Persbericht, 31 oktober 2019
Hulp van binnenuit:
inwonende bacteriën beschermen planten tegen infecties
Micro-organismen die in plantenwortels leven, werken nauw samen met planten om
hun groei en stressbestendigheid te vergroten. Een internationaal team geleid
door het Nederlands Instituut voor Ecologie (NIOO-KNAW) en Wageningen UR laat
dat deze week zien in het bekende wetenschappelijke tijdschrift Science.
[cid:image001.jpg@01D59030.F71B9E70]Bij een dreigende schimmelinfectie van de
wortels kunnen bepaalde families van inwonende bacteriën een plant beschermen.
Een internationaal onderzoeksteam uit Nederland (Wageningen, Leiden,
Rotterdam), Brazilië, Colombia en de Verenigde Staten toonde dat aan.
Deze bacterie-families kwamen de onderzoekers op het spoor dankzij
'metagenomics': een DNA-technologie waarmee je de hele diversiteit van
micro-gemeenschappen in kaart kan brengen. "Het is uniek dat we de
samenstelling en de functies van deze gemeenschap in plantenwortels konden
reconstrueren, alleen op grond van de DNA-volgordes," legt laatste auteur en
onderzoeksleider Jos Raaijmakers van het NIOO uit.
Duurzame gewasproductie
"Bacteriën zijn essentieel voor het functioneren van planten, dieren en
mensen," stelt Raaijmakers. "Ons belangrijkste doel was om in de wortels van de
plant micro-organismen te ontdekken die de plant rekruteert bij een dreigende
infectie. Deze studie betekent een grote stap voorwaarts in de ontwikkeling van
duurzamere gewasproductie met minder pesticiden."
Wat gebeurt er nu in plantenwortels bij een schimmelinfectie? De onderzoekers
ontdekten dat de helpers in de wortels allerlei nuttige stoffen gaan
produceren. Zoals chitinases, enzymen die de wand van de aanvallende
schimmelcellen afbreken.
Met de nieuwverworven kennis ontwikkelden de onderzoekers vervolgens zelf
microscopisch kleine hulptroepen van Chitinophaga- en Flavobacterium-soorten,
die planten kunnen beschermen. Dit bleek bij testen met suikerbiet keer op keer
effectief tegen schimmelinfecties van de wortels.
Schat aan nieuwe genen
"De micro-organismen die in de wortels leven, bleken ook een nog onbekende
schat aan andere genetische eigenschappen te bezitten," zegt Raaijmakers.
Nieuwe software, ontwikkeld door onderzoekers van Wageningen University &
Research (WUR), maakte het mogelijk om snel het DNA van duizenden soorten
tegelijk te analyseren.
De onderzoekers vonden zo samen meer dan 700 onbekende clusters van genen die
verantwoordelijk zijn voor de aanmaak van bijzondere stoffen. Slechts 12 waren
er al bekend in de wereldwijde databases. Raaijmakers: "We hebben dus een schat
aan eigenschappen ontdekt, waarvan we de functies nog niet kennen. Dit is echt
nog maar het topje van de ijsberg."
"Deze ontdekkingen waren mogelijk dankzij een multidisciplinaire aanpak met
zowel ecologen, microbiologen, moleculair biologen, bioinformatici en
statistici," legt Raaijmakers uit. Het onderzoek hoort bij het
BackToRoots-project<https://back2roots.nioo.knaw.nl/>. Gesubsidieerd door een
TTW Perspectief-beurs doorgronden de onderzoekers de microbiële gemeenschappen
die planten kunnen helpen. Onder andere bij wilde voorouders van onze huidige
gewassen.
__________________________________________________________________________________________
Het Nederlands Instituut voor Ecologie (NIOO-KNAW) is met ruim 300 medewerkers
en studenten een van de grootste onderzoeksinstituten van de Koninklijke
Nederlandse Akademie van Wetenschappen (KNAW). Het is gespecialiseerd in de
ecologie van het water en het land: hoe werkt de natuur? Sinds 2011 is het
gevestigd in een duurzaam gebouwd onderzoekspand in Wageningen. De historie van
het onderzoek gaat meer dan 60 jaar terug en loopt door ons hele land, en ver
daarbuiten. www.nioo.knaw.nl<http://www.nioo.knaw.nl>
Voor meer informatie:
· Onderzoeksleider prof. dr. Jos
Raaijmakers<https://nioo.knaw.nl/en/employees/Jos-Raaijmakers>, Afdeling
Microbiële Ecologie NIOO-KNAW, tel. 0317-473497 / 06-20346270,
j.raaijmakers@xxxxxxxxxxxx<mailto:j.raaijmakers@xxxxxxxxxxxx>
· Mede-onderzoeksleider dr. Marnix Medema, Bioinformatics Group
Wageningen UR, tel. 0317-484706 / 06-54758321,
marnix.medema@xxxxxx<mailto:marnix.medema@xxxxxx>
· Hoofd wetenschapscommunicatie Froukje Rienks, Nederlands Instituut voor
Ecologie (NIOO-KNAW), tel. 06-10487481 / 0317-473590,
f.rienks@xxxxxxxxxxxx<mailto:f.rienks@xxxxxxxxxxxx>
Illustraties: wel of geen kleine hulptroepen aanwezig? Het verschil is
duidelijk te zien aan zaailingen van suikerbieten. Bron: NIOO-KNAW. Downloads
via de online versie van dit
bericht<https://nioo.knaw.nl/nl/pers/inwonende-bacterien-beschermen-planten-tegen-infecties>.
Artikel (met NIOO-auteurs onderstreept): Pathogen-induced activation of
disease-suppressive functions in the endophytic root microbiome. Víctor J.
Carrión, Juan Perez-Jaramillo, Viviane Cordovez, Vittorio Tracanna, Mattias de
Hollander, Daniel Ruiz-Buck, Lucas W. Mendes, Wilfred F.J. van IJcken, Ruth
Gomez-Exposito, Somayah S. Elsayed, Prarthana Mohanraju, Adini Arifah, John van
der Oost, Joseph N. Paulson, Rodrigo Mendes, Gilles P. van Wezel, Marnix H.
Medema & Jos M. Raaijmakers, Science, 1 november 2019.
DOI:
10.1126/science.aaw9285<https://science.sciencemag.org/content/366/6465/606>
Twitter: @niooknaw<https://twitter.com/niooknaw>
Website NIOO: www.nioo.knaw.nl<http://www.nioo.knaw.nl>
Als u dit persbericht ten onrechte ontvangt of geen persberichten meer wenst te
ontvangen, meld dat dan s.v.p. via
communicatie@xxxxxxxxxxxx<mailto:communicatie@xxxxxxxxxxxx>.
Froukje Rienks
Wetenschapsvoorlichter / Hoofd PR & Wetenschapscommunicatie
Nederlands Instituut voor Ecologie (NIOO-KNAW)
Bureau Bedrijfsvoering
Droevendaalsesteeg 10, 6708 PB Wageningen
Postbus 50, 6700 AB Wageningen
T 0317-473590
M 06-10487481
f.rienks@xxxxxxxxxxxx<mailto:f.rienks@xxxxxxxxxxxx>
www.nioo.knaw.nl<http://www.nioo.knaw.nl/>
@niooknaw (Twitter)<twitter.com/niooknaw>
Het NIOO is het onderzoeksinstituut voor ecologie van de Koninklijke
Nederlandse Akademie van Wetenschappen (KNAW)