmx to a4.
==> default: /usr/bin/tl-paper: setting paper size for xdvi to a4.
==> default: /usr/bin/tl-paper: setting paper size for pdftex to a4.
==> default: /usr/bin/tl-paper: setting paper size for dvipdfmx to letter.
==> default: /usr/bin/tl-paper: setting paper size for dvips to letter.
==> default: /usr/bin/tl-paper: setting paper size for pdftex to letter.
==> default: /usr/bin/tl-paper: setting paper size for xdvi to letter.
==> default: Running mktexlsr. This may take some time... 
==> default: done.
==> default: Building format(s) --refresh.
==> default:    This may take some time... 
==> default: done.
==> default: Running mktexlsr. This may take some time... 
==> default: done.
==> default: Building format(s) --all.
==> default:    This may take some time... 
==> default: done.
==> default: Setting up libalgorithm-diff-perl (1.19.02-3) ...
==> default: Setting up libalgorithm-diff-xs-perl (0.04-2build4) ...
==> default: Setting up libalgorithm-merge-perl (0.08-2) ...
==> default: Setting up libblas3 (1.2.20110419-7) ...
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/libblas/libblas.so.3 to provide 
/usr/lib/libblas.so.3 (libblas.so.3) in auto mode
==> default: Setting up zlib1g-dev:amd64 (1:1.2.8.dfsg-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up libpng12-dev (1.2.50-1ubuntu2.14.04.2) ...
==> default: Setting up libfreetype6-dev (2.5.2-1ubuntu2.6) ...
==> default: Setting up pkg-config (0.26-1ubuntu4) ...
==> default: Setting up libfontconfig1-dev (2.11.0-0ubuntu4.2) ...
==> default: Setting up xorg-sgml-doctools (1:1.11-1) ...
==> default: Setting up x11proto-core-dev (7.0.26-1~ubuntu2) ...
==> default: Setting up libxau-dev:amd64 (1:1.0.8-1) ...
==> default: Setting up libxdmcp-dev:amd64 (1:1.1.1-1) ...
==> default: Setting up x11proto-input-dev (2.3-1) ...
==> default: Setting up x11proto-kb-dev (1.0.6-2) ...
==> default: Setting up xtrans-dev (1.3.5-1~ubuntu14.04.1) ...
==> default: Setting up libpthread-stubs0-dev:amd64 (0.3-4) ...
==> default: Setting up libxcb1-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Setting up libx11-dev:amd64 (2:1.6.2-1ubuntu2) ...
==> default: Setting up x11proto-render-dev (2:0.11.1-2) ...
==> default: Setting up libxrender-dev:amd64 (1:0.9.8-1build0.14.04.1) ...
==> default: Setting up libice-dev:amd64 (2:1.0.8-2) ...
==> default: Setting up libsm-dev:amd64 (2:1.2.1-2) ...
==> default: Setting up libpixman-1-dev (0.30.2-2ubuntu1.1) ...
==> default: Setting up libxcb-render0-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Setting up libxcb-shm0-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Setting up x11proto-xext-dev (7.3.0-1) ...
==> default: Setting up libxext-dev:amd64 (2:1.3.2-1ubuntu0.0.14.04.1) ...
==> default: Setting up libglib2.0-bin (2.40.2-0ubuntu1) ...
==> default: Setting up libpcre3-dev:amd64 (1:8.31-2ubuntu2.3) ...
==> default: Setting up libglib2.0-dev (2.40.2-0ubuntu1) ...
==> default: Setting up libcairo2-dev (1.13.0~20140204-0ubuntu1.1) ...
==> default: Setting up libidn11-dev (1.28-1ubuntu2.1) ...
==> default: Setting up libkrb5-dev (1.12+dfsg-2ubuntu5.3) ...
==> default: Setting up libldap2-dev:amd64 (2.4.31-1+nmu2ubuntu8.3) ...
==> default: Setting up libgpg-error-dev (1.12-0.2ubuntu1) ...
==> default: Setting up libgcrypt11-dev (1.5.3-2ubuntu4.4) ...
==> default: Setting up libtasn1-6-dev (3.4-3ubuntu0.4) ...
==> default: Setting up libp11-kit-dev (0.20.2-2ubuntu2) ...
==> default: Setting up libgnutls-dev (2.12.23-12ubuntu2.7) ...
==> default: Setting up librtmp-dev (2.4+20121230.gitdf6c518-1) ...
==> default: Setting up libssl-dev:amd64 (1.0.1f-1ubuntu2.22) ...
==> default: Setting up libcurl4-openssl-dev:amd64 (7.35.0-1ubuntu2.10) ...
==> default: Setting up x11proto-dmx-dev (1:2.3.1-2) ...
==> default: Setting up libdmx-dev:amd64 (1:1.1.3-1) ...
==> default: Setting up libdrm-dev:amd64 (2.4.67-1ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Setting up x11proto-dri2-dev (2.8-2) ...
==> default: Setting up x11proto-gl-dev (1.4.17-1) ...
==> default: Setting up x11proto-xf86vidmode-dev (2.3.1-2) ...
==> default: Setting up libxxf86vm-dev:amd64 (1:1.1.3-1) ...
==> default: Setting up x11proto-fixes-dev (1:5.0-2ubuntu2) ...
==> default: Setting up libxfixes-dev:amd64 (1:5.0.1-1ubuntu1.1) ...
==> default: Setting up x11proto-damage-dev (1:1.2.1-2) ...
==> default: Setting up libxdamage-dev:amd64 (1:1.1.4-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up libxcb-glx0-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Setting up libxcb-dri2-0-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Setting up libxcb-dri3-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Setting up libxcb-randr0-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Setting up libxcb-shape0-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Setting up libxcb-xfixes0-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Setting up libxcb-sync-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Setting up libxcb-present-dev:amd64 (1.10-2ubuntu1) ...
==> default: Setting up libxshmfence-dev:amd64 (1.1-2) ...
==> default: Setting up libx11-xcb-dev:amd64 (2:1.6.2-1ubuntu2) ...
==> default: Setting up libprotobuf-lite8:amd64 (2.5.0-9ubuntu1) ...
==> default: Setting up libprotobuf-dev:amd64 (2.5.0-9ubuntu1) ...
==> default: Setting up libmirprotobuf-dev:amd64 
(0.1.8+14.04.20140411-0ubuntu1) ...
==> default: Setting up mircommon-dev:amd64 (0.1.8+14.04.20140411-0ubuntu1) ...
==> default: Setting up libwayland-dev (1.4.0-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up libfile-basedir-perl (0.03-1fakesync1) ...
==> default: Setting up libfile-desktopentry-perl (0.07-1) ...
==> default: Setting up libfile-fcntllock-perl (0.14-2build1) ...
==> default: Setting up libfile-mimeinfo-perl (0.22-1) ...
==> default: Setting up libfontenc-dev:amd64 (1:1.1.2-1) ...
==> default: Setting up x11proto-fonts-dev (2.1.3-1~ubuntu2) ...
==> default: Setting up libfs-dev:amd64 (2:1.0.5-1) ...
==> default: Setting up mesa-common-dev (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Setting up libgl1-mesa-dev (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Setting up libglu1-mesa-dev (9.0.0-2) ...
==> default: Setting up libxdot4 (2.36.0-0ubuntu3.1) ...
==> default: Setting up libltdl-dev:amd64 (2.4.2-1.7ubuntu1) ...
==> default: Setting up libgraphviz-dev (2.36.0-0ubuntu3.1) ...
==> default: Setting up libgtk2.0-bin (2.24.23-0ubuntu1.4) ...
==> default: Setting up libhtml-template-perl (2.95-1) ...
==> default: Setting up libhunspell-dev:amd64 (1.3.2-6ubuntu2.1) ...
==> default: Setting up liblapack3 (3.5.0-2ubuntu1) ...
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/lapack/liblapack.so.3 to provide 
/usr/lib/liblapack.so.3 (liblapack.so.3) in auto mode
==> default: Setting up libmysqlclient-dev (5.5.54-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Setting up libpython-dev:amd64 (2.7.5-5ubuntu3) ...
==> default: Setting up libssl-doc (1.0.1f-1ubuntu2.22) ...
==> default: Setting up libtool (2.4.2-1.7ubuntu1) ...
==> default: Setting up libutempter0 (1.1.5-4build1) ...
==> default: Creating utempter group...
==> default: Setting up libv8-3.14.5 (3.14.5.8-5ubuntu2) ...
==> default: Setting up libx11-doc (2:1.6.2-1ubuntu2) ...
==> default: Setting up libxt-dev:amd64 (1:1.1.4-1) ...
==> default: Setting up libxmu-headers (2:1.1.1-1) ...
==> default: Setting up libxmu-dev:amd64 (2:1.1.1-1) ...
==> default: Setting up libxpm-dev:amd64 (1:3.5.10-1ubuntu0.1) ...
==> default: Setting up libxaw7-dev:amd64 (2:1.0.12-1) ...
==> default: Setting up x11proto-composite-dev (1:0.4.2-2) ...
==> default: Setting up libxcomposite-dev (1:0.4.4-1) ...
==> default: Setting up libxcursor-dev:amd64 (1:1.1.14-1) ...
==> default: Setting up libxfont-dev (1:1.4.7-1ubuntu0.2) ...
==> default: Setting up libxft-dev (2.3.1-2) ...
==> default: Setting up libxi-dev (2:1.7.1.901-1ubuntu1.1) ...
==> default: Setting up x11proto-xinerama-dev (1.2.1-2) ...
==> default: Setting up libxinerama-dev:amd64 (2:1.1.3-1) ...
==> default: Setting up libxkbfile-dev:amd64 (1:1.0.8-1) ...
==> default: Setting up libxml2-dev:amd64 (2.9.1+dfsg1-3ubuntu4.9) ...
==> default: Setting up libxmuu-dev:amd64 (2:1.1.1-1) ...
==> default: Setting up x11proto-randr-dev (1.5.0-1~trusty1) ...
==> default: Setting up libxrandr-dev:amd64 (2:1.5.0-1~trusty1) ...
==> default: Setting up x11proto-resource-dev (1.2.0-3) ...
==> default: Setting up libxres-dev (2:1.0.7-1) ...
==> default: Setting up libxslt1-dev:amd64 (1.1.28-2build1) ...
==> default: Setting up x11proto-scrnsaver-dev (1.2.2-1) ...
==> default: Setting up libxss-dev:amd64 (1:1.2.2-1) ...
==> default: Setting up x11proto-record-dev (1.14.2-1) ...
==> default: Setting up libxtst-dev:amd64 (2:1.2.2-1) ...
==> default: Setting up x11proto-video-dev (2.3.2-1) ...
==> default: Setting up libxv-dev:amd64 (2:1.0.10-1) ...
==> default: Setting up libxvmc-dev:amd64 (2:1.0.8-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up x11proto-xf86dga-dev (2.1-3) ...
==> default: Setting up libxxf86dga-dev:amd64 (2:1.1.4-1) ...
==> default: Setting up lksctp-tools (1.0.15+dfsg-1) ...
==> default: Setting up mysql-client (5.5.54-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Setting up policykit-1-gnome (0.105-1ubuntu4) ...
==> default: Setting up ps2eps (1.68-1build1) ...
==> default: Setting up python-cairo (1.8.8-1ubuntu5) ...
==> default: Setting up python3-pkg-resources (3.3-1ubuntu2) ...
==> default: Setting up python-chardet-whl (2.2.1-2~ubuntu1) ...
==> default: Setting up python-colorama (0.2.5-0.1ubuntu2) ...
==> default: Setting up python-colorama-whl (0.2.5-0.1ubuntu2) ...
==> default: Setting up python-dateutil (1.5+dfsg-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up python2.7-dev (2.7.6-8ubuntu0.3) ...
==> default: Setting up python-dev (2.7.5-5ubuntu3) ...
==> default: Setting up python-distlib (0.1.8-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up python-distlib-whl (0.1.8-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up python-gobject-2 (2.28.6-12build1) ...
==> default: Setting up python-gtk2 (2.24.0-3ubuntu3) ...
==> default: Setting up python-glade2 (2.24.0-3ubuntu3) ...
==> default: Setting up python-html5lib (0.999-3~ubuntu1) ...
==> default: Setting up python-html5lib-whl (0.999-3~ubuntu1) ...
==> default: Setting up python-pil (2.3.0-1ubuntu3.4) ...
==> default: Setting up python-imaging (2.3.0-1ubuntu3.4) ...
==> default: Setting up python-libxml2 (2.9.1+dfsg1-3ubuntu4.9) ...
==> default: Setting up python-lxml (3.3.3-1ubuntu0.1) ...
==> default: Setting up python-matplotlib-data (1.3.1-1ubuntu5) ...
==> default: Setting up python-pyparsing (2.0.1+dfsg1-1build1) ...
==> default: Setting up python-tz (2012c-1ubuntu0.1) ...
==> default: Setting up python-numpy (1:1.8.2-0ubuntu0.1) ...
==> default: Setting up python-support (1.0.15) ...
==> default: Setting up python-matplotlib (1.3.1-1ubuntu5) ...
==> default: Setting up python-notify (0.1.1-3ubuntu2) ...
==> default: Setting up python-six-whl (1.5.2-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up python-urllib3-whl (1.7.1-1ubuntu4) ...
==> default: Setting up python-requests-whl (2.2.1-1ubuntu0.3) ...
==> default: Setting up python-setuptools-whl (3.3-1ubuntu2) ...
==> default: Setting up python-pip-whl (1.5.4-1ubuntu4) ...
==> default: Setting up python-setuptools (3.3-1ubuntu2) ...
==> default: Setting up python-pip (1.5.4-1ubuntu4) ...
==> default: Setting up python-tk (2.7.5-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up python-wheel (0.24.0-1~ubuntu1) ...
==> default: Setting up sinntp (1.5-1) ...
==> default: Setting up sloccount (2.26-5.1) ...
==> default: Setting up subversion (1.8.8-1ubuntu3.2) ...
==> default: Setting up tcl8.6 (8.6.1-4ubuntu1) ...
==> default: Setting up tcl (8.6.0+6ubuntu3) ...
==> default: Setting up tk8.6 (8.6.1-3ubuntu2) ...
==> default: Setting up tk (8.6.0+6ubuntu3) ...
==> default: Setting up x11-xserver-utils (7.7+2ubuntu1) ...
==> default: Setting up x11proto-bigreqs-dev (1:1.1.2-1) ...
==> default: Setting up x11proto-dri3-dev (1.0-1) ...
==> default: Setting up x11proto-present-dev (1.0-1) ...
==> default: Setting up x11proto-xcmisc-dev (1.2.2-1) ...
==> default: Setting up x11proto-xf86bigfont-dev (1.2.0-3) ...
==> default: Setting up x11proto-xf86dri-dev (2.1.1-2) ...
==> default: Setting up xbitmaps (1.1.1-2) ...
==> default: Setting up libpciaccess-dev:amd64 (0.13.2-1) ...
==> default: Setting up xsltproc (1.1.28-2build1) ...
==> default: Setting up xterm (297-1ubuntu1) ...
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/bin/xterm to provide /usr/bin/x-terminal-emulator 
(x-terminal-emulator) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/bin/lxterm to provide /usr/bin/x-terminal-emulator 
(x-terminal-emulator) in auto mode
==> default: Setting up libyaml-dev:amd64 (0.1.4-3ubuntu3.1) ...
==> default: Setting up nodejs (0.10.25~dfsg2-2ubuntu1) ...
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/bin/nodejs to provide /usr/bin/js (js) in auto mode
==> default: Setting up python-mock (1.0.1-3) ...
==> default: Processing triggers for tex-common (4.04) ...
==> default: Running mktexlsr. This may take some time... 
==> default: done.
==> default: Running updmap-sys. This may take some time... 
==> default: done.
==> default: Running mktexlsr /var/lib/texmf ... 
==> default: done.
==> default: Setting up lmodern (2.004.4-3) ...
==> default: Setting up tex-gyre (2.004.2-4) ...
==> default: Setting up texlive-latex-base (2013.20140215-1) ...
==> default: Running mktexlsr. This may take some time... 
==> default: done.
==> default: Building format(s) --all --cnffile 
/etc/texmf/fmt.d/10texlive-latex-base.cnf.
==> default:    This may take some time... 
==> default: done.
==> default: Setting up texlive-generic-recommended (2013.20140215-1) ...
==> default: Setting up texlive-fonts-recommended (2013.20140215-1) ...
==> default: Setting up texlive-font-utils (2013.20140215-2) ...
==> default: Setting up texlive-fonts-recommended-doc (2013.20140215-1) ...
==> default: Setting up texlive-latex-base-doc (2013.20140215-1) ...
==> default: Setting up texlive-latex-recommended-doc (2013.20140215-1) ...
==> default: Setting up texlive-luatex (2013.20140215-1) ...
==> default: Setting up texlive-pstricks-doc (2013.20140215-2) ...
==> default: Processing triggers for tex-common (4.04) ...
==> default: Running mktexlsr. This may take some time... 
==> default: done.
==> default: Running updmap-sys. This may take some time... 
==> default: done.
==> default: Running mktexlsr /var/lib/texmf ... 
==> default: done.
==> default: Setting up texlive-latex-recommended (2013.20140215-1) ...
==> default: Setting up texlive-extra-utils (2013.20140215-2) ...
==> default: Setting up tipa (2:1.3-19) ...
==> default: Processing triggers for tex-common (4.04) ...
==> default: Running mktexlsr. This may take some time... 
==> default: done.
==> default: Running updmap-sys. This may take some time... 
==> default: done.
==> default: Running mktexlsr /var/lib/texmf ... 
==> default: done.
==> default: Setting up latex-xcolor (2.11-1.1) ...
==> default: Setting up texlive (2013.20140215-1) ...
==> default: Processing triggers for ureadahead (0.100.0-16) ...
==> default: Setting up mysql-server (5.5.54-0ubuntu0.14.04.1) ...
==> default: Processing triggers for tex-common (4.04) ...
==> default: Running mktexlsr. This may take some time... 
==> default: done.
==> default: Setting up pgf (2.10-1) ...
==> default: Processing triggers for tex-common (4.04) ...
==> default: Running mktexlsr. This may take some time... 
==> default: done.
==> default: Setting up texlive-pstricks (2013.20140215-2) ...
==> default: Setting up latex-beamer (3.24-1) ...
==> default: Processing triggers for dictionaries-common (1.20.5) ...
==> default: Setting up hunspell-en-us (20070829-4ubuntu3) ...
==> default: Processing triggers for tex-common (4.04) ...
==> default: Running mktexlsr. This may take some time... 
==> default: done.
==> default: Setting up prosper (1.00.4+cvs.2007.05.01-4) ...
==> default: Running mktexlsr. This may take some time... 
==> default: done.
==> default: Setting up default-jre-headless (2:1.7-51) ...
==> default: Setting up default-jre (2:1.7-51) ...
==> default: Setting up gconf-service (3.2.6-0ubuntu2) ...
==> default: Setting up libgnome2-bin (2.32.1-4ubuntu1) ...
==> default: Setting up libmirclientplatform-mesa:amd64 
(0.1.8+14.04.20140411-0ubuntu1) ...
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/x86_64-linux-gnu/mir/clientplatform/mesa/ld.so.conf 
to provide /etc/ld.so.conf.d/x86_64-linux-gnu_mirclientplatform.conf 
(x86_64-linux-gnu_mirclientplatform_conf) in auto mode
==> default: Setting up libmirclient7:amd64 (0.1.8+14.04.20140411-0ubuntu1) ...
==> default: Setting up libmirclient-dev:amd64 (0.1.8+14.04.20140411-0ubuntu1) 
...
==> default: Setting up libegl1-mesa-dev (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Setting up libgconf2-4:amd64 (3.2.6-0ubuntu2) ...
==> default: Setting up libgles2-mesa-dev (10.1.3-0ubuntu0.6) ...
==> default: Setting up libpoppler-dev (0.24.5-2ubuntu4.4) ...
==> default: Setting up libpoppler-glib-dev (0.24.5-2ubuntu4.4) ...
==> default: Setting up xserver-xorg-dev (2:1.15.1-0ubuntu2.7) ...
==> default: Setting up xorg-dev (1:7.7+1ubuntu8.1) ...
==> default: Setting up libnss3-nssdb (2:3.26.2-0ubuntu0.14.04.3) ...
==> default: Setting up libnss3:amd64 (2:3.26.2-0ubuntu0.14.04.3) ...
==> default: Setting up ca-certificates-java (20130815ubuntu1) ...
==> default: Adding debian:Equifax_Secure_Global_eBusiness_CA.pem
==> default: Adding 
debian:Verisign_Class_3_Public_Primary_Certification_Authority_2.pem
==> default: Adding debian:USERTrust_ECC_Certification_Authority.pem
==> default: Adding debian:ACCVRAIZ1.pem
==> default: Adding debian:AddTrust_Public_Services_Root.pem
==> default: Adding debian:EBG_Elektronik_Sertifika_Hizmet_Sağlayıcısı.pem
==> default: Adding debian:T-TeleSec_GlobalRoot_Class_2.pem
==> default: Adding debian:GlobalSign_Root_CA_-_R3.pem
==> default: Adding debian:DigiCert_Global_Root_G2.pem
==> default: Adding debian:OISTE_WISeKey_Global_Root_GB_CA.pem
==> default: Adding debian:Go_Daddy_Root_Certificate_Authority_-_G2.pem
==> default: Adding 
debian:China_Internet_Network_Information_Center_EV_Certificates_Root.pem
==> default: Adding 
debian:Verisign_Class_3_Public_Primary_Certification_Authority_-_G2.pem
==> default: Adding debian:thawte_Primary_Root_CA_-_G2.pem
==> default: Adding debian:USERTrust_RSA_Certification_Authority.pem
==> default: Adding debian:Entrust_Root_Certification_Authority_-_EC1.pem
==> default: Adding debian:Sonera_Class_1_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:SecureTrust_CA.pem
==> default: Adding debian:Comodo_AAA_Services_root.pem
==> default: Adding debian:D-TRUST_Root_Class_3_CA_2_2009.pem
==> default: Adding 
debian:VeriSign_Class_3_Public_Primary_Certification_Authority_-_G4.pem
==> default: Adding debian:thawte_Primary_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:Visa_eCommerce_Root.pem
==> default: Adding debian:thawte_Primary_Root_CA_-_G3.pem
==> default: Adding debian:GeoTrust_Universal_CA.pem
==> default: Adding debian:DigiCert_Trusted_Root_G4.pem
==> default: Adding debian:Secure_Global_CA.pem
==> default: Adding debian:Certum_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:DigiCert_Assured_ID_Root_G3.pem
==> default: Adding debian:TURKTRUST_Certificate_Services_Provider_Root_2007.pem
==> default: Adding debian:WellsSecure_Public_Root_Certificate_Authority.pem
==> default: Adding debian:AddTrust_Low-Value_Services_Root.pem
==> default: Adding debian:DigiCert_Assured_ID_Root_G2.pem
==> default: Adding debian:Security_Communication_RootCA2.pem
==> default: Adding debian:QuoVadis_Root_CA_3_G3.pem
==> default: Adding debian:GeoTrust_Universal_CA_2.pem
==> default: Adding debian:ComSign_CA.pem
==> default: Adding debian:Certinomis_-_Autorité_Racine.pem
==> default: Adding debian:certSIGN_ROOT_CA.pem
==> default: Adding debian:ePKI_Root_Certification_Authority.pem
==> default: Adding debian:Staat_der_Nederlanden_Root_CA_-_G2.pem
==> default: Adding debian:Certum_Trusted_Network_CA.pem
==> default: Adding debian:TC_TrustCenter_Class_3_CA_II.pem
==> default: Adding 
debian:VeriSign_Class_3_Public_Primary_Certification_Authority_-_G5.pem
==> default: Adding debian:Chambers_of_Commerce_Root_-_2008.pem
==> default: Adding debian:Microsec_e-Szigno_Root_CA_2009.pem
==> default: Adding debian:Entrust_Root_Certification_Authority.pem
==> default: Adding debian:Taiwan_GRCA.pem
==> default: Adding 
debian:Autoridad_de_Certificacion_Firmaprofesional_CIF_A62634068.pem
==> default: Adding debian:DigiCert_Global_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:Izenpe.com.pem
==> default: Adding debian:VeriSign_Universal_Root_Certification_Authority.pem
==> default: Adding debian:OISTE_WISeKey_Global_Root_GA_CA.pem
==> default: Adding 
debian:Verisign_Class_2_Public_Primary_Certification_Authority_-_G3.pem
==> default: Adding debian:Starfield_Class_2_CA.pem
==> default: Adding 
debian:TÜRKTRUST_Elektronik_Sertifika_Hizmet_Sağlayıcısı_H5.pem
==> default: Adding 
debian:Verisign_Class_1_Public_Primary_Certification_Authority_-_G2.pem
==> default: Adding debian:Entrust_Root_Certification_Authority_-_G2.pem
==> default: Adding debian:QuoVadis_Root_CA_3.pem
==> default: Adding debian:StartCom_Certification_Authority_G2.pem
==> default: Adding 
debian:S-TRUST_Authentication_and_Encryption_Root_CA_2005_PN.pem
==> default: Adding 
debian:Verisign_Class_1_Public_Primary_Certification_Authority_-_G3.pem
==> default: Adding debian:CNNIC_ROOT.pem
==> default: Adding debian:Entrust.net_Premium_2048_Secure_Server_CA.pem
==> default: Adding debian:Swisscom_Root_CA_2.pem
==> default: Adding debian:NetLock_Notary_=Class_A=_Root.pem
==> default: Adding debian:Buypass_Class_3_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:AffirmTrust_Networking.pem
==> default: Adding debian:T-TeleSec_GlobalRoot_Class_3.pem
==> default: Adding debian:Swisscom_Root_CA_1.pem
==> default: Adding debian:Certigna.pem
==> default: Adding debian:StartCom_Certification_Authority.pem
==> default: Adding debian:Starfield_Root_Certificate_Authority_-_G2.pem
==> default: Adding debian:RSA_Security_2048_v3.pem
==> default: Adding debian:QuoVadis_Root_CA_2.pem
==> default: Adding debian:COMODO_Certification_Authority.pem
==> default: Adding debian:Camerfirma_Global_Chambersign_Root.pem
==> default: Adding debian:ACEDICOM_Root.pem
==> default: Adding debian:TWCA_Root_Certification_Authority.pem
==> default: Adding debian:Comodo_Secure_Services_root.pem
==> default: Adding 
debian:Verisign_Class_1_Public_Primary_Certification_Authority.pem
==> default: Adding debian:COMODO_ECC_Certification_Authority.pem
==> default: Adding debian:PSCProcert.pem
==> default: Adding debian:CFCA_EV_ROOT.pem
==> default: Adding debian:IdenTrust_Commercial_Root_CA_1.pem
==> default: Adding debian:AddTrust_External_Root.pem
==> default: Adding debian:UTN_USERFirst_Hardware_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:TeliaSonera_Root_CA_v1.pem
==> default: Adding debian:AffirmTrust_Premium_ECC.pem
==> default: Adding debian:Deutsche_Telekom_Root_CA_2.pem
==> default: Adding debian:CA_Disig_Root_R2.pem
==> default: Adding debian:QuoVadis_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:Staat_der_Nederlanden_Root_CA_-_G3.pem
==> default: Adding debian:CA_Disig.pem
==> default: Adding debian:GlobalSign_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:Global_Chambersign_Root_-_2008.pem
==> default: Adding debian:GlobalSign_Root_CA_-_R2.pem
==> default: Adding debian:SwissSign_Platinum_CA_-_G2.pem
==> default: Adding debian:SwissSign_Gold_CA_-_G2.pem
==> default: Adding debian:Sonera_Class_2_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:UTN_USERFirst_Email_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:SwissSign_Silver_CA_-_G2.pem
==> default: Adding debian:AffirmTrust_Premium.pem
==> default: Adding debian:Buypass_Class_2_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:DigiCert_Assured_ID_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:AffirmTrust_Commercial.pem
==> default: Adding debian:Equifax_Secure_CA.pem
==> default: Adding debian:IdenTrust_Public_Sector_Root_CA_1.pem
==> default: Adding debian:GlobalSign_ECC_Root_CA_-_R5.pem
==> default: Adding debian:Certification_Authority_of_WoSign_G2.pem
==> default: Adding 
debian:Verisign_Class_2_Public_Primary_Certification_Authority_-_G2.pem
==> default: Adding debian:WoSign_China.pem
==> default: Adding debian:Certinomis_-_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:QuoVadis_Root_CA_2_G3.pem
==> default: Adding debian:Juur-SK.pem
==> default: Adding debian:COMODO_RSA_Certification_Authority.pem
==> default: Adding debian:DigiCert_High_Assurance_EV_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:Staat_der_Nederlanden_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:Hongkong_Post_Root_CA_1.pem
==> default: Adding debian:Staat_der_Nederlanden_EV_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:GeoTrust_Global_CA.pem
==> default: Adding 
debian:Starfield_Services_Root_Certificate_Authority_-_G2.pem
==> default: Adding debian:S-TRUST_Universal_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:SecureSign_RootCA11.pem
==> default: Adding debian:Trustis_FPS_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:NetLock_Arany_=Class_Gold=_Főtanúsítvány.pem
==> default: Adding debian:Actalis_Authentication_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:StartCom_Certification_Authority_2.pem
==> default: Adding debian:D-TRUST_Root_Class_3_CA_2_EV_2009.pem
==> default: Adding 
debian:Verisign_Class_3_Public_Primary_Certification_Authority_-_G3.pem
==> default: Adding debian:WoSign.pem
==> default: Adding debian:Baltimore_CyberTrust_Root.pem
==> default: Adding debian:CA_WoSign_ECC_Root.pem
==> default: Adding debian:E-Tugra_Certification_Authority.pem
==> default: Adding debian:NetLock_Express_=Class_C=_Root.pem
==> default: Adding debian:Certplus_Class_2_Primary_CA.pem
==> default: Adding debian:Swisscom_Root_EV_CA_2.pem
==> default: Adding debian:Network_Solutions_Certificate_Authority.pem
==> default: Adding debian:AC_Raíz_Certicámara_S.A..pem
==> default: Adding debian:Buypass_Class_2_CA_1.pem
==> default: Adding debian:GeoTrust_Primary_Certification_Authority.pem
==> default: Adding 
debian:TÜRKTRUST_Elektronik_Sertifika_Hizmet_Sağlayıcısı_H6.pem
==> default: Adding debian:QuoVadis_Root_CA_1_G3.pem
==> default: Adding debian:EE_Certification_Centre_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:GeoTrust_Primary_Certification_Authority_-_G2.pem
==> default: Adding debian:TWCA_Global_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:EC-ACC.pem
==> default: Adding debian:Atos_TrustedRoot_2011.pem
==> default: Adding debian:Security_Communication_EV_RootCA1.pem
==> default: Adding debian:ApplicationCA_-_Japanese_Government.pem
==> default: Adding debian:XRamp_Global_CA_Root.pem
==> default: Adding debian:Comodo_Trusted_Services_root.pem
==> default: Adding debian:DigiCert_Global_Root_G3.pem
==> default: Adding debian:Go_Daddy_Class_2_CA.pem
==> default: Adding debian:IGC_A.pem
==> default: Adding debian:NetLock_Qualified_=Class_QA=_Root.pem
==> default: Adding 
debian:TÜBİTAK_UEKAE_Kök_Sertifika_Hizmet_Sağlayıcısı_-_Sürüm_3.pem
==> default: Adding debian:GlobalSign_ECC_Root_CA_-_R4.pem
==> default: Adding debian:Cybertrust_Global_Root.pem
==> default: Adding debian:DST_Root_CA_X3.pem
==> default: Adding debian:GeoTrust_Primary_Certification_Authority_-_G3.pem
==> default: Adding debian:CA_Disig_Root_R1.pem
==> default: Adding debian:Root_CA_Generalitat_Valenciana.pem
==> default: Adding 
debian:Hellenic_Academic_and_Research_Institutions_RootCA_2011.pem
==> default: Adding debian:AddTrust_Qualified_Certificates_Root.pem
==> default: Adding debian:DST_ACES_CA_X6.pem
==> default: Adding debian:NetLock_Business_=Class_B=_Root.pem
==> default: Adding debian:Equifax_Secure_eBusiness_CA_1.pem
==> default: Adding debian:Security_Communication_Root_CA.pem
==> default: Adding debian:Camerfirma_Chambers_of_Commerce_Root.pem
==> default: Adding debian:GeoTrust_Global_CA_2.pem
==> default: Adding debian:Microsec_e-Szigno_Root_CA.pem
==> default: Adding 
debian:Verisign_Class_3_Public_Primary_Certification_Authority.pem
==> default: done.
==> default: Setting up openjdk-7-jre-headless:amd64 
(7u121-2.6.8-1ubuntu0.14.04.3) ...
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/bin/java to provide 
/usr/bin/java (java) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/bin/keytool to provide 
/usr/bin/keytool (keytool) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/bin/pack200 to provide 
/usr/bin/pack200 (pack200) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/bin/rmid to provide 
/usr/bin/rmid (rmid) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/bin/rmiregistry to 
provide /usr/bin/rmiregistry (rmiregistry) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/bin/unpack200 to 
provide /usr/bin/unpack200 (unpack200) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/bin/orbd to provide 
/usr/bin/orbd (orbd) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/bin/servertool to 
provide /usr/bin/servertool (servertool) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/bin/tnameserv to 
provide /usr/bin/tnameserv (tnameserv) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/jexec to provide 
/usr/bin/jexec (jexec) in auto mode
==> default: Setting up libatk-wrapper-java (0.30.4-4) ...
==> default: Setting up libatk-wrapper-java-jni:amd64 (0.30.4-4) ...
==> default: Setting up openjdk-7-jre:amd64 (7u121-2.6.8-1ubuntu0.14.04.3) ...
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/bin/policytool to 
provide /usr/bin/policytool (policytool) in auto mode
==> default: Setting up gconf-service-backend (3.2.6-0ubuntu2) ...
==> default: Setting up gconf2 (3.2.6-0ubuntu2) ...
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/bin/gconftool-2 to provide /usr/bin/gconftool 
(gconftool) in auto mode
==> default: 
==> default: (gconftool-2:27352): GConf-WARNING **: Client failed to connect to 
the D-BUS daemon:
==> default: Unable to autolaunch a dbus-daemon without a $DISPLAY for X11
==> default: Setting up libgnomevfs2-common (1:2.24.4-1ubuntu6) ...
==> default: Setting up libgnomevfs2-0:amd64 (1:2.24.4-1ubuntu6) ...
==> default: Setting up libgnome2-common (2.32.1-4ubuntu1) ...
==> default: Setting up libgnome2-0:amd64 (2.32.1-4ubuntu1) ...
==> default: Setting up openjdk-7-jdk:amd64 (7u121-2.6.8-1ubuntu0.14.04.3) ...
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/appletviewer to 
provide /usr/bin/appletviewer (appletviewer) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/extcheck to provide 
/usr/bin/extcheck (extcheck) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/idlj to provide 
/usr/bin/idlj (idlj) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/jar to provide 
/usr/bin/jar (jar) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/jarsigner to provide 
/usr/bin/jarsigner (jarsigner) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/javac to provide 
/usr/bin/javac (javac) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/javadoc to provide 
/usr/bin/javadoc (javadoc) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/javah to provide 
/usr/bin/javah (javah) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/javap to provide 
/usr/bin/javap (javap) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/jcmd to provide 
/usr/bin/jcmd (jcmd) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/jconsole to provide 
/usr/bin/jconsole (jconsole) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/jdb to provide 
/usr/bin/jdb (jdb) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/jhat to provide 
/usr/bin/jhat (jhat) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/jinfo to provide 
/usr/bin/jinfo (jinfo) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/jmap to provide 
/usr/bin/jmap (jmap) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/jps to provide 
/usr/bin/jps (jps) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/jrunscript to provide 
/usr/bin/jrunscript (jrunscript) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/jsadebugd to provide 
/usr/bin/jsadebugd (jsadebugd) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/jstack to provide 
/usr/bin/jstack (jstack) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/jstat to provide 
/usr/bin/jstat (jstat) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/jstatd to provide 
/usr/bin/jstatd (jstatd) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/native2ascii to 
provide /usr/bin/native2ascii (native2ascii) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/rmic to provide 
/usr/bin/rmic (rmic) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/schemagen to provide 
/usr/bin/schemagen (schemagen) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/serialver to provide 
/usr/bin/serialver (serialver) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/wsgen to provide 
/usr/bin/wsgen (wsgen) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/wsimport to provide 
/usr/bin/wsimport (wsimport) in auto mode
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/bin/xjc to provide 
/usr/bin/xjc (xjc) in auto mode
==> default: Setting up default-jdk (2:1.7-51) ...
==> default: Setting up libpoppler-private-dev (0.24.5-2ubuntu4.4) ...
==> default: Processing triggers for libc-bin (2.19-0ubuntu6.11) ...
==> default: Processing triggers for python-support (1.0.15) ...
==> default: Processing triggers for ca-certificates (20160104ubuntu0.14.04.1) 
...
==> default: Updating certificates in /etc/ssl/certs... 
==> default: 0 added, 0 removed; done.
==> default: Running hooks in /etc/ca-certificates/update.d....
==> default: done.
==> default: done.
==> default: nodejs is /usr/bin/nodejs
==> default: ln: failed to create symbolic link ‘/usr/bin/nodejs’: File exists
==> default: Providing R libraries
==> default: 
Extracting templates from packages: 36%
==> default: 
Extracting templates from packages: 72%
==> default: 
Extracting templates from packages: 100%
==> default: Selecting previously unselected package libcroco3:amd64.
==> default: (Reading database ... 94314 files and directories currently 
installed.)
==> default: Preparing to unpack .../libcroco3_0.6.8-2ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libcroco3:amd64 (0.6.8-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libunistring0:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libunistring0_0.9.3-5ubuntu3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libunistring0:amd64 (0.9.3-5ubuntu3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgettextpo0:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libgettextpo0_0.18.3.1-1ubuntu3_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libgettextpo0:amd64 (0.18.3.1-1ubuntu3) ...
==> default: Selecting previously unselected package m4.
==> default: Preparing to unpack .../m4_1.4.17-2ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking m4 (1.4.17-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package autoconf.
==> default: Preparing to unpack .../autoconf_2.69-6_all.deb ...
==> default: Unpacking autoconf (2.69-6) ...
==> default: Selecting previously unselected package automake.
==> default: Preparing to unpack .../automake_1%3a1.14.1-2ubuntu1_all.deb ...
==> default: Unpacking automake (1:1.14.1-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package gettext.
==> default: Preparing to unpack .../gettext_0.18.3.1-1ubuntu3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking gettext (0.18.3.1-1ubuntu3) ...
==> default: Selecting previously unselected package intltool-debian.
==> default: Preparing to unpack .../intltool-debian_0.35.0+20060710.1_all.deb 
...
==> default: Unpacking intltool-debian (0.35.0+20060710.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package po-debconf.
==> default: Preparing to unpack .../po-debconf_1.0.16+nmu2ubuntu1_all.deb ...
==> default: Unpacking po-debconf (1.0.16+nmu2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package dh-apparmor.
==> default: Preparing to unpack 
.../dh-apparmor_2.10.95-0ubuntu2.5~14.04.1_all.deb ...
==> default: Unpacking dh-apparmor (2.10.95-0ubuntu2.5~14.04.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package debhelper.
==> default: Preparing to unpack .../debhelper_9.20131227ubuntu1_all.deb ...
==> default: Unpacking debhelper (9.20131227ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package liburi-perl.
==> default: Preparing to unpack .../liburi-perl_1.60-1_all.deb ...
==> default: Unpacking liburi-perl (1.60-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libencode-locale-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libencode-locale-perl_1.03-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libencode-locale-perl (1.03-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libhttp-date-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libhttp-date-perl_6.02-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libhttp-date-perl (6.02-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libfile-listing-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libfile-listing-perl_6.04-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libfile-listing-perl (6.04-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libhtml-tagset-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libhtml-tagset-perl_3.20-2_all.deb ...
==> default: Unpacking libhtml-tagset-perl (3.20-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libhtml-parser-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libhtml-parser-perl_3.71-1build1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libhtml-parser-perl (3.71-1build1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libhtml-tree-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libhtml-tree-perl_5.03-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libhtml-tree-perl (5.03-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libio-html-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libio-html-perl_1.00-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libio-html-perl (1.00-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package liblwp-mediatypes-perl.
==> default: Preparing to unpack .../liblwp-mediatypes-perl_6.02-1_all.deb ...
==> default: Unpacking liblwp-mediatypes-perl (6.02-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libhttp-message-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libhttp-message-perl_6.06-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libhttp-message-perl (6.06-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libhttp-cookies-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libhttp-cookies-perl_6.00-2_all.deb ...
==> default: Unpacking libhttp-cookies-perl (6.00-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libhttp-negotiate-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libhttp-negotiate-perl_6.00-2_all.deb ...
==> default: Unpacking libhttp-negotiate-perl (6.00-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libnet-ssleay-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libnet-ssleay-perl_1.58-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libnet-ssleay-perl (1.58-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libio-socket-ssl-perl.
==> default: Preparing to unpack 
.../libio-socket-ssl-perl_1.965-1ubuntu1_all.deb ...
==> default: Unpacking libio-socket-ssl-perl (1.965-1ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libnet-http-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libnet-http-perl_6.06-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libnet-http-perl (6.06-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package liblwp-protocol-https-perl.
==> default: Preparing to unpack 
.../liblwp-protocol-https-perl_6.04-2ubuntu0.1_all.deb ...
==> default: Unpacking liblwp-protocol-https-perl (6.04-2ubuntu0.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libwww-robotrules-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libwww-robotrules-perl_6.01-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libwww-robotrules-perl (6.01-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libwww-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libwww-perl_6.05-2_all.deb ...
==> default: Unpacking libwww-perl (6.05-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libxml-parser-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libxml-parser-perl_2.41-1build3_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libxml-parser-perl (2.41-1build3) ...
==> default: Selecting previously unselected package intltool.
==> default: Preparing to unpack .../intltool_0.50.2-2_all.deb ...
==> default: Unpacking intltool (0.50.2-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package dh-translations.
==> default: Preparing to unpack .../dh-translations_121_all.deb ...
==> default: Unpacking dh-translations (121) ...
==> default: Selecting previously unselected package python-scour.
==> default: Preparing to unpack .../python-scour_0.26-3build1_all.deb ...
==> default: Unpacking python-scour (0.26-3build1) ...
==> default: Selecting previously unselected package cdbs.
==> default: Preparing to unpack .../cdbs_0.4.122ubuntu2_all.deb ...
==> default: Unpacking cdbs (0.4.122ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package icu-devtools.
==> default: Preparing to unpack .../icu-devtools_52.1-3ubuntu0.5_amd64.deb ...
==> default: Unpacking icu-devtools (52.1-3ubuntu0.5) ...
==> default: Selecting previously unselected package libasprintf-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libasprintf-dev_0.18.3.1-1ubuntu3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libasprintf-dev:amd64 (0.18.3.1-1ubuntu3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libblas-dev.
==> default: Preparing to unpack .../libblas-dev_1.2.20110419-7_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libblas-dev (1.2.20110419-7) ...
==> default: Selecting previously unselected package libbz2-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libbz2-dev_1.0.6-5_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libbz2-dev:amd64 (1.0.6-5) ...
==> default: Selecting previously unselected package libfont-afm-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libfont-afm-perl_1.20-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libfont-afm-perl (1.20-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libgettextpo-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libgettextpo-dev_0.18.3.1-1ubuntu3_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libgettextpo-dev:amd64 (0.18.3.1-1ubuntu3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libhtml-form-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libhtml-form-perl_6.03-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libhtml-form-perl (6.03-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libhtml-format-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libhtml-format-perl_2.11-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libhtml-format-perl (2.11-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libhttp-daemon-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libhttp-daemon-perl_6.01-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libhttp-daemon-perl (6.01-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libicu-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libicu-dev_52.1-3ubuntu0.5_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libicu-dev:amd64 (52.1-3ubuntu0.5) ...
==> default: Selecting previously unselected package libsocket6-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libsocket6-perl_0.25-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libsocket6-perl (0.25-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libio-socket-inet6-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libio-socket-inet6-perl_2.71-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libio-socket-inet6-perl (2.71-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libjpeg-turbo8-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libjpeg-turbo8-dev_1.3.0-0ubuntu2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libjpeg-turbo8-dev:amd64 (1.3.0-0ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libjpeg8-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libjpeg8-dev_8c-2ubuntu8_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libjpeg8-dev:amd64 (8c-2ubuntu8) ...
==> default: Selecting previously unselected package libjpeg-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libjpeg-dev_8c-2ubuntu8_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libjpeg-dev:amd64 (8c-2ubuntu8) ...
==> default: Selecting previously unselected package liblapack-dev.
==> default: Preparing to unpack .../liblapack-dev_3.5.0-2ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking liblapack-dev (3.5.0-2ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libsys-hostname-long-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libsys-hostname-long-perl_1.4-3_all.deb ...
==> default: Unpacking libsys-hostname-long-perl (1.4-3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libmail-sendmail-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libmail-sendmail-perl_0.79.16-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libmail-sendmail-perl (0.79.16-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libnet-smtp-ssl-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libnet-smtp-ssl-perl_1.01-3_all.deb ...
==> default: Unpacking libnet-smtp-ssl-perl (1.01-3) ...
==> default: Selecting previously unselected package libmailtools-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libmailtools-perl_2.12-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libmailtools-perl (2.12-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libtinfo-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libtinfo-dev_5.9+20140118-1ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libtinfo-dev:amd64 (5.9+20140118-1ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libncurses5-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../libncurses5-dev_5.9+20140118-1ubuntu1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libncurses5-dev:amd64 (5.9+20140118-1ubuntu1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libreadline6-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libreadline6-dev_6.3-4ubuntu2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libreadline6-dev:amd64 (6.3-4ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package libreadline-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libreadline-dev_6.3-4ubuntu2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libreadline-dev:amd64 (6.3-4ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package zip.
==> default: Preparing to unpack .../archives/zip_3.0-8_amd64.deb ...
==> default: Unpacking zip (3.0-8) ...
==> default: Selecting previously unselected package unzip.
==> default: Preparing to unpack .../unzip_6.0-9ubuntu1.5_amd64.deb ...
==> default: Unpacking unzip (6.0-9ubuntu1.5) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-base-core.
==> default: Preparing to unpack .../r-base-core_3.3.3-1trusty0_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-base-core (3.3.3-1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-boot.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-boot_1.3-17-1trusty0_all.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-boot (1.3-17-1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-cluster.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-cluster_2.0.6-1trusty0_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-cluster (2.0.6-1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-foreign.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-foreign_0.8.67-1trusty0_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking r-cran-foreign (0.8.67-1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-mass.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-mass_7.3-44-1trusty0_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-mass (7.3-44-1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-kernsmooth.
==> default: Preparing to unpack 
.../r-cran-kernsmooth_2.23-15-2trusty0_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-kernsmooth (2.23-15-2trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-lattice.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-lattice_0.20-34-1trusty0_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking r-cran-lattice (0.20-34-1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-nlme.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-nlme_3.1.131-2trusty0_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-nlme (3.1.131-2trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-matrix.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-matrix_1.2-8-1trusty0_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-matrix (1.2-8-1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-mgcv.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-mgcv_1.8-16-1cran1trusty0_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking r-cran-mgcv (1.8-16-1cran1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-survival.
==> default: Preparing to unpack 
.../r-cran-survival_2.41-2-1cran1trusty0_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-survival (2.41-2-1cran1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-rpart.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-rpart_4.1-10-1trusty0_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-rpart (4.1-10-1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-class.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-class_7.3-14-1trusty0_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-class (7.3-14-1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-nnet.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-nnet_7.3-12-1trusty0_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-nnet (7.3-12-1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-spatial.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-spatial_7.3-10-1trusty0_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking r-cran-spatial (7.3-10-1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-codetools.
==> default: Preparing to unpack 
.../r-cran-codetools_0.2-15-1cran1trusty0_all.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-codetools (0.2-15-1cran1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-recommended.
==> default: Preparing to unpack .../r-recommended_3.3.3-1trusty0_all.deb ...
==> default: Unpacking r-recommended (3.3.3-1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-base.
==> default: Preparing to unpack .../r-base_3.3.3-1trusty0_all.deb ...
==> default: Unpacking r-base (3.3.3-1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package liblzma-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack 
.../liblzma-dev_5.1.1alpha+20120614-2ubuntu2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking liblzma-dev:amd64 (5.1.1alpha+20120614-2ubuntu2) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-base-dev.
==> default: Preparing to unpack .../r-base-dev_3.3.3-1trusty0_all.deb ...
==> default: Unpacking r-base-dev (3.3.3-1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-doc-html.
==> default: Preparing to unpack .../r-doc-html_3.3.3-1trusty0_all.deb ...
==> default: Unpacking r-doc-html (3.3.3-1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package libauthen-sasl-perl.
==> default: Preparing to unpack .../libauthen-sasl-perl_2.1500-1_all.deb ...
==> default: Unpacking libauthen-sasl-perl (2.1500-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-base-html.
==> default: Preparing to unpack .../r-base-html_3.3.3-1trusty0_all.deb ...
==> default: Unpacking r-base-html (3.3.3-1trusty0) ...
==> default: Processing triggers for man-db (2.6.7.1-1ubuntu1) ...
==> default: Processing triggers for install-info (5.2.0.dfsg.1-2) ...
==> default: Processing triggers for mime-support (3.54ubuntu1.1) ...
==> default: Processing triggers for hicolor-icon-theme (0.13-1) ...
==> default: Processing triggers for desktop-file-utils (0.22-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up libcroco3:amd64 (0.6.8-2ubuntu1) ...
==> default: Setting up libunistring0:amd64 (0.9.3-5ubuntu3) ...
==> default: Setting up libgettextpo0:amd64 (0.18.3.1-1ubuntu3) ...
==> default: Setting up m4 (1.4.17-2ubuntu1) ...
==> default: Setting up autoconf (2.69-6) ...
==> default: Setting up automake (1:1.14.1-2ubuntu1) ...
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/bin/automake-1.14 to provide /usr/bin/automake 
(automake) in auto mode
==> default: Setting up gettext (0.18.3.1-1ubuntu3) ...
==> default: Setting up intltool-debian (0.35.0+20060710.1) ...
==> default: Setting up po-debconf (1.0.16+nmu2ubuntu1) ...
==> default: Setting up dh-apparmor (2.10.95-0ubuntu2.5~14.04.1) ...
==> default: Setting up debhelper (9.20131227ubuntu1) ...
==> default: Setting up liburi-perl (1.60-1) ...
==> default: Setting up libencode-locale-perl (1.03-1) ...
==> default: Setting up libhttp-date-perl (6.02-1) ...
==> default: Setting up libfile-listing-perl (6.04-1) ...
==> default: Setting up libhtml-tagset-perl (3.20-2) ...
==> default: Setting up libhtml-parser-perl (3.71-1build1) ...
==> default: Setting up libhtml-tree-perl (5.03-1) ...
==> default: Setting up libio-html-perl (1.00-1) ...
==> default: Setting up liblwp-mediatypes-perl (6.02-1) ...
==> default: Setting up libhttp-message-perl (6.06-1) ...
==> default: Setting up libhttp-cookies-perl (6.00-2) ...
==> default: Setting up libhttp-negotiate-perl (6.00-2) ...
==> default: Setting up libnet-ssleay-perl (1.58-1) ...
==> default: Setting up libio-socket-ssl-perl (1.965-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up libnet-http-perl (6.06-1) ...
==> default: Setting up libwww-robotrules-perl (6.01-1) ...
==> default: Setting up python-scour (0.26-3build1) ...
==> default: Setting up icu-devtools (52.1-3ubuntu0.5) ...
==> default: Setting up libasprintf-dev:amd64 (0.18.3.1-1ubuntu3) ...
==> default: Setting up libblas-dev (1.2.20110419-7) ...
==> default: update-alternatives: 
==> default: using /usr/lib/libblas/libblas.so to provide /usr/lib/libblas.so 
(libblas.so) in auto mode
==> default: Setting up libbz2-dev:amd64 (1.0.6-5) ...
==> default: Setting up libfont-afm-perl (1.20-1) ...
==> default: Setting up libgettextpo-dev:amd64 (0.18.3.1-1ubuntu3) ...
==> default: Setting up libhtml-form-perl (6.03-1) ...
==> default: Setting up libhtml-format-perl (2.11-1) ...
==> default: Setting up libhttp-daemon-perl (6.01-1) ...
==> default: Setting up libicu-dev:amd64 (52.1-3ubuntu0.5) ...
==> default: Setting up libsocket6-perl (0.25-1) ...
==> default: Setting up libio-socket-inet6-perl (2.71-1) ...
==> default: Setting up libjpeg-turbo8-dev:amd64 (1.3.0-0ubuntu2) ...
==> default: Setting up libjpeg8-dev:amd64 (8c-2ubuntu8) ...
==> default: Setting up libjpeg-dev:amd64 (8c-2ubuntu8) ...
==> default: Setting up liblapack-dev (3.5.0-2ubuntu1) ...
==> default: update-alternatives: using /usr/lib/lapack/liblapack.so to provide 
/usr/lib/liblapack.so (liblapack.so) in auto mode
==> default: Setting up libsys-hostname-long-perl (1.4-3) ...
==> default: Setting up libmail-sendmail-perl (0.79.16-1) ...
==> default: Setting up libnet-smtp-ssl-perl (1.01-3) ...
==> default: Setting up libmailtools-perl (2.12-1) ...
==> default: Setting up libtinfo-dev:amd64 (5.9+20140118-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up libncurses5-dev:amd64 (5.9+20140118-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up libreadline6-dev:amd64 (6.3-4ubuntu2) ...
==> default: Setting up libreadline-dev:amd64 (6.3-4ubuntu2) ...
==> default: Setting up zip (3.0-8) ...
==> default: Setting up unzip (6.0-9ubuntu1.5) ...
==> default: Setting up r-base-core (3.3.3-1trusty0) ...
==> default: 
==> default: Creating config file /etc/R/Renviron with new version
==> default: Setting up r-cran-boot (1.3-17-1trusty0) ...
==> default: Setting up r-cran-cluster (2.0.6-1trusty0) ...
==> default: Setting up r-cran-foreign (0.8.67-1trusty0) ...
==> default: Setting up r-cran-mass (7.3-44-1trusty0) ...
==> default: Setting up r-cran-kernsmooth (2.23-15-2trusty0) ...
==> default: Setting up r-cran-lattice (0.20-34-1trusty0) ...
==> default: Setting up r-cran-nlme (3.1.131-2trusty0) ...
==> default: Setting up r-cran-matrix (1.2-8-1trusty0) ...
==> default: Setting up r-cran-mgcv (1.8-16-1cran1trusty0) ...
==> default: Setting up r-cran-survival (2.41-2-1cran1trusty0) ...
==> default: Setting up r-cran-rpart (4.1-10-1trusty0) ...
==> default: Setting up r-cran-class (7.3-14-1trusty0) ...
==> default: Setting up r-cran-nnet (7.3-12-1trusty0) ...
==> default: Setting up r-cran-spatial (7.3-10-1trusty0) ...
==> default: Setting up r-cran-codetools (0.2-15-1cran1trusty0) ...
==> default: Setting up r-recommended (3.3.3-1trusty0) ...
==> default: Setting up r-base (3.3.3-1trusty0) ...
==> default: Setting up liblzma-dev:amd64 (5.1.1alpha+20120614-2ubuntu2) ...
==> default: Setting up r-doc-html (3.3.3-1trusty0) ...
==> default: Setting up libauthen-sasl-perl (2.1500-1) ...
==> default: Setting up r-base-html (3.3.3-1trusty0) ...
==> default: Setting up liblwp-protocol-https-perl (6.04-2ubuntu0.1) ...
==> default: Setting up libwww-perl (6.05-2) ...
==> default: Setting up libxml-parser-perl (2.41-1build3) ...
==> default: Setting up intltool (0.50.2-2) ...
==> default: Setting up dh-translations (121) ...
==> default: Setting up cdbs (0.4.122ubuntu2) ...
==> default: Setting up r-base-dev (3.3.3-1trusty0) ...
==> default: Processing triggers for libc-bin (2.19-0ubuntu6.11) ...
==> default: Java interpreter : /usr/lib/jvm/default-java/jre/bin/java
==> default: Java version     : 1.7.0_121
==> default: Java home path   : /usr/lib/jvm/default-java
==> default: Java compiler    : /usr/lib/jvm/default-java/bin/javac
==> default: Java headers gen.: /usr/lib/jvm/default-java/bin/javah
==> default: Java archive tool: /usr/lib/jvm/default-java/bin/jar
==> default: trying to compile and link a JNI program 
==> default: detected JNI cpp flags    : -I$(JAVA_HOME)/include
==> default: detected JNI linker flags : 
-L/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server -ljvm
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG 
-I/usr/lib/jvm/default-java/include     -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c conftest.c -o conftest.o
==> default: gcc -std=gnu99 -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions 
-Wl,-z,relro -o conftest.so conftest.o 
-L/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server -ljvm -L/usr/lib/R/lib 
-lR
==> default: JAVA_HOME        : /usr/lib/jvm/default-java
==> default: Java library path: 
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server
==> default: JNI cpp flags    : -I$(JAVA_HOME)/include
==> default: JNI linker flags : 
-L/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server -ljvm
==> default: Updating Java configuration in /usr/lib/R
==> default: Done.
==> default: Selecting previously unselected package libcurl3-nss:amd64.
==> default: (Reading database ... 98807 files and directories currently 
installed.)
==> default: Preparing to unpack .../libcurl3-nss_7.35.0-1ubuntu2.10_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libcurl3-nss:amd64 (7.35.0-1ubuntu2.10) ...
==> default: Selecting previously unselected package libssh2-1:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libssh2-1_1.4.3-2ubuntu0.1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking libssh2-1:amd64 (1.4.3-2ubuntu0.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package libssh2-1-dev:amd64.
==> default: Preparing to unpack .../libssh2-1-dev_1.4.3-2ubuntu0.1_amd64.deb 
...
==> default: Unpacking libssh2-1-dev:amd64 (1.4.3-2ubuntu0.1) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-littler.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-littler_0.3.2-1trusty0_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-littler (0.3.2-1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package littler.
==> default: Preparing to unpack .../littler_0.3.2-1trusty0_all.deb ...
==> default: Unpacking littler (0.3.2-1trusty0) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-bitops.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-bitops_1.0-6-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-bitops (1.0-6-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-colorspace.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-colorspace_1.2-2-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-colorspace (1.2-2-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-dbi.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-dbi_0.2-7-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-dbi (0.2-7-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-dichromat.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-dichromat_2.0.0-2_all.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-dichromat (2.0.0-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-digest.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-digest_0.6.4-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-digest (0.6.4-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-plyr.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-plyr_1.8-1build1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-plyr (1.8-1build1) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-stringr.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-stringr_0.6.2-1_all.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-stringr (0.6.2-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-evaluate.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-evaluate_0.5.1-1_all.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-evaluate (0.5.1-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-labeling.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-labeling_0.1-2_all.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-labeling (0.1-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-munsell.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-munsell_0.4.2-1_all.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-munsell (0.4.2-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-rcolorbrewer.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-rcolorbrewer_1.0-5-2_all.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-rcolorbrewer (1.0-5-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-rcurl.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-rcurl_1.95-4.1-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-rcurl (1.95-4.1-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-reshape.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-reshape_0.8.4-2build1_all.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-reshape (0.8.4-2build1) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-rjson.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-rjson_0.2.13-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-rjson (0.2.13-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-rmysql.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-rmysql_0.9-3-2_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-rmysql (0.9-3-2) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-scales.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-scales_0.2.3-1_all.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-scales (0.2.3-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-testthat.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-testthat_0.7.1-1_all.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-testthat (0.7.1-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-xtable.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-xtable_1%3a1.7-1-1build1_all.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-xtable (1:1.7-1-1build1) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-zoo.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-zoo_1.7-10-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-zoo (1.7-10-1) ...
==> default: Selecting previously unselected package r-cran-xts.
==> default: Preparing to unpack .../r-cran-xts_0.9-7-1_amd64.deb ...
==> default: Unpacking r-cran-xts (0.9-7-1) ...
==> default: Processing triggers for man-db (2.6.7.1-1ubuntu1) ...
==> default: Setting up libcurl3-nss:amd64 (7.35.0-1ubuntu2.10) ...
==> default: Setting up libssh2-1:amd64 (1.4.3-2ubuntu0.1) ...
==> default: Setting up libssh2-1-dev:amd64 (1.4.3-2ubuntu0.1) ...
==> default: Setting up r-cran-littler (0.3.2-1trusty0) ...
==> default: Setting up littler (0.3.2-1trusty0) ...
==> default: Setting up r-cran-bitops (1.0-6-1) ...
==> default: Setting up r-cran-colorspace (1.2-2-1) ...
==> default: Setting up r-cran-dbi (0.2-7-1) ...
==> default: Setting up r-cran-dichromat (2.0.0-2) ...
==> default: Setting up r-cran-digest (0.6.4-1) ...
==> default: Setting up r-cran-plyr (1.8-1build1) ...
==> default: Setting up r-cran-stringr (0.6.2-1) ...
==> default: Setting up r-cran-evaluate (0.5.1-1) ...
==> default: Setting up r-cran-labeling (0.1-2) ...
==> default: Setting up r-cran-munsell (0.4.2-1) ...
==> default: Setting up r-cran-rcolorbrewer (1.0-5-2) ...
==> default: Setting up r-cran-rcurl (1.95-4.1-1) ...
==> default: Setting up r-cran-reshape (0.8.4-2build1) ...
==> default: Setting up r-cran-rjson (0.2.13-1) ...
==> default: Setting up r-cran-rmysql (0.9-3-2) ...
==> default: Setting up r-cran-scales (0.2.3-1) ...
==> default: Setting up r-cran-testthat (0.7.1-1) ...
==> default: Setting up r-cran-xtable (1:1.7-1-1build1) ...
==> default: Setting up r-cran-zoo (1.7-10-1) ...
==> default: Setting up r-cran-xts (0.9-7-1) ...
==> default: Processing triggers for libc-bin (2.19-0ubuntu6.11) ...
==> default: Providing R libraries - packages.r
==> default: Installing package into ‘/usr/local/lib/R/site-library’
==> default: (as ‘lib’ is unspecified)
==> default: trying URL 
'https://bioconductor.org/packages/3.4/bioc/src/contrib/BiocInstaller_1.24.0.tar.gz'
==> default: Content type 'unknown'
==> default:  length 17756 bytes (17 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: ====================
==> default: downloaded 17 KB
==> default: * installing *source* package ‘BiocInstaller’ ...
==> default: ** R
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: Bioconductor version 3.4 (BiocInstaller 1.24.0), ?biocLite for help
==> default: * DONE (BiocInstaller)
==> default: The downloaded source packages are in
==> default:    ‘/tmp/RtmpUbPz0C/downloaded_packages’
==> default: Bioconductor version 3.4 (BiocInstaller 1.24.0), ?biocLite for help
==> default: BioC_mirror: https://bioconductor.org
==> default: Using Bioconductor 3.4 (BiocInstaller 1.24.0), R 3.3.3 
(2017-03-06).
==> default: Installing package(s) ‘BiRewire’, ‘graph’
==> default: also installing the dependencies ‘assertthat’, ‘stringi’, 
‘iterators’, ‘gtable’, ‘scales’, ‘tibble’, ‘lazyeval’, ‘plyr’, ‘Rcpp’, 
‘pkgmaker’, ‘registry’, ‘rngtools’, ‘stringr’, ‘gridBase’, ‘foreach’, 
‘doParallel’, ‘ggplot2’, ‘reshape2’, ‘magrittr’, ‘NMF’, ‘irlba’, ‘igraph’, 
‘slam’, ‘tsne’, ‘BiocGenerics’
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/assertthat_0.1.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 10187 bytes
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: ==============================
==> default: downloaded 10187 bytes
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/stringi_1.1.3.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 3644529 bytes (3.5 MB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: downloaded 3.5 MB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/iterators_1.0.8.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 290412 bytes (283 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: downloaded 283 KB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/gtable_0.2.0.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 24157 bytes (23 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: ============
==> default: downloaded 23 KB
==> default: 
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/scales_0.4.1.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 57703 bytes (56 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: ===============
==> default: =======
==> default: ========
==> default: downloaded 56 KB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/tibble_1.2.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 54517 bytes (53 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =============
==> default: ====
==> default: ====
==> default: ===
==> default: ==
==> default: 
==> default: downloaded 53 KB
==> default: 
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/lazyeval_0.2.0.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 317272 bytes (309 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: ==
==> default: =
==> default: =
==> default: ==
==> default: =
==> default: ==
==> default: ===
==> default: =
==> default: ====
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: ==
==> default: ===
==> default: 
==> default: downloaded 309 KB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/plyr_1.8.4.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip' length 392451 bytes (383 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: ===
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: downloaded 383 KB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/Rcpp_0.12.10.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 2446049 bytes (2.3 MB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: downloaded 2.3 MB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/pkgmaker_0.22.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 351479 bytes (343 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: downloaded 343 KB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/registry_0.3.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 177554 bytes (173 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: ==
==> default: ==
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: downloaded 173 KB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/rngtools_1.2.4.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 120986 bytes (118 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: ===
==> default: =
==> default: =
==> default: ===
==> default: ==
==> default: ===
==> default: 
==> default: downloaded 118 KB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/stringr_1.2.0.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 94095 bytes (91 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: downloaded 91 KB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/gridBase_0.4-7.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 153373 bytes (149 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: downloaded 149 KB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/foreach_1.4.3.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 359787 bytes (351 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: downloaded 351 KB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/doParallel_1.0.10.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 173022 bytes (168 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: downloaded 168 KB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/ggplot2_2.2.1.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 2213308 bytes (2.1 MB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: downloaded 2.1 MB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/reshape2_1.4.2.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 34688 bytes (33 KB)
==> default: =
==> default: ================
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =================
==> default: downloaded 33 KB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/magrittr_1.5.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 200504 bytes (195 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: downloaded 195 KB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/NMF_0.20.6.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 1764466 bytes (1.7 MB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: downloaded 1.7 MB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/irlba_2.1.2.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 218471 bytes (213 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: downloaded 213 KB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/igraph_1.0.1.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 3328353 bytes (3.2 MB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: downloaded 3.2 MB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/slam_0.1-40.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 50146 bytes (48 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: ===
==> default: =
==> default: =======
==> default: =
==> default: ===
==> default: ======
==> default: downloaded 48 KB
==> default: trying URL 
'http://cran.r-project.org/src/contrib/tsne_0.1-3.tar.gz'
==> default: Content type 'application/x-gzip'
==> default:  length 4553 bytes
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =======================================
==> default: downloaded 4553 bytes
==> default: trying URL 
'https://bioconductor.org/packages/3.4/bioc/src/contrib/BiocGenerics_0.20.0.tar.gz'
==> default: Content type 'unknown'
==> default:  length 40398 bytes (39 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =========================
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =======
==> default: downloaded 39 KB
==> default: trying URL 
'https://bioconductor.org/packages/3.4/bioc/src/contrib/BiRewire_3.6.0.tar.gz'
==> default: Content type 'unknown'
==> default:  length 652580 bytes (637 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: downloaded 637 KB
==> default: trying URL 
'https://bioconductor.org/packages/3.4/bioc/src/contrib/graph_1.52.0.tar.gz'
==> default: Content type 'unknown'
==> default:  length 958185 bytes (935 KB)
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: =
==> default: downloaded 935 KB
==> default: * installing *source* package ‘assertthat’ ...
==> default: ** package ‘assertthat’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** R
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (assertthat)
==> default: * installing *source* package ‘stringi’ ...
==> default: ** package ‘stringi’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: checking for local ICUDT_DIR... 
==> default: icu55/data
==> default: checking for R_HOME... 
==> default: /usr/lib/R
==> default: checking for R... 
==> default: /usr/lib/R/bin/R
==> default: checking for R >= 3.1.0... 
==> default: yes
==> default: checking for cat... 
==> default: /bin/cat
==> default: checking for gcc... 
==> default: gcc -std=gnu99
==> default: checking whether the C compiler works... 
==> default: yes
==> default: checking for C compiler default output file name... 
==> default: a.out
==> default: checking for suffix of executables... 
==> default: checking whether we are cross compiling... 
==> default: no
==> default: checking for suffix of object files... 
==> default: o
==> default: checking whether we are using the GNU C compiler... 
==> default: yes
==> default: checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... 
==> default: yes
==> default: checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... 
==> default: none needed
==> default: checking how to run the C preprocessor... 
==> default: g++ -E
==> default: checking for grep that handles long lines and -e... 
==> default: /bin/grep
==> default: checking for egrep... 
==> default: /bin/grep -E
==> default: checking for ANSI C header files... 
==> default: yes
==> default: checking for sys/types.h... 
==> default: yes
==> default: checking for sys/stat.h... 
==> default: yes
==> default: checking for stdlib.h... 
==> default: yes
==> default: checking for string.h... 
==> default: yes
==> default: checking for memory.h... 
==> default: yes
==> default: checking for strings.h... 
==> default: yes
==> default: checking for inttypes.h... 
==> default: yes
==> default: checking for stdint.h... 
==> default: yes
==> default: checking for unistd.h... 
==> default: yes
==> default: checking elf.h usability... 
==> default: yes
==> default: checking elf.h presence... 
==> default: yes
==> default: checking for elf.h... 
==> default: yes
==> default: checking whether we are using the GNU C++ compiler... 
==> default: yes
==> default: checking whether g++ -std=c++11 accepts -g... 
==> default: yes
==> default: checking whether the C++ compiler supports the long long type... 
==> default: yes
==> default: checking whether the compiler implements namespaces... 
==> default: yes
==> default: checking whether the compiler supports Standard Template 
Library... 
==> default: yes
==> default: checking whether std::map is available... 
==> default: yes
==> default: checking for pkg-config... 
==> default: /usr/bin/pkg-config
==> default: checking with pkg-config for ICU4C installed... 
==> default: 52.1
==> default: checking for ICU4C >= 50... 
==> default: yes
==> default: checking for proper CPPFLAGS, LDFLAGS, and LIBS... 
==> default: done
==> default: checking whether we may build an ICU-based project... 
==> default: yes
==> default: checking for available ICU data library (ucnv, uloc, utrans)... 
==> default: yes
==> default: checking for available ICU data library (ucol)... 
==> default: yes
==> default: configure: creating ./config.status
==> default: config.status: creating src/Makevars
==> default: config.status: creating src/uconfig_local.h
==> default: config.status: creating src/install.libs.R
==> default: *** stringi configure summary:
==> default:     ICU_FOUND=1
==> default:     ICUDT_DIR=icu55/data
==> default:     STRINGI_CXXSTD=CXX_STD=CXX11
==> default:     STRINGI_CFLAGS=   -fpic
==> default:     STRINGI_CPPFLAGS=-I. -I/usr/include/x86_64-linux-gnu     
-UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H
==> default:     STRINGI_CXXFLAGS=   -fpic
==> default:     STRINGI_LDFLAGS=-L/usr/lib/x86_64-linux-gnu    
==> default:     STRINGI_LIBS=-licui18n -licuuc -licudata    
==> default: *** compiler settings used:
==> default:     CC=gcc -std=gnu99
==> default:     CPP=g++ -E
==> default:     LD=g++
==> default:     CFLAGS=-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -fpic  
==> default:     CPPFLAGS=   -UDEBUG -DNDEBUG
==> default:     CXX=g++ -std=c++11
==> default:     CXXFLAGS=-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -fpic  
==> default:     LDFLAGS=  
==> default:     LIBS=  
==> default: ** libs
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_brkiter.cpp -o 
stri_brkiter.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_collator.cpp -o 
stri_collator.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_common.cpp -o 
stri_common.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_compare.cpp -o 
stri_compare.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_container_base.cpp -o 
stri_container_base.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_container_bytesearch.cpp 
-o stri_container_bytesearch.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_container_listint.cpp -o 
stri_container_listint.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_container_listraw.cpp -o 
stri_container_listraw.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_container_listutf8.cpp 
-o stri_container_listutf8.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_container_regex.cpp -o 
stri_container_regex.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_container_usearch.cpp -o 
stri_container_usearch.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_container_utf16.cpp -o 
stri_container_utf16.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_container_utf8.cpp -o 
stri_container_utf8.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c 
stri_container_utf8_indexable.cpp -o stri_container_utf8_indexable.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_encoding_conversion.cpp 
-o stri_encoding_conversion.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_encoding_detection.cpp 
-o stri_encoding_detection.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_encoding_management.cpp 
-o stri_encoding_management.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_escape.cpp -o 
stri_escape.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_exception.cpp -o 
stri_exception.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_ICU_settings.cpp -o 
stri_ICU_settings.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_join.cpp -o stri_join.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_length.cpp -o 
stri_length.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_pad.cpp -o stri_pad.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_prepare_arg.cpp -o 
stri_prepare_arg.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_random.cpp -o 
stri_random.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_reverse.cpp -o 
stri_reverse.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_class_count.cpp 
-o stri_search_class_count.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_class_detect.cpp 
-o stri_search_class_detect.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_class_extract.cpp 
-o stri_search_class_extract.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_class_locate.cpp 
-o stri_search_class_locate.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_class_replace.cpp 
-o stri_search_class_replace.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_class_split.cpp 
-o stri_search_class_split.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c 
stri_search_class_startsendswith.cpp -o stri_search_class_startsendswith.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_class_subset.cpp 
-o stri_search_class_subset.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_class_trim.cpp -o 
stri_search_class_trim.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_common.cpp -o 
stri_search_common.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_coll_count.cpp -o 
stri_search_coll_count.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_coll_detect.cpp 
-o stri_search_coll_detect.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_coll_extract.cpp 
-o stri_search_coll_extract.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_coll_locate.cpp 
-o stri_search_coll_locate.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_coll_replace.cpp 
-o stri_search_coll_replace.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_coll_split.cpp -o 
stri_search_coll_split.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c 
stri_search_coll_startsendswith.cpp -o stri_search_coll_startsendswith.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_coll_subset.cpp 
-o stri_search_coll_subset.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c 
stri_search_boundaries_count.cpp -o stri_search_boundaries_count.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c 
stri_search_boundaries_extract.cpp -o stri_search_boundaries_extract.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c 
stri_search_boundaries_locate.cpp -o stri_search_boundaries_locate.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c 
stri_search_boundaries_split.cpp -o stri_search_boundaries_split.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_fixed_count.cpp 
-o stri_search_fixed_count.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_fixed_detect.cpp 
-o stri_search_fixed_detect.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_fixed_extract.cpp 
-o stri_search_fixed_extract.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_fixed_locate.cpp 
-o stri_search_fixed_locate.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_fixed_replace.cpp 
-o stri_search_fixed_replace.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_fixed_split.cpp 
-o stri_search_fixed_split.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_fixed_subset.cpp 
-o stri_search_fixed_subset.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c 
stri_search_fixed_startsendswith.cpp -o stri_search_fixed_startsendswith.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_in.cpp -o 
stri_search_in.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_other_replace.cpp 
-o stri_search_other_replace.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_other_split.cpp 
-o stri_search_other_split.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_regex_count.cpp 
-o stri_search_regex_count.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_regex_detect.cpp 
-o stri_search_regex_detect.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_regex_extract.cpp 
-o stri_search_regex_extract.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_regex_locate.cpp 
-o stri_search_regex_locate.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_regex_match.cpp 
-o stri_search_regex_match.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_regex_replace.cpp 
-o stri_search_regex_replace.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_regex_split.cpp 
-o stri_search_regex_split.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_search_regex_subset.cpp 
-o stri_search_regex_subset.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_sort.cpp -o stri_sort.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_stats.cpp -o stri_stats.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_stringi.cpp -o 
stri_stringi.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_sub.cpp -o stri_sub.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_test.cpp -o stri_test.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_time_zone.cpp -o 
stri_time_zone.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_time_calendar.cpp -o 
stri_time_calendar.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_time_symbols.cpp -o 
stri_time_symbols.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_time_format.cpp -o 
stri_time_format.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_trans_casemap.cpp -o 
stri_trans_casemap.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_trans_other.cpp -o 
stri_trans_other.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_trans_normalization.cpp 
-o stri_trans_normalization.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_trans_transliterate.cpp 
-o stri_trans_transliterate.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_ucnv.cpp -o stri_ucnv.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_uloc.cpp -o stri_uloc.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_utils.cpp -o stri_utils.o
==> default: g++ -std=c++11 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I. 
-I/usr/include/x86_64-linux-gnu     -UDEBUG -DNDEBUG -DU_HAVE_ELF_H    -fpic 
-fpic  -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c stri_wrap.cpp -o stri_wrap.o
==> default: g++ -std=c++11 -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions 
-Wl,-z,relro -o stringi.so stri_brkiter.o stri_collator.o stri_common.o 
stri_compare.o stri_container_base.o stri_container_bytesearch.o 
stri_container_listint.o stri_container_listraw.o stri_container_listutf8.o 
stri_container_regex.o stri_container_usearch.o stri_container_utf16.o 
stri_container_utf8.o stri_container_utf8_indexable.o 
stri_encoding_conversion.o stri_encoding_detection.o stri_encoding_management.o 
stri_escape.o stri_exception.o stri_ICU_settings.o stri_join.o stri_length.o 
stri_pad.o stri_prepare_arg.o stri_random.o stri_reverse.o 
stri_search_class_count.o stri_search_class_detect.o 
stri_search_class_extract.o stri_search_class_locate.o 
stri_search_class_replace.o stri_search_class_split.o 
stri_search_class_startsendswith.o stri_search_class_subset.o 
stri_search_class_trim.o stri_search_common.o stri_search_coll_count.o 
stri_search_coll_detect.o stri_search_coll_extract.o stri_search_coll_locate.o 
stri_search_col
==> default: l_replace.o stri_search_coll_split.o 
stri_search_coll_startsendswith.o stri_search_coll_subset.o 
stri_search_boundaries_count.o stri_search_boundaries_extract.o 
stri_search_boundaries_locate.o stri_search_boundaries_split.o 
stri_search_fixed_count.o stri_search_fixed_detect.o 
stri_search_fixed_extract.o stri_search_fixed_locate.o 
stri_search_fixed_replace.o stri_search_fixed_split.o 
stri_search_fixed_subset.o stri_search_fixed_startsendswith.o stri_search_in.o 
stri_search_other_replace.o stri_search_other_split.o stri_search_regex_count.o 
stri_search_regex_detect.o stri_search_regex_extract.o 
stri_search_regex_locate.o stri_search_regex_match.o 
stri_search_regex_replace.o stri_search_regex_split.o 
stri_search_regex_subset.o stri_sort.o stri_stats.o stri_stringi.o stri_sub.o 
stri_test.o stri_time_zone.o stri_time_calendar.o stri_time_symbols.o 
stri_time_format.o stri_trans_casemap.o stri_trans_other.o 
stri_trans_normalization.o stri_trans_transliterate.o stri_ucnv.o stri_uloc.o 
stri_utils.o str
==> default: i_wrap.o -L/usr/lib/x86_64-linux-gnu -licui18n -licuuc -licudata 
-L/usr/lib/R/lib -lR
==> default: installing via 'install.libs.R' to 
/usr/local/lib/R/site-library/stringi
==> default: ** R
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (stringi)
==> default: * installing *source* package ‘iterators’ ...
==> default: ** package ‘iterators’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** R
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** installing vignettes
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (iterators)
==> default: * installing *source* package ‘gtable’ ...
==> default: ** package ‘gtable’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** R
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (gtable)
==> default: * installing *source* package ‘lazyeval’ ...
==> default: ** package ‘lazyeval’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** libs
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c expr.c -o expr.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c interp.c -o interp.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c lazy.c -o lazy.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c name.c -o name.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c utils.c -o utils.o
==> default: gcc -std=gnu99 -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions 
-Wl,-z,relro -o lazyeval.so expr.o interp.o lazy.o name.o utils.o 
-L/usr/lib/R/lib -lR
==> default: installing to /usr/local/lib/R/site-library/lazyeval/libs
==> default: ** R
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** installing vignettes
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (lazyeval)
==> default: * installing *source* package ‘Rcpp’ ...
==> default: ** package ‘Rcpp’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** libs
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I../inst/include/     -fpic  
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c Date.cpp -o Date.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I../inst/include/     -fpic  
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c Module.cpp -o Module.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I../inst/include/     -fpic  
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c Rcpp_init.cpp -o Rcpp_init.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I../inst/include/     -fpic  
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c api.cpp -o api.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I../inst/include/     -fpic  
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c attributes.cpp -o 
attributes.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I../inst/include/     -fpic  
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c barrier.cpp -o barrier.o
==> default: g++ -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro 
-o Rcpp.so Date.o Module.o Rcpp_init.o api.o attributes.o barrier.o 
-L/usr/lib/R/lib -lR
==> default: installing to /usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/libs
==> default: ** R
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** installing vignettes
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (Rcpp)
==> default: * installing *source* package ‘registry’ ...
==> default: ** package ‘registry’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** R
==> default: ** demo
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** installing vignettes
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (registry)
==> default: * installing *source* package ‘gridBase’ ...
==> default: ** package ‘gridBase’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** R
==> default: ** demo
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** installing vignettes
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (gridBase)
==> default: * installing *source* package ‘magrittr’ ...
==> default: ** package ‘magrittr’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** R
==> default: ** inst
==> default: ** byte-compile and prepare package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** installing vignettes
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (magrittr)
==> default: * installing *source* package ‘irlba’ ...
==> default: ** package ‘irlba’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** libs
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   
-I"/usr/lib/R/library/Matrix/include"   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c irlb.c -o irlb.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   
-I"/usr/lib/R/library/Matrix/include"   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c utility.c -o utility.o
==> default: gcc -std=gnu99 -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions 
-Wl,-z,relro -o irlba.so irlb.o utility.o -llapack -lblas -lgfortran -lm 
-lquadmath -L/usr/lib/R/lib -lR
==> default: installing to /usr/local/lib/R/site-library/irlba/libs
==> default: ** R
==> default: ** demo
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** installing vignettes
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (irlba)
==> default: * installing *source* package ‘slam’ ...
==> default: ** package ‘slam’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** libs
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c apply.c -o apply.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c grouped.c -o grouped.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c sparse.c -o sparse.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c util.c -o util.o
==> default: gcc -std=gnu99 -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions 
-Wl,-z,relro -o slam.so apply.o grouped.o sparse.o util.o -lblas -lgfortran -lm 
-lquadmath -L/usr/lib/R/lib -lR
==> default: installing to /usr/local/lib/R/site-library/slam/libs
==> default: ** R
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (slam)
==> default: * installing *source* package ‘tsne’ ...
==> default: ** package ‘tsne’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** R
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (tsne)
==> default: * installing *source* package ‘BiocGenerics’ ...
==> default: ** R
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: Creating a new generic function for ‘append’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘as.data.frame’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘cbind’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘rbind’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘do.call’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘duplicated’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘anyDuplicated’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘eval’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘pmax’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘pmin’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘pmax.int’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘pmin.int’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘Reduce’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘Filter’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘Find’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘Map’ in package ‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘Position’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘get’ in package ‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘mget’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘grep’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘grepl’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘is.unsorted’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘lapply’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘sapply’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘lengths’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘mapply’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘match’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘order’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘paste’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘rank’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘rownames’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘colnames’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘union’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘intersect’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘setdiff’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘sort’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘table’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘tapply’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘unique’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘unsplit’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘which’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘which.max’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘which.min’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘IQR’ in package ‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘mad’ in package ‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘xtabs’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘clusterCall’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘clusterApply’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘clusterApplyLB’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘clusterEvalQ’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘clusterExport’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘clusterMap’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘parLapply’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘parSapply’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘parApply’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘parRapply’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘parCapply’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘parLapplyLB’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: Creating a new generic function for ‘parSapplyLB’ in package 
‘BiocGenerics’
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (BiocGenerics)
==> default: * installing *source* package ‘tibble’ ...
==> default: ** package ‘tibble’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** libs
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   
-I"/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include"   -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   
-I"/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include"   -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c matrixToDataFrame.cpp -o matrixToDataFrame.o
==> default: g++ -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro 
-o tibble.so RcppExports.o matrixToDataFrame.o -L/usr/lib/R/lib -lR
==> default: installing to /usr/local/lib/R/site-library/tibble/libs
==> default: ** R
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** installing vignettes
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (tibble)
==> default: * installing *source* package ‘plyr’ ...
==> default: ** package ‘plyr’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** libs
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   
-I"/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include"   -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   
-I"/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include"   -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c loop_apply.c -o loop_apply.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   
-I"/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include"   -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c split-numeric.cpp -o split-numeric.o
==> default: g++ -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro 
-o plyr.so RcppExports.o loop_apply.o split-numeric.o -L/usr/lib/R/lib -lR
==> default: installing to /usr/local/lib/R/site-library/plyr/libs
==> default: ** R
==> default: ** data
==> default: *** moving datasets to lazyload DB
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (plyr)
==> default: * installing *source* package ‘stringr’ ...
==> default: ** package ‘stringr’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** R
==> default: ** data
==> default: *** moving datasets to lazyload DB
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** installing vignettes
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (stringr)
==> default: * installing *source* package ‘foreach’ ...
==> default: ** package ‘foreach’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** R
==> default: ** demo
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** installing vignettes
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (foreach)
==> default: * installing *source* package ‘graph’ ...
==> default: ** libs
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c graph.c -o graph.o
==> default: gcc -std=gnu99 -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions 
-Wl,-z,relro -o graph.so graph.o -L/usr/lib/R/lib -lR
==> default: mv graph.so BioC_graph.so
==> default: installing to /usr/local/lib/R/site-library/graph/libs
==> default: ** R
==> default: ** data
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** installing vignettes
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (graph)
==> default: * installing *source* package ‘scales’ ...
==> default: ** package ‘scales’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** libs
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   
-I"/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include"   -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   
-I"/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include"   -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c colors.cpp -o colors.o
==> default: g++ -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro 
-o scales.so RcppExports.o colors.o -L/usr/lib/R/lib -lR
==> default: installing to /usr/local/lib/R/site-library/scales/libs
==> default: ** R
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (scales)
==> default: * installing *source* package ‘pkgmaker’ ...
==> default: ** package ‘pkgmaker’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** R
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: Creating meta registry in package 'pkgmaker' ... 
==> default: OK
==> default: Creating registry 'extra_handler' in package 'pkgmaker' ... 
==> default: OK
==> default: Creating registry 'extra_action' in package 'pkgmaker' ... 
==> default: OK
==> default: Registering extra handler 'install.packages' [function] ... 
==> default: OK
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** installing vignettes
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (pkgmaker)
==> default: * installing *source* package ‘doParallel’ ...
==> default: ** package ‘doParallel’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** R
==> default: ** demo
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** installing vignettes
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (doParallel)
==> default: * installing *source* package ‘reshape2’ ...
==> default: ** package ‘reshape2’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** libs
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   
-I"/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include"   -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   
-I"/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/include"   -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c melt.cpp -o melt.o
==> default: g++ -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro 
-o reshape2.so RcppExports.o melt.o -L/usr/lib/R/lib -lR
==> default: installing to /usr/local/lib/R/site-library/reshape2/libs
==> default: ** R
==> default: ** data
==> default: *** moving datasets to lazyload DB
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (reshape2)
==> default: * installing *source* package ‘rngtools’ ...
==> default: ** package ‘rngtools’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** R
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** installing vignettes
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (rngtools)
==> default: * installing *source* package ‘ggplot2’ ...
==> default: ** package ‘ggplot2’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** R
==> default: ** data
==> default: *** moving datasets to lazyload DB
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** installing vignettes
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (ggplot2)
==> default: * installing *source* package ‘NMF’ ...
==> default: ** package ‘NMF’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: ** libs
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c distance.cpp -o distance.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c divergence.cpp -o divergence.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c euclidean.cpp -o euclidean.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c utils.cpp -o utils.o
==> default: g++ -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro 
-o NMF.so distance.o divergence.o euclidean.o utils.o -L/usr/lib/R/lib -lR
==> default: installing to /usr/local/lib/R/site-library/NMF/libs
==> default: ** R
==> default: ** data
==> default: ** demo
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: Setting package specific options: package:NMF (10 default 
option(s))
==> default: Registering extra action 'Biobase' for handler 'install.packages' 
... 
==> default: OK
==> default: Creating meta registry in package 'NMF' ... 
==> default: OK
==> default: Creating registry 'pkgmaker::extra_action' in package 'NMF' ... 
==> default: OK
==> default: Adding entry 'Biobase' in registry 'pkgmaker::extra_action' ... 
==> default: OK
==> default: Creating registry 'algorithm' in package 'NMF' ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF algorithm '.R#brunet' [NMFStrategyIterative] ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF algorithm 'brunet' [NMFStrategyIterative] based on 
template '.R#brunet' ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF algorithm 'KL' [NMFStrategyIterative] ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF algorithm '.R#lee' [NMFStrategyIterative] ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF algorithm 'lee' [NMFStrategyIterative] based on 
template '.R#lee' ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF algorithm 'Frobenius' [NMFStrategyIterative] ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF algorithm '.R#offset' [NMFStrategyIterative] ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF algorithm 'offset' [NMFStrategyIterative] based on 
template '.R#offset' ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF algorithm '.R#nsNMF' [NMFStrategyIterative] ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF algorithm 'nsNMF' [NMFStrategyIterative] based on 
template '.R#nsNMF' ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF algorithm '.M#brunet' [NMFStrategyOctave] ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF algorithm 'ls-nmf' [NMFStrategyIterative] ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF algorithm 'pe-nmf' [NMFStrategyIterative] ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF algorithm '.siNMF' [NMFStrategyIterative] based on 
template 'lee' ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF algorithm 'siNMF' [NMFStrategyIterative] based on 
template 'lee' ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF algorithm 'snmf/r' [NMFStrategyFunction] ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF algorithm 'snmf/l' [NMFStrategyFunction] ... 
==> default: OK
==> default: Creating registry 'seed' in package 'NMF' ... 
==> default: OK
==> default: Registering extra action 'bigmemory' for handler 
'install.packages' ... 
==> default: OK
==> default: Adding entry 'bigmemory' in registry 'pkgmaker::extra_action' ... 
==> default: OK
==> default: Registering extra action 'synchronicity' for handler 
'install.packages' ... 
==> default: OK
==> default: Adding entry 'synchronicity' in registry 'pkgmaker::extra_action' 
... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF seeding method 'none' [NMFSeed] ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF seeding method 'random' [NMFSeed] ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF seeding method 'ica' [NMFSeed] ... 
==> default: OK
==> default: Registering NMF seeding method 'nndsvd' [NMFSeed] ... 
==> default: OK
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** installing vignettes
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (NMF)
==> default: * installing *source* package ‘igraph’ ...
==> default: ** package ‘igraph’ successfully unpacked and MD5 sums checked
==> default: checking for gcc... 
==> default: gcc -std=gnu99
==> default: checking whether the C compiler works... 
==> default: yes
==> default: checking for C compiler default output file name... 
==> default: a.out
==> default: checking for suffix of executables... 
==> default: checking whether we are cross compiling... 
==> default: no
==> default: checking for suffix of object files... 
==> default: o
==> default: checking whether we are using the GNU C compiler... 
==> default: yes
==> default: checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... 
==> default: yes
==> default: checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... 
==> default: none needed
==> default: checking whether we are using the GNU Fortran compiler... 
==> default: yes
==> default: checking whether gfortran accepts -g... 
==> default: yes
==> default: checking whether we are using the GNU C++ compiler... 
==> default: yes
==> default: checking whether g++ accepts -g... 
==> default: yes
==> default: checking how to run the C++ preprocessor... 
==> default: g++ -E
==> default: checking for rintf... 
==> default: yes
==> default: checking for finite... 
==> default: yes
==> default: checking for expm1... 
==> default: yes
==> default: checking for rint... 
==> default: yes
==> default: checking for log2... 
==> default: yes
==> default: checking for logbl... 
==> default: yes
==> default: checking for snprintf... 
==> default: yes
==> default: checking for log1p... 
==> default: yes
==> default: checking for round... 
==> default: yes
==> default: checking for fmin... 
==> default: yes
==> default: checking for stpcpy... 
==> default: yes
==> default: checking how to run the C preprocessor... 
==> default: gcc -std=gnu99 -E
==> default: checking for grep that handles long lines and -e... 
==> default: /bin/grep
==> default: checking for egrep... 
==> default: /bin/grep -E
==> default: checking for ANSI C header files... 
==> default: yes
==> default: checking for sys/types.h... 
==> default: yes
==> default: checking for sys/stat.h... 
==> default: yes
==> default: checking for stdlib.h... 
==> default: yes
==> default: checking for string.h... 
==> default: yes
==> default: checking for memory.h... 
==> default: yes
==> default: checking for strings.h... 
==> default: yes
==> default: checking for inttypes.h... 
==> default: yes
==> default: checking for stdint.h... 
==> default: yes
==> default: checking for unistd.h... 
==> default: yes
==> default: checking whether stpcpy is declared... 
==> default: yes
==> default: checking sys/times.h usability... 
==> default: yes
==> default: checking sys/times.h presence... 
==> default: yes
==> default: checking for sys/times.h... 
==> default: yes
==> default: checking net/if.h usability... 
==> default: yes
==> default: checking net/if.h presence... 
==> default: yes
==> default: checking for net/if.h... 
==> default: yes
==> default: checking netinet/in.h usability... 
==> default: yes
==> default: checking netinet/in.h presence... 
==> default: yes
==> default: checking for netinet/in.h... 
==> default: yes
==> default: checking net/if_dl.h usability... 
==> default: no
==> default: checking net/if_dl.h presence... 
==> default: no
==> default: checking for net/if_dl.h... 
==> default: no
==> default: checking sys/sockio.h usability... 
==> default: no
==> default: checking sys/sockio.h presence... 
==> default: no
==> default: checking for sys/sockio.h... 
==> default: no
==> default: checking sys/un.h usability... 
==> default: yes
==> default: checking sys/un.h presence... 
==> default: yes
==> default: checking for sys/un.h... 
==> default: yes
==> default: checking sys/socket.h usability... 
==> default: yes
==> default: checking sys/socket.h presence... 
==> default: yes
==> default: checking for sys/socket.h... 
==> default: yes
==> default: checking sys/ioctl.h usability... 
==> default: yes
==> default: checking sys/ioctl.h presence... 
==> default: yes
==> default: checking for sys/ioctl.h... 
==> default: yes
==> default: checking sys/time.h usability... 
==> default: yes
==> default: checking sys/time.h presence... 
==> default: yes
==> default: checking for sys/time.h... 
==> default: yes
==> default: checking sys/file.h usability... 
==> default: yes
==> default: checking sys/file.h presence... 
==> default: yes
==> default: checking for sys/file.h... 
==> default: yes
==> default: checking for struct sockaddr.sa_len... 
==> default: no
==> default: checking for xml2-config... 
==> default: /usr/bin/xml2-config
==> default: checking for xmlSAXUserParseFile in -lxml2... 
==> default: yes
==> default: checking libxml/parser.h usability... 
==> default: yes
==> default: checking libxml/parser.h presence... 
==> default: yes
==> default: checking for libxml/parser.h... 
==> default: yes
==> default: checking for __gmpz_add in -lgmp... 
==> default: no
==> default: configure: creating ./config.status
==> default: config.status: creating src/Makevars.tmp
==> default: config.status: creating src/Makevars
==> default: config.status: creating src/config.h
==> default: ** libs
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c AMD/Source/amd.f -o AMD/Source/amd.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c AMD/Source/amd_1.c -o AMD/Source/amd_1.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c AMD/Source/amd_2.c -o AMD/Source/amd_2.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c AMD/Source/amd_aat.c -o AMD/Source/amd_aat.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c AMD/Source/amd_control.c -o AMD/Source/amd_control.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c AMD/Source/amd_defaults.c -o AMD/Source/amd_defaults.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c AMD/Source/amd_dump.c -o AMD/Source/amd_dump.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c AMD/Source/amd_global.c -o AMD/Source/amd_global.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c AMD/Source/amd_info.c -o AMD/Source/amd_info.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c AMD/Source/amd_order.c -o AMD/Source/amd_order.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c AMD/Source/amd_post_tree.c -o AMD/Source/amd_post_tree.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c AMD/Source/amd_postorder.c -o AMD/Source/amd_postorder.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c AMD/Source/amd_preprocess.c -o AMD/Source/amd_preprocess.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c AMD/Source/amd_valid.c -o AMD/Source/amd_valid.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c AMD/Source/amdbar.f -o AMD/Source/amdbar.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Check/cholmod_check.c -o CHOLMOD/Check/cholmod_check.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Check/cholmod_read.c -o CHOLMOD/Check/cholmod_read.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Check/cholmod_write.c -o CHOLMOD/Check/cholmod_write.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Cholesky/cholmod_amd.c -o CHOLMOD/Cholesky/cholmod_amd.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Cholesky/cholmod_analyze.c -o CHOLMOD/Cholesky/cholmod_analyze.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Cholesky/cholmod_colamd.c -o CHOLMOD/Cholesky/cholmod_colamd.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Cholesky/cholmod_etree.c -o CHOLMOD/Cholesky/cholmod_etree.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Cholesky/cholmod_factorize.c -o 
CHOLMOD/Cholesky/cholmod_factorize.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Cholesky/cholmod_postorder.c -o 
CHOLMOD/Cholesky/cholmod_postorder.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Cholesky/cholmod_rcond.c -o CHOLMOD/Cholesky/cholmod_rcond.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Cholesky/cholmod_resymbol.c -o 
CHOLMOD/Cholesky/cholmod_resymbol.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Cholesky/cholmod_rowcolcounts.c -o 
CHOLMOD/Cholesky/cholmod_rowcolcounts.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Cholesky/cholmod_rowfac.c -o CHOLMOD/Cholesky/cholmod_rowfac.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Cholesky/cholmod_solve.c -o CHOLMOD/Cholesky/cholmod_solve.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Cholesky/cholmod_spsolve.c -o CHOLMOD/Cholesky/cholmod_spsolve.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Core/cholmod_aat.c -o CHOLMOD/Core/cholmod_aat.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Core/cholmod_add.c -o CHOLMOD/Core/cholmod_add.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Core/cholmod_band.c -o CHOLMOD/Core/cholmod_band.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Core/cholmod_change_factor.c -o 
CHOLMOD/Core/cholmod_change_factor.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Core/cholmod_common.c -o CHOLMOD/Core/cholmod_common.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Core/cholmod_complex.c -o CHOLMOD/Core/cholmod_complex.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Core/cholmod_copy.c -o CHOLMOD/Core/cholmod_copy.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Core/cholmod_dense.c -o CHOLMOD/Core/cholmod_dense.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Core/cholmod_error.c -o CHOLMOD/Core/cholmod_error.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Core/cholmod_factor.c -o CHOLMOD/Core/cholmod_factor.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Core/cholmod_memory.c -o CHOLMOD/Core/cholmod_memory.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Core/cholmod_sparse.c -o CHOLMOD/Core/cholmod_sparse.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Core/cholmod_transpose.c -o CHOLMOD/Core/cholmod_transpose.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Core/cholmod_triplet.c -o CHOLMOD/Core/cholmod_triplet.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Core/cholmod_version.c -o CHOLMOD/Core/cholmod_version.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_drop.c -o CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_drop.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_horzcat.c -o 
CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_horzcat.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_norm.c -o CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_norm.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_scale.c -o CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_scale.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_sdmult.c -o CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_sdmult.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_ssmult.c -o CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_ssmult.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_submatrix.c -o 
CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_submatrix.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_symmetry.c -o 
CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_symmetry.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_vertcat.c -o 
CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_vertcat.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Modify/cholmod_rowadd.c -o CHOLMOD/Modify/cholmod_rowadd.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Modify/cholmod_rowdel.c -o CHOLMOD/Modify/cholmod_rowdel.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Modify/cholmod_updown.c -o CHOLMOD/Modify/cholmod_updown.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Partition/cholmod_camd.c -o CHOLMOD/Partition/cholmod_camd.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Partition/cholmod_ccolamd.c -o 
CHOLMOD/Partition/cholmod_ccolamd.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Partition/cholmod_csymamd.c -o 
CHOLMOD/Partition/cholmod_csymamd.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Partition/cholmod_metis.c -o CHOLMOD/Partition/cholmod_metis.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Partition/cholmod_nesdis.c -o CHOLMOD/Partition/cholmod_nesdis.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Supernodal/cholmod_super_numeric.c -o 
CHOLMOD/Supernodal/cholmod_super_numeric.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Supernodal/cholmod_super_solve.c -o 
CHOLMOD/Supernodal/cholmod_super_solve.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c CHOLMOD/Supernodal/cholmod_super_symbolic.c -o 
CHOLMOD/Supernodal/cholmod_super_symbolic.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c COLAMD/Source/colamd.c -o COLAMD/Source/colamd.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c COLAMD/Source/colamd_global.c -o COLAMD/Source/colamd_global.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c DensityGrid.cpp -o DensityGrid.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c DensityGrid_3d.cpp -o DensityGrid_3d.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c NetDataTypes.cpp -o NetDataTypes.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c NetRoutines.cpp -o NetRoutines.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c SuiteSparse_config/SuiteSparse_config.c -o 
SuiteSparse_config/SuiteSparse_config.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c adjlist.c -o adjlist.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c arpack.c -o arpack.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c array.c -o array.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c atlas.c -o atlas.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c attributes.c -o attributes.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c basic_query.c -o basic_query.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c bfgs.c -o bfgs.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c bigint.c -o bigint.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c bignum.c -o bignum.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c bipartite.c -o bipartite.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c blas.c -o blas.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c bliss.cc -o bliss.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c bliss_eqrefhash.cc -o bliss_eqrefhash.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c bliss_graph.cc -o bliss_graph.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c bliss_heap.cc -o bliss_heap.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c bliss_orbit.cc -o bliss_orbit.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c bliss_partition.cc -o bliss_partition.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c bliss_timer.cc -o bliss_timer.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c bliss_utils.cc -o bliss_utils.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cattributes.c -o cattributes.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c centrality.c -o centrality.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cliques.c -o cliques.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c clustertool.cpp -o clustertool.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cocitation.c -o cocitation.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cohesive_blocks.c -o cohesive_blocks.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c community.c -o community.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c complex.c -o complex.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c components.c -o components.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c conversion.c -o conversion.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cores.c -o cores.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_add.c -o cs/cs_add.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_amd.c -o cs/cs_amd.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_chol.c -o cs/cs_chol.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_cholsol.c -o cs/cs_cholsol.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_compress.c -o cs/cs_compress.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_counts.c -o cs/cs_counts.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_cumsum.c -o cs/cs_cumsum.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_dfs.c -o cs/cs_dfs.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_dmperm.c -o cs/cs_dmperm.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_droptol.c -o cs/cs_droptol.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_dropzeros.c -o cs/cs_dropzeros.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_dupl.c -o cs/cs_dupl.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_entry.c -o cs/cs_entry.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_ereach.c -o cs/cs_ereach.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_etree.c -o cs/cs_etree.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_fkeep.c -o cs/cs_fkeep.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_gaxpy.c -o cs/cs_gaxpy.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_happly.c -o cs/cs_happly.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_house.c -o cs/cs_house.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_ipvec.c -o cs/cs_ipvec.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_leaf.c -o cs/cs_leaf.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_load.c -o cs/cs_load.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_lsolve.c -o cs/cs_lsolve.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_ltsolve.c -o cs/cs_ltsolve.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_lu.c -o cs/cs_lu.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_lusol.c -o cs/cs_lusol.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_malloc.c -o cs/cs_malloc.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_maxtrans.c -o cs/cs_maxtrans.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_multiply.c -o cs/cs_multiply.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_norm.c -o cs/cs_norm.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_permute.c -o cs/cs_permute.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_pinv.c -o cs/cs_pinv.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_post.c -o cs/cs_post.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_print.c -o cs/cs_print.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_pvec.c -o cs/cs_pvec.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_qr.c -o cs/cs_qr.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_qrsol.c -o cs/cs_qrsol.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_randperm.c -o cs/cs_randperm.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_reach.c -o cs/cs_reach.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_scatter.c -o cs/cs_scatter.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_scc.c -o cs/cs_scc.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_schol.c -o cs/cs_schol.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_spsolve.c -o cs/cs_spsolve.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_sqr.c -o cs/cs_sqr.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_symperm.c -o cs/cs_symperm.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_tdfs.c -o cs/cs_tdfs.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_transpose.c -o cs/cs_transpose.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_updown.c -o cs/cs_updown.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_usolve.c -o cs/cs_usolve.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_util.c -o cs/cs_util.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c cs/cs_utsolve.c -o cs/cs_utsolve.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c decomposition.c -o decomposition.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c distances.c -o distances.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c dotproduct.c -o dotproduct.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c dqueue.c -o dqueue.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c drl_graph.cpp -o drl_graph.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c drl_graph_3d.cpp -o drl_graph_3d.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c drl_layout.cpp -o drl_layout.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c drl_layout_3d.cpp -o drl_layout_3d.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c drl_parse.cpp -o drl_parse.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c eigen.c -o eigen.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c embedding.c -o embedding.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c fast_community.c -o fast_community.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c feedback_arc_set.c -o feedback_arc_set.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c flow.c -o flow.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c foreign-dl-lexer.c -o foreign-dl-lexer.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c foreign-dl-parser.c -o foreign-dl-parser.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c foreign-gml-lexer.c -o foreign-gml-lexer.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c foreign-gml-parser.c -o foreign-gml-parser.o
==> default: In file included from src/foreign-gml-parser.y:59:0:
==> default: igraph_hacks_internal.h:42:0: warning: "strdup" redefined [enabled 
by default]
==> default:  #  define strdup igraph_i_strdup
==> default:  ^
==> default: In file included from /usr/include/string.h:635:0,
==> default:                  from src/foreign-gml-parser.y:54:
==> default: /usr/include/x86_64-linux-gnu/bits/string2.h:1291:0: note: this is 
the location of the previous definition
==> default:  #   define strdup(s) __strdup (s)
==> default:  ^
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c foreign-graphml.c -o foreign-graphml.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c foreign-lgl-lexer.c -o foreign-lgl-lexer.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c foreign-lgl-parser.c -o foreign-lgl-parser.o
==> default: In file included from src/foreign-lgl-parser.y:54:0:
==> default: igraph_hacks_internal.h:42:0: warning: "strdup" redefined [enabled 
by default]
==> default:  #  define strdup igraph_i_strdup
==> default:  ^
==> default: In file included from /usr/include/string.h:635:0,
==> default:                  from src/foreign-lgl-parser.y:53:
==> default: /usr/include/x86_64-linux-gnu/bits/string2.h:1291:0: note: this is 
the location of the previous definition
==> default:  #   define strdup(s) __strdup (s)
==> default:  ^
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c foreign-ncol-lexer.c -o foreign-ncol-lexer.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c foreign-ncol-parser.c -o foreign-ncol-parser.o
==> default: In file included from src/foreign-ncol-parser.y:54:0:
==> default: igraph_hacks_internal.h:42:0: warning: "strdup" redefined [enabled 
by default]
==> default:  #  define strdup igraph_i_strdup
==> default:  ^
==> default: In file included from /usr/include/string.h:635:0,
==> default:                  from src/foreign-ncol-parser.y:53:
==> default: /usr/include/x86_64-linux-gnu/bits/string2.h:1291:0: note: this is 
the location of the previous definition
==> default:  #   define strdup(s) __strdup (s)
==> default:  ^
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c foreign-pajek-lexer.c -o foreign-pajek-lexer.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c foreign-pajek-parser.c -o foreign-pajek-parser.o
==> default: In file included from src/foreign-pajek-parser.y:54:0:
==> default: igraph_hacks_internal.h:42:0: warning: "strdup" redefined [enabled 
by default]
==> default:  #  define strdup igraph_i_strdup
==> default:  ^
==> default: In file included from /usr/include/string.h:635:0,
==> default:                  from src/foreign-pajek-parser.y:53:
==> default: /usr/include/x86_64-linux-gnu/bits/string2.h:1291:0: note: this is 
the location of the previous definition
==> default:  #   define strdup(s) __strdup (s)
==> default:  ^
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c foreign.c -o foreign.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c forestfire.c -o forestfire.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c fortran_intrinsics.c -o fortran_intrinsics.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c games.c -o games.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c gengraph_box_list.cpp -o gengraph_box_list.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c gengraph_degree_sequence.cpp -o gengraph_degree_sequence.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c gengraph_graph_molloy_hash.cpp -o gengraph_graph_molloy_hash.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c gengraph_graph_molloy_optimized.cpp -o gengraph_graph_molloy_optimized.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c gengraph_mr-connected.cpp -o gengraph_mr-connected.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c gengraph_powerlaw.cpp -o gengraph_powerlaw.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c gengraph_random.cpp -o gengraph_random.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glet.c -o glet.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk_support.c -o glpk_support.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c gml_tree.c -o gml_tree.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c hacks.c -o hacks.o
==> default: In file included from hacks.c:27:0:
==> default: igraph_hacks_internal.h:42:0: warning: "strdup" redefined [enabled 
by default]
==> default:  #  define strdup igraph_i_strdup
==> default:  ^
==> default: In file included from /usr/include/string.h:635:0,
==> default:                  from /usr/include/memory.h:29,
==> default:                  from hacks.c:24:
==> default: /usr/include/x86_64-linux-gnu/bits/string2.h:1291:0: note: this is 
the location of the previous definition
==> default:  #   define strdup(s) __strdup (s)
==> default:  ^
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c heap.c -o heap.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c igraph_buckets.c -o igraph_buckets.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c igraph_error.c -o igraph_error.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c igraph_estack.c -o igraph_estack.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c igraph_fixed_vectorlist.c -o igraph_fixed_vectorlist.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c igraph_grid.c -o igraph_grid.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c igraph_hashtable.c -o igraph_hashtable.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c igraph_heap.c -o igraph_heap.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c igraph_hrg.cc -o igraph_hrg.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c igraph_hrg_types.cc -o igraph_hrg_types.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c igraph_marked_queue.c -o igraph_marked_queue.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c igraph_psumtree.c -o igraph_psumtree.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c igraph_set.c -o igraph_set.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c igraph_stack.c -o igraph_stack.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c igraph_strvector.c -o igraph_strvector.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c igraph_trie.c -o igraph_trie.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c infomap.cc -o infomap.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c infomap_FlowGraph.cc -o infomap_FlowGraph.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c infomap_Greedy.cc -o infomap_Greedy.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c infomap_Node.cc -o infomap_Node.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c interrupt.c -o interrupt.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c iterators.c -o iterators.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c lad.c -o lad.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c lapack.c -o lapack.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c layout.c -o layout.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c layout_dh.c -o layout_dh.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c layout_fr.c -o layout_fr.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c layout_gem.c -o layout_gem.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c layout_kk.c -o layout_kk.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c lsap.c -o lsap.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c matching.c -o matching.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c math.c -o math.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c matrix.c -o matrix.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c maximal_cliques.c -o maximal_cliques.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c memory.c -o memory.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c microscopic_update.c -o microscopic_update.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c mixing.c -o mixing.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c motifs.c -o motifs.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c operators.c -o operators.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c optimal_modularity.c -o optimal_modularity.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c other.c -o other.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c paths.c -o paths.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c plfit/error.c -o plfit/error.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c plfit/gss.c -o plfit/gss.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c plfit/kolmogorov.c -o plfit/kolmogorov.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c plfit/lbfgs.c -o plfit/lbfgs.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c plfit/options.c -o plfit/options.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c plfit/plfit.c -o plfit/plfit.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c plfit/zeta.c -o plfit/zeta.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c pottsmodel_2.cpp -o pottsmodel_2.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c progress.c -o progress.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c prpack.cpp -o prpack.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c prpack/prpack_base_graph.cpp -o prpack/prpack_base_graph.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c prpack/prpack_igraph_graph.cpp -o prpack/prpack_igraph_graph.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c prpack/prpack_preprocessed_ge_graph.cpp -o 
prpack/prpack_preprocessed_ge_graph.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c prpack/prpack_preprocessed_gs_graph.cpp -o 
prpack/prpack_preprocessed_gs_graph.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c prpack/prpack_preprocessed_scc_graph.cpp -o 
prpack/prpack_preprocessed_scc_graph.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c prpack/prpack_preprocessed_schur_graph.cpp -o 
prpack/prpack_preprocessed_schur_graph.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c prpack/prpack_result.cpp -o prpack/prpack_result.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c prpack/prpack_solver.cpp -o prpack/prpack_solver.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c prpack/prpack_utils.cpp -o prpack/prpack_utils.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c qsort.c -o qsort.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c qsort_r.c -o qsort_r.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c random.c -o random.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c random_walk.c -o random_walk.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c sbm.c -o sbm.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c scan.c -o scan.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c scg.c -o scg.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c scg_approximate_methods.c -o scg_approximate_methods.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c scg_exact_scg.c -o scg_exact_scg.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c scg_kmeans.c -o scg_kmeans.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c scg_optimal_method.c -o scg_optimal_method.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c scg_utils.c -o scg_utils.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c separators.c -o separators.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c sir.c -o sir.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c spanning_trees.c -o spanning_trees.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c sparsemat.c -o sparsemat.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c spectral_properties.c -o spectral_properties.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c spmatrix.c -o spmatrix.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c st-cuts.c -o st-cuts.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c statusbar.c -o statusbar.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c structural_properties.c -o structural_properties.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c structure_generators.c -o structure_generators.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c sugiyama.c -o sugiyama.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c topology.c -o topology.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c triangles.c -o triangles.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c type_indexededgelist.c -o type_indexededgelist.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c types.c -o types.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c vector.c -o vector.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c vector_ptr.c -o vector_ptr.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c version.c -o version.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c visitors.c -o visitors.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c walktrap.cpp -o walktrap.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c walktrap_communities.cpp -o walktrap_communities.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c walktrap_graph.cpp -o walktrap_graph.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c walktrap_heap.cpp -o walktrap_heap.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c zeroin.c -o zeroin.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dgetv0.f -o dgetv0.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dlaqrb.f -o dlaqrb.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dmout.f -o dmout.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dnaitr.f -o dnaitr.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dnapps.f -o dnapps.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dnaup2.f -o dnaup2.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dnaupd.f -o dnaupd.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dnconv.f -o dnconv.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dneigh.f -o dneigh.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dneupd.f -o dneupd.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dngets.f -o dngets.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dsaitr.f -o dsaitr.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dsapps.f -o dsapps.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dsaup2.f -o dsaup2.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dsaupd.f -o dsaupd.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dsconv.f -o dsconv.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dseigt.f -o dseigt.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dsesrt.f -o dsesrt.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dseupd.f -o dseupd.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dsgets.f -o dsgets.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dsortc.f -o dsortc.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dsortr.f -o dsortr.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dstatn.f -o dstatn.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dstats.f -o dstats.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dstqrb.f -o dstqrb.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c dvout.f -o dvout.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c ivout.f -o ivout.o
==> default: gfortran   -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4  -c second.f -o second.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/amd/amd_1.c -o glpk/amd/amd_1.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/amd/amd_2.c -o glpk/amd/amd_2.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/amd/amd_aat.c -o glpk/amd/amd_aat.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/amd/amd_control.c -o glpk/amd/amd_control.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/amd/amd_defaults.c -o glpk/amd/amd_defaults.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/amd/amd_dump.c -o glpk/amd/amd_dump.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/amd/amd_info.c -o glpk/amd/amd_info.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/amd/amd_order.c -o glpk/amd/amd_order.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/amd/amd_post_tree.c -o glpk/amd/amd_post_tree.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/amd/amd_postorder.c -o glpk/amd/amd_postorder.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/amd/amd_preprocess.c -o glpk/amd/amd_preprocess.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/amd/amd_valid.c -o glpk/amd/amd_valid.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/colamd/colamd.c -o glpk/colamd/colamd.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi01.c -o glpk/glpapi01.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi02.c -o glpk/glpapi02.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi03.c -o glpk/glpapi03.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi04.c -o glpk/glpapi04.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi05.c -o glpk/glpapi05.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi06.c -o glpk/glpapi06.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi07.c -o glpk/glpapi07.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi08.c -o glpk/glpapi08.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi09.c -o glpk/glpapi09.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi10.c -o glpk/glpapi10.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi11.c -o glpk/glpapi11.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi12.c -o glpk/glpapi12.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi13.c -o glpk/glpapi13.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi14.c -o glpk/glpapi14.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi15.c -o glpk/glpapi15.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi16.c -o glpk/glpapi16.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi17.c -o glpk/glpapi17.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi18.c -o glpk/glpapi18.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpapi19.c -o glpk/glpapi19.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpavl.c -o glpk/glpavl.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpbfd.c -o glpk/glpbfd.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpbfx.c -o glpk/glpbfx.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpcpx.c -o glpk/glpcpx.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpdmp.c -o glpk/glpdmp.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpdmx.c -o glpk/glpdmx.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpenv01.c -o glpk/glpenv01.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpenv02.c -o glpk/glpenv02.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpenv03.c -o glpk/glpenv03.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpenv04.c -o glpk/glpenv04.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpenv05.c -o glpk/glpenv05.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpenv06.c -o glpk/glpenv06.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpenv07.c -o glpk/glpenv07.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpenv08.c -o glpk/glpenv08.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpfhv.c -o glpk/glpfhv.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpgmp.c -o glpk/glpgmp.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glphbm.c -o glpk/glphbm.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpini01.c -o glpk/glpini01.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpini02.c -o glpk/glpini02.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpios01.c -o glpk/glpios01.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpios02.c -o glpk/glpios02.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpios03.c -o glpk/glpios03.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpios04.c -o glpk/glpios04.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpios05.c -o glpk/glpios05.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpios06.c -o glpk/glpios06.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpios07.c -o glpk/glpios07.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpios08.c -o glpk/glpios08.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpios09.c -o glpk/glpios09.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpios10.c -o glpk/glpios10.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpios11.c -o glpk/glpios11.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpios12.c -o glpk/glpios12.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpipm.c -o glpk/glpipm.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glplib01.c -o glpk/glplib01.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glplib02.c -o glpk/glplib02.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glplib03.c -o glpk/glplib03.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glplpf.c -o glpk/glplpf.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glplpx01.c -o glpk/glplpx01.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glplpx02.c -o glpk/glplpx02.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glplpx03.c -o glpk/glplpx03.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpluf.c -o glpk/glpluf.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glplux.c -o glpk/glplux.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpmat.c -o glpk/glpmat.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpmpl01.c -o glpk/glpmpl01.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpmpl02.c -o glpk/glpmpl02.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpmpl03.c -o glpk/glpmpl03.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpmpl04.c -o glpk/glpmpl04.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpmpl05.c -o glpk/glpmpl05.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpmpl06.c -o glpk/glpmpl06.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpmps.c -o glpk/glpmps.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpnet01.c -o glpk/glpnet01.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpnet02.c -o glpk/glpnet02.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpnet03.c -o glpk/glpnet03.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpnet04.c -o glpk/glpnet04.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpnet05.c -o glpk/glpnet05.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpnet06.c -o glpk/glpnet06.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpnet07.c -o glpk/glpnet07.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpnet08.c -o glpk/glpnet08.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpnet09.c -o glpk/glpnet09.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpnpp01.c -o glpk/glpnpp01.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpnpp02.c -o glpk/glpnpp02.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpnpp03.c -o glpk/glpnpp03.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpnpp04.c -o glpk/glpnpp04.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpnpp05.c -o glpk/glpnpp05.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpqmd.c -o glpk/glpqmd.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glprgr.c -o glpk/glprgr.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glprng01.c -o glpk/glprng01.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glprng02.c -o glpk/glprng02.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpscf.c -o glpk/glpscf.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpscl.c -o glpk/glpscl.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpsdf.c -o glpk/glpsdf.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpspm.c -o glpk/glpspm.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpspx01.c -o glpk/glpspx01.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpspx02.c -o glpk/glpspx02.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpsql.c -o glpk/glpsql.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpssx01.c -o glpk/glpssx01.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glpssx02.c -o glpk/glpssx02.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c glpk/glptsp.c -o glpk/glptsp.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c simpleraytracer/Color.cpp -o simpleraytracer/Color.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c simpleraytracer/Light.cpp -o simpleraytracer/Light.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c simpleraytracer/Point.cpp -o simpleraytracer/Point.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c simpleraytracer/RIgraphRay.cpp -o simpleraytracer/RIgraphRay.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c simpleraytracer/Ray.cpp -o simpleraytracer/Ray.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c simpleraytracer/RayTracer.cpp -o simpleraytracer/RayTracer.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c simpleraytracer/RayVector.cpp -o simpleraytracer/RayVector.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c simpleraytracer/Shape.cpp -o simpleraytracer/Shape.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c simpleraytracer/Sphere.cpp -o simpleraytracer/Sphere.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c simpleraytracer/Triangle.cpp -o simpleraytracer/Triangle.o
==> default: g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R 
-DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -DNDEBUG -Iprpack -I. -Iinclude 
-DPRPACK_IGRAPH_SUPPORT -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c simpleraytracer/unit_limiter.cpp -o simpleraytracer/unit_limiter.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c uuid/R.c -o uuid/R.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c uuid/clear.c -o uuid/clear.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c uuid/compare.c -o uuid/compare.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c uuid/copy.c -o uuid/copy.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c uuid/gen_uuid.c -o uuid/gen_uuid.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c uuid/isnull.c -o uuid/isnull.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c uuid/pack.c -o uuid/pack.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c uuid/parse.c -o uuid/parse.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c uuid/unpack.c -o uuid/unpack.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c uuid/unparse.c -o uuid/unparse.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c rinterface.c -o rinterface.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c rinterface_extra.c -o rinterface_extra.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG     -DUSING_R -I. 
-Iinclude -Ics -Iglpk -Iplfit -ICHOLMOD/Include -IAMD/Include -ICOLAMD/Include 
-ISuiteSparse_config -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 
-Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 
-g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat 
-Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -I/usr/include/libxml2 -DNDEBUG 
-DNPARTITION -DNTIMER -DNCAMD -DNPRINT -DPACKAGE_VERSION=\"@VERSION@\" 
-DINTERNAL_ARPACK -DIGRAPH_THREAD_LOCAL=/**/ -fpic  -g -O2 -fstack-protector 
--param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 
-g  -c lazyeval.c -o lazyeval.o
==> default: g++ -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions -Wl,-z,relro 
-o igraph.so AMD/Source/amd.o AMD/Source/amd_1.o AMD/Source/amd_2.o 
AMD/Source/amd_aat.o AMD/Source/amd_control.o AMD/Source/amd_defaults.o 
AMD/Source/amd_dump.o AMD/Source/amd_global.o AMD/Source/amd_info.o 
AMD/Source/amd_order.o AMD/Source/amd_post_tree.o AMD/Source/amd_postorder.o 
AMD/Source/amd_preprocess.o AMD/Source/amd_valid.o AMD/Source/amdbar.o 
CHOLMOD/Check/cholmod_check.o CHOLMOD/Check/cholmod_read.o 
CHOLMOD/Check/cholmod_write.o CHOLMOD/Cholesky/cholmod_amd.o 
CHOLMOD/Cholesky/cholmod_analyze.o CHOLMOD/Cholesky/cholmod_colamd.o 
CHOLMOD/Cholesky/cholmod_etree.o CHOLMOD/Cholesky/cholmod_factorize.o 
CHOLMOD/Cholesky/cholmod_postorder.o CHOLMOD/Cholesky/cholmod_rcond.o 
CHOLMOD/Cholesky/cholmod_resymbol.o CHOLMOD/Cholesky/cholmod_rowcolcounts.o 
CHOLMOD/Cholesky/cholmod_rowfac.o CHOLMOD/Cholesky/cholmod_solve.o 
CHOLMOD/Cholesky/cholmod_spsolve.o CHOLMOD/Core/cholmod_aat.o 
CHOLMOD/Core/cholmod_add.o CHOLMOD/Core/cholmod_ban
==> default: d.o CHOLMOD/Core/cholmod_change_factor.o 
CHOLMOD/Core/cholmod_common.o CHOLMOD/Core/cholmod_complex.o 
CHOLMOD/Core/cholmod_copy.o CHOLMOD/Core/cholmod_dense.o 
CHOLMOD/Core/cholmod_error.o CHOLMOD/Core/cholmod_factor.o 
CHOLMOD/Core/cholmod_memory.o CHOLMOD/Core/cholmod_sparse.o 
CHOLMOD/Core/cholmod_transpose.o CHOLMOD/Core/cholmod_triplet.o 
CHOLMOD/Core/cholmod_version.o CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_drop.o 
CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_horzcat.o CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_norm.o 
CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_scale.o CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_sdmult.o 
CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_ssmult.o CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_submatrix.o 
CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_symmetry.o CHOLMOD/MatrixOps/cholmod_vertcat.o 
CHOLMOD/Modify/cholmod_rowadd.o CHOLMOD/Modify/cholmod_rowdel.o 
CHOLMOD/Modify/cholmod_updown.o CHOLMOD/Partition/cholmod_camd.o 
CHOLMOD/Partition/cholmod_ccolamd.o CHOLMOD/Partition/cholmod_csymamd.o 
CHOLMOD/Partition/cholmod_metis.o CHOLMOD/Partition/cholmod_nesdis.o 
CHOLMOD/Supernodal/cholmod_super_numeric.o CHOLM
==> default: OD/Supernodal/cholmod_super_solve.o 
CHOLMOD/Supernodal/cholmod_super_symbolic.o COLAMD/Source/colamd.o 
COLAMD/Source/colamd_global.o DensityGrid.o DensityGrid_3d.o NetDataTypes.o 
NetRoutines.o SuiteSparse_config/SuiteSparse_config.o adjlist.o arpack.o 
array.o atlas.o attributes.o basic_query.o bfgs.o bigint.o bignum.o bipartite.o 
blas.o bliss.o bliss_eqrefhash.o bliss_graph.o bliss_heap.o bliss_orbit.o 
bliss_partition.o bliss_timer.o bliss_utils.o cattributes.o centrality.o 
cliques.o clustertool.o cocitation.o cohesive_blocks.o community.o complex.o 
components.o conversion.o cores.o cs/cs_add.o cs/cs_amd.o cs/cs_chol.o 
cs/cs_cholsol.o cs/cs_compress.o cs/cs_counts.o cs/cs_cumsum.o cs/cs_dfs.o 
cs/cs_dmperm.o cs/cs_droptol.o cs/cs_dropzeros.o cs/cs_dupl.o cs/cs_entry.o 
cs/cs_ereach.o cs/cs_etree.o cs/cs_fkeep.o cs/cs_gaxpy.o cs/cs_happly.o 
cs/cs_house.o cs/cs_ipvec.o cs/cs_leaf.o cs/cs_load.o cs/cs_lsolve.o 
cs/cs_ltsolve.o cs/cs_lu.o cs/cs_lusol.o cs/cs_malloc.o cs/cs_maxtrans.o 
cs/cs_multiply.o
==> default:  cs/cs_norm.o cs/cs_permute.o cs/cs_pinv.o cs/cs_post.o 
cs/cs_print.o cs/cs_pvec.o cs/cs_qr.o cs/cs_qrsol.o cs/cs_randperm.o 
cs/cs_reach.o cs/cs_scatter.o cs/cs_scc.o cs/cs_schol.o cs/cs_spsolve.o 
cs/cs_sqr.o cs/cs_symperm.o cs/cs_tdfs.o cs/cs_transpose.o cs/cs_updown.o 
cs/cs_usolve.o cs/cs_util.o cs/cs_utsolve.o decomposition.o distances.o 
dotproduct.o dqueue.o drl_graph.o drl_graph_3d.o drl_layout.o drl_layout_3d.o 
drl_parse.o eigen.o embedding.o fast_community.o feedback_arc_set.o flow.o 
foreign-dl-lexer.o foreign-dl-parser.o foreign-gml-lexer.o foreign-gml-parser.o 
foreign-graphml.o foreign-lgl-lexer.o foreign-lgl-parser.o foreign-ncol-lexer.o 
foreign-ncol-parser.o foreign-pajek-lexer.o foreign-pajek-parser.o foreign.o 
forestfire.o fortran_intrinsics.o games.o gengraph_box_list.o 
gengraph_degree_sequence.o gengraph_graph_molloy_hash.o 
gengraph_graph_molloy_optimized.o gengraph_mr-connected.o gengraph_powerlaw.o 
gengraph_random.o glet.o glpk_support.o gml_tree.o hacks.o heap.o igraph_bucket
==> default: s.o igraph_error.o igraph_estack.o igraph_fixed_vectorlist.o 
igraph_grid.o igraph_hashtable.o igraph_heap.o igraph_hrg.o igraph_hrg_types.o 
igraph_marked_queue.o igraph_psumtree.o igraph_set.o igraph_stack.o 
igraph_strvector.o igraph_trie.o infomap.o infomap_FlowGraph.o infomap_Greedy.o 
infomap_Node.o interrupt.o iterators.o lad.o lapack.o layout.o layout_dh.o 
layout_fr.o layout_gem.o layout_kk.o lsap.o matching.o math.o matrix.o 
maximal_cliques.o memory.o microscopic_update.o mixing.o motifs.o operators.o 
optimal_modularity.o other.o paths.o plfit/error.o plfit/gss.o 
plfit/kolmogorov.o plfit/lbfgs.o plfit/options.o plfit/plfit.o plfit/zeta.o 
pottsmodel_2.o progress.o prpack.o prpack/prpack_base_graph.o 
prpack/prpack_igraph_graph.o prpack/prpack_preprocessed_ge_graph.o 
prpack/prpack_preprocessed_gs_graph.o prpack/prpack_preprocessed_scc_graph.o 
prpack/prpack_preprocessed_schur_graph.o prpack/prpack_result.o 
prpack/prpack_solver.o prpack/prpack_utils.o qsort.o qsort_r.o random.o 
random_walk.o s
==> default: bm.o scan.o scg.o scg_approximate_methods.o scg_exact_scg.o 
scg_kmeans.o scg_optimal_method.o scg_utils.o separators.o sir.o 
spanning_trees.o sparsemat.o spectral_properties.o spmatrix.o st-cuts.o 
statusbar.o structural_properties.o structure_generators.o sugiyama.o 
topology.o triangles.o type_indexededgelist.o types.o vector.o vector_ptr.o 
version.o visitors.o walktrap.o walktrap_communities.o walktrap_graph.o 
walktrap_heap.o zeroin.o dgetv0.o dlaqrb.o dmout.o dnaitr.o dnapps.o dnaup2.o 
dnaupd.o dnconv.o dneigh.o dneupd.o dngets.o dsaitr.o dsapps.o dsaup2.o 
dsaupd.o dsconv.o dseigt.o dsesrt.o dseupd.o dsgets.o dsortc.o dsortr.o 
dstatn.o dstats.o dstqrb.o dvout.o ivout.o second.o glpk/amd/amd_1.o 
glpk/amd/amd_2.o glpk/amd/amd_aat.o glpk/amd/amd_control.o 
glpk/amd/amd_defaults.o glpk/amd/amd_dump.o glpk/amd/amd_info.o 
glpk/amd/amd_order.o glpk/amd/amd_post_tree.o glpk/amd/amd_postorder.o 
glpk/amd/amd_preprocess.o glpk/amd/amd_valid.o glpk/colamd/colamd.o 
glpk/glpapi01.o glpk/glpapi02.o glpk/glp
==> default: api03.o glpk/glpapi04.o glpk/glpapi05.o glpk/glpapi06.o 
glpk/glpapi07.o glpk/glpapi08.o glpk/glpapi09.o glpk/glpapi10.o glpk/glpapi11.o 
glpk/glpapi12.o glpk/glpapi13.o glpk/glpapi14.o glpk/glpapi15.o glpk/glpapi16.o 
glpk/glpapi17.o glpk/glpapi18.o glpk/glpapi19.o glpk/glpavl.o glpk/glpbfd.o 
glpk/glpbfx.o glpk/glpcpx.o glpk/glpdmp.o glpk/glpdmx.o glpk/glpenv01.o 
glpk/glpenv02.o glpk/glpenv03.o glpk/glpenv04.o glpk/glpenv05.o glpk/glpenv06.o 
glpk/glpenv07.o glpk/glpenv08.o glpk/glpfhv.o glpk/glpgmp.o glpk/glphbm.o 
glpk/glpini01.o glpk/glpini02.o glpk/glpios01.o glpk/glpios02.o glpk/glpios03.o 
glpk/glpios04.o glpk/glpios05.o glpk/glpios06.o glpk/glpios07.o glpk/glpios08.o 
glpk/glpios09.o glpk/glpios10.o glpk/glpios11.o glpk/glpios12.o glpk/glpipm.o 
glpk/glplib01.o glpk/glplib02.o glpk/glplib03.o glpk/glplpf.o glpk/glplpx01.o 
glpk/glplpx02.o glpk/glplpx03.o glpk/glpluf.o glpk/glplux.o glpk/glpmat.o 
glpk/glpmpl01.o glpk/glpmpl02.o glpk/glpmpl03.o glpk/glpmpl04.o glpk/glpmpl05.o 
glpk/glpmpl06.o glpk
==> default: /glpmps.o glpk/glpnet01.o glpk/glpnet02.o glpk/glpnet03.o 
glpk/glpnet04.o glpk/glpnet05.o glpk/glpnet06.o glpk/glpnet07.o glpk/glpnet08.o 
glpk/glpnet09.o glpk/glpnpp01.o glpk/glpnpp02.o glpk/glpnpp03.o glpk/glpnpp04.o 
glpk/glpnpp05.o glpk/glpqmd.o glpk/glprgr.o glpk/glprng01.o glpk/glprng02.o 
glpk/glpscf.o glpk/glpscl.o glpk/glpsdf.o glpk/glpspm.o glpk/glpspx01.o 
glpk/glpspx02.o glpk/glpsql.o glpk/glpssx01.o glpk/glpssx02.o glpk/glptsp.o 
simpleraytracer/Color.o simpleraytracer/Light.o simpleraytracer/Point.o 
simpleraytracer/RIgraphRay.o simpleraytracer/Ray.o simpleraytracer/RayTracer.o 
simpleraytracer/RayVector.o simpleraytracer/Shape.o simpleraytracer/Sphere.o 
simpleraytracer/Triangle.o simpleraytracer/unit_limiter.o uuid/R.o uuid/clear.o 
uuid/compare.o uuid/copy.o uuid/gen_uuid.o uuid/isnull.o uuid/pack.o 
uuid/parse.o uuid/unpack.o uuid/unparse.o rinterface.o rinterface_extra.o 
lazyeval.o -lxml2 -lgfortran -lm -lquadmath -llapack -lblas -lgfortran -lm 
-lquadmath -L/usr/lib/R/lib -lR
==> default: installing to /usr/local/lib/R/site-library/igraph/libs
==> default: ** R
==> default: ** demo
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (igraph)
==> default: * installing *source* package ‘BiRewire’ ...
==> default: ** libs
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c BiRewire.c -o BiRewire.o
==> default: gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -g -O2 
-fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security 
-D_FORTIFY_SOURCE=2 -g  -c interface.c -o interface.o
==> default: gcc -std=gnu99 -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions 
-Wl,-z,relro -o BiRewire.so BiRewire.o interface.o -L/usr/lib/R/lib -lR
==> default: installing to /usr/local/lib/R/site-library/BiRewire/libs
==> default: ** R
==> default: ** data
==> default: ** inst
==> default: ** preparing package for lazy loading
==> default: ** help
==> default: *** installing help indices
==> default: ** building package indices
==> default: ** installing vignettes
==> default: ** testing if installed package can be loaded
==> default: * DONE (BiRewire)
==> default: The downloaded source packages are in
==> default:    ‘/tmp/RtmpUbPz0C/downloaded_packages’
==> default: Old packages: 'colorspace', 'DBI', 'digest', 'evaluate', 
'labeling', 'munsell',
==> default:   'plyr', 'RColorBrewer', 'RCurl', 'reshape', 'rjson', 'RMySQL', 
'scales',
==> default:   'stringr', 'testthat', 'xtable', 'zoo', 'boot', 'MASS', 'mgcv', 
'spatial'
==> default: Warning:
==> default:  dependencies ‘Rcampdf’, ‘Rgraphviz’, 
‘tm.lexicon.GeneralInquirer’, ‘GenomicRanges’ are not available
==> default: also installing the dependencies ‘minqa’, ‘nloptr’, ‘RcppEigen’, 
‘modeltools’, ‘DBI’, ‘lme4’, ‘SparseM’, ‘MatrixModels’, ‘mclust’, ‘flexmix’, 
‘prabclus’, ‘diptest’, ‘kernlab’, ‘trimcluster’, ‘DEoptimR’, ‘htmlwidgets’, 
‘viridisLite’, ‘tidyr’, ‘dplyr’, ‘purrr’, ‘pbkrtest’, ‘quantreg’, ‘backports’, 
‘fpc’, ‘viridis’, ‘robustbase’, ‘coda’, ‘trust’, ‘lpSolve’, ‘animation’, 
‘base64’, ‘deSolve’, ‘ape’, ‘mvtnorm’, ‘abind’, ‘evaluate’, ‘highr’, 
‘scatterplot3d’, ‘vcd’, ‘DT’, ‘plotly’, ‘bit’, ‘RcppCCTZ’, ‘gtools’, ‘car’, 
‘ModelMetrics’, ‘Formula’, ‘bdsmatrix’, ‘sandwich’, ‘lmtest’, ‘caTools’, 
‘base64enc’, ‘rprojroot’, ‘rex’, ‘fontBitstreamVera’, ‘fontLiberation’, 
‘openssl’, ‘stringdist’, ‘brew’, ‘desc’, ‘commonmark’, ‘TSP’, ‘qap’, ‘gclus’, 
‘dendextend’, ‘gplots’, ‘tergm’, ‘ergm.count’, ‘sna’, ‘statnet.common’, 
‘network’, ‘networkDynamic’, ‘ergm’, ‘networksis’, ‘degreenet’, ‘relevent’, 
‘ndtv’, ‘EpiModel’, ‘latentnet’, ‘tsna’, ‘NLP’, ‘BH’, ‘filehash’, ‘Rpoppler’, 
‘SnowballC’, ‘XML’, ‘getopt’, ‘knitr’, ‘pmml’, ‘arulesViz’, ‘bit64’, 
‘nanotime’, ‘chron’, ‘hexbin’, ‘fastmatch’, ‘gdata’, ‘caret’, ‘curl’, ‘plm’, 
‘rmarkdown’, ‘covr’, ‘rJava’, ‘gdtools’, ‘htmltools’, ‘xml2’, ‘fontquiver’, 
‘mime’, ‘jsonlite’, ‘R6’, ‘sourcetools’, ‘Cairo’, ‘markdown’, ‘proxy’, ‘httr’, 
‘memoise’, ‘whisker’, ‘rstudioapi’, ‘git2r’, ‘withr’, ‘crayon’, ‘hunspell’, 
‘lintr’, ‘roxygen2’, ‘rversions’, ‘gmailr’, ‘seriation’, ‘svUnit’
==> default: Providing id_service
==> default: integration-scripts/install_codeface_node.sh: 8: 
integration-scripts/install_codeface_node.sh: 
==> default: npm: not found
==> default: Providing codeface python
==> default: In file included from _mysql.c:44:0:
==> default: /usr/include/mysql/my_config.h:423:0: warning: "HAVE_WCSCOLL" 
redefined [enabled by default]
==> default:  #define HAVE_WCSCOLL
==> default:  ^
==> default: In file included from /usr/include/python2.7/pyconfig.h:3:0,
==> default:                  from /usr/include/python2.7/Python.h:8,
==> default:                  from _mysql.c:29:
==> default: /usr/include/x86_64-linux-gnu/python2.7/pyconfig.h:911:0: note: 
this is the location of the previous definition
==> default:  #define HAVE_WCSCOLL 1
==> default:  ^
==> default: zip_safe flag not set; analyzing archive contents...
==> default: src/_readtags.c: In function 
‘__pyx_pf_9_readtags_8TagEntry___getitem__’:
==> default: src/_readtags.c:957:20: warning: assignment discards ‘const’ 
qualifier from pointer target type [enabled by default]
==> default:      __pyx_v_result = tagsField((&((struct 
__pyx_obj_9_readtags_TagEntry *)__pyx_v_self)->c_entry), __pyx_3);
==> default:                     ^
==> default: zip_safe flag not set; analyzing archive contents...
==> default: warning: no previously-included files matching '*' found under 
directory 'docs/build'
==> default: zip_safe flag not set; analyzing archive contents...
==> default: Providing cppstats 0.9.3
==> default: /vagrant /vagrant
==> default: cppstats-0.9.3/
==> default: cppstats-0.9.3/.gitignore
==> default: cppstats-0.9.3/INSTALL.md
==> default: cppstats-0.9.3/LICENSE
==> default: cppstats-0.9.3/LICENSE.LESSER
==> default: cppstats-0.9.3/OLD_BRANCHES
==> default: cppstats-0.9.3/README.md
==> default: cppstats-0.9.3/analyses/
==> default: cppstats-0.9.3/analyses/__init__.py
==> default: cppstats-0.9.3/analyses/derivative.py
==> default: cppstats-0.9.3/analyses/discipline.py
==> default: cppstats-0.9.3/analyses/featurelocations.py
==> default: cppstats-0.9.3/analyses/general.py
==> default: cppstats-0.9.3/analyses/generalvalues.py
==> default: cppstats-0.9.3/analyses/interaction.py
==> default: cppstats-0.9.3/cppstats.sh
==> default: cppstats-0.9.3/cppstats/
==> default: cppstats-0.9.3/cppstats/__init__.py
==> default: cppstats-0.9.3/cppstats/analysis.py
==> default: cppstats-0.9.3/cppstats/cli.py
==> default: cppstats-0.9.3/cppstats/cppstats.py
==> default: cppstats-0.9.3/cppstats/preparation.py
==> default: cppstats-0.9.3/cppstats_input.txt
==> default: cppstats-0.9.3/lib/
==> default: cppstats-0.9.3/lib/__init__.py
==> default: cppstats-0.9.3/lib/cpplib.py
==> default: cppstats-0.9.3/preparations/
==> default: cppstats-0.9.3/preparations/__init__.py
==> default: cppstats-0.9.3/preparations/deleteComments.xsl
==> default: cppstats-0.9.3/preparations/deleteIncludeGuards.py
==> default: cppstats-0.9.3/preparations/rewriteIfdefs.py
==> default: cppstats-0.9.3/preparations/rewriteMultilineMacros.py
==> default: cppstats-0.9.3/scripts/
==> default: cppstats-0.9.3/scripts/__init__.py
==> default: cppstats-0.9.3/scripts/ascope.py
==> default: cppstats-0.9.3/scripts/convert2xml.sh
==> default: cppstats-0.9.3/scripts/disable_errorneous_files.sh
==> default: cppstats-0.9.3/scripts/ifdefendifratio.py
==> default: cppstats-0.9.3/scripts/partial_preprocessor.py
==> default: cppstats-0.9.3/scripts/reversecpp.py
==> default: cppstats-0.9.3/setup.py
==> default: running install
==> default: running bdist_egg
==> default: running egg_info
==> default: creating cppstats.egg-info
==> default: writing requirements to cppstats.egg-info/requires.txt
==> default: writing cppstats.egg-info/PKG-INFO
==> default: writing top-level names to cppstats.egg-info/top_level.txt
==> default: writing dependency_links to cppstats.egg-info/dependency_links.txt
==> default: writing entry points to cppstats.egg-info/entry_points.txt
==> default: writing manifest file 'cppstats.egg-info/SOURCES.txt'
==> default: reading manifest file 'cppstats.egg-info/SOURCES.txt'
==> default: writing manifest file 'cppstats.egg-info/SOURCES.txt'
==> default: installing library code to build/bdist.linux-x86_64/egg
==> default: running install_lib
==> default: running build_py
==> default: creating build
==> default: creating build/lib.linux-x86_64-2.7
==> default: creating build/lib.linux-x86_64-2.7/preparations
==> default: copying preparations/rewriteIfdefs.py -> 
build/lib.linux-x86_64-2.7/preparations
==> default: copying preparations/deleteIncludeGuards.py -> 
build/lib.linux-x86_64-2.7/preparations
==> default: copying preparations/rewriteMultilineMacros.py -> 
build/lib.linux-x86_64-2.7/preparations
==> default: copying preparations/__init__.py -> 
build/lib.linux-x86_64-2.7/preparations
==> default: creating build/lib.linux-x86_64-2.7/lib
==> default: copying lib/cpplib.py -> build/lib.linux-x86_64-2.7/lib
==> default: copying lib/__init__.py -> build/lib.linux-x86_64-2.7/lib
==> default: creating build/lib.linux-x86_64-2.7/analyses
==> default: copying analyses/derivative.py -> 
build/lib.linux-x86_64-2.7/analyses
==> default: copying analyses/generalvalues.py -> 
build/lib.linux-x86_64-2.7/analyses
==> default: copying analyses/general.py -> build/lib.linux-x86_64-2.7/analyses
==> default: copying analyses/__init__.py -> build/lib.linux-x86_64-2.7/analyses
==> default: copying analyses/featurelocations.py -> 
build/lib.linux-x86_64-2.7/analyses
==> default: copying analyses/discipline.py -> 
build/lib.linux-x86_64-2.7/analyses
==> default: copying analyses/interaction.py -> 
build/lib.linux-x86_64-2.7/analyses
==> default: creating build/lib.linux-x86_64-2.7/cppstats
==> default: copying cppstats/__init__.py -> build/lib.linux-x86_64-2.7/cppstats
==> default: copying cppstats/cli.py -> build/lib.linux-x86_64-2.7/cppstats
==> default: copying cppstats/cppstats.py -> build/lib.linux-x86_64-2.7/cppstats
==> default: copying cppstats/analysis.py -> build/lib.linux-x86_64-2.7/cppstats
==> default: copying cppstats/preparation.py -> 
build/lib.linux-x86_64-2.7/cppstats
==> default: copying preparations/deleteComments.xsl -> 
build/lib.linux-x86_64-2.7/preparations
==> default: creating build/bdist.linux-x86_64
==> default: creating build/bdist.linux-x86_64/egg
==> default: creating build/bdist.linux-x86_64/egg/preparations
==> default: copying build/lib.linux-x86_64-2.7/preparations/rewriteIfdefs.py 
-> build/bdist.linux-x86_64/egg/preparations
==> default: copying build/lib.linux-x86_64-2.7/preparations/deleteComments.xsl 
-> build/bdist.linux-x86_64/egg/preparations
==> default: copying 
build/lib.linux-x86_64-2.7/preparations/deleteIncludeGuards.py -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/preparations
==> default: copying 
build/lib.linux-x86_64-2.7/preparations/rewriteMultilineMacros.py -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/preparations
==> default: copying build/lib.linux-x86_64-2.7/preparations/__init__.py -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/preparations
==> default: creating build/bdist.linux-x86_64/egg/lib
==> default: copying build/lib.linux-x86_64-2.7/lib/cpplib.py -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/lib
==> default: copying build/lib.linux-x86_64-2.7/lib/__init__.py -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/lib
==> default: creating build/bdist.linux-x86_64/egg/analyses
==> default: copying build/lib.linux-x86_64-2.7/analyses/derivative.py -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/analyses
==> default: copying build/lib.linux-x86_64-2.7/analyses/generalvalues.py -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/analyses
==> default: copying build/lib.linux-x86_64-2.7/analyses/general.py -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/analyses
==> default: copying build/lib.linux-x86_64-2.7/analyses/__init__.py -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/analyses
==> default: copying build/lib.linux-x86_64-2.7/analyses/featurelocations.py -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/analyses
==> default: copying build/lib.linux-x86_64-2.7/analyses/discipline.py -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/analyses
==> default: copying build/lib.linux-x86_64-2.7/analyses/interaction.py -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/analyses
==> default: creating build/bdist.linux-x86_64/egg/cppstats
==> default: copying build/lib.linux-x86_64-2.7/cppstats/__init__.py -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/cppstats
==> default: copying build/lib.linux-x86_64-2.7/cppstats/cli.py -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/cppstats
==> default: copying build/lib.linux-x86_64-2.7/cppstats/cppstats.py -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/cppstats
==> default: copying build/lib.linux-x86_64-2.7/cppstats/analysis.py -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/cppstats
==> default: copying build/lib.linux-x86_64-2.7/cppstats/preparation.py -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/cppstats
==> default: byte-compiling 
build/bdist.linux-x86_64/egg/preparations/rewriteIfdefs.py to rewriteIfdefs.pyc
==> default: byte-compiling 
build/bdist.linux-x86_64/egg/preparations/deleteIncludeGuards.py to 
deleteIncludeGuards.pyc
==> default: byte-compiling 
build/bdist.linux-x86_64/egg/preparations/rewriteMultilineMacros.py to 
rewriteMultilineMacros.pyc
==> default: byte-compiling 
build/bdist.linux-x86_64/egg/preparations/__init__.py to __init__.pyc
==> default: byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/lib/cpplib.py to 
cpplib.pyc
==> default: byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/lib/__init__.py to 
__init__.pyc
==> default: byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/analyses/derivative.py 
to derivative.pyc
==> default: byte-compiling 
build/bdist.linux-x86_64/egg/analyses/generalvalues.py to generalvalues.pyc
==> default: byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/analyses/general.py to 
general.pyc
==> default: byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/analyses/__init__.py 
to __init__.pyc
==> default: byte-compiling 
build/bdist.linux-x86_64/egg/analyses/featurelocations.py to 
featurelocations.pyc
==> default: byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/analyses/discipline.py 
to discipline.pyc
==> default: byte-compiling 
build/bdist.linux-x86_64/egg/analyses/interaction.py to interaction.pyc
==> default: byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/cppstats/__init__.py 
to __init__.pyc
==> default: byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/cppstats/cli.py to 
cli.pyc
==> default: byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/cppstats/cppstats.py 
to cppstats.pyc
==> default: byte-compiling build/bdist.linux-x86_64/egg/cppstats/analysis.py 
to analysis.pyc
==> default: byte-compiling 
build/bdist.linux-x86_64/egg/cppstats/preparation.py to preparation.pyc
==> default: creating build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
==> default: copying cppstats.egg-info/PKG-INFO -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
==> default: copying cppstats.egg-info/SOURCES.txt -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
==> default: copying cppstats.egg-info/dependency_links.txt -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
==> default: copying cppstats.egg-info/entry_points.txt -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
==> default: copying cppstats.egg-info/requires.txt -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
==> default: copying cppstats.egg-info/top_level.txt -> 
build/bdist.linux-x86_64/egg/EGG-INFO
==> default: zip_safe flag not set; analyzing archive contents...
==> default: cppstats.preparation: module references __file__
==> default: creating dist
==> default: creating 'dist/cppstats-0.9.3-py2.7.egg' and adding 
'build/bdist.linux-x86_64/egg' to it
==> default: removing 'build/bdist.linux-x86_64/egg' (and everything under it)
==> default: Processing cppstats-0.9.3-py2.7.egg
==> default: creating 
/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/cppstats-0.9.3-py2.7.egg
==> default: Extracting cppstats-0.9.3-py2.7.egg to 
/usr/local/lib/python2.7/dist-packages
==> default: Adding cppstats 0.9.3 to easy-install.pth file
==> default: Installing cppstats script to /usr/local/bin
==> default: Installing cppstats.analysis script to /usr/local/bin
==> default: Installing cppstats.preparation script to /usr/local/bin
==> default: 
==> default: Installed 
/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/cppstats-0.9.3-py2.7.egg
==> default: Processing dependencies for cppstats==0.9.3
==> default: Searching for lxml>=3.4
==> default: Reading https://pypi.python.org/simple/lxml/
==> default: Downloading 
https://pypi.python.org/packages/39/e8/a8e0b1fa65dd021d48fe21464f71783655f39a41f218293c1c590d54eb82/lxml-3.7.3.tar.gz#md5=075692ce442e69bbd604d44e21c02753
==> default: Best match: lxml 3.7.3
==> default: Processing lxml-3.7.3.tar.gz
==> default: Writing /tmp/easy_install-44myWe/lxml-3.7.3/setup.cfg
==> default: Running lxml-3.7.3/setup.py -q bdist_egg --dist-dir 
/tmp/easy_install-44myWe/lxml-3.7.3/egg-dist-tmp-vqDcKw
==> default: Building lxml version 3.7.3.
==> default: Building without Cython.
==> default: Using build configuration of libxslt 1.1.28
==> default: creating 
/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/lxml-3.7.3-py2.7-linux-x86_64.egg
==> default: Extracting lxml-3.7.3-py2.7-linux-x86_64.egg to 
/usr/local/lib/python2.7/dist-packages
==> default: Adding lxml 3.7.3 to easy-install.pth file
==> default: 
==> default: Installed 
/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/lxml-3.7.3-py2.7-linux-x86_64.egg
==> default: Searching for enum
==> default: Reading https://pypi.python.org/simple/enum/
==> default: Downloading 
https://pypi.python.org/packages/0c/4e/1ea357e7783c756bb579333c1e4a026fb331371ee771f616ffedc781e531/enum-0.4.6.tar.gz#md5=173d468112cfa13a149b2c8af3e8fd52
==> default: Best match: enum 0.4.6
==> default: Processing enum-0.4.6.tar.gz
==> default: Writing /tmp/easy_install-XAInrC/enum-0.4.6/setup.cfg
==> default: Running enum-0.4.6/setup.py -q bdist_egg --dist-dir 
/tmp/easy_install-XAInrC/enum-0.4.6/egg-dist-tmp-GYkl6K
==> default: creating 
/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/enum-0.4.6-py2.7.egg
==> default: Extracting enum-0.4.6-py2.7.egg to 
/usr/local/lib/python2.7/dist-packages
==> default: Adding enum 0.4.6 to easy-install.pth file
==> default: 
==> default: Installed 
/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/enum-0.4.6-py2.7.egg
==> default: Searching for statlib==1.2
==> default: Downloading 
https://github.com/clhunsen/python-statlib/archive/release-1.2.tar.gz#egg=statlib-1.2
==> default: Best match: statlib 1.2
==> default: Processing release-1.2.tar.gz
==> default: Writing 
/tmp/easy_install-EJhTge/python-statlib-release-1.2/setup.cfg
==> default: Running python-statlib-release-1.2/setup.py -q bdist_egg 
--dist-dir 
/tmp/easy_install-EJhTge/python-statlib-release-1.2/egg-dist-tmp-C1eu40
==> default: warning: no files found matching '*.html' under directory 'docs'
==> default: zip_safe flag not set; analyzing archive contents...
==> default: Moving statlib-1.2-py2.7.egg to 
/usr/local/lib/python2.7/dist-packages
==> default: Adding statlib 1.2 to easy-install.pth file
==> default: 
==> default: Installed 
/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/statlib-1.2-py2.7.egg
==> default: Searching for pyparsing==2.2.0
==> default: Best match: pyparsing 2.2.0
==> default: Adding pyparsing 2.2.0 to easy-install.pth file
==> default: 
==> default: Using /usr/local/lib/python2.7/dist-packages
==> default: Searching for setuptools==34.3.2
==> default: Best match: setuptools 34.3.2
==> default: Adding setuptools 34.3.2 to easy-install.pth file
==> default: Installing easy_install script to /usr/local/bin
==> default: Installing easy_install-3.6 script to /usr/local/bin
==> default: 
==> default: Using /usr/local/lib/python2.7/dist-packages
==> default: Searching for six==1.10.0
==> default: Best match: six 1.10.0
==> default: Adding six 1.10.0 to easy-install.pth file
==> default: 
==> default: Using /usr/local/lib/python2.7/dist-packages
==> default: Searching for packaging==16.8
==> default: Best match: packaging 16.8
==> default: Adding packaging 16.8 to easy-install.pth file
==> default: 
==> default: Using /usr/local/lib/python2.7/dist-packages
==> default: Searching for appdirs==1.4.3
==> default: Best match: appdirs 1.4.3
==> default: Adding appdirs 1.4.3 to easy-install.pth file
==> default: 
==> default: Using /usr/local/lib/python2.7/dist-packages
==> default: Finished processing dependencies for cppstats==0.9.3
==> default: Providing srcML
==> default: Selecting previously unselected package srcml.
==> default: (Reading database ... 99994 files and directories currently 
installed.)
==> default: Preparing to unpack /tmp/tmp.h5atZzArvN/srcML.deb ...
==> default: Unpacking srcml (0.9.5) ...
==> default: Setting up srcml (0.9.5) ...
==> default: /vagrant
==> default: Providing codeface database
==> default: Running provisioner: test (shell)...
    default: Running: inline script
==> default: module.js:340
==> default:     throw err;
==> default:           ^
==> default: Error: Cannot find module 'express'
==> default:     at Function.Module._resolveFilename (module.js:338:15)
==> default:     at Function.Module._load (module.js:280:25)
==> default:     at Module.require (module.js:364:17)
==> default:     at require (module.js:380:17)
==> default:     at Object.<anonymous> (/vagrant/id_service/id_service.js:19:15)
==> default:     at Module._compile (module.js:456:26)
==> default:     at Object.Module._extensions..js (module.js:474:10)
==> default:     at Module.load (module.js:356:32)
==> default:     at Function.Module._load (module.js:312:12)
==> default:     at Function.Module.runMain (module.js:497:10)
==> default: 
==> default: ===== running unittests =====
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 1
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 2
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 3
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 4
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 5
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 6
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 7
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 8
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 10
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 9
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-4 INFO: 3
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:3
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 4
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-2 INFO: 1
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:1
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 2
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 2 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 4 has finished!
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-8 INFO: 7
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:7
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 8
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-7 INFO: 6
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:6
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 7
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 7 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 8 has finished!
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-3 INFO: 2
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:2
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 3
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-1 INFO: 0
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-10 INFO: 
9
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:9
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 10
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:0
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 1
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-9 INFO: 8
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:8
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 9
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 1 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 3 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 9 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 10 has finished!
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-5 INFO: 4
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:4
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 5
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-6 INFO: 5
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:5
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 6
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 5 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 6 has finished!
==> default: DEVINFO:codeface.util:Terminating workers...
==> default: DEVINFO:codeface.util:Workers terminated.
==> default: .
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 1
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-25 INFO: 0
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:0
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 1
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 1 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 2
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-48 INFO: 
1
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:1
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 2
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 2 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 3
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-27 INFO: 
2
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:2
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 3
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 3 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 4
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-28 INFO: 
3
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:3
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 4
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 4 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 5
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-29 INFO: 
4
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:4
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 5
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 5 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 6
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-30 INFO: 
5
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:5
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 6
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 6 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 7
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-31 INFO: 
6
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:6
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 7
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 7 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 8
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-32 INFO: 
7
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:7
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 8
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 8 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 9
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-33 INFO: 
8
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:8
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 9
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 9 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 10
==> default: 2017-03-25 12:28:02 [codeface.test.unit.batchjob] Process-34 INFO: 
9
==> default: INFO:codeface.test.unit.batchjob:9
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 10
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 10 has finished!
==> default: DEVINFO:codeface.util:Terminating workers...
==> default: DEVINFO:codeface.util:Workers terminated.
==> default: .
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 1
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 2
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 3
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 3
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 1
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 4
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 2
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 4
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 6
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 5
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 5
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 6
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 7
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 7
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 8
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 8
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 9
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 9
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 10
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 10
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 11
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 12
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 13
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 13
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 11
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 15
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 14
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 14
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 15
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 16
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 16
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 18
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 12
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 17
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 17
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 18
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 19
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 19
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 20
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 20
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 21
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 21
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 22
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 22
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 23
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 23
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 24
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 26
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 25
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 25
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 26
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 27
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 27
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 28
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 28
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 29
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 29
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 30
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 30
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 31
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 31
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 32
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 32
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 33
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 33
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 34
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 34
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 35
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 35
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 36
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 36
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 37
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 37
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 38
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 38
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 39
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 39
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 40
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 40
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 41
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 41
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 42
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 42
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 43
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 43
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 44
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 44
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 45
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 45
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 46
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 46
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 47
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 47
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 24
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 48
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 48
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 49
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 49
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 51
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 51
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 52
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 52
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 53
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 53
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 54
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 54
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 55
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 55
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 56
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 56
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 57
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 57
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 58
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 58
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 59
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 59
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 60
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 60
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 61
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 61
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 62
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 62
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 63
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 63
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 64
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 64
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 65
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 65
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 66
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 66
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 67
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 67
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 68
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 68
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 69
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 69
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 70
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 70
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 71
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 71
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 72
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 72
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 73
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 73
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 74
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 74
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 75
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 75
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 50
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 76
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 50
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 76
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 79
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 80
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 80
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 81
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 79
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 81
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 83
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 82
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 84
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 82
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 83
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 85
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 84
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 87
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 85
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 88
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 87
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 86
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 86
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 88
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 89
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 91
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 89
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 92
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 90
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 90
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 92
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 91
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 94
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 95
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 95
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 93
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 93
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 96
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 97
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 97
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 98
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 98
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 99
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 99
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 100
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 100
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 101
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 101
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 102
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 102
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 103
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 103
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 104
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 104
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 105
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 105
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 106
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 106
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 107
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 107
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 108
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 108
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 109
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 109
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 110
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 110
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 111
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 111
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 112
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 112
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 113
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 113
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 114
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 114
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 115
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 115
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 116
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 116
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 117
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 117
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 118
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 118
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 119
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 119
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 120
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 120
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 121
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 121
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 122
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 122
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 123
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 123
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 124
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 124
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 125
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 125
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 126
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 126
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 127
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 127
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 128
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 128
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 129
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 129
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 130
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 130
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 131
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 131
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 132
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 132
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 133
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 133
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 134
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 134
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 135
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 135
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 136
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 136
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 137
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 137
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 138
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 138
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 77
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 77
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 78
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 78
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 96
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 94
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 139
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 139
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 140
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 140
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 141
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 141
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 142
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 142
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 143
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 144
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 144
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 143
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 145
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 146
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 147
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 148
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 148
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 149
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 149
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 150
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 150
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 151
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 151
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 152
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 152
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 153
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 154
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 154
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 155
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 155
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 156
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 156
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 157
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 157
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 158
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 158
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 159
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 159
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 160
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 160
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 161
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 161
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 162
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 162
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 163
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 163
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 164
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 164
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 165
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 165
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 166
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 153
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 166
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 167
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 146
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 167
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 168
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 168
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 169
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 169
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 147
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 170
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 170
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 145
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 171
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 171
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 172
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 174
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 174
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 175
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 175
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 176
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 176
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 177
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 177
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 178
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 178
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 179
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 179
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 180
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 180
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 173
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 181
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 181
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 182
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 182
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 183
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 183
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 173
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 184
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 184
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 185
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 185
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 186
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 186
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 187
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 187
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 188
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 188
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 189
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 189
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 190
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 190
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 172
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 191
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 192
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 192
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 193
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 193
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 194
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 195
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 195
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 196
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 196
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 197
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 197
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 198
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 198
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 199
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 199
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 200
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 200
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 201
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 201
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 202
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 202
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 203
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 203
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 204
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 204
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 205
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 205
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 206
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 206
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 207
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 207
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 194
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 208
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 208
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 209
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 209
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 210
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 210
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 191
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 211
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 211
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 213
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 213
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 214
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 214
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 215
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 215
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 216
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 212
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 216
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 212
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 217
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 217
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 218
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 218
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 219
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 220
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 220
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 221
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 221
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 222
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 222
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 223
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 223
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 224
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 224
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 225
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 225
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 219
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 226
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 227
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 227
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 228
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 228
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 229
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 229
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 230
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 230
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 231
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 231
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 232
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 232
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 226
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 233
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 233
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 234
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 234
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 235
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 235
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 236
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 236
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 237
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 238
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 238
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 237
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 1 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 239
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 2 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 3 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 4 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 5 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 7 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 78 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 8 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 9 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 10 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 82 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 12 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 13 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 14 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 16 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 17 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 140 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 93 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 86 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 90 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 23 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 25 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 240
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 239
==> default: DEBUG:codeface.util:Finished work id 240
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 26 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 6 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 80 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 27 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 51 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 18 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 238 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 11 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 97 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 141 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 153 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 154 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 192 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 227 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 19 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 236 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 21 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 174 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 195 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 148 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 79 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 76 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 28 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 52 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 20 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 15 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 98 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 142 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 172 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 155 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 193 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 228 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 144 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 175 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 196 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 149 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 84 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 173 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 29 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 53 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 22 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 81 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 99 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 143 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 239 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 156 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 213 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 229 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 220 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 176 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 197 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 150 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 87 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 191 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 30 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 54 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 24 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 83 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 100 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 157 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 214 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 230 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 221 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 177 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 198 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 151 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 89 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 240 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 31 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 55 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 145 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 85 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 101 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 158 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 215 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 231 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 222 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 178 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 199 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 152 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 92 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 32 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 56 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 194 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 88 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 102 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 159 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 216 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 232 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 223 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 179 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 200 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 95 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 33 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 57 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 226 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 91 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 103 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 160 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 217 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 233 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 224 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 180 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 201 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 96 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 34 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 58 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 235 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 94 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 104 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 161 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 218 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 234 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 225 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 181 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 202 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 146 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 35 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 59 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 237 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 105 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 162 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 182 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 203 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 170 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 36 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 60 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 106 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 163 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 183 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 204 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 171 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 37 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 61 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 107 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 164 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 184 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 205 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 38 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 62 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 108 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 165 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 185 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 206 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 39 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 63 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 109 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 166 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 186 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 207 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 40 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 64 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 110 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 167 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 187 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 208 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 41 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 65 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 111 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 168 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 188 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 209 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 42 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 66 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 112 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 169 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 189 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 210 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 43 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 67 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 113 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 190 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 211 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 44 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 68 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 114 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 45 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 69 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 115 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 46 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 70 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 116 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 47 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 71 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 117 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 48 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 72 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 118 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 49 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 73 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 119 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 50 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 74 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 120 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 77 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 75 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 121 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 147 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 122 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 212 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 123 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 219 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 124 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 125 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 126 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 127 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 128 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 129 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 130 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 131 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 132 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 133 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 134 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 135 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 136 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 137 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 138 has finished!
==> default: DEBUG:codeface.util:Job 139 has finished!
==> default: DEVINFO:codeface.util:Terminating workers...
==> default: DEVINFO:codeface.util:Workers terminated.
==> default: .
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 1
==> default: DEBUG:codeface.util:Failed work id 1
==> default: 2017-03-25 12:28:03 [codeface.util] MainProcess CRITICAL: Uncaught 
exception in worker thread:
==> default: CRITICAL:codeface.util:Uncaught exception in worker thread:
==> default: DEVINFO:codeface.util:Terminating workers...
==> default: DEVINFO:codeface.util:Workers terminated.
==> default: .
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 1
==> default: DEBUG:codeface.util:Failed work id 1
==> default: 2017-03-25 12:28:03 [codeface.util] MainProcess CRITICAL: Uncaught 
exception in worker thread:
==> default: CRITICAL:codeface.util:Uncaught exception in worker thread:
==> default: DEVINFO:codeface.util:Terminating workers...
==> default: DEVINFO:codeface.util:Workers terminated.
==> default: .
==> default: DEBUG:codeface.util:Starting job id 1
==> default: DEBUG:codeface.util:Failed work id 1
==> default: 2017-03-25 12:28:04 [codeface.util] MainProcess CRITICAL: Uncaught 
exception in worker thread:
==> default: CRITICAL:codeface.util:Uncaught exception in worker thread:
==> default: DEVINFO:codeface.util:Terminating workers...
==> default: DEVINFO:codeface.util:Workers terminated.
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/tmp/does_not_exist_42_42'
==> default: 2017-03-25 12:28:04 [codeface.configuration] MainProcess ERROR: 
Could not open configuration file '/tmp/does_not_exist_42_42'
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/configuration.py", line 85, in _load
==> default:     return yaml.load(open(filename))
==> default: IOError: [Errno 2] No such file or directory: 
'/tmp/does_not_exist_42_42'
==> default: ERROR:codeface.configuration:Could not open configuration file 
'/tmp/does_not_exist_42_42'
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/configuration.py", line 85, in _load
==> default:     return yaml.load(open(filename))
==> default: IOError: [Errno 2] No such file or directory: 
'/tmp/does_not_exist_42_42'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/tmp/tmp9I4Pl1'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/tmpCZ3v6n'
==> default: 2017-03-25 12:28:04 [codeface.configuration] MainProcess ERROR: 
Could not parse configuration file '/tmp/tmpCZ3v6n'
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/configuration.py", line 85, in _load
==> default:     return yaml.load(open(filename))
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/__init__.py", line 
71, in load
==> default:     return loader.get_single_data()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/constructor.py", 
line 37, in get_single_data
==> default:     node = self.get_single_node()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/composer.py", line 
36, in get_single_node
==> default:     document = self.compose_document()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/composer.py", line 
55, in compose_document
==> default:     node = self.compose_node(None, None)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/composer.py", line 
84, in compose_node
==> default:     node = self.compose_mapping_node(anchor)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/composer.py", line 
127, in compose_mapping_node
==> default:     while not self.check_event(MappingEndEvent):
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/parser.py", line 98, 
in check_event
==> default:     self.current_event = self.state()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/parser.py", line 
428, in parse_block_mapping_key
==> default:     if self.check_token(KeyToken):
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/scanner.py", line 
115, in check_token
==> default:     while self.need_more_tokens():
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/scanner.py", line 
149, in need_more_tokens
==> default:     self.stale_possible_simple_keys()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/scanner.py", line 
289, in stale_possible_simple_keys
==> default:     "could not found expected ':'", self.get_mark())
==> default: ScannerError: while scanning a simple key
==> default:   in "/tmp/tmpCZ3v6n", line 6, column 1
==> default: could not found expected ':'
==> default:   in "/tmp/tmpCZ3v6n", line 7, column 1
==> default: ERROR:codeface.configuration:Could not parse configuration file 
'/tmp/tmpCZ3v6n'
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/configuration.py", line 85, in _load
==> default:     return yaml.load(open(filename))
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/__init__.py", line 
71, in load
==> default:     return loader.get_single_data()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/constructor.py", 
line 37, in get_single_data
==> default:     node = self.get_single_node()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/composer.py", line 
36, in get_single_node
==> default:     document = self.compose_document()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/composer.py", line 
55, in compose_document
==> default:     node = self.compose_node(None, None)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/composer.py", line 
84, in compose_node
==> default:     node = self.compose_mapping_node(anchor)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/composer.py", line 
127, in compose_mapping_node
==> default:     while not self.check_event(MappingEndEvent):
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/parser.py", line 98, 
in check_event
==> default:     self.current_event = self.state()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/parser.py", line 
428, in parse_block_mapping_key
==> default:     if self.check_token(KeyToken):
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/scanner.py", line 
115, in check_token
==> default:     while self.need_more_tokens():
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/scanner.py", line 
149, in need_more_tokens
==> default:     self.stale_possible_simple_keys()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/yaml/scanner.py", line 
289, in stale_possible_simple_keys
==> default:     "could not found expected ':'", self.get_mark())
==> default: ScannerError: while scanning a simple key
==> default:   in "/tmp/tmpCZ3v6n", line 6, column 1
==> default: could not found expected ':'
==> default:   in "/tmp/tmpCZ3v6n", line 7, column 1
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/tmp/tmp9I4Pl1'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/tmp1WbqzJ'
==> default: 2017-03-25 12:28:04 [codeface.configuration] MainProcess CRITICAL: 
Malformed configuration: revision and rcs list lengths differ! Found 5 
revisions and 4 release candidates.
==> default: CRITICAL:codeface.configuration:Malformed configuration: revision 
and rcs list lengths differ! Found 5 revisions and 4 release candidates.
==> default: .
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/tmp/tmpi23nEl'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/tmphp_Cpz'
==> default: 2017-03-25 12:28:04 [codeface.configuration] MainProcess WARNING: 
Unknown key 'new_tag' in configuration.
==> default: WARNING:codeface.configuration:Unknown key 'new_tag' in 
configuration.
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/tmp/tmp4_Emi8'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Not loading project configuration 
file!
==> default: 2017-03-25 12:28:04 [codeface.configuration] MainProcess WARNING: 
Unknown key 'new_tag' in configuration.
==> default: WARNING:codeface.configuration:Unknown key 'new_tag' in 
configuration.
==> default: .
==> default: .
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: /usr/bin/env cppstats --kind 
featurelocations --file /tmp/tmpxa0VVl.c /tmp/tmpTx22mP.csv
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: Rscript do_test.r
==> default: Loading required package: NLP
==> default: TESTS
==> default: =====
==> default: 
==> default: projects list from database
==> default: data frame with 0 columns and 0 rows
==> default: R data structure
==> default: [[1]]
==> default: [[1]]$label
==> default: [1]
==> default:  "Codeface projects"
==> default: [[1]]$url
==> default: [1]
==> default:  "../dashboard/"
==> default: [[1]]$active
==> default: [1]
==> default:  FALSE
==> default: [[1]]$children
==> default: [[1]]$children[[1]]
==> default: [[1]]$children[[1]]$label
==> default: NULL
==> default: [[1]]$children[[1]]$url
==> default: [1]
==> default:  "../dashboard/?projectid="
==> default: [[2]]
==> default: [[2]]$label
==> default: NULL
==> default: [[2]]$url
==> default: [1]
==> default:  "../dashboard/?projectid=4"
==> default: [[2]]$active
==> default: [1]
==> default:  FALSE
==> default: [[2]]$children
==> default: [[2]]$children[[1]]
==> default: [[2]]$children[[1]]$label
==> default: <div style="font-family: symbola; display: inline; font-weight: 
500;">&#128129</div>
==> default: Basics
==> default: [[2]]$children[[1]]$url
==> default: [1]
==> default:  "../dashboard/?projectid=4&topic=basics&widget="
==> default: [[2]]$children[[2]]
==> default: [[2]]$children[[2]]$label
==> default: <div style="font-family: symbola; display: inline; font-weight: 
500;">&#128491</div>
==> default: Communication
==> default: [[2]]$children[[2]]$url
==> default: [1]
==> default:  "../dashboard/?projectid=4&topic=communication&widget="
==> default: [[2]]$children[[3]]
==> default: [[2]]$children[[3]]$label
==> default: <div style="font-family: symbola; display: inline; font-weight: 
500;">&#128296</div>
==> default: Construction
==> default: [[2]]$children[[3]]$url
==> default: [1]
==> default:  "../dashboard/?projectid=4&topic=construction&widget="
==> default: [[2]]$children[[4]]
==> default: [[2]]$children[[4]]$label
==> default: <div style="font-family: symbola; display: inline; font-weight: 
500;">&#127983</div>
==> default: Complexity
==> default: [[2]]$children[[4]]$url
==> default: [1]
==> default:  "../dashboard/?projectid=4&topic=complexity&widget="
==> default: [[2]]$children[[5]]
==> default: [[2]]$children[[5]]$label
==> default: <div style="font-family: symbola; display: inline; font-weight: 
500;">&#128101</div>
==> default: Collaboration
==> default: [[2]]$children[[5]]$url
==> default: [1]
==> default:  "../dashboard/?projectid=4&topic=collaboration&widget="
==> default: [[3]]
==> default: [[3]]$label
==> default: <div style="font-family: symbola; display: inline; font-weight: 
500;">&#128129</div>
==> default: Basics
==> default: [[3]]$url
==> default: [1] "../dashboard/?projectid=4&widget="
==> default: 
==> default: [[3]]$active
==> default: [1] FALSE
==> default: 
==> default: [[3]]$children
==> default: [[3]]$children[[1]]
==> default: [[3]]$children[[1]]$label
==> default: [1] "Commit Information"
==> default: 
==> default: [[3]]$children[[1]]$url
==> default: [1] 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.commit.info.splom,widget.commit.info.corrgram,widget.commit.doc"
==> default: 
==> default: 
==> default: [[3]]$children[[2]]
==> default: [[3]]$children[[2]]$label
==> default: [1] "Authors / Contributions"
==> default: 
==> default: [[3]]$children[[2]]$url
==> default: [1]
==> default:  
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.contributions.overview,widget.contributions.multiCycles,widget.contributions.authorsPerCycle"
==> default: 
==> default: 
==> default: [[3]]$children[[3]]
==> default: [[3]]$children[[3]]$label
==> default: [1] "Authors / Pagerank"
==> default: 
==> default: [[3]]$children[[3]]$url
==> default: [1] 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.contributors.pagerank,widget.contributors.pagerank.transposed,widget.contributors.commits,widget.contributors.changes"
==> default: 
==> default: 
==> default: [[3]]$children[[4]]
==> default: [[3]]$children[[4]]$label
==> default: [1] "Show Time Series"
==> default: 
==> default: [[3]]$children[[4]]$url
==> default: [1] 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.timeseries.plots"
==> default: 
==> default: 
==> default: [[3]]$children[[5]]
==> default: [[3]]$children[[5]]$label
==> default: [1] "Developer commit timezones"
==> default: 
==> default: [[3]]$children[[5]]$url
==> default: [1] 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.timezones.commits"
==> default: 
==> default: 
==> default: [[3]]$children[[6]]
==> default: [[3]]$children[[6]]$label
==> default: [1] "Authors / Time of Activity"
==> default: 
==> default: [[3]]$children[[6]]$url
==> default: [1] 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.weekend.fraction,widget.weekend.fraction.type,widget.punchcard"
==> default: 
==> default: 
==> default: 
==> default: 
==> default: [[4]]
==> default: [[4]]$label
==> default: [1] "Details"
==> default: 
==> default: [[4]]$url
==> default: [1] "../details?projectid=4"
==> default: 
==> default: [[4]]$active
==> default: [1] TRUE
==> default: 
==> default: [[4]]$children
==> default: list()
==> default: 
==> default: 
==> default: 
==> default: JSON data structure
==> default: [
==> default:    {
==> default:            "label" : "Codeface projects",
==> default:            "url" : "../dashboard/",
==> default:            "active" : false,
==> default:            "children" : [
==> default:                    {
==> default:                            "label" : null,
==> default:                            "url" : "../dashboard/?projectid="
==> default:                    }
==> default:            ]
==> default:    },
==> default:    {
==> default:            "label" : null,
==> default:            "url" : "../dashboard/?projectid=4",
==> default:            "active" : false,
==> default:            "children" : [
==> default:                    {
==> default:                            "label" : [
==> default:                                    {
==> default:                                            "name" : "div",
==> default:                                            "attribs" : {
==> default:                                                    "style" : 
"font-family: symbola; display: inline; font-weight: 500;"
==> default:                                            },
==> default:                                            "children" : [
==> default:                                                    "&#128129"
==> default:                                            ]
==> default:                                    },
==> default:                                    "Basics"
==> default:                            ],
==> default:                            "url" : 
"../dashboard/?projectid=4&topic=basics&widget="
==> default:                    },
==> default:                    {
==> default:                            "label" : [
==> default:                                    {
==> default:                                            "name" : "div",
==> default:                                            "attribs" : {
==> default:                                                    "style" : 
"font-family: symbola; display: inline; font-weight: 500;"
==> default:                                            },
==> default:                                            "children" : [
==> default:                                                    "&#128491"
==> default:                                            ]
==> default:                                    },
==> default:                                    "Communication"
==> default:                            ],
==> default:                            "url" : 
"../dashboard/?projectid=4&topic=communication&widget="
==> default:                    },
==> default:                    {
==> default:                            "label" : [
==> default:                                    {
==> default:                                            "name" : "div",
==> default:                                            "attribs" : {
==> default:                                                    "style" : 
"font-family: symbola; display: inline; font-weight: 500;"
==> default:                                            },
==> default:                                            "children" : [
==> default:                                                    "&#128296"
==> default:                                            ]
==> default:                                    },
==> default:                                    "Construction"
==> default:                            ],
==> default:                            "url" : 
"../dashboard/?projectid=4&topic=construction&widget="
==> default:                    },
==> default:                    {
==> default:                            "label" : [
==> default:                                    {
==> default:                                            "name" : "div",
==> default:                                            "attribs" : {
==> default:                                                    "style" : 
"font-family: symbola; display: inline; font-weight: 500;"
==> default:                                            },
==> default:                                            "children" : [
==> default:                                                    "&#127983"
==> default:                                            ]
==> default:                                    },
==> default:                                    "Complexity"
==> default:                            ],
==> default:                            "url" : 
"../dashboard/?projectid=4&topic=complexity&widget="
==> default:                    },
==> default:                    {
==> default:                            "label" : [
==> default:                                    {
==> default:                                            "name" : "div",
==> default:                                            "attribs" : {
==> default:                                                    "style" : 
"font-family: symbola; display: inline; font-weight: 500;"
==> default:                                            },
==> default:                                            "children" : [
==> default:                                                    "&#128101"
==> default:                                            ]
==> default:                                    },
==> default:                                    "Collaboration"
==> default:                            ],
==> default:                            "url" : 
"../dashboard/?projectid=4&topic=collaboration&widget="
==> default:                    }
==> default:            ]
==> default:    },
==> default:    {
==> default:            "label" : [
==> default:                    {
==> default:                            "name" : "div",
==> default:                            "attribs" : {
==> default:                                    "style" : "font-family: 
symbola; display: inline; font-weight: 500;"
==> default:                            },
==> default:                            "children" : [
==> default:                                    "&#128129"
==> default:                            ]
==> default:                    },
==> default:                    "Basics"
==> default:            ],
==> default:            "url" : "../dashboard/?projectid=4&widget=",
==> default:            "active" : false,
==> default:            "children" : [
==> default:                    {
==> default:                            "label" : "Commit Information",
==> default:                            "url" : 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.commit.info.splom,widget.commit.info.corrgram,widget.commit.doc"
==> default:                    },
==> default:                    {
==> default:                            "label" : "Authors / Contributions",
==> default:                            "url" : 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.contributions.overview,widget.contributions.multiCycles,widget.contributions.authorsPerCycle"
==> default:                    },
==> default:                    {
==> default:                            "label" : "Authors / Pagerank",
==> default:                            "url" : 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.contributors.pagerank,widget.contributors.pagerank.transposed,widget.contributors.commits,widget.contributors.changes"
==> default:                    },
==> default:                    {
==> default:                            "label" : "Show Time Series",
==> default:                            "url" : 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.timeseries.plots"
==> default:                    },
==> default:                    {
==> default:                            "label" : "Developer commit timezones",
==> default:                            "url" : 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.timezones.commits"
==> default:                    },
==> default:                    {
==> default:                            "label" : "Authors / Time of Activity",
==> default:                            "url" : 
"../details?projectid=4&topic=basics&widget=widget.weekend.fraction,widget.weekend.fraction.type,widget.punchcard"
==> default:                    }
==> default:            ]
==> default:    },
==> default:    {
==> default:            "label" : "Details",
==> default:            "url" : "../details?projectid=4",
==> default:            "active" : true,
==> default:            "children" : []
==> default:    }
==> default: ]
==> default: Bootstrap Html code
==> default: <ul class="breadcrumb">
==> default:   <li class="dropdown">
==> default:     <a data-target="#" href="../dashboard/">Codeface projects</a>
==> default:     <b class="dropdown-toggle caret" data-toggle="dropdown"></b>
==> default:     <ul class="dropdown-menu" role="menu">
==> default:       <li role="presentation" style="display:inline;">
==> default:         <a href="../dashboard/?projectid=" tabindex="-1" 
role="menuitem"></a>
==> default:       </li>
==> default:     </ul>
==> default:     <span class="divider">/</span>
==> default:   </li>
==> default:   <li class="dropdown">
==> default:     <a data-target="#" href="../dashboard/?projectid=4"></a>
==> default:     <b class="dropdown-toggle caret" data-toggle="dropdown"></b>
==> default:     <ul class="dropdown-menu" role="menu">
==> default:       <li role="presentation" style="display:inline;">
==> default:         <a 
href="../dashboard/?projectid=4&amp;topic=basics&amp;widget=" tabindex="-1" 
role="menuitem">&lt;div style="font-family: symbola; display: inline; 
font-weight: 500;"&gt;&amp;#128129&lt;/div&gt;
==> default: Basics</a>
==> default:       </li>
==> default:       <li role="presentation" style="display:inline;">
==> default:         <a 
href="../dashboard/?projectid=4&amp;topic=communication&amp;widget=" 
tabindex="-1" role="menuitem">&lt;div style="font-family: symbola; display: 
inline; font-weight: 500;"&gt;&amp;#128491&lt;/div&gt;
==> default: Communication</a>
==> default:       </li>
==> default:       <li role="presentation" style="display:inline;">
==> default:         <a 
href="../dashboard/?projectid=4&amp;topic=construction&amp;widget=" 
tabindex="-1" role="menuitem">&lt;div style="font-family: symbola; display: 
inline; font-weight: 500;"&gt;&amp;#128296&lt;/div&gt;
==> default: Construction</a>
==> default:       </li>
==> default:       <li role="presentation" style="display:inline;">
==> default:         <a 
href="../dashboard/?projectid=4&amp;topic=complexity&amp;widget=" tabindex="-1" 
role="menuitem">&lt;div style="font-family: symbola; display: inline; 
font-weight: 500;"&gt;&amp;#127983&lt;/div&gt;
==> default: Complexity</a>
==> default:       </li>
==> default:       <li role="presentation" style="display:inline;">
==> default:         <a 
href="../dashboard/?projectid=4&amp;topic=collaboration&amp;widget=" 
tabindex="-1" role="menuitem">&lt;div style="font-family: symbola; display: 
inline; font-weight: 500;"&gt;&amp;#128101&lt;/div&gt;
==> default: Collaboration</a>
==> default:       </li>
==> default:     </ul>
==> default:     <span class="divider">/</span>
==> default:   </li>
==> default:   <li class="dropdown">
==> default:     <a data-target="#" 
href="../dashboard/?projectid=4&amp;widget=">&lt;div style="font-family: 
symbola; display: inline; font-weight: 500;"&gt;&amp;#128129&lt;/div&gt;
==> default: Basics</a>
==> default:     <b class="dropdown-toggle caret" data-toggle="dropdown"></b>
==> default:     <ul class="dropdown-menu" role="menu">
==> default:       <li role="presentation" style="display:inline;">
==> default:         <a 
href="../details?projectid=4&amp;topic=basics&amp;widget=widget.commit.info.splom,widget.commit.info.corrgram,widget.commit.doc"
 tabindex="-1" role="menuitem">Commit Information</a>
==> default:       </li>
==> default:       <li role="presentation" style="display:inline;">
==> default:         <a 
href="../details?projectid=4&amp;topic=basics&amp;widget=widget.contributions.overview,widget.contributions.multiCycles,widget.contributions.authorsPerCycle"
 tabindex="-1" role="menuitem">Authors / Contributions</a>
==> default:       </li>
==> default:       <li role="presentation" style="display:inline;">
==> default:         <a 
href="../details?projectid=4&amp;topic=basics&amp;widget=widget.contributors.pagerank,widget.contributors.pagerank.transposed,widget.contributors.commits,widget.contributors.changes"
 tabindex="-1" role="menuitem">Authors / Pagerank</a>
==> default:       </li>
==> default:       <li role="presentation" style="display:inline;">
==> default:         <a 
href="../details?projectid=4&amp;topic=basics&amp;widget=widget.timeseries.plots"
 tabindex="-1" role="menuitem">Show Time Series</a>
==> default:       </li>
==> default:       <li role="presentation" style="display:inline;">
==> default:         <a 
href="../details?projectid=4&amp;topic=basics&amp;widget=widget.timezones.commits"
 tabindex="-1" role="menuitem">Developer commit timezones</a>
==> default:       </li>
==> default:       <li role="presentation" style="display:inline;">
==> default:         <a 
href="../details?projectid=4&amp;topic=basics&amp;widget=widget.weekend.fraction,widget.weekend.fraction.type,widget.punchcard"
 tabindex="-1" role="menuitem">Authors / Time of Activity</a>
==> default:       </li>
==> default:     </ul>
==> default:     <span class="divider">/</span>
==> default:   </li>
==> default:   <li class="dropdown">
==> default:     <b>Details</b>
==> default:     <span></span>
==> default:   </li>
==> default: </ul>
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: .
==> default: [1]
==> default:  "Test Passed"
==> default: .
==> default: You rock!
==> default:  
==> default: Warning messages:
==> default: 1: 
==> default: In max(dat) :
==> default:  no non-missing arguments to max; returning -Inf
==> default: 2: 
==> default: In min(dat) :
==> default:  no non-missing arguments to min; returning Inf
==> default: 3: 
==> default: In max(dat) :
==> default:  no non-missing arguments to max; returning -Inf
==> default: 4: 
==> default: In min(dat) :
==> default:  no non-missing arguments to min; returning Inf
==> default: .
==> default: 
----------------------------------------------------------------------
==> default: Ran 29 tests in 6.599s
==> default: OK
==> default: Initialized empty Git repository in 
/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git/
==> default: [master (root-commit) 9eaa63b] Commit 0
==> default:  1 file changed, 2 insertions(+)
==> default:  create mode 100644 README
==> default: [master 22c535f] Commit 1
==> default:  2 files changed, 3 insertions(+), 2 deletions(-)
==> default:  create mode 100644 src/code.c
==> default: [master b5a89b4] Commit 2
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+)
==> default:  create mode 100644 src/carp.c
==> default: [master 9c20869] Commit 3
==> default:  2 files changed, 3 insertions(+), 2 deletions(-)
==> default:  delete mode 100644 src/carp.c
==> default: [master 4cfafa9] Commit 4
==> default:  Author: Max Maintainer <max@xxxxxxxxxxx>
==> default:  1 file changed, 3 insertions(+)
==> default:  create mode 100644 src/newcode.c
==> default: [master e853181] Commit 5
==> default:  1 file changed, 0 insertions(+), 0 deletions(-)
==> default:  rename src/{newcode.c => answer.c} (100%)
==> default: [master 9c00245] Commit 6
==> default:  Author: Clara Confident <clara@xxxxxxx>
==> default:  1 file changed, 2 insertions(+)
==> default:  create mode 100644 Makefile
==> default: [master 4198f61] Commit 7
==> default:  2 files changed, 2 insertions(+), 3 deletions(-)
==> default:  delete mode 100644 Makefile
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git/testproject.conf'
==> default: DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface] MainProcess DEVINFO: Opened logfile 
'/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git/log' with log level 'debug'
==> default: DEVINFO:codeface:Opened logfile 
'/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git/log' with log level 'debug'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git/testproject.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git/testproject.conf'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.project] MainProcess INFO: => 
Setting up project 'codeface_test_projectXKDALx'
==> default: INFO:codeface.project:=> Setting up project 
'codeface_test_projectXKDALx'
==> default: DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Creating new project codeface_test_projectXKDALx/committer2author
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_projectXKDALx/committer2author
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectXKDALx/committer2author with ID 1
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectXKDALx/committer2author with ID 1
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess WARNING: 
Deleting and re-creating project codeface_test_projectXKDALx/committer2author.
==> default: WARNING:codeface.dbmanager:Deleting and re-creating project 
codeface_test_projectXKDALx/committer2author.
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Creating new project codeface_test_projectXKDALx/committer2author
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_projectXKDALx/committer2author
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectXKDALx/committer2author with ID 2
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectXKDALx/committer2author with ID 2
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess INFO: Adding 
3 new releases...
==> default: INFO:codeface.dbmanager:Adding 3 new releases...
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectXKDALx/committer2author with ID 2
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectXKDALx/committer2author with ID 2
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> 
Revision range v0_release..v1_release: Analysing commits...
==> default: INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: 
Analysing commits...
==> default: DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Creating data base for v0_release..v1_release
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Creating data base for 
v0_release..v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v0_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v1_rc_1..v1_release
==> default: Pass 1/2:   0% |                                               | 
ETA:  --:--:--
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git show --format=full --shortstat 
--numstat b5a89b41acadf241dc8146c2263fff4a779573b3
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change b5a89b41acadf241dc8146c2263fff4a779573b3
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience b5a89b41acadf241dc8146c2263fff4a779573b3
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
b5a89b41acadf241dc8146c2263fff4a779573b3
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 22c535f4f19980bf1174dcb9687c70c0187c5312
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 22c535f4f19980bf1174dcb9687c70c0187c5312
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 22c535f4f19980bf1174dcb9687c70c0187c5312
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
22c535f4f19980bf1174dcb9687c70c0187c5312
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 9c20869a9ee16feef22d7cf0cc3bfc4ffddbddda
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 9c20869a9ee16feef22d7cf0cc3bfc4ffddbddda
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 9c20869a9ee16feef22d7cf0cc3bfc4ffddbddda
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
9c20869a9ee16feef22d7cf0cc3bfc4ffddbddda
==> default: Pass 1/2: 100% |################################################| 
Time: 0:00:00
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Shelving the VCS object
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Shelving the VCS object
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Finished shelving the VCS object
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Finished shelving the VCS object
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectXKDALx/committer2author with ID 2
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectXKDALx/committer2author with ID 2
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Reading from data base 
/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git/results/codeface_test_projectXKDALx/committer2author/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Reading from data base 
/tmp/codeface_test_projectXKDALx/.git/results/codeface_test_projectXKDALx/committer2author/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.VCS] MainProcess DEVINFO: Using 
cached data to extract commit information
==> default: DEVINFO:codeface.VCS:Using cached data to extract commit 
information
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectXKDALx/committer2author with ID 2
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectXKDALx/committer2author with ID 2
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.cluster.idManager] MainProcess 
ERROR: Could not reach ID service. Is the server running?
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: ERROR:codeface.cluster.idManager:Could not reach ID service. Is 
the server running?
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: E
==> default: Initialized empty Git repository in 
/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git/
==> default: [master (root-commit) 9eaa63b] Commit 0
==> default:  1 file changed, 2 insertions(+)
==> default:  create mode 100644 README
==> default: [master 22c535f] Commit 1
==> default:  2 files changed, 3 insertions(+), 2 deletions(-)
==> default:  create mode 100644 src/code.c
==> default: [master b5a89b4] Commit 2
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+)
==> default:  create mode 100644 src/carp.c
==> default: [master 9c20869] Commit 3
==> default:  2 files changed, 3 insertions(+), 2 deletions(-)
==> default:  delete mode 100644 src/carp.c
==> default: [master 4cfafa9] Commit 4
==> default:  Author: Max Maintainer <max@xxxxxxxxxxx>
==> default:  1 file changed, 3 insertions(+)
==> default:  create mode 100644 src/newcode.c
==> default: [master e853181] Commit 5
==> default:  1 file changed, 0 insertions(+), 0 deletions(-)
==> default:  rename src/{newcode.c => answer.c} (100%)
==> default: [master 9c00245] Commit 6
==> default:  Author: Clara Confident <clara@xxxxxxx>
==> default:  1 file changed, 2 insertions(+)
==> default:  create mode 100644 Makefile
==> default: [master 4198f61] Commit 7
==> default:  2 files changed, 2 insertions(+), 3 deletions(-)
==> default:  delete mode 100644 Makefile
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git/testproject.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git/testproject.conf'
==> default: DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface] MainProcess DEVINFO: Opened logfile 
'/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git/log' with log level 'debug'
==> default: DEVINFO:codeface:Opened logfile 
'/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git/log' with log level 'debug'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git/testproject.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git/testproject.conf'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.project] MainProcess INFO: => 
Setting up project 'codeface_test_projecthW80CP'
==> default: INFO:codeface.project:=> Setting up project 
'codeface_test_projecthW80CP'
==> default: DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Creating new project codeface_test_projecthW80CP/tag
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_projecthW80CP/tag
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projecthW80CP/tag with ID 3
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projecthW80CP/tag with ID 3
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess WARNING: 
Deleting and re-creating project codeface_test_projecthW80CP/tag.
==> default: WARNING:codeface.dbmanager:Deleting and re-creating project 
codeface_test_projecthW80CP/tag.
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Creating new project codeface_test_projecthW80CP/tag
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_projecthW80CP/tag
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projecthW80CP/tag with ID 4
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projecthW80CP/tag with ID 4
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess INFO: Adding 
3 new releases...
==> default: INFO:codeface.dbmanager:Adding 3 new releases...
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projecthW80CP/tag with ID 4
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projecthW80CP/tag with ID 4
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> 
Revision range v0_release..v1_release: Analysing commits...
==> default: INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: 
Analysing commits...
==> default: DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Creating data base for v0_release..v1_release
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Creating data base for 
v0_release..v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v0_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v1_rc_1..v1_release
==> default: Pass 1/2:   0% |                                               | 
ETA:  --:--:--
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git show --format=full --shortstat 
--numstat b5a89b41acadf241dc8146c2263fff4a779573b3
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change b5a89b41acadf241dc8146c2263fff4a779573b3
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience b5a89b41acadf241dc8146c2263fff4a779573b3
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
b5a89b41acadf241dc8146c2263fff4a779573b3
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 22c535f4f19980bf1174dcb9687c70c0187c5312
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 22c535f4f19980bf1174dcb9687c70c0187c5312
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 22c535f4f19980bf1174dcb9687c70c0187c5312
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
22c535f4f19980bf1174dcb9687c70c0187c5312
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 9c20869a9ee16feef22d7cf0cc3bfc4ffddbddda
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 9c20869a9ee16feef22d7cf0cc3bfc4ffddbddda
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 9c20869a9ee16feef22d7cf0cc3bfc4ffddbddda
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
9c20869a9ee16feef22d7cf0cc3bfc4ffddbddda
==> default: Pass 1/2: 100% |################################################| 
Time: 0:00:00
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Shelving the VCS object
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Shelving the VCS object
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Finished shelving the VCS object
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Finished shelving the VCS object
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projecthW80CP/tag with ID 4
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projecthW80CP/tag with ID 4
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Reading from data base 
/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git/results/codeface_test_projecthW80CP/tag/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Reading from data base 
/tmp/codeface_test_projecthW80CP/.git/results/codeface_test_projecthW80CP/tag/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.VCS] MainProcess DEVINFO: Using 
cached data to extract commit information
==> default: DEVINFO:codeface.VCS:Using cached data to extract commit 
information
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projecthW80CP/tag with ID 4
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projecthW80CP/tag with ID 4
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.cluster.idManager] MainProcess 
ERROR: Could not reach ID service. Is the server running?
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: ERROR:codeface.cluster.idManager:Could not reach ID service. Is 
the server running?
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: E
==> default: Initialized empty Git repository in 
/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git/
==> default: [master (root-commit) 9eaa63b] Commit 0
==> default:  1 file changed, 2 insertions(+)
==> default:  create mode 100644 README
==> default: [master 6fd38f3] Commit 1
==> default:  2 files changed, 5 insertions(+), 2 deletions(-)
==> default:  create mode 100644 src/code.c
==> default: [master 9b9857a] Commit 2
==> default:  1 file changed, 3 insertions(+)
==> default:  create mode 100644 src/carp.c
==> default: [master 4e1f9da] Commit 3
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+)
==> default: [master 43913fe] Commit 4
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+)
==> default: [master 86be366] Commit 5
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+)
==> default: [master 96a470c] Commit 6
==> default:  1 file changed, 3 insertions(+), 1 deletion(-)
==> default: [master c31f5d8] Commit 7
==> default:  1 file changed, 2 insertions(+), 2 deletions(-)
==> default: [master 19ed287] Commit 8
==> default:  Author: Max Maintainer <max@xxxxxxxxxxx>
==> default:  1 file changed, 2 insertions(+)
==> default: [master fab5f63] Commit 9
==> default:  1 file changed, 2 insertions(+)
==> default: [master c9501ad] Commit 10
==> default:  Author: Clara Confident <clara@xxxxxxx>
==> default:  2 files changed, 5 insertions(+)
==> default:  create mode 100644 Makefile
==> default: [master ceba3d5] Commit 11
==> default:  4 files changed, 10 insertions(+), 9 deletions(-)
==> default:  delete mode 100644 Makefile
==> default: [master 54acd6d] Commit 12
==> default:  1 file changed, 2 insertions(+)
==> default: [master 4d25aab] Commit 13
==> default:  Author: Max Maintainer <max@xxxxxxxxxxx>
==> default:  4 files changed, 7 insertions(+), 20 deletions(-)
==> default:  delete mode 100644 src/carp.c
==> default:  create mode 100644 src/newcode.c
==> default: [master 2d6981d] Commit 14
==> default:  2 files changed, 1 insertion(+), 3 deletions(-)
==> default:  rename src/{newcode.c => answer.c} (100%)
==> default: [master 6c0f879] Commit 15
==> default:  Author: Clara Confident <clara@xxxxxxx>
==> default:  2 files changed, 2 insertions(+), 2 deletions(-)
==> default:  create mode 100644 Makefile
==> default: [master 88c2a52] Commit 16
==> default:  3 files changed, 10 insertions(+), 3 deletions(-)
==> default:  delete mode 100644 Makefile
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git/testproject.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git/testproject.conf'
==> default: DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface] MainProcess DEVINFO: Opened logfile 
'/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git/log' with log level 'debug'
==> default: DEVINFO:codeface:Opened logfile 
'/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git/log' with log level 'debug'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git/testproject.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git/testproject.conf'
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: ctags-exuberant --version
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.project] MainProcess INFO: => 
Setting up project 'codeface_test_projectCESyPI'
==> default: INFO:codeface.project:=> Setting up project 
'codeface_test_projectCESyPI'
==> default: DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Creating new project codeface_test_projectCESyPI/proximity
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_projectCESyPI/proximity
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectCESyPI/proximity with ID 5
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectCESyPI/proximity with ID 5
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess WARNING: 
Deleting and re-creating project codeface_test_projectCESyPI/proximity.
==> default: WARNING:codeface.dbmanager:Deleting and re-creating project 
codeface_test_projectCESyPI/proximity.
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Creating new project codeface_test_projectCESyPI/proximity
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_projectCESyPI/proximity
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectCESyPI/proximity with ID 6
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectCESyPI/proximity with ID 6
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess INFO: Adding 
3 new releases...
==> default: INFO:codeface.dbmanager:Adding 3 new releases...
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectCESyPI/proximity with ID 6
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectCESyPI/proximity with ID 6
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> 
Revision range v0_release..v1_release: Analysing commits...
==> default: INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: 
Analysing commits...
==> default: DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
==> default: 2017-03-25 12:28:09 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Creating data base for v0_release..v1_release
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Creating data base for 
v0_release..v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v0_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v1_rc_1..v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 4e1f9daf88f2208753ad5b64f2f641c84498e143
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 54acd6d5b793f615781a6b86d070562af8a2167f
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 96a470cace2d1e6a6bc983ea29253703e80642a1
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 19ed28730787cadb7209bd1e43aabd54a5734c39
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r fab5f6359b9df96367dcf6c73c61b7d04689b27f
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 43913fe3fd287177408bf186b105492600cd7292
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r ceba3d53836ec9c1ac86039d0e3d81210255248c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r c31f5d85cbb2cdac0e33825e2f4f54e88f0c9472
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 9b9857a9dc6e40072ef5f103ae44729bec717bcf
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 86be366758f7978f663438404b2c7b237aabf526
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r c9501ad4e843bc861899d2e5d416f866fe5195c4
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 6fd38f3b83b6fe80da9d14c3a43e294e6bf728d0
==> default: Blame Analysis:   0% |                                         | 
ETA:  --:--:--
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git log --no-merges -M -C 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release -- src/carp.c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git ls-tree --name-only --full-tree 
-r v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git blame -p -w -C -M v1_release -- 
src/carp.c
==> default: DEBUG:codeface.VCS:Running Doxygen analysis
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git log --no-merges -M -C 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release -- src/code.c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git ls-tree --name-only --full-tree 
-r v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git blame -p -w -C -M v1_release -- 
src/code.c
==> default: DEBUG:codeface.VCS:Running Doxygen analysis
==> default: Blame Analysis: 100% |##########################################| 
Time: 0:00:00
==> default: Pass 1/2:   0% |                                               | 
ETA:  --:--:--
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 4e1f9daf88f2208753ad5b64f2f641c84498e143
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 4e1f9daf88f2208753ad5b64f2f641c84498e143
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 4e1f9daf88f2208753ad5b64f2f641c84498e143
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
4e1f9daf88f2208753ad5b64f2f641c84498e143
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 54acd6d5b793f615781a6b86d070562af8a2167f
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 54acd6d5b793f615781a6b86d070562af8a2167f
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 54acd6d5b793f615781a6b86d070562af8a2167f
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
54acd6d5b793f615781a6b86d070562af8a2167f
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 96a470cace2d1e6a6bc983ea29253703e80642a1
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 96a470cace2d1e6a6bc983ea29253703e80642a1
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 96a470cace2d1e6a6bc983ea29253703e80642a1
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
96a470cace2d1e6a6bc983ea29253703e80642a1
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 19ed28730787cadb7209bd1e43aabd54a5734c39
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 19ed28730787cadb7209bd1e43aabd54a5734c39
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 19ed28730787cadb7209bd1e43aabd54a5734c39
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
19ed28730787cadb7209bd1e43aabd54a5734c39
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat fab5f6359b9df96367dcf6c73c61b7d04689b27f
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change fab5f6359b9df96367dcf6c73c61b7d04689b27f
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience fab5f6359b9df96367dcf6c73c61b7d04689b27f
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
fab5f6359b9df96367dcf6c73c61b7d04689b27f
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 43913fe3fd287177408bf186b105492600cd7292
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 43913fe3fd287177408bf186b105492600cd7292
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 43913fe3fd287177408bf186b105492600cd7292
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
43913fe3fd287177408bf186b105492600cd7292
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat ceba3d53836ec9c1ac86039d0e3d81210255248c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change ceba3d53836ec9c1ac86039d0e3d81210255248c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience ceba3d53836ec9c1ac86039d0e3d81210255248c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
ceba3d53836ec9c1ac86039d0e3d81210255248c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat c31f5d85cbb2cdac0e33825e2f4f54e88f0c9472
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change c31f5d85cbb2cdac0e33825e2f4f54e88f0c9472
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience c31f5d85cbb2cdac0e33825e2f4f54e88f0c9472
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
c31f5d85cbb2cdac0e33825e2f4f54e88f0c9472
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 9b9857a9dc6e40072ef5f103ae44729bec717bcf
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 9b9857a9dc6e40072ef5f103ae44729bec717bcf
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 9b9857a9dc6e40072ef5f103ae44729bec717bcf
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
9b9857a9dc6e40072ef5f103ae44729bec717bcf
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 86be366758f7978f663438404b2c7b237aabf526
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 86be366758f7978f663438404b2c7b237aabf526
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 86be366758f7978f663438404b2c7b237aabf526
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
86be366758f7978f663438404b2c7b237aabf526
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat c9501ad4e843bc861899d2e5d416f866fe5195c4
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change c9501ad4e843bc861899d2e5d416f866fe5195c4
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience c9501ad4e843bc861899d2e5d416f866fe5195c4
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
c9501ad4e843bc861899d2e5d416f866fe5195c4
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 6fd38f3b83b6fe80da9d14c3a43e294e6bf728d0
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 6fd38f3b83b6fe80da9d14c3a43e294e6bf728d0
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 6fd38f3b83b6fe80da9d14c3a43e294e6bf728d0
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
6fd38f3b83b6fe80da9d14c3a43e294e6bf728d0
==> default: Pass 1/2: 100% |################################################| 
Time: 0:00:00
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Shelving the VCS object
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Shelving the VCS object
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Finished shelving the VCS object
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Finished shelving the VCS object
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectCESyPI/proximity with ID 6
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectCESyPI/proximity with ID 6
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Reading from data base 
/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git/results/codeface_test_projectCESyPI/proximity/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Reading from data base 
/tmp/codeface_test_projectCESyPI/.git/results/codeface_test_projectCESyPI/proximity/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.VCS] MainProcess DEVINFO: Using 
cached data to extract commit information
==> default: DEVINFO:codeface.VCS:Using cached data to extract commit 
information
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectCESyPI/proximity with ID 6
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectCESyPI/proximity with ID 6
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.cluster.idManager] MainProcess 
ERROR: Could not reach ID service. Is the server running?
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: ERROR:codeface.cluster.idManager:Could not reach ID service. Is 
the server running?
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: E
==> default: Initialized empty Git repository in 
/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git/
==> default: [master (root-commit) 9eaa63b] Commit 0
==> default:  1 file changed, 2 insertions(+)
==> default:  create mode 100644 README
==> default: [master 6fd38f3] Commit 1
==> default:  2 files changed, 5 insertions(+), 2 deletions(-)
==> default:  create mode 100644 src/code.c
==> default: [master 9b9857a] Commit 2
==> default:  1 file changed, 3 insertions(+)
==> default:  create mode 100644 src/carp.c
==> default: [master 4e1f9da] Commit 3
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+)
==> default: [master 43913fe] Commit 4
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+)
==> default: [master 86be366] Commit 5
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+)
==> default: [master 96a470c] Commit 6
==> default:  1 file changed, 3 insertions(+), 1 deletion(-)
==> default: [master c31f5d8] Commit 7
==> default:  1 file changed, 2 insertions(+), 2 deletions(-)
==> default: [master 19ed287] Commit 8
==> default:  Author: Max Maintainer <max@xxxxxxxxxxx>
==> default:  1 file changed, 2 insertions(+)
==> default: [master fab5f63] Commit 9
==> default:  1 file changed, 2 insertions(+)
==> default: [master c9501ad] Commit 10
==> default:  Author: Clara Confident <clara@xxxxxxx>
==> default:  2 files changed, 5 insertions(+)
==> default:  create mode 100644 Makefile
==> default: [master ceba3d5] Commit 11
==> default:  4 files changed, 10 insertions(+), 9 deletions(-)
==> default:  delete mode 100644 Makefile
==> default: [master 54acd6d] Commit 12
==> default:  1 file changed, 2 insertions(+)
==> default: [master 4d25aab] Commit 13
==> default:  Author: Max Maintainer <max@xxxxxxxxxxx>
==> default:  4 files changed, 7 insertions(+), 20 deletions(-)
==> default:  delete mode 100644 src/carp.c
==> default:  create mode 100644 src/newcode.c
==> default: [master 2d6981d] Commit 14
==> default:  2 files changed, 1 insertion(+), 3 deletions(-)
==> default:  rename src/{newcode.c => answer.c} (100%)
==> default: [master 6c0f879] Commit 15
==> default:  Author: Clara Confident <clara@xxxxxxx>
==> default:  2 files changed, 2 insertions(+), 2 deletions(-)
==> default:  create mode 100644 Makefile
==> default: [master 88c2a52] Commit 16
==> default:  3 files changed, 10 insertions(+), 3 deletions(-)
==> default:  delete mode 100644 Makefile
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git/testproject.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git/testproject.conf'
==> default: DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface] MainProcess DEVINFO: Opened logfile 
'/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git/log' with log level 'debug'
==> default: DEVINFO:codeface:Opened logfile 
'/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git/log' with log level 'debug'
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git/testproject.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git/testproject.conf'
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.project] MainProcess INFO: => 
Setting up project 'codeface_test_project7whLS8'
==> default: INFO:codeface.project:=> Setting up project 
'codeface_test_project7whLS8'
==> default: DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Creating new project codeface_test_project7whLS8/tag
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_project7whLS8/tag
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_project7whLS8/tag with ID 7
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_project7whLS8/tag with ID 7
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.dbmanager] MainProcess WARNING: 
Deleting and re-creating project codeface_test_project7whLS8/tag.
==> default: WARNING:codeface.dbmanager:Deleting and re-creating project 
codeface_test_project7whLS8/tag.
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Creating new project codeface_test_project7whLS8/tag
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_project7whLS8/tag
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_project7whLS8/tag with ID 8
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_project7whLS8/tag with ID 8
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.dbmanager] MainProcess INFO: Adding 
3 new releases...
==> default: INFO:codeface.dbmanager:Adding 3 new releases...
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_project7whLS8/tag with ID 8
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_project7whLS8/tag with ID 8
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> 
Revision range v0_release..v1_release: Analysing commits...
==> default: INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: 
Analysing commits...
==> default: DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Creating data base for v0_release..v1_release
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Creating data base for 
v0_release..v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v0_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v1_rc_1..v1_release
==> default: Pass 1/2:   0% |                                               | 
ETA:  --:--:--
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 4e1f9daf88f2208753ad5b64f2f641c84498e143
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 4e1f9daf88f2208753ad5b64f2f641c84498e143
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 4e1f9daf88f2208753ad5b64f2f641c84498e143
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
4e1f9daf88f2208753ad5b64f2f641c84498e143
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 54acd6d5b793f615781a6b86d070562af8a2167f
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 54acd6d5b793f615781a6b86d070562af8a2167f
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 54acd6d5b793f615781a6b86d070562af8a2167f
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
54acd6d5b793f615781a6b86d070562af8a2167f
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 96a470cace2d1e6a6bc983ea29253703e80642a1
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 96a470cace2d1e6a6bc983ea29253703e80642a1
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 96a470cace2d1e6a6bc983ea29253703e80642a1
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
96a470cace2d1e6a6bc983ea29253703e80642a1
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 19ed28730787cadb7209bd1e43aabd54a5734c39
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 19ed28730787cadb7209bd1e43aabd54a5734c39
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 19ed28730787cadb7209bd1e43aabd54a5734c39
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
19ed28730787cadb7209bd1e43aabd54a5734c39
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat fab5f6359b9df96367dcf6c73c61b7d04689b27f
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change fab5f6359b9df96367dcf6c73c61b7d04689b27f
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience fab5f6359b9df96367dcf6c73c61b7d04689b27f
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
fab5f6359b9df96367dcf6c73c61b7d04689b27f
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 43913fe3fd287177408bf186b105492600cd7292
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 43913fe3fd287177408bf186b105492600cd7292
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 43913fe3fd287177408bf186b105492600cd7292
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
43913fe3fd287177408bf186b105492600cd7292
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat ceba3d53836ec9c1ac86039d0e3d81210255248c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change ceba3d53836ec9c1ac86039d0e3d81210255248c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience ceba3d53836ec9c1ac86039d0e3d81210255248c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
ceba3d53836ec9c1ac86039d0e3d81210255248c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat c31f5d85cbb2cdac0e33825e2f4f54e88f0c9472
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change c31f5d85cbb2cdac0e33825e2f4f54e88f0c9472
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience c31f5d85cbb2cdac0e33825e2f4f54e88f0c9472
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
c31f5d85cbb2cdac0e33825e2f4f54e88f0c9472
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 9b9857a9dc6e40072ef5f103ae44729bec717bcf
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 9b9857a9dc6e40072ef5f103ae44729bec717bcf
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 9b9857a9dc6e40072ef5f103ae44729bec717bcf
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
9b9857a9dc6e40072ef5f103ae44729bec717bcf
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 86be366758f7978f663438404b2c7b237aabf526
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 86be366758f7978f663438404b2c7b237aabf526
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 86be366758f7978f663438404b2c7b237aabf526
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
86be366758f7978f663438404b2c7b237aabf526
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat c9501ad4e843bc861899d2e5d416f866fe5195c4
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change c9501ad4e843bc861899d2e5d416f866fe5195c4
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience c9501ad4e843bc861899d2e5d416f866fe5195c4
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
c9501ad4e843bc861899d2e5d416f866fe5195c4
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 6fd38f3b83b6fe80da9d14c3a43e294e6bf728d0
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 6fd38f3b83b6fe80da9d14c3a43e294e6bf728d0
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 6fd38f3b83b6fe80da9d14c3a43e294e6bf728d0
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
6fd38f3b83b6fe80da9d14c3a43e294e6bf728d0
==> default: Pass 1/2: 100% |################################################| 
Time: 0:00:00
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Shelving the VCS object
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Shelving the VCS object
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Finished shelving the VCS object
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Finished shelving the VCS object
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_project7whLS8/tag with ID 8
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_project7whLS8/tag with ID 8
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Reading from data base 
/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git/results/codeface_test_project7whLS8/tag/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Reading from data base 
/tmp/codeface_test_project7whLS8/.git/results/codeface_test_project7whLS8/tag/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.VCS] MainProcess DEVINFO: Using 
cached data to extract commit information
==> default: DEVINFO:codeface.VCS:Using cached data to extract commit 
information
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_project7whLS8/tag with ID 8
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_project7whLS8/tag with ID 8
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.cluster.idManager] MainProcess 
ERROR: Could not reach ID service. Is the server running?
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: ERROR:codeface.cluster.idManager:Could not reach ID service. Is 
the server running?
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: E
==> default: Initialized empty Git repository in 
/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git/
==> default: [master (root-commit) ac61e7e] Commit 0
==> default:  1 file changed, 6 insertions(+)
==> default:  create mode 100644 src/carp.c
==> default: [master f95b804] Commit 1
==> default:  1 file changed, 3 insertions(+), 1 deletion(-)
==> default: [master 458c1a5] Commit 2
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
==> default: [master 4be60ac] Commit 3
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
==> default: [master 3b7cc95] Commit 4
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
==> default: [master 3fe9884] Commit 5
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
==> default: [master 7b16cf1] Commit 6
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
==> default: [master c9b5904] Commit 7
==> default:  1 file changed, 15 insertions(+)
==> default:  create mode 100644 src/code.c
==> default: [master 29b9c8b] Commit 8
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
==> default: [master c52343a] Commit 9
==> default:  1 file changed, 3 insertions(+), 3 deletions(-)
==> default: [master 55eec10] Commit 10
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
==> default: [master 2d29196] Commit 11
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git/testproject.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git/testproject.conf'
==> default: DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface] MainProcess DEVINFO: Opened logfile 
'/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git/log' with log level 'debug'
==> default: DEVINFO:codeface:Opened logfile 
'/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git/log' with log level 'debug'
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
==> default: 2017-03-25 12:28:10 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git/testproject.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git/testproject.conf'
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: /usr/bin/env cppstats 
--version
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.project] MainProcess INFO: => 
Setting up project 'codeface_test_projectn1rnds'
==> default: INFO:codeface.project:=> Setting up project 
'codeface_test_projectn1rnds'
==> default: DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Creating new project codeface_test_projectn1rnds/feature
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_projectn1rnds/feature
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectn1rnds/feature with ID 9
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectn1rnds/feature with ID 9
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.dbmanager] MainProcess WARNING: 
Deleting and re-creating project codeface_test_projectn1rnds/feature.
==> default: WARNING:codeface.dbmanager:Deleting and re-creating project 
codeface_test_projectn1rnds/feature.
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Creating new project codeface_test_projectn1rnds/feature
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_projectn1rnds/feature
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectn1rnds/feature with ID 10
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectn1rnds/feature with ID 10
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.dbmanager] MainProcess INFO: Adding 
3 new releases...
==> default: INFO:codeface.dbmanager:Adding 3 new releases...
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectn1rnds/feature with ID 10
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectn1rnds/feature with ID 10
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> 
Revision range v0_release..v1_release: Analysing commits...
==> default: INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: 
Analysing commits...
==> default: DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Creating data base for v0_release..v1_release
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Creating data base for 
v0_release..v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v0_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v1_rc_1..v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
==> default: Blame Analysis:   0% |                                         | 
ETA:  --:--:--
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git log --no-merges -M -C 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release -- src/carp.c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git ls-tree --name-only --full-tree 
-r v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git blame -p -w -C -M v1_release -- 
src/carp.c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: /usr/bin/env cppstats --kind 
featurelocations --file /tmp/tmpJe6kyc.c /tmp/tmpVPrHeR.csv
==> default: Blame Analysis: 100% |##########################################| 
Time: 0:00:00
==> default: Pass 1/2:   0% |                                               | 
ETA:  --:--:--
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
==> default: Pass 1/2: 100% |################################################| 
Time: 0:00:00
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Shelving the VCS object
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Shelving the VCS object
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Finished shelving the VCS object
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Finished shelving the VCS object
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectn1rnds/feature with ID 10
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectn1rnds/feature with ID 10
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Reading from data base 
/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git/results/codeface_test_projectn1rnds/feature/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Reading from data base 
/tmp/codeface_test_projectn1rnds/.git/results/codeface_test_projectn1rnds/feature/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.VCS] MainProcess DEVINFO: Using 
cached data to extract commit information
==> default: DEVINFO:codeface.VCS:Using cached data to extract commit 
information
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectn1rnds/feature with ID 10
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectn1rnds/feature with ID 10
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.cluster.idManager] MainProcess 
ERROR: Could not reach ID service. Is the server running?
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: ERROR:codeface.cluster.idManager:Could not reach ID service. Is 
the server running?
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: E
==> default: Initialized empty Git repository in 
/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git/
==> default: [master (root-commit) ac61e7e] Commit 0
==> default:  1 file changed, 6 insertions(+)
==> default:  create mode 100644 src/carp.c
==> default: [master f95b804] Commit 1
==> default:  1 file changed, 3 insertions(+), 1 deletion(-)
==> default: [master 458c1a5] Commit 2
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
==> default: [master 4be60ac] Commit 3
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
==> default: [master 3b7cc95] Commit 4
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
==> default: [master 3fe9884] Commit 5
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
==> default: [master 7b16cf1] Commit 6
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
==> default: [master c9b5904] Commit 7
==> default:  1 file changed, 15 insertions(+)
==> default:  create mode 100644 src/code.c
==> default: [master 29b9c8b] Commit 8
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
==> default: [master c52343a] Commit 9
==> default:  1 file changed, 3 insertions(+), 3 deletions(-)
==> default: [master 55eec10] Commit 10
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
==> default: [master 2d29196] Commit 11
==> default:  1 file changed, 1 insertion(+), 1 deletion(-)
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git/testproject.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git/testproject.conf'
==> default: DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface] MainProcess DEVINFO: Opened logfile 
'/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git/log' with log level 'debug'
==> default: DEVINFO:codeface:Opened logfile 
'/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git/log' with log level 'debug'
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading global configuration file '/vagrant/codeface.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading global configuration file 
'/vagrant/codeface.conf'
==> default: 2017-03-25 12:28:11 [codeface.configuration] MainProcess DEVINFO: 
Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git/testproject.conf'
==> default: DEVINFO:codeface.configuration:Loading project configuration file 
'/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git/testproject.conf'
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: /usr/bin/env cppstats 
--version
==> default: 2017-03-25 12:28:12 [codeface.project] MainProcess INFO: => 
Setting up project 'codeface_test_projectoovCWy'
==> default: INFO:codeface.project:=> Setting up project 
'codeface_test_projectoovCWy'
==> default: DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
==> default: 2017-03-25 12:28:12 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Creating new project codeface_test_projectoovCWy/feature_file
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_projectoovCWy/feature_file
==> default: 2017-03-25 12:28:12 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectoovCWy/feature_file with ID 11
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectoovCWy/feature_file with ID 11
==> default: 2017-03-25 12:28:12 [codeface.dbmanager] MainProcess WARNING: 
Deleting and re-creating project codeface_test_projectoovCWy/feature_file.
==> default: WARNING:codeface.dbmanager:Deleting and re-creating project 
codeface_test_projectoovCWy/feature_file.
==> default: 2017-03-25 12:28:12 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Creating new project codeface_test_projectoovCWy/feature_file
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Creating new project 
codeface_test_projectoovCWy/feature_file
==> default: 2017-03-25 12:28:12 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectoovCWy/feature_file with ID 12
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectoovCWy/feature_file with ID 12
==> default: 2017-03-25 12:28:12 [codeface.dbmanager] MainProcess INFO: Adding 
3 new releases...
==> default: INFO:codeface.dbmanager:Adding 3 new releases...
==> default: 2017-03-25 12:28:12 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectoovCWy/feature_file with ID 12
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectoovCWy/feature_file with ID 12
==> default: 2017-03-25 12:28:12 [codeface.util] MainProcess INFO:   -> 
Revision range v0_release..v1_release: Analysing commits...
==> default: INFO:codeface.util:  -> Revision range v0_release..v1_release: 
Analysing commits...
==> default: DEBUG:codeface.dbmanager:Establishing MySQL connection to 
codeface@localhost:3306, DB 'codeface'
==> default: 2017-03-25 12:28:12 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Creating data base for v0_release..v1_release
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Creating data base for 
v0_release..v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v0_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git log --no-merges --format=%ct -1 
v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git log -M -C --no-merges 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v1_rc_1..v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git diff-tree --diff-filter=ACMRTB 
--no-commit-id --name-only -r 3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
==> default: Blame Analysis:   0% |                                         | 
ETA:  --:--:--
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git log --no-merges -M -C 
--pretty=format:%ct %H %at %ai v0_release..v1_release -- src/carp.c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git ls-tree --name-only --full-tree 
-r v1_release
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git blame -p -w -C -M v1_release -- 
src/carp.c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: /usr/bin/env cppstats --kind 
featurelocations --file /tmp/tmpgfV6IM.c /tmp/tmpXr1bo4.csv
==> default: Blame Analysis: 100% |##########################################| 
Time: 0:00:00
==> default: Pass 1/2:   0% |                                               | 
ETA:  --:--:--
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
f95b8047236f75641d6d7a2b5790b9e1db869ccd
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
4be60ac55e29d769a40fe11f41f33e88ba7f059b
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
3fe9884f98487cce4603d2bd5578e94944412d3c
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
7b16cf10845bc64e2589fa63822f3ddc49aedd4d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
458c1a53c8adb5b09268546a035235cf9a8b034d
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat 3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --ignore-space-change 3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience 3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
==> default: DEBUG:codeface.util:Running command: git 
--git-dir=/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git show --format=full --shortstat 
--numstat --patience --ignore-space-change 
3b7cc950b4446fa4a3e06a6cf0992ded1a5fe923
==> default: Pass 1/2: 100% |################################################| 
Time: 0:00:00
==> default: 2017-03-25 12:28:12 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Shelving the VCS object
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Shelving the VCS object
==> default: 2017-03-25 12:28:12 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Finished shelving the VCS object
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Finished shelving the VCS object
==> default: 2017-03-25 12:28:12 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectoovCWy/feature_file with ID 12
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectoovCWy/feature_file with ID 12
==> default: 2017-03-25 12:28:12 [codeface.cluster.cluster] MainProcess 
DEVINFO: Reading from data base 
/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git/results/codeface_test_projectoovCWy/feature_file/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
==> default: DEVINFO:codeface.cluster.cluster:Reading from data base 
/tmp/codeface_test_projectoovCWy/.git/results/codeface_test_projectoovCWy/feature_file/v0_release-v1_release/vcs_analysis.db...
==> default: 2017-03-25 12:28:12 [codeface.VCS] MainProcess DEVINFO: Using 
cached data to extract commit information
==> default: DEVINFO:codeface.VCS:Using cached data to extract commit 
information
==> default: 2017-03-25 12:28:12 [codeface.dbmanager] MainProcess DEVINFO: 
Using project codeface_test_projectoovCWy/feature_file with ID 12
==> default: DEVINFO:codeface.dbmanager:Using project 
codeface_test_projectoovCWy/feature_file with ID 12
==> default: 2017-03-25 12:28:12 [codeface.cluster.idManager] MainProcess 
ERROR: Could not reach ID service. Is the server running?
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: ERROR:codeface.cluster.idManager:Could not reach ID service. Is 
the server running?
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: E
==> default: DEVINFO:codeface:Opened logfile '/tmp/tmpS4UIUI' with log level 
'devinfo'
==> default: DEBUG:codeface.test.integration.test_logger:Should not be in 
logfile! :-( 
==> default: INFO:codeface.test.integration.test_logger:Should be in logfile 
:-) 
==> default: DEVINFO:codeface.test.integration.test_logger:Should be in logfile 
:-) 
==> default: WARNING:codeface.test.integration.test_logger:Should really be in 
logfile :-D 
==> default: DEVINFO:codeface:Stopped logging into logfile '/tmp/tmpS4UIUI'
==> default: .
==> default: WARNING:codeface.test.integration.test_logger::-)
==> default: INFO:codeface.test.integration.test_logger::-(
==> default: DEVINFO:codeface.test.integration.test_logger::-(
==> default: WARNING:codeface.test.integration.test_logger::-)
==> default: INFO:codeface.test.integration.test_logger::-)
==> default: DEVINFO:codeface.test.integration.test_logger::-(
==> default: DEVINFO:codeface.test.integration.test_logger::-)
==> default: DEBUG:codeface.test.integration.test_logger::-(
==> default: DEBUG:codeface.test.integration.test_logger::-)
==> default: .
==> default: 
======================================================================
==> default: ERROR: testEndToEnd 
(integration.test_exampleprojects.TestEndToEndExample1C2A)
==> default: 
----------------------------------------------------------------------
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 250, in 
testEndToEnd
==> default:     self.analyseEndToEnd()
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, in 
analyseEndToEnd
==> default:     load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
==> default:     return run(sys.argv)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
==> default:     return args.func(args)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
==> default:     args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
==> default:   File "/vagrant/codeface/project.py", line 113, in project_analyse
==> default:     endmsg=prefix + "Commit analysis done."
==> default:   File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
==> default:     func(*args, **kwargs)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1951, in 
doProjectAnalysis
==> default:     rc_range)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1856, in 
performAnalysis
==> default:     populatePersonDB(cmtdict.values(), id_mgr, link_type)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1377, in 
populatePersonDB
==> default:     ID = id_mgr.getPersonID(cmt.getAuthorName())
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 141, in 
getPersonID
==> default:     self._cache[(name, email)] = self._query_user_id(name, email)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: 
======================================================================
==> default: ERROR: testEndToEnd 
(integration.test_exampleprojects.TestEndToEndExample1Tag)
==> default: 
----------------------------------------------------------------------
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 250, in 
testEndToEnd
==> default:     self.analyseEndToEnd()
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, in 
analyseEndToEnd
==> default:     load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
==> default:     return run(sys.argv)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
==> default:     return args.func(args)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
==> default:     args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
==> default:   File "/vagrant/codeface/project.py", line 113, in project_analyse
==> default:     endmsg=prefix + "Commit analysis done."
==> default:   File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
==> default:     func(*args, **kwargs)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1951, in 
doProjectAnalysis
==> default:     rc_range)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1856, in 
performAnalysis
==> default:     populatePersonDB(cmtdict.values(), id_mgr, link_type)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1377, in 
populatePersonDB
==> default:     ID = id_mgr.getPersonID(cmt.getAuthorName())
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 141, in 
getPersonID
==> default:     self._cache[(name, email)] = self._query_user_id(name, email)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: 
======================================================================
==> default: ERROR: testEndToEnd 
(integration.test_exampleprojects.TestEndToEndExample2Proximity)
==> default: 
----------------------------------------------------------------------
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 250, in 
testEndToEnd
==> default:     self.analyseEndToEnd()
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, in 
analyseEndToEnd
==> default:     load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
==> default:     return run(sys.argv)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
==> default:     return args.func(args)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
==> default:     args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
==> default:   File "/vagrant/codeface/project.py", line 113, in project_analyse
==> default:     endmsg=prefix + "Commit analysis done."
==> default:   File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
==> default:     func(*args, **kwargs)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1951, in 
doProjectAnalysis
==> default:     rc_range)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1856, in 
performAnalysis
==> default:     populatePersonDB(cmtdict.values(), id_mgr, link_type)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1377, in 
populatePersonDB
==> default:     ID = id_mgr.getPersonID(cmt.getAuthorName())
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 141, in 
getPersonID
==> default:     self._cache[(name, email)] = self._query_user_id(name, email)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: 
======================================================================
==> default: ERROR: testEndToEnd 
(integration.test_exampleprojects.TestEndToEndExample2Tag)
==> default: 
----------------------------------------------------------------------
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 250, in 
testEndToEnd
==> default:     self.analyseEndToEnd()
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, in 
analyseEndToEnd
==> default:     load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
==> default:     return run(sys.argv)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
==> default:     return args.func(args)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
==> default:     args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
==> default:   File "/vagrant/codeface/project.py", line 113, in project_analyse
==> default:     endmsg=prefix + "Commit analysis done."
==> default:   File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
==> default:     func(*args, **kwargs)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1951, in 
doProjectAnalysis
==> default:     rc_range)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1856, in 
performAnalysis
==> default:     populatePersonDB(cmtdict.values(), id_mgr, link_type)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1377, in 
populatePersonDB
==> default:     ID = id_mgr.getPersonID(cmt.getAuthorName())
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 141, in 
getPersonID
==> default:     self._cache[(name, email)] = self._query_user_id(name, email)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: 
======================================================================
==> default: ERROR: testEndToEnd 
(integration.test_features.TestEndToEndOnlyTaggingExample3Feature)
==> default: 
----------------------------------------------------------------------
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/test/integration/test_features.py", line 
44, in testEndToEnd
==> default:     self.analyseEndToEnd()
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, in 
analyseEndToEnd
==> default:     load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
==> default:     return run(sys.argv)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
==> default:     return args.func(args)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
==> default:     args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
==> default:   File "/vagrant/codeface/project.py", line 113, in project_analyse
==> default:     endmsg=prefix + "Commit analysis done."
==> default:   File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
==> default:     func(*args, **kwargs)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1951, in 
doProjectAnalysis
==> default:     rc_range)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1856, in 
performAnalysis
==> default:     populatePersonDB(cmtdict.values(), id_mgr, link_type)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1377, in 
populatePersonDB
==> default:     ID = id_mgr.getPersonID(cmt.getAuthorName())
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 141, in 
getPersonID
==> default:     self._cache[(name, email)] = self._query_user_id(name, email)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: 
======================================================================
==> default: ERROR: testEndToEnd 
(integration.test_features.TestEndToEndOnlyTaggingExample3Feature_File)
==> default: 
----------------------------------------------------------------------
==> default: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/test/integration/test_features.py", line 
44, in testEndToEnd
==> default:     self.analyseEndToEnd()
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, in 
analyseEndToEnd
==> default:     load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
==> default:     return run(sys.argv)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
==> default:     return args.func(args)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
==> default:     args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
==> default:   File "/vagrant/codeface/project.py", line 113, in project_analyse
==> default:     endmsg=prefix + "Commit analysis done."
==> default:   File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
==> default:     func(*args, **kwargs)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1951, in 
doProjectAnalysis
==> default:     rc_range)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1856, in 
performAnalysis
==> default:     populatePersonDB(cmtdict.values(), id_mgr, link_type)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1377, in 
populatePersonDB
==> default:     ID = id_mgr.getPersonID(cmt.getAuthorName())
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 141, in 
getPersonID
==> default:     self._cache[(name, email)] = self._query_user_id(name, email)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: 
----------------------------------------------------------------------
==> default: Ran 8 tests in 3.648s
==> default: FAILED
==> default:  (errors=6)
==> default: --- # global codeface configuration
==> default: idServiceHostname: '127.0.0.1'
==> default: idServicePort: 8080
==> default: # codeface project configuration
==> default: 
==> default: ===== running integration tests =====
==> default: 
==> default: Left directory '/tmp/codeface_test_projectXKDALx' for inspection.
==> default: Left directory '/tmp/codeface_test_projecthW80CP' for inspection.
==> default: Left directory '/tmp/codeface_test_projectCESyPI' for inspection.
==> default: Left directory '/tmp/codeface_test_project7whLS8' for inspection.
==> default: Left directory '/tmp/codeface_test_projectn1rnds' for inspection.
==> default: Left directory '/tmp/codeface_test_projectoovCWy' for inspection.
==> default: 
==> default: ===== Some unit or integration tests failed :( =====
==> default: Error in integration test: testEndToEnd 
(integration.test_exampleprojects.TestEndToEndExample1C2A)
==> default:                    Result: Traceback (most recent call last):
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 250, in 
testEndToEnd
==> default:     self.analyseEndToEnd()
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, in 
analyseEndToEnd
==> default:     load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
==> default:     return run(sys.argv)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
==> default:     return args.func(args)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
==> default:     args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
==> default:   File "/vagrant/codeface/project.py", line 113, in project_analyse
==> default:     endmsg=prefix + "Commit analysis done."
==> default:   File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
==> default:     func(*args, **kwargs)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1951, in 
doProjectAnalysis
==> default:     rc_range)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1856, in 
performAnalysis
==> default:     populatePersonDB(cmtdict.values(), id_mgr, link_type)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1377, in 
populatePersonDB
==> default:     ID = id_mgr.getPersonID(cmt.getAuthorName())
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 141, in 
getPersonID
==> default:     self._cache[(name, email)] = self._query_user_id(name, email)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: 
==> default: 
==> default: 
==> default: Error in integration test: testEndToEnd 
(integration.test_exampleprojects.TestEndToEndExample1Tag)
==> default:                    Result: Traceback (most recent call last):
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 250, in 
testEndToEnd
==> default:     self.analyseEndToEnd()
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, in 
analyseEndToEnd
==> default:     load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
==> default:     return run(sys.argv)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
==> default:     return args.func(args)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
==> default:     args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
==> default:   File "/vagrant/codeface/project.py", line 113, in project_analyse
==> default:     endmsg=prefix + "Commit analysis done."
==> default:   File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
==> default:     func(*args, **kwargs)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1951, in 
doProjectAnalysis
==> default:     rc_range)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1856, in 
performAnalysis
==> default:     populatePersonDB(cmtdict.values(), id_mgr, link_type)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1377, in 
populatePersonDB
==> default:     ID = id_mgr.getPersonI
==> default: D(cmt.getAuthorName())
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 141, in 
getPersonID
==> default:     self._cache[(name, email)] = self._query_user_id(name, email)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: 
==> default: 
==> default: 
==> default: Error in integration test: testEndToEnd 
(integration.test_exampleprojects.TestEndToEndExample2Proximity)
==> default:                    Result: Traceback (most recent call last):
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 250, in 
testEndToEnd
==> default:     self.analyseEndToEnd()
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, in 
analyseEndToEnd
==> default:     load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
==> default:     return run(sys.argv)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
==> default:     return args.func(args)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
==> default:     args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
==> default:   File "/vagrant/codeface/project.py", line 113, in project_analyse
==> default:     endmsg=prefix + "Commit analysis done."
==> default:   File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
==> default:     func(*args, **kwargs)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1951, in 
doProjectAnalysis
==> default:     rc_range)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1856, in 
performAnalysis
==> default:     populatePersonDB(cmtdict.values(), id_mgr, link_type)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1377, in 
populatePersonDB
==> default:     ID = id_mgr.getPersonID(cmt.getAuthorName())
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 141, in 
getPersonID
==> default:     self._cache[(name, email)] = self._query_user_id(name, email)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: 
==> default: 
==> default: 
==> default: Error in integration test: testEndToEnd 
(integration.test_exampleprojects.TestEndToEndExample2Tag)
==> default:                    Result: Traceback (most recent call last):
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 250, in 
testEndToEnd
==> default:     self.analyseEndToEnd()
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, in 
analyseEndToEnd
==> default:     load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
==> default:     return run(sys.argv)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
==> default:     return args.func(args)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
==> default:     args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
==> default:   File "/vagrant/codeface/project.py", line 113, in project_analyse
==> default:     endmsg=prefix + "Commit analysis done."
==> default:   File "/vagran
==> default: t/codeface/util.py", line 110, in add
==> default:     func(*args, **kwargs)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1951, in 
doProjectAnalysis
==> default:     rc_range)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1856, in 
performAnalysis
==> default:     populatePersonDB(cmtdict.values(), id_mgr, link_type)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1377, in 
populatePersonDB
==> default:     ID = id_mgr.getPersonID(cmt.getAuthorName())
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 141, in 
getPersonID
==> default:     self._cache[(name, email)] = self._query_user_id(name, email)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: 
==> default: 
==> default: 
==> default: Error in integration test: testEndToEnd 
(integration.test_features.TestEndToEndOnlyTaggingExample3Feature)
==> default:                    Result: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/test/integration/test_features.py", line 
44, in testEndToEnd
==> default:     self.analyseEndToEnd()
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, in 
analyseEndToEnd
==> default:     load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
==> default:     return run(sys.argv)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
==> default:     return args.func(args)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
==> default:     args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
==> default:   File "/vagrant/codeface/project.py", line 113, in project_analyse
==> default:     endmsg=prefix + "Commit analysis done."
==> default:   File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
==> default:     func(*args, **kwargs)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1951, in 
doProjectAnalysis
==> default:     rc_range)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1856, in 
performAnalysis
==> default:     populatePersonDB(cmtdict.values(), id_mgr, link_type)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1377, in 
populatePersonDB
==> default:     ID = id_mgr.getPersonID(cmt.getAuthorName())
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 141, in 
getPersonID
==> default:     self._cache[(name, email)] = self._query_user_id(name, email)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: 
==> default: 
==> default: 
==> default: Error in integration test: testEndToEnd 
(integration.test_features.TestEndToEndOnlyTaggingExample3Feature_File)
==> default:                    Result: Traceback (most recent call last):
==> default:   File "/vagrant/codeface/test/integration/test_features.py", line 
44, in testEndToEnd
==> default:     self.analyseEndToEnd()
==> default:   File 
"/vagrant/codeface/test/integration/test_exampleprojects.py", line 120, in 
analyseEndToEnd
==> default:     load_entry_point('codeface', 'console_scripts', 'codeface')()
==> default:   Fil
==> default: e "/vagrant/codeface/cli.py", line 220, in main
==> default:     return run(sys.argv)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 216, in run
==> default:     return args.func(args)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cli.py", line 119, in cmd_run
==> default:     args.profile_r, args.jobs, args.tagging, args.reuse_db)
==> default:   File "/vagrant/codeface/project.py", line 113, in project_analyse
==> default:     endmsg=prefix + "Commit analysis done."
==> default:   File "/vagrant/codeface/util.py", line 110, in add
==> default:     func(*args, **kwargs)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1951, in 
doProjectAnalysis
==> default:     rc_range)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1856, in 
performAnalysis
==> default:     populatePersonDB(cmtdict.values(), id_mgr, link_type)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/cluster.py", line 1377, in 
populatePersonDB
==> default:     ID = id_mgr.getPersonID(cmt.getAuthorName())
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 141, in 
getPersonID
==> default:     self._cache[(name, email)] = self._query_user_id(name, email)
==> default:   File "/vagrant/codeface/cluster/idManager.py", line 114, in 
_query_user_id
==> default:     self._conn.request("POST", "/post_user_id", params, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1017, in request
==> default:     self._send_request(method, url, body, headers)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1051, in _send_request
==> default:     self.endheaders(body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 1013, in endheaders
==> default:     self._send_output(message_body)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 864, in _send_output
==> default:     self.send(msg)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 826, in send
==> default:     self.connect()
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/httplib.py", line 807, in connect
==> default:     self.timeout, self.source_address)
==> default:   File "/usr/lib/python2.7/socket.py", line 571, in 
create_connection
==> default:     raise err
==> default: error: [Errno 111] Connection refused
==> default: integration-scripts/test_codeface.sh: line 12: kill: (11636) - No 
such process
################
### Workaround
################


vagrant ssh

sudo apt-get install npm

sudo apt-get update

cd /vagrant/id_service

npm install --no-bin-links

/vagrant/integration-scripts/test_codeface.sh

• References:
  • [codeface] Fwd: Re: Can't execute analysis_example
    • From: Stefan Kuppelwieser
  • [codeface] Re: Fwd: Re: Can't execute analysis_example
    • From: Wolfgang Mauerer
  • [codeface] Re: Fwd: Re: Can't execute analysis_example
    • From: Stefan Kuppelwieser
  • [codeface] Re: Fwd: Re: Can't execute analysis_example
    • From: Wolfgang Mauerer

Other related posts:

• » [codeface] Fwd: Re: Can't execute analysis_example- Stefan Kuppelwieser
• » [codeface] Re: Fwd: Re: Can't execute analysis_example- Wolfgang Mauerer
• » [codeface] Re: Fwd: Re: Can't execute analysis_example- Wolfgang Mauerer
• » [codeface] Re: Fwd: Re: Can't execute analysis_example- Wolfgang Mauerer
• » [codeface] Re: Fwd: Re: Can't execute analysis_example- Stefan Kuppelwieser
• » [codeface] Re: Fwd: Re: Can't execute analysis_example- Stefan Kuppelwieser
• » [codeface] Re: Fwd: Re: Can't execute analysis_example- Stefan Kuppelwieser
• » [codeface] Re: Fwd: Re: Can't execute analysis_example- Wolfgang Mauerer
• » [codeface] Re: Fwd: Re: Can't execute analysis_example- Wolfgang Mauerer
• » [codeface] Re: Fwd: Re: Can't execute analysis_example - Stefan Kuppelwieser